More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GM21_4002 on replicon NC_012918
Organism: Geobacter sp. M21



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012918  GM21_4002  NADH-quinone oxidoreductase, chain I  100 
 
 
132 aa  277  4e-74  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.89067e-17 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3918  NADH-quinone oxidoreductase, chain I  100 
 
 
132 aa  277  4e-74  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4236  NADH-quinone oxidoreductase, chain I  86.36 
 
 
132 aa  244  2e-64  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000114859  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0346  NADH dehydrogenase I, I subunit  83.33 
 
 
132 aa  233  6e-61  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3130  NADH-quinone oxidoreductase, chain I  81.4 
 
 
135 aa  230  5e-60  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3347  NADH-quinone oxidoreductase, chain I  80.92 
 
 
131 aa  226  7e-59  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.715886  normal  0.525186 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7011  NADH-quinone oxidoreductase, chain I  47.06 
 
 
169 aa  132  1.9999999999999998e-30  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1043  NADH dehydrogenase subunit I  44.62 
 
 
163 aa  126  8.000000000000001e-29  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0829  NADH dehydrogenase subunit I  44.62 
 
 
163 aa  126  9.000000000000001e-29  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.260339  normal 
 
 
-
 
NC_002978  WD0980  NADH dehydrogenase subunit I  46.83 
 
 
169 aa  126  1.0000000000000001e-28  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1660  NADH-quinone oxidoreductase, chain I  45.67 
 
 
234 aa  125  1.0000000000000001e-28  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0917  NADH-quinone oxidoreductase, chain I  44.85 
 
 
179 aa  125  2.0000000000000002e-28  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.5865  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3248  NADH dehydrogenase subunit I  44.62 
 
 
165 aa  124  4.0000000000000003e-28  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.779883  normal 
 
 
-
 
NC_009370  OSTLU_18502  predicted protein  43.08 
 
 
167 aa  123  9e-28  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.0613487 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1020  NADH dehydrogenase subunit I  44.8 
 
 
171 aa  122  1e-27  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.755319  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1432  NADH dehydrogenase subunit I  42.31 
 
 
165 aa  122  2e-27  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.277545  normal 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0361  NADH dehydrogenase subunit I  45.97 
 
 
167 aa  122  2e-27  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.326031  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0691  NADH dehydrogenase subunit I  45.16 
 
 
169 aa  122  2e-27  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.438917  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2053  NADH dehydrogenase subunit I  42.31 
 
 
163 aa  122  2e-27  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.330204  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1374  NADH dehydrogenase I chain I  44.53 
 
 
175 aa  122  2e-27  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  decreased coverage  0.00228535  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1157  NADH-quinone oxidoreductase, chain I  46.21 
 
 
177 aa  121  3e-27  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1238  NADH-quinone oxidoreductase, chain I  45.65 
 
 
181 aa  121  4e-27  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0825  NADH dehydrogenase subunit I  43.41 
 
 
163 aa  120  4e-27  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2805  NADH dehydrogenase subunit I  43.08 
 
 
169 aa  121  4e-27  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.166718 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0546  NADH dehydrogenase subunit I  45.19 
 
 
217 aa  120  5e-27  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.175795  normal  0.434998 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0880  NADH dehydrogenase subunit I  42.31 
 
 
170 aa  120  5e-27  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6086  NADH dehydrogenase subunit I  45.19 
 
 
211 aa  120  8e-27  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  decreased coverage  0.00224994  normal  0.0520295 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0289  NADH-quinone oxidoreductase, chain I  45.8 
 
 
171 aa  120  8e-27  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.998746  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3502  NADH dehydrogenase subunit I  43.08 
 
 
181 aa  120  9e-27  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5172  NADH dehydrogenase subunit I  42.31 
 
 
169 aa  119  9.999999999999999e-27  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.950727  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0929  NADH dehydrogenase subunit I  41.54 
 
 
163 aa  119  9.999999999999999e-27  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3387  NADH-quinone oxidoreductase, chain I  44.12 
 
 
165 aa  119  9.999999999999999e-27  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.533197  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5569  NADH dehydrogenase subunit I  43.08 
 
 
162 aa  119  9.999999999999999e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.156755 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1271  NADH dehydrogenase subunit I  41.54 
 
 
171 aa  119  9.999999999999999e-27  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.400573  normal  0.480107 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1069  NADH dehydrogenase subunit I  43.08 
 
 
162 aa  119  9.999999999999999e-27  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.74272  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2265  NADH dehydrogenase subunit I  43.08 
 
 
162 aa  118  1.9999999999999998e-26  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.477325  normal  0.254179 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4057  NADH dehydrogenase subunit I  44.44 
 
 
211 aa  119  1.9999999999999998e-26  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.819652  normal  0.545712 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1750  NADH dehydrogenase subunit I  40.77 
 
 
161 aa  119  1.9999999999999998e-26  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1629  NADH dehydrogenase subunit I  43.08 
 
 
162 aa  118  1.9999999999999998e-26  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2241  NADH dehydrogenase subunit I  43.08 
 
 
162 aa  118  1.9999999999999998e-26  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.493495  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4455  NADH dehydrogenase subunit I  44.44 
 
 
211 aa  119  1.9999999999999998e-26  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.829117  normal  0.833546 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0965  NADH dehydrogenase subunit I  42.31 
 
 
170 aa  118  3e-26  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.837483  normal  0.0693949 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1501  NADH dehydrogenase subunit I  42.31 
 
 
177 aa  118  3e-26  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0649483  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1298  NADH dehydrogenase subunit I  42.31 
 
 
162 aa  117  3.9999999999999996e-26  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1138  NADH dehydrogenase subunit I  42.31 
 
 
162 aa  117  3.9999999999999996e-26  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.299701  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1821  NADH dehydrogenase subunit I  42.31 
 
 
162 aa  117  3.9999999999999996e-26  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1443  NADH dehydrogenase subunit I  42.31 
 
 
162 aa  117  3.9999999999999996e-26  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.798759  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1036  NADH dehydrogenase subunit I  42.31 
 
 
162 aa  117  3.9999999999999996e-26  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.160572  normal  0.248767 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0421  NADH dehydrogenase subunit I  42.31 
 
 
162 aa  117  3.9999999999999996e-26  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.735915  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1307  NADH dehydrogenase subunit I  42.31 
 
 
162 aa  117  3.9999999999999996e-26  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.91191  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2279  NADH dehydrogenase subunit I  42.31 
 
 
162 aa  117  3.9999999999999996e-26  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.336058  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0729  NADH dehydrogenase subunit I  42.31 
 
 
162 aa  117  3.9999999999999996e-26  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.384636  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2158  NADH dehydrogenase subunit I  42.31 
 
 
162 aa  117  3.9999999999999996e-26  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.394971  normal  0.941111 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1351  NADH dehydrogenase subunit I  42.31 
 
 
162 aa  117  6e-26  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0309776  hitchhiker  0.0086006 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1411  NADH dehydrogenase subunit I  40.77 
 
 
165 aa  117  6e-26  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.0328529 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3206  NADH dehydrogenase subunit I  42.31 
 
 
162 aa  117  6e-26  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00643522  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2235  NADH-quinone oxidoreductase, chain I  43.38 
 
 
165 aa  117  6e-26  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.272952  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0957  NADH dehydrogenase subunit I  41.54 
 
 
162 aa  117  7e-26  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0765322  normal  0.470027 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7683  NADH-quinone oxidoreductase, chain I  45.8 
 
 
203 aa  117  7e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2001  NADH dehydrogenase subunit I  41.54 
 
 
162 aa  116  9e-26  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0496982 
 
 
-
 
NC_006681  CNL05770  conserved hypothetical protein  38.89 
 
 
273 aa  115  9.999999999999999e-26  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4074  NADH-quinone oxidoreductase, chain I  43.17 
 
 
165 aa  116  9.999999999999999e-26  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.138304  normal 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05703  hypothetical protein similar to : Formate hydrogenlyase subunit 6/NADH:ubiquinone oxidoreductase 23 kD subunit (Broad)  42.86 
 
 
224 aa  115  1.9999999999999998e-25  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.803618 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5061  NADH-quinone oxidoreductase, chain I  45.04 
 
 
185 aa  115  1.9999999999999998e-25  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.451376  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2054  NADH dehydrogenase subunit I  41.54 
 
 
163 aa  115  1.9999999999999998e-25  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.151951 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3865  NADH-quinone oxidoreductase, chain I  43.7 
 
 
222 aa  115  1.9999999999999998e-25  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0969  NADH dehydrogenase subunit I  42.31 
 
 
163 aa  115  1.9999999999999998e-25  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0765514  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2206  NADH dehydrogenase subunit I  41.54 
 
 
163 aa  115  1.9999999999999998e-25  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1883  NADH dehydrogenase subunit I  41.54 
 
 
163 aa  115  1.9999999999999998e-25  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.604396 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1956  NADH-quinone oxidoreductase, chain I  41.22 
 
 
162 aa  115  1.9999999999999998e-25  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.198639  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0994  NADH dehydrogenase subunit I  40.77 
 
 
163 aa  115  1.9999999999999998e-25  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3615  NADH-quinone oxidoreductase, chain I  42.64 
 
 
211 aa  115  3e-25  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1563  NADH dehydrogenase subunit I  40.31 
 
 
162 aa  114  3e-25  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.339949  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1845  NADH-quinone oxidoreductase, chain I  42.36 
 
 
175 aa  114  3e-25  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4625  NADH dehydrogenase subunit I  41.22 
 
 
162 aa  114  3.9999999999999997e-25  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.11536 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1282  NADH-quinone oxidoreductase chain I  44.62 
 
 
185 aa  114  3.9999999999999997e-25  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.425102 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0275  NADH dehydrogenase subunit I  41.22 
 
 
199 aa  114  3.9999999999999997e-25  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1099  NADH dehydrogenase subunit I  40 
 
 
162 aa  114  5e-25  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009043  PICST_88630  mitochondrial complex I NUIM TYKY subunit (proton translocation)  41.73 
 
 
226 aa  114  5e-25  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.970128  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0935  NADH dehydrogenase subunit I  40.77 
 
 
163 aa  114  5e-25  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.13658  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1385  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  53.1 
 
 
239 aa  114  6e-25  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.236148  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3818  NADH-quinone oxidoreductase, chain I  42.4 
 
 
171 aa  114  6e-25  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.121238  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1284  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  53.1 
 
 
239 aa  114  6e-25  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2564  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding protein  53.1 
 
 
239 aa  114  6e-25  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1997  NADH dehydrogenase subunit I  39.39 
 
 
167 aa  113  6.9999999999999995e-25  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0446418  normal 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0820  NADH dehydrogenase subunit I  44 
 
 
160 aa  113  6.9999999999999995e-25  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1536  NADH-quinone oxidoreductase, chain I  44.09 
 
 
170 aa  113  6.9999999999999995e-25  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0172  NADH dehydrogenase subunit I  43.41 
 
 
176 aa  113  6.9999999999999995e-25  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2523  NADH dehydrogenase subunit I  38.64 
 
 
167 aa  113  7.999999999999999e-25  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.208294  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1185  NADH dehydrogenase subunit I  38.64 
 
 
167 aa  113  7.999999999999999e-25  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0684834  normal  0.389473 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0154  NADH dehydrogenase subunit I  43.65 
 
 
176 aa  113  7.999999999999999e-25  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.947551 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1363  NADH dehydrogenase subunit I  39.69 
 
 
162 aa  113  7.999999999999999e-25  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.353821  normal  0.140777 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3216  NADH-quinone oxidoreductase, chain I  42.54 
 
 
168 aa  113  1.0000000000000001e-24  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1150  NADH dehydrogenase subunit I  39.23 
 
 
162 aa  112  1.0000000000000001e-24  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2292  NADH dehydrogenase subunit I  41.09 
 
 
161 aa  112  1.0000000000000001e-24  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1187  NADH dehydrogenase subunit I  38.46 
 
 
164 aa  112  1.0000000000000001e-24  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.438944  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1962  NADH dehydrogenase subunit I  41.98 
 
 
163 aa  113  1.0000000000000001e-24  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.528282  normal  0.0448739 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6674  NADH dehydrogenase subunit I  45.04 
 
 
188 aa  113  1.0000000000000001e-24  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1322  NADH dehydrogenase subunit I  38.93 
 
 
164 aa  112  2.0000000000000002e-24  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.323962  normal  0.0547108 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0592  Formate hydrogenlyase subunit 6/NADH:ubiquinone oxidoreductase 23 kD subunit (chain I)-like protein  43.51 
 
 
171 aa  112  2.0000000000000002e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>