More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sdel_0146 on replicon NC_013512
Organism: Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013512  Sdel_0146  NADH-quinone oxidoreductase, chain I  100 
 
 		 204 aa  422  1e-117  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00110619  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1820  NADH dehydrogenase subunit I  64.85 
 
 		 211 aa  290  1e-77  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.000000189199  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0189  NADH dehydrogenase subunit I  57.59 
 
 		 200 aa  237  8e-62  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1742  NADH dehydrogenase subunit I  58.12 
 
 		 213 aa  233  1.0000000000000001e-60  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1556  NADH dehydrogenase subunit I  58.12 
 
 		 213 aa  233  1.0000000000000001e-60  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  hitchhiker  0.0000101443  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1922  NADH dehydrogenase subunit I  58.12 
 
 		 213 aa  233  2.0000000000000002e-60  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  decreased coverage  0.000283263  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1521  NADH dehydrogenase subunit I  55.79 
 
 		 231 aa  232  4.0000000000000004e-60  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.00088837  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1437  NADH dehydrogenase subunit I  59.24 
 
 		 210 aa  229  2e-59  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1664  NADH dehydrogenase subunit I  51.85 
 
 		 212 aa  204  9e-52  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.910659  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3336  NADH dehydrogenase subunit I  38.13 
 
 		 162 aa  105  6e-22  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.463064  normal  0.437664 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3627  NADH dehydrogenase subunit I  39.07 
 
 		 164 aa  105  6e-22  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0704772 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1501  NADH dehydrogenase subunit I  41.09 
 
 		 177 aa  103  2e-21  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0649483  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05703  hypothetical protein similar to : Formate hydrogenlyase subunit 6/NADH:ubiquinone oxidoreductase 23 kD subunit (Broad)  39.44 
 
 		 224 aa  101  7e-21  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.803618 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3248  NADH dehydrogenase subunit I  38.28 
 
 		 165 aa  99.8  2e-20  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.779883  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1363  NADH dehydrogenase subunit I  38.28 
 
 		 162 aa  100  2e-20  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.353821  normal  0.140777 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0829  NADH dehydrogenase subunit I  38.28 
 
 		 163 aa  99.4  3e-20  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.260339  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3502  NADH dehydrogenase subunit I  38.28 
 
 		 181 aa  99.4  4e-20  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1043  NADH dehydrogenase subunit I  38.28 
 
 		 163 aa  99  4e-20  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006681  CNL05770  conserved hypothetical protein  37.31 
 
 		 273 aa  98.2  6e-20  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2805  NADH dehydrogenase subunit I  37.5 
 
 		 169 aa  98.2  8e-20  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.166718 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1411  NADH dehydrogenase subunit I  37.5 
 
 		 165 aa  97.8  9e-20  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0328529 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0825  NADH dehydrogenase subunit I  39.23 
 
 		 163 aa  97.8  9e-20  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2292  NADH dehydrogenase subunit I  37.8 
 
 		 161 aa  97.8  9e-20  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0935  NADH dehydrogenase subunit I  37.14 
 
 		 163 aa  97.8  9e-20  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.13658  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1322  NADH dehydrogenase subunit I  37.86 
 
 		 164 aa  97.8  1e-19  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.323962  normal  0.0547108 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1660  NADH-quinone oxidoreductase, chain I  38.26 
 
 		 234 aa  97.4  1e-19  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1432  NADH dehydrogenase subunit I  37.4 
 
 		 165 aa  97.1  1e-19  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.277545  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1187  NADH dehydrogenase subunit I  37.21 
 
 		 164 aa  97.1  1e-19  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.438944  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2001  NADH dehydrogenase subunit I  37.14 
 
 		 162 aa  97.1  1e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0496982 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2238  NADH dehydrogenase subunit I  37.98 
 
 		 163 aa  97.4  1e-19  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.180184 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1351  NADH dehydrogenase subunit I  36.43 
 
 		 162 aa  96.7  2e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0309776  hitchhiker  0.0086006 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0880  NADH dehydrogenase subunit I  37.5 
 
 		 170 aa  97.1  2e-19  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2523  NADH dehydrogenase subunit I  40 
 
 		 167 aa  96.7  2e-19  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.208294  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1185  NADH dehydrogenase subunit I  40 
 
 		 167 aa  96.7  2e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0684834  normal  0.389473 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1563  NADH dehydrogenase subunit I  39.53 
 
 		 162 aa  97.1  2e-19  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.339949  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2993  NADH dehydrogenase subunit I  37.3 
 
 		 161 aa  97.1  2e-19  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3206  NADH dehydrogenase subunit I  36.43 
 
 		 162 aa  96.7  2e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00643522  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1997  NADH dehydrogenase subunit I  40.83 
 
 		 167 aa  97.1  2e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0446418  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0929  NADH dehydrogenase subunit I  40.31 
 
 		 163 aa  97.1  2e-19  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5172  NADH dehydrogenase subunit I  35.56 
 
 		 169 aa  96.3  3e-19  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.950727  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0965  NADH dehydrogenase subunit I  37.5 
 
 		 170 aa  95.9  3e-19  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.837483  normal  0.0693949 
 
 
-
 
NC_002978  WD0980  NADH dehydrogenase subunit I  39.84 
 
 		 169 aa  96.3  3e-19  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0729  NADH dehydrogenase subunit I  36.43 
 
 		 162 aa  96.3  3e-19  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.384636  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1821  NADH dehydrogenase subunit I  36.43 
 
 		 162 aa  96.3  3e-19  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0421  NADH dehydrogenase subunit I  36.43 
 
 		 162 aa  96.3  3e-19  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.735915  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1138  NADH dehydrogenase subunit I  36.43 
 
 		 162 aa  96.3  3e-19  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.299701  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1443  NADH dehydrogenase subunit I  36.43 
 
 		 162 aa  96.3  3e-19  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.798759  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1307  NADH dehydrogenase subunit I  36.43 
 
 		 162 aa  96.3  3e-19  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.91191  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1298  NADH dehydrogenase subunit I  36.43 
 
 		 162 aa  96.3  3e-19  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0969  NADH dehydrogenase subunit I  34.56 
 
 		 163 aa  95.9  4e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0765514  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0691  NADH dehydrogenase subunit I  41.23 
 
 		 169 aa  95.5  4e-19  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.438917  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2054  NADH dehydrogenase subunit I  37.14 
 
 		 163 aa  95.5  5e-19  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.151951 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1883  NADH dehydrogenase subunit I  37.14 
 
 		 163 aa  95.5  5e-19  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.604396 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1509  NADH dehydrogenase subunit I  39.45 
 
 		 165 aa  95.5  5e-19  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00304735 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1030  NADH dehydrogenase subunit I  38.73 
 
 		 163 aa  95.5  5e-19  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.206882  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2206  NADH dehydrogenase subunit I  37.14 
 
 		 163 aa  95.5  5e-19  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0361  NADH dehydrogenase subunit I  41.23 
 
 		 167 aa  95.1  6e-19  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.326031  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5569  NADH dehydrogenase subunit I  35.71 
 
 		 162 aa  95.1  6e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.156755 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0754  NADH dehydrogenase subunit I  35.25 
 
 		 164 aa  95.1  6e-19  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.180315  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2158  NADH dehydrogenase subunit I  36.43 
 
 		 162 aa  94.7  7e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.394971  normal  0.941111 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1036  NADH dehydrogenase subunit I  36.43 
 
 		 162 aa  94.7  7e-19  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.160572  normal  0.248767 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2279  NADH dehydrogenase subunit I  36.43 
 
 		 162 aa  94.7  7e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.336058  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2415  NADH dehydrogenase subunit I  38.03 
 
 		 163 aa  94.7  8e-19  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.87535  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1271  NADH dehydrogenase subunit I  37.5 
 
 		 171 aa  94.7  8e-19  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.400573  normal  0.480107 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1069  NADH dehydrogenase subunit I  35.71 
 
 		 162 aa  94.4  1e-18  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.74272  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1956  NADH-quinone oxidoreductase, chain I  37.59 
 
 		 162 aa  93.2  2e-18  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.198639  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2265  NADH dehydrogenase subunit I  35.71 
 
 		 162 aa  93.6  2e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.477325  normal  0.254179 
 
 
-
 
NC_009370  OSTLU_18502  predicted protein  39.34 
 
 		 167 aa  93.6  2e-18  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.0613487 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1301  NADH dehydrogenase subunit I  42.42 
 
 		 162 aa  93.6  2e-18  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  decreased coverage  0.00320411  normal  0.488956 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1629  NADH dehydrogenase subunit I  35.71 
 
 		 162 aa  93.6  2e-18  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2241  NADH dehydrogenase subunit I  35.71 
 
 		 162 aa  93.6  2e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.493495  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0810  NADH dehydrogenase subunit I  44.14 
 
 		 163 aa  92.4  4e-18  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.719018  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2390  NADH dehydrogenase subunit I  41.41 
 
 		 162 aa  92.4  4e-18  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  hitchhiker  0.0000573568  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4625  NADH dehydrogenase subunit I  41.67 
 
 		 162 aa  92.4  4e-18  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.11536 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0805  NADH dehydrogenase subunit I  44.14 
 
 		 163 aa  92.4  5e-18  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0211  NADH dehydrogenase subunit I  33.33 
 
 		 176 aa  92  5e-18  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0994  NADH dehydrogenase subunit I  35.71 
 
 		 163 aa  92  5e-18  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0323  NADH dehydrogenase subunit I  44.14 
 
 		 176 aa  91.7  7e-18  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1269  NADH dehydrogenase subunit I  41.67 
 
 		 163 aa  90.9  1e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.142775  normal  1 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_88630  mitochondrial complex I NUIM TYKY subunit (proton translocation)  36.73 
 
 		 226 aa  90.5  1e-17  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.970128  normal  1 
 
 
-
 
NC_011682  PHATRDRAFT_14260  predicted protein  40.52 
 
 		 163 aa  90.5  1e-17  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2926  NADH dehydrogenase subunit I  39.84 
 
 		 162 aa  90.5  1e-17  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0163  NADH dehydrogenase subunit I  44.14 
 
 		 184 aa  89.7  2e-17  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3387  NADH-quinone oxidoreductase, chain I  38.57 
 
 		 165 aa  90.1  2e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.533197  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0898  NADH dehydrogenase subunit I  41.53 
 
 		 163 aa  90.1  2e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0404509  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1099  NADH dehydrogenase subunit I  37.5 
 
 		 162 aa  89.7  3e-17  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1361  NADH dehydrogenase subunit I  41.53 
 
 		 163 aa  89.4  3e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.182164  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1157  NADH-quinone oxidoreductase, chain I  37.16 
 
 		 177 aa  89.7  3e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3918  NADH-quinone oxidoreductase, chain I  36.22 
 
 		 132 aa  89  4e-17  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0957  NADH dehydrogenase subunit I  35.56 
 
 		 162 aa  89.4  4e-17  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0765322  normal  0.470027 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4002  NADH-quinone oxidoreductase, chain I  36.22 
 
 		 132 aa  89  4e-17  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.89067e-17 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3818  NADH-quinone oxidoreductase, chain I  38.71 
 
 		 171 aa  89.4  4e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.121238  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3290  NADH dehydrogenase subunit I  44.55 
 
 		 162 aa  89.4  4e-17  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.221287  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2877  NADH dehydrogenase subunit I  39.06 
 
 		 162 aa  89  4e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.670141  normal  0.245456 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0820  NADH dehydrogenase subunit I  41.09 
 
 		 160 aa  88.6  6e-17  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2053  NADH dehydrogenase subunit I  33.59 
 
 		 163 aa  88.6  6e-17  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.330204  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1962  NADH dehydrogenase subunit I  39.39 
 
 		 163 aa  88.2  7e-17  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.528282  normal  0.0448739 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2622  NADH dehydrogenase subunit I  34.35 
 
 		 163 aa  88.2  8e-17  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2582  NADH dehydrogenase subunit I  45.54 
 
 		 162 aa  88.2  8e-17  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.561308  normal  0.2116 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2212  NADH dehydrogenase subunit I  45.54 
 
 		 162 aa  88.2  8e-17  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.199823  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>