More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acid345_1845 on replicon NC_008009
Organism: Candidatus Koribacter versatilis Ellin345



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008009  Acid345_1845  NADH-quinone oxidoreductase, chain I  100 
 
 
175 aa  365  1e-100  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1869  NADH-quinone oxidoreductase chain I  54.23 
 
 
177 aa  153  2e-36  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4550  NADH-quinone oxidoreductase, chain I  50.74 
 
 
211 aa  152  2e-36  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0275  NADH dehydrogenase subunit I  52.21 
 
 
199 aa  152  2e-36  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4455  NADH dehydrogenase subunit I  50 
 
 
211 aa  149  2e-35  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.829117  normal  0.833546 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4057  NADH dehydrogenase subunit I  50 
 
 
211 aa  149  2e-35  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.819652  normal  0.545712 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7683  NADH-quinone oxidoreductase, chain I  51.39 
 
 
203 aa  148  3e-35  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6086  NADH dehydrogenase subunit I  50.74 
 
 
211 aa  145  2.0000000000000003e-34  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  decreased coverage  0.00224994  normal  0.0520295 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0546  NADH dehydrogenase subunit I  50.74 
 
 
217 aa  145  3e-34  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.175795  normal  0.434998 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1275  NADH-quinone oxidoreductase, chain I  49.31 
 
 
199 aa  145  3e-34  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0394  NADH-quinone oxidoreductase, chain I  48.55 
 
 
175 aa  144  5e-34  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13174  NADH dehydrogenase subunit I  48.94 
 
 
218 aa  144  5e-34  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0917  NADH-quinone oxidoreductase, chain I  53.19 
 
 
179 aa  144  5e-34  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.5865  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1877  NADH dehydrogenase subunit I  44.44 
 
 
174 aa  144  7.0000000000000006e-34  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1157  NADH-quinone oxidoreductase, chain I  48.98 
 
 
177 aa  142  2e-33  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4489  NADH dehydrogenase subunit I  46.58 
 
 
175 aa  142  3e-33  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.159742 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3221  NADH-quinone oxidoreductase, chain I  45.89 
 
 
254 aa  141  4e-33  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.129277 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2687  NADH dehydrogenase subunit I  50.74 
 
 
183 aa  140  9.999999999999999e-33  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0721276  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1282  NADH-quinone oxidoreductase chain I  48.18 
 
 
185 aa  139  1.9999999999999998e-32  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.425102 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2708  NADH-quinone oxidoreductase, chain I  45.14 
 
 
247 aa  138  3.9999999999999997e-32  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5061  NADH-quinone oxidoreductase, chain I  50 
 
 
185 aa  138  4.999999999999999e-32  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.451376  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0982  NADH-quinone oxidoreductase, chain I  47.06 
 
 
214 aa  136  1e-31  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_03240  NADH dehydrogenase subunit I  50 
 
 
187 aa  136  1e-31  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4410  NADH-quinone oxidoreductase, chain I  48.53 
 
 
194 aa  136  2e-31  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0289  NADH-quinone oxidoreductase, chain I  48.18 
 
 
171 aa  135  3.0000000000000003e-31  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.998746  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0477  NADH-quinone oxidoreductase, chain I  43.42 
 
 
300 aa  135  3.0000000000000003e-31  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.376416  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0592  Formate hydrogenlyase subunit 6/NADH:ubiquinone oxidoreductase 23 kD subunit (chain I)-like protein  47.45 
 
 
171 aa  134  8e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_07460  NADH dehydrogenase subunit I  44.22 
 
 
252 aa  133  9.999999999999999e-31  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.0206751 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6674  NADH dehydrogenase subunit I  46.26 
 
 
188 aa  133  1.9999999999999998e-30  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1572  NADH dehydrogenase subunit I  45.19 
 
 
174 aa  132  1.9999999999999998e-30  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1542  NADH dehydrogenase subunit I  45.19 
 
 
174 aa  132  1.9999999999999998e-30  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.383544  normal  0.0726132 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1596  NADH dehydrogenase subunit I  45.19 
 
 
174 aa  132  1.9999999999999998e-30  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.557888  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0547  NADH-quinone oxidoreductase, chain I  42.28 
 
 
226 aa  130  7.999999999999999e-30  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.481769 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0528  NADH dehydrogenase subunit I  46.76 
 
 
196 aa  129  2.0000000000000002e-29  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2235  NADH-quinone oxidoreductase, chain I  45.75 
 
 
165 aa  127  8.000000000000001e-29  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.272952  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3387  NADH-quinone oxidoreductase, chain I  46.41 
 
 
165 aa  127  1.0000000000000001e-28  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.533197  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3216  NADH-quinone oxidoreductase, chain I  46.53 
 
 
168 aa  125  4.0000000000000003e-28  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3176  NADH-quinone oxidoreductase, chain I  43.7 
 
 
167 aa  123  1e-27  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1020  NADH dehydrogenase subunit I  45.59 
 
 
171 aa  121  5e-27  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.755319  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0371  NADH-quinone oxidoreductase, chain I  40.79 
 
 
229 aa  119  1.9999999999999998e-26  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.839117  n/a   
 
 
-
 
NC_009370  OSTLU_18502  predicted protein  44.68 
 
 
167 aa  117  6e-26  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.0613487 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3336  NADH dehydrogenase subunit I  43.97 
 
 
162 aa  117  7e-26  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.463064  normal  0.437664 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0361  NADH dehydrogenase subunit I  47.41 
 
 
167 aa  117  9e-26  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.326031  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0691  NADH dehydrogenase subunit I  46.67 
 
 
169 aa  117  9e-26  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.438917  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3434  NADH dehydrogenase subunit I  45.58 
 
 
176 aa  117  9.999999999999999e-26  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.460482  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3130  NADH-quinone oxidoreductase, chain I  44.68 
 
 
135 aa  117  9.999999999999999e-26  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0163  NADH dehydrogenase subunit I  37.7 
 
 
184 aa  115  1.9999999999999998e-25  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1563  NADH dehydrogenase subunit I  42.96 
 
 
162 aa  116  1.9999999999999998e-25  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.339949  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0980  NADH dehydrogenase subunit I  43.15 
 
 
169 aa  115  3.9999999999999997e-25  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3918  NADH-quinone oxidoreductase, chain I  42.36 
 
 
132 aa  114  5e-25  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4002  NADH-quinone oxidoreductase, chain I  42.36 
 
 
132 aa  114  5e-25  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.89067e-17 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4126  NADH dehydrogenase subunit I  42.95 
 
 
182 aa  114  6e-25  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3698  NADH dehydrogenase subunit I  42.95 
 
 
182 aa  114  6e-25  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.380267  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1739  NADH dehydrogenase subunit I  42.95 
 
 
182 aa  114  6e-25  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.235938  normal  0.220023 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1866  NADH dehydrogenase subunit I  42.95 
 
 
182 aa  114  6e-25  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.0422789 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4236  NADH-quinone oxidoreductase, chain I  40.97 
 
 
132 aa  113  1.0000000000000001e-24  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000114859  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3627  NADH dehydrogenase subunit I  42.03 
 
 
164 aa  113  1.0000000000000001e-24  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.0704772 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7011  NADH-quinone oxidoreductase, chain I  42.38 
 
 
169 aa  112  2.0000000000000002e-24  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011682  PHATRDRAFT_14260  predicted protein  43.97 
 
 
163 aa  112  2.0000000000000002e-24  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3818  NADH-quinone oxidoreductase, chain I  42.22 
 
 
171 aa  112  3e-24  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.121238  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4074  NADH-quinone oxidoreductase, chain I  44.06 
 
 
165 aa  111  4.0000000000000004e-24  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.138304  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1692  NADH dehydrogenase subunit I  42.25 
 
 
182 aa  111  5e-24  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0346  NADH dehydrogenase I, I subunit  41.67 
 
 
132 aa  111  6e-24  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1120  NADH dehydrogenase subunit I  38.51 
 
 
180 aa  110  9e-24  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.311189  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2292  NADH dehydrogenase subunit I  42.25 
 
 
161 aa  110  9e-24  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0154  NADH dehydrogenase subunit I  37.84 
 
 
176 aa  110  1.0000000000000001e-23  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.947551 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3347  NADH-quinone oxidoreductase, chain I  43.26 
 
 
131 aa  110  1.0000000000000001e-23  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.715886  normal  0.525186 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0172  NADH dehydrogenase subunit I  37.84 
 
 
176 aa  110  1.0000000000000001e-23  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1014  NADH dehydrogenase subunit I  38.51 
 
 
180 aa  109  2.0000000000000002e-23  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3372  NADH dehydrogenase I, I subunit  41.03 
 
 
182 aa  109  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.675448  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3204  NADH dehydrogenase subunit I  41.03 
 
 
182 aa  109  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0843328  normal  0.169624 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1536  NADH-quinone oxidoreductase, chain I  44.12 
 
 
170 aa  109  2.0000000000000002e-23  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3610  NADH dehydrogenase subunit I  41.03 
 
 
182 aa  109  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.487333  normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0829  NADH dehydrogenase subunit I  43.48 
 
 
163 aa  109  2.0000000000000002e-23  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.260339  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3615  NADH-quinone oxidoreductase, chain I  40.12 
 
 
211 aa  108  3e-23  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05703  hypothetical protein similar to : Formate hydrogenlyase subunit 6/NADH:ubiquinone oxidoreductase 23 kD subunit (Broad)  41.13 
 
 
224 aa  108  4.0000000000000004e-23  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.803618 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0211  NADH dehydrogenase subunit I  38.36 
 
 
176 aa  108  4.0000000000000004e-23  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2523  NADH dehydrogenase subunit I  42.96 
 
 
167 aa  108  5e-23  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.208294  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1185  NADH dehydrogenase subunit I  42.96 
 
 
167 aa  108  5e-23  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0684834  normal  0.389473 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1374  NADH dehydrogenase I chain I  40.94 
 
 
175 aa  108  5e-23  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  decreased coverage  0.00228535  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2419  NADH dehydrogenase subunit I  38.93 
 
 
182 aa  108  5e-23  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.193406 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0323  NADH dehydrogenase subunit I  39.04 
 
 
176 aa  107  6e-23  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1301  NADH dehydrogenase subunit I  40.85 
 
 
162 aa  107  6e-23  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  decreased coverage  0.00320411  normal  0.488956 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1113  NADH-quinone oxidoreductase, chain I  40.6 
 
 
170 aa  107  7.000000000000001e-23  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.182151  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0820  NADH dehydrogenase subunit I  42.22 
 
 
160 aa  107  7.000000000000001e-23  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1187  NADH dehydrogenase subunit I  43.38 
 
 
164 aa  107  7.000000000000001e-23  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.438944  normal 
 
 
-
 
NC_006681  CNL05770  conserved hypothetical protein  40 
 
 
273 aa  107  8.000000000000001e-23  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1997  NADH dehydrogenase subunit I  42.65 
 
 
167 aa  107  9.000000000000001e-23  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0446418  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0805  NADH dehydrogenase subunit I  40.43 
 
 
163 aa  107  9.000000000000001e-23  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0754  NADH dehydrogenase subunit I  41.3 
 
 
164 aa  107  9.000000000000001e-23  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.180315  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1043  NADH dehydrogenase subunit I  42.75 
 
 
163 aa  107  9.000000000000001e-23  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0810  NADH dehydrogenase subunit I  40.43 
 
 
163 aa  107  1e-22  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.719018  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2543  NADH dehydrogenase subunit I  39.6 
 
 
180 aa  106  1e-22  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.879169  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1401  NADH dehydrogenase subunit I  39.6 
 
 
180 aa  106  1e-22  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.590324  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1940  NADH dehydrogenase subunit I  40.71 
 
 
178 aa  107  1e-22  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.509162 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2238  NADH dehydrogenase subunit I  42.65 
 
 
163 aa  106  1e-22  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.180184 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4625  NADH dehydrogenase subunit I  41.84 
 
 
162 aa  106  2e-22  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.11536 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0374  NADH dehydrogenase subunit I  40.56 
 
 
180 aa  105  2e-22  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1030  NADH dehydrogenase subunit I  43.18 
 
 
163 aa  106  2e-22  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.206882  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1322  NADH dehydrogenase subunit I  42.96 
 
 
164 aa  105  3e-22  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.323962  normal  0.0547108 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>