More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Haur_3216 on replicon NC_009972
Organism: Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009972  Haur_3216  NADH-quinone oxidoreductase, chain I  100 
 
 		 168 aa  350  7e-96  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3387  NADH-quinone oxidoreductase, chain I  80.86 
 
 		 165 aa  280  9e-75  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.533197  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2235  NADH-quinone oxidoreductase, chain I  81.48 
 
 		 165 aa  278  2e-74  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.272952  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1041  NADH-quinone oxidoreductase, chain I  83.02 
 
 		 165 aa  247  6e-65  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1275  NADH-quinone oxidoreductase, chain I  56.74 
 
 		 199 aa  168  4e-41  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0917  NADH-quinone oxidoreductase, chain I  55.06 
 
 		 179 aa  166  1e-40  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.5865  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1869  NADH-quinone oxidoreductase chain I  57.66 
 
 		 177 aa  165  2e-40  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1157  NADH-quinone oxidoreductase, chain I  60.61 
 
 		 177 aa  164  6.9999999999999995e-40  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0289  NADH-quinone oxidoreductase, chain I  53.69 
 
 		 171 aa  162  1.0000000000000001e-39  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.998746  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5061  NADH-quinone oxidoreductase, chain I  53.02 
 
 		 185 aa  158  3e-38  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.451376  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2687  NADH dehydrogenase subunit I  52.35 
 
 		 183 aa  155  2e-37  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0721276  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4410  NADH-quinone oxidoreductase, chain I  51.01 
 
 		 194 aa  154  4e-37  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0592  Formate hydrogenlyase subunit 6/NADH:ubiquinone oxidoreductase 23 kD subunit (chain I)-like protein  48.99 
 
 		 171 aa  148  3e-35  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4489  NADH dehydrogenase subunit I  52.14 
 
 		 175 aa  148  3e-35  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.159742 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0546  NADH dehydrogenase subunit I  49.32 
 
 		 217 aa  148  4e-35  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.175795  normal  0.434998 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0371  NADH-quinone oxidoreductase, chain I  50 
 
 		 229 aa  148  4e-35  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.839117  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3176  NADH-quinone oxidoreductase, chain I  48.99 
 
 		 167 aa  145  2.0000000000000003e-34  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3221  NADH-quinone oxidoreductase, chain I  47.59 
 
 		 254 aa  145  3e-34  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.129277 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6086  NADH dehydrogenase subunit I  46.79 
 
 		 211 aa  145  4.0000000000000006e-34  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  decreased coverage  0.00224994  normal  0.0520295 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1877  NADH dehydrogenase subunit I  51.06 
 
 		 174 aa  145  4.0000000000000006e-34  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0825  NADH dehydrogenase subunit I  45.89 
 
 		 163 aa  143  1e-33  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7683  NADH-quinone oxidoreductase, chain I  47.3 
 
 		 203 aa  142  2e-33  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1282  NADH-quinone oxidoreductase chain I  49.3 
 
 		 185 aa  142  2e-33  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.425102 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0275  NADH dehydrogenase subunit I  47.65 
 
 		 199 aa  141  3e-33  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6674  NADH dehydrogenase subunit I  48.65 
 
 		 188 aa  141  5e-33  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1572  NADH dehydrogenase subunit I  51.11 
 
 		 174 aa  141  5e-33  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1596  NADH dehydrogenase subunit I  51.11 
 
 		 174 aa  141  5e-33  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.557888  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1542  NADH dehydrogenase subunit I  51.11 
 
 		 174 aa  140  6e-33  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.383544  normal  0.0726132 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2708  NADH-quinone oxidoreductase, chain I  46.31 
 
 		 247 aa  140  9.999999999999999e-33  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4455  NADH dehydrogenase subunit I  51.39 
 
 		 211 aa  140  9.999999999999999e-33  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.829117  normal  0.833546 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4057  NADH dehydrogenase subunit I  51.39 
 
 		 211 aa  140  9.999999999999999e-33  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.819652  normal  0.545712 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13174  NADH dehydrogenase subunit I  52.27 
 
 		 218 aa  137  4.999999999999999e-32  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4550  NADH-quinone oxidoreductase, chain I  46 
 
 		 211 aa  137  6e-32  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_03240  NADH dehydrogenase subunit I  48.3 
 
 		 187 aa  137  7e-32  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0547  NADH-quinone oxidoreductase, chain I  49.66 
 
 		 226 aa  137  7.999999999999999e-32  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.481769 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_07460  NADH dehydrogenase subunit I  46.85 
 
 		 252 aa  137  1e-31  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.0206751 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1043  NADH dehydrogenase subunit I  45.33 
 
 		 163 aa  135  4e-31  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0982  NADH-quinone oxidoreductase, chain I  46.67 
 
 		 214 aa  134  5e-31  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0394  NADH-quinone oxidoreductase, chain I  49.62 
 
 		 175 aa  134  9e-31  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0829  NADH dehydrogenase subunit I  44.67 
 
 		 163 aa  133  9.999999999999999e-31  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.260339  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0528  NADH dehydrogenase subunit I  47.06 
 
 		 196 aa  133  9.999999999999999e-31  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0994  NADH dehydrogenase subunit I  44.6 
 
 		 163 aa  132  3e-30  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0477  NADH-quinone oxidoreductase, chain I  44.94 
 
 		 300 aa  132  3e-30  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.376416  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3248  NADH dehydrogenase subunit I  43.97 
 
 		 165 aa  131  3.9999999999999996e-30  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.779883  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3502  NADH dehydrogenase subunit I  43.97 
 
 		 181 aa  130  9e-30  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2054  NADH dehydrogenase subunit I  46.1 
 
 		 163 aa  129  1.0000000000000001e-29  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.151951 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4080  NADH-quinone oxidoreductase, chain I  50.38 
 
 		 197 aa  130  1.0000000000000001e-29  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.0562629 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2206  NADH dehydrogenase subunit I  46.1 
 
 		 163 aa  129  1.0000000000000001e-29  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1883  NADH dehydrogenase subunit I  46.1 
 
 		 163 aa  129  1.0000000000000001e-29  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.604396 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0935  NADH dehydrogenase subunit I  45.59 
 
 		 163 aa  128  4.0000000000000003e-29  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.13658  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5172  NADH dehydrogenase subunit I  41.72 
 
 		 169 aa  127  8.000000000000001e-29  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.950727  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0957  NADH dehydrogenase subunit I  43.97 
 
 		 162 aa  126  1.0000000000000001e-28  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0765322  normal  0.470027 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1956  NADH-quinone oxidoreductase, chain I  43.97 
 
 		 162 aa  126  2.0000000000000002e-28  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.198639  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1351  NADH dehydrogenase subunit I  42.55 
 
 		 162 aa  125  2.0000000000000002e-28  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0309776  hitchhiker  0.0086006 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4074  NADH-quinone oxidoreductase, chain I  47.86 
 
 		 165 aa  125  2.0000000000000002e-28  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.138304  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1432  NADH dehydrogenase subunit I  41.13 
 
 		 165 aa  126  2.0000000000000002e-28  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.277545  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1501  NADH dehydrogenase subunit I  44.85 
 
 		 177 aa  125  3e-28  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0649483  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2001  NADH dehydrogenase subunit I  41.84 
 
 		 162 aa  125  3e-28  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0496982 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3627  NADH dehydrogenase subunit I  38.67 
 
 		 164 aa  125  3e-28  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0704772 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2805  NADH dehydrogenase subunit I  43.38 
 
 		 169 aa  125  3e-28  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.166718 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0969  NADH dehydrogenase subunit I  44.85 
 
 		 163 aa  124  4.0000000000000003e-28  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0765514  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3206  NADH dehydrogenase subunit I  42.55 
 
 		 162 aa  125  4.0000000000000003e-28  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00643522  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1845  NADH-quinone oxidoreductase, chain I  46.53 
 
 		 175 aa  125  4.0000000000000003e-28  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009370  OSTLU_18502  predicted protein  41.5 
 
 		 167 aa  124  4.0000000000000003e-28  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.0613487 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1187  NADH dehydrogenase subunit I  41.5 
 
 		 164 aa  124  7e-28  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.438944  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1363  NADH dehydrogenase subunit I  41.61 
 
 		 162 aa  124  8.000000000000001e-28  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.353821  normal  0.140777 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0880  NADH dehydrogenase subunit I  42.14 
 
 		 170 aa  124  8.000000000000001e-28  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1411  NADH dehydrogenase subunit I  40.28 
 
 		 165 aa  124  9e-28  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0328529 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0754  NADH dehydrogenase subunit I  41.1 
 
 		 164 aa  124  9e-28  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.180315  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1750  NADH dehydrogenase subunit I  40.94 
 
 		 161 aa  123  1e-27  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1322  NADH dehydrogenase subunit I  41.5 
 
 		 164 aa  123  1e-27  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.323962  normal  0.0547108 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3336  NADH dehydrogenase subunit I  45.52 
 
 		 162 aa  123  1e-27  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.463064  normal  0.437664 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2249  NADH dehydrogenase subunit I  42.55 
 
 		 163 aa  122  2e-27  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.650546  hitchhiker  0.0000391532 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2622  NADH dehydrogenase subunit I  42.55 
 
 		 163 aa  122  2e-27  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1509  NADH dehydrogenase subunit I  42.22 
 
 		 165 aa  122  2e-27  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00304735 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0965  NADH dehydrogenase subunit I  42.14 
 
 		 170 aa  122  2e-27  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.837483  normal  0.0693949 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1374  NADH dehydrogenase I chain I  45.59 
 
 		 175 aa  122  2e-27  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  decreased coverage  0.00228535  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1298  NADH dehydrogenase subunit I  42.55 
 
 		 162 aa  122  3e-27  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1997  NADH dehydrogenase subunit I  40.27 
 
 		 167 aa  122  3e-27  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0446418  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1271  NADH dehydrogenase subunit I  42.96 
 
 		 171 aa  121  4e-27  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.400573  normal  0.480107 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0421  NADH dehydrogenase subunit I  41.84 
 
 		 162 aa  121  4e-27  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.735915  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1821  NADH dehydrogenase subunit I  41.84 
 
 		 162 aa  121  4e-27  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1443  NADH dehydrogenase subunit I  41.84 
 
 		 162 aa  121  4e-27  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.798759  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1138  NADH dehydrogenase subunit I  41.84 
 
 		 162 aa  121  4e-27  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.299701  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0729  NADH dehydrogenase subunit I  41.84 
 
 		 162 aa  121  4e-27  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.384636  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1307  NADH dehydrogenase subunit I  41.84 
 
 		 162 aa  121  4e-27  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.91191  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1962  NADH dehydrogenase subunit I  40.43 
 
 		 163 aa  121  4e-27  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.528282  normal  0.0448739 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2292  NADH dehydrogenase subunit I  42.18 
 
 		 161 aa  121  5e-27  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0716  NADH-quinone oxidoreductase, chain I  43.94 
 
 		 162 aa  121  5e-27  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.479335  normal  1 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0820  NADH dehydrogenase subunit I  40.67 
 
 		 160 aa  120  6e-27  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0929  NADH dehydrogenase subunit I  39.6 
 
 		 163 aa  120  7e-27  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1563  NADH dehydrogenase subunit I  42.07 
 
 		 162 aa  120  8e-27  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.339949  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7011  NADH-quinone oxidoreductase, chain I  48.2 
 
 		 169 aa  120  9e-27  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1238  NADH-quinone oxidoreductase, chain I  44.9 
 
 		 181 aa  119  9.999999999999999e-27  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1150  NADH dehydrogenase subunit I  41.33 
 
 		 162 aa  120  9.999999999999999e-27  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2523  NADH dehydrogenase subunit I  40.27 
 
 		 167 aa  119  9.999999999999999e-27  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.208294  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1069  NADH dehydrogenase subunit I  41.13 
 
 		 162 aa  120  9.999999999999999e-27  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.74272  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1185  NADH dehydrogenase subunit I  40.27 
 
 		 167 aa  119  9.999999999999999e-27  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0684834  normal  0.389473 
 
 
-
 
NC_006681  CNL05770  conserved hypothetical protein  38.62 
 
 		 273 aa  119  1.9999999999999998e-26  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5106  NADH-quinone oxidoreductase, chain I  46.67 
 
 		 188 aa  119  1.9999999999999998e-26  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>