More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plim_3865 on replicon NC_014148
Organism: Planctomyces limnophilus DSM 3776



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014148  Plim_3865  NADH-quinone oxidoreductase, chain I  100 
 
 
222 aa  463  9.999999999999999e-131  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0478  NADH-quinone oxidoreductase, chain I  43.87 
 
 
180 aa  134  1.9999999999999998e-30  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.195582 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1660  NADH-quinone oxidoreductase, chain I  44.97 
 
 
234 aa  129  4.0000000000000003e-29  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0164  NADH-ubiquinone oxidoreductase subunit 8  42.96 
 
 
165 aa  120  1.9999999999999998e-26  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4236  NADH-quinone oxidoreductase, chain I  45.19 
 
 
132 aa  118  6e-26  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000114859  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1374  NADH dehydrogenase I chain I  38.1 
 
 
175 aa  117  9.999999999999999e-26  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  decreased coverage  0.00228535  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3918  NADH-quinone oxidoreductase, chain I  43.7 
 
 
132 aa  115  5e-25  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4002  NADH-quinone oxidoreductase, chain I  43.7 
 
 
132 aa  115  5e-25  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.89067e-17 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2805  NADH dehydrogenase subunit I  42.96 
 
 
169 aa  114  1.0000000000000001e-24  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.166718 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0346  NADH dehydrogenase I, I subunit  44.44 
 
 
132 aa  113  2.0000000000000002e-24  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1411  NADH dehydrogenase subunit I  39.07 
 
 
165 aa  114  2.0000000000000002e-24  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.0328529 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3248  NADH dehydrogenase subunit I  40.54 
 
 
165 aa  113  3e-24  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.779883  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1043  NADH dehydrogenase subunit I  39.52 
 
 
163 aa  112  3e-24  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3130  NADH-quinone oxidoreductase, chain I  43.7 
 
 
135 aa  112  3e-24  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5106  NADH-quinone oxidoreductase, chain I  44.44 
 
 
188 aa  112  5e-24  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1351  NADH dehydrogenase subunit I  39.6 
 
 
162 aa  112  5e-24  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0309776  hitchhiker  0.0086006 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3206  NADH dehydrogenase subunit I  39.6 
 
 
162 aa  112  5e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00643522  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2001  NADH dehydrogenase subunit I  38.93 
 
 
162 aa  111  7.000000000000001e-24  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0496982 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1238  NADH-quinone oxidoreductase, chain I  39.86 
 
 
181 aa  111  7.000000000000001e-24  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0829  NADH dehydrogenase subunit I  38.92 
 
 
163 aa  111  7.000000000000001e-24  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.260339  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5569  NADH dehydrogenase subunit I  39.86 
 
 
162 aa  110  2.0000000000000002e-23  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.156755 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3615  NADH-quinone oxidoreductase, chain I  39.57 
 
 
211 aa  110  2.0000000000000002e-23  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1609  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  36 
 
 
187 aa  109  3e-23  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.999472 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3347  NADH-quinone oxidoreductase, chain I  42.22 
 
 
131 aa  109  3e-23  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.715886  normal  0.525186 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1956  NADH-quinone oxidoreductase, chain I  39.47 
 
 
162 aa  109  3e-23  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.198639  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4080  NADH-quinone oxidoreductase, chain I  42.86 
 
 
197 aa  109  4.0000000000000004e-23  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.0562629 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2158  NADH dehydrogenase subunit I  39.86 
 
 
162 aa  108  7.000000000000001e-23  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.394971  normal  0.941111 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1036  NADH dehydrogenase subunit I  39.86 
 
 
162 aa  108  7.000000000000001e-23  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.160572  normal  0.248767 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1069  NADH dehydrogenase subunit I  39.19 
 
 
162 aa  108  7.000000000000001e-23  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.74272  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3502  NADH dehydrogenase subunit I  39.86 
 
 
181 aa  108  7.000000000000001e-23  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2279  NADH dehydrogenase subunit I  39.86 
 
 
162 aa  108  7.000000000000001e-23  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.336058  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2265  NADH dehydrogenase subunit I  39.19 
 
 
162 aa  108  8.000000000000001e-23  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.477325  normal  0.254179 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1501  NADH dehydrogenase subunit I  39.86 
 
 
177 aa  108  8.000000000000001e-23  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0649483  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1629  NADH dehydrogenase subunit I  39.19 
 
 
162 aa  108  8.000000000000001e-23  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2241  NADH dehydrogenase subunit I  39.19 
 
 
162 aa  108  8.000000000000001e-23  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.493495  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4074  NADH-quinone oxidoreductase, chain I  34.76 
 
 
165 aa  107  1e-22  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.138304  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5172  NADH dehydrogenase subunit I  41.22 
 
 
169 aa  107  1e-22  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.950727  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7011  NADH-quinone oxidoreductase, chain I  37.93 
 
 
169 aa  107  1e-22  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1509  NADH dehydrogenase subunit I  42.74 
 
 
165 aa  107  2e-22  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00304735 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1307  NADH dehydrogenase subunit I  38.51 
 
 
162 aa  106  2e-22  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.91191  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1298  NADH dehydrogenase subunit I  38.51 
 
 
162 aa  107  2e-22  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1821  NADH dehydrogenase subunit I  38.51 
 
 
162 aa  106  2e-22  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1443  NADH dehydrogenase subunit I  38.51 
 
 
162 aa  106  2e-22  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.798759  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1296  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  56.84 
 
 
238 aa  107  2e-22  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.109179  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1138  NADH dehydrogenase subunit I  38.51 
 
 
162 aa  106  2e-22  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.299701  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0935  NADH dehydrogenase subunit I  37.84 
 
 
163 aa  106  2e-22  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.13658  normal 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0421  NADH dehydrogenase subunit I  38.51 
 
 
162 aa  106  2e-22  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.735915  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0729  NADH dehydrogenase subunit I  38.51 
 
 
162 aa  106  2e-22  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.384636  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0994  NADH dehydrogenase subunit I  38.26 
 
 
163 aa  107  2e-22  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2054  NADH dehydrogenase subunit I  39.86 
 
 
163 aa  106  3e-22  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.151951 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1432  NADH dehydrogenase subunit I  37.09 
 
 
165 aa  106  3e-22  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.277545  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2206  NADH dehydrogenase subunit I  39.86 
 
 
163 aa  106  3e-22  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1883  NADH dehydrogenase subunit I  39.86 
 
 
163 aa  106  3e-22  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.604396 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0957  NADH dehydrogenase subunit I  37.09 
 
 
162 aa  105  4e-22  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0765322  normal  0.470027 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2631  NADH-quinone oxidoreductase, chain I  40.13 
 
 
230 aa  105  4e-22  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.87866  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0880  NADH dehydrogenase subunit I  39.19 
 
 
170 aa  105  6e-22  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0969  NADH dehydrogenase subunit I  37.84 
 
 
163 aa  103  1e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0765514  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1385  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  46.28 
 
 
239 aa  103  1e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.236148  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2564  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding protein  46.28 
 
 
239 aa  103  1e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1284  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  46.28 
 
 
239 aa  103  1e-21  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3336  NADH dehydrogenase subunit I  40 
 
 
162 aa  103  2e-21  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.463064  normal  0.437664 
 
 
-
 
NC_002978  WD0980  NADH dehydrogenase subunit I  41.96 
 
 
169 aa  103  2e-21  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0965  NADH dehydrogenase subunit I  39.19 
 
 
170 aa  103  2e-21  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.837483  normal  0.0693949 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1150  NADH dehydrogenase subunit I  38.51 
 
 
162 aa  103  3e-21  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1322  NADH dehydrogenase subunit I  42.65 
 
 
164 aa  102  4e-21  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.323962  normal  0.0547108 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1157  NADH-quinone oxidoreductase, chain I  35.23 
 
 
177 aa  102  7e-21  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4515  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  39.26 
 
 
204 aa  100  1e-20  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.203354  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4625  NADH dehydrogenase subunit I  40.28 
 
 
162 aa  101  1e-20  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.11536 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1271  NADH dehydrogenase subunit I  41.94 
 
 
171 aa  101  1e-20  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.400573  normal  0.480107 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0929  NADH dehydrogenase subunit I  39.86 
 
 
163 aa  100  2e-20  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006681  CNL05770  conserved hypothetical protein  37.11 
 
 
273 aa  100  2e-20  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0716  NADH-quinone oxidoreductase, chain I  42.74 
 
 
162 aa  100  2e-20  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.479335  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1962  NADH dehydrogenase subunit I  37.84 
 
 
163 aa  100  2e-20  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.528282  normal  0.0448739 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_88630  mitochondrial complex I NUIM TYKY subunit (proton translocation)  37.5 
 
 
226 aa  99.8  3e-20  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.970128  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_28510  NADH dehydrogenase subunit I  43.97 
 
 
182 aa  99.4  3e-20  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.559317  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1563  NADH dehydrogenase subunit I  39.74 
 
 
162 aa  99.8  3e-20  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.339949  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0546  NADH dehydrogenase subunit I  35.82 
 
 
217 aa  99.8  3e-20  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.175795  normal  0.434998 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0820  NADH dehydrogenase subunit I  38.85 
 
 
160 aa  99.8  3e-20  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1187  NADH dehydrogenase subunit I  41.01 
 
 
164 aa  99.8  3e-20  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.438944  normal 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05703  hypothetical protein similar to : Formate hydrogenlyase subunit 6/NADH:ubiquinone oxidoreductase 23 kD subunit (Broad)  38.99 
 
 
224 aa  99.4  4e-20  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.803618 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0825  NADH dehydrogenase subunit I  38.73 
 
 
163 aa  99.4  4e-20  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2053  NADH dehydrogenase subunit I  35.53 
 
 
163 aa  99  6e-20  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.330204  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0711  NADH-quinone oxidoreductase, chain I  37.5 
 
 
170 aa  98.2  8e-20  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0425782  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2867  NADH-quinone oxidoreductase, chain I  45.69 
 
 
171 aa  98.2  8e-20  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.708253  normal  0.0292468 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1940  NADH dehydrogenase subunit I  39.07 
 
 
178 aa  98.2  8e-20  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.509162 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3387  NADH-quinone oxidoreductase, chain I  37.96 
 
 
165 aa  98.2  9e-20  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.533197  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2419  NADH dehydrogenase subunit I  43.97 
 
 
182 aa  97.8  1e-19  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.193406 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3372  NADH dehydrogenase I, I subunit  43.1 
 
 
182 aa  97.8  1e-19  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.675448  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3204  NADH dehydrogenase subunit I  43.1 
 
 
182 aa  97.8  1e-19  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0843328  normal  0.169624 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3216  NADH-quinone oxidoreductase, chain I  35.71 
 
 
168 aa  97.4  1e-19  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3610  NADH dehydrogenase subunit I  43.1 
 
 
182 aa  97.8  1e-19  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.487333  normal 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0691  NADH dehydrogenase subunit I  42.42 
 
 
169 aa  97.8  1e-19  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.438917  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6086  NADH dehydrogenase subunit I  35.07 
 
 
211 aa  97.4  1e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  decreased coverage  0.00224994  normal  0.0520295 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4126  NADH dehydrogenase subunit I  43.1 
 
 
182 aa  97.1  2e-19  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0898  NADH dehydrogenase subunit I  38.36 
 
 
163 aa  97.4  2e-19  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0404509  normal 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0361  NADH dehydrogenase subunit I  42.11 
 
 
167 aa  97.1  2e-19  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.326031  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1020  NADH dehydrogenase subunit I  41.03 
 
 
171 aa  97.4  2e-19  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.755319  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3301  NADH dehydrogenase subunit I  43.1 
 
 
180 aa  96.7  2e-19  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.9572 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1750  NADH dehydrogenase subunit I  36.49 
 
 
161 aa  97.1  2e-19  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3698  NADH dehydrogenase subunit I  43.1 
 
 
182 aa  97.1  2e-19  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.380267  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>