More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mjls_1542 on replicon NC_009077
Organism: Mycobacterium sp. JLS



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009077  Mjls_1542  NADH dehydrogenase subunit I  100 
 
 
174 aa  359  9e-99  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.383544  normal  0.0726132 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1572  NADH dehydrogenase subunit I  99.43 
 
 
174 aa  357  3e-98  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1596  NADH dehydrogenase subunit I  99.43 
 
 
174 aa  357  3e-98  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.557888  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1877  NADH dehydrogenase subunit I  85.63 
 
 
174 aa  315  2e-85  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4489  NADH dehydrogenase subunit I  85.96 
 
 
175 aa  310  5.999999999999999e-84  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.159742 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13174  NADH dehydrogenase subunit I  83.54 
 
 
218 aa  291  2e-78  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0394  NADH-quinone oxidoreductase, chain I  76.19 
 
 
175 aa  271  3e-72  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0546  NADH dehydrogenase subunit I  76.1 
 
 
217 aa  265  2e-70  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.175795  normal  0.434998 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2708  NADH-quinone oxidoreductase, chain I  70.69 
 
 
247 aa  262  2e-69  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7683  NADH-quinone oxidoreductase, chain I  73.58 
 
 
203 aa  257  6e-68  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2687  NADH dehydrogenase subunit I  74.1 
 
 
183 aa  257  7e-68  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0721276  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6086  NADH dehydrogenase subunit I  73.58 
 
 
211 aa  255  2e-67  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  decreased coverage  0.00224994  normal  0.0520295 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3221  NADH-quinone oxidoreductase, chain I  69.77 
 
 
254 aa  253  8e-67  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.129277 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4410  NADH-quinone oxidoreductase, chain I  71.26 
 
 
194 aa  253  1.0000000000000001e-66  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0289  NADH-quinone oxidoreductase, chain I  75.16 
 
 
171 aa  253  1.0000000000000001e-66  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.998746  normal 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5061  NADH-quinone oxidoreductase, chain I  73.46 
 
 
185 aa  252  2.0000000000000002e-66  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.451376  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3176  NADH-quinone oxidoreductase, chain I  73.75 
 
 
167 aa  252  2.0000000000000002e-66  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_03240  NADH dehydrogenase subunit I  71.88 
 
 
187 aa  250  6e-66  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4550  NADH-quinone oxidoreductase, chain I  75.32 
 
 
211 aa  249  2e-65  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0528  NADH dehydrogenase subunit I  71.01 
 
 
196 aa  249  2e-65  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0275  NADH dehydrogenase subunit I  75.16 
 
 
199 aa  248  3e-65  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6674  NADH dehydrogenase subunit I  71.25 
 
 
188 aa  248  4e-65  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0982  NADH-quinone oxidoreductase, chain I  71.6 
 
 
214 aa  246  2e-64  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0592  Formate hydrogenlyase subunit 6/NADH:ubiquinone oxidoreductase 23 kD subunit (chain I)-like protein  72.67 
 
 
171 aa  245  3e-64  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0547  NADH-quinone oxidoreductase, chain I  68.36 
 
 
226 aa  244  4e-64  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.481769 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4057  NADH dehydrogenase subunit I  68.07 
 
 
211 aa  243  9e-64  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.819652  normal  0.545712 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4455  NADH dehydrogenase subunit I  67.47 
 
 
211 aa  242  1.9999999999999999e-63  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.829117  normal  0.833546 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_07460  NADH dehydrogenase subunit I  66.86 
 
 
252 aa  239  2e-62  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.0206751 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1282  NADH-quinone oxidoreductase chain I  67.5 
 
 
185 aa  238  2.9999999999999997e-62  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.425102 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0477  NADH-quinone oxidoreductase, chain I  65.17 
 
 
300 aa  235  2e-61  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.376416  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0371  NADH-quinone oxidoreductase, chain I  56.72 
 
 
229 aa  161  4.0000000000000004e-39  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.839117  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1869  NADH-quinone oxidoreductase chain I  54.89 
 
 
177 aa  161  5.0000000000000005e-39  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0917  NADH-quinone oxidoreductase, chain I  52.45 
 
 
179 aa  158  5e-38  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.5865  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1275  NADH-quinone oxidoreductase, chain I  52.82 
 
 
199 aa  157  8e-38  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1157  NADH-quinone oxidoreductase, chain I  54.68 
 
 
177 aa  152  2e-36  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2235  NADH-quinone oxidoreductase, chain I  51.11 
 
 
165 aa  143  1e-33  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.272952  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3387  NADH-quinone oxidoreductase, chain I  51.11 
 
 
165 aa  141  5e-33  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.533197  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3216  NADH-quinone oxidoreductase, chain I  51.11 
 
 
168 aa  140  6e-33  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1845  NADH-quinone oxidoreductase, chain I  45.19 
 
 
175 aa  132  1.9999999999999998e-30  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1238  NADH-quinone oxidoreductase, chain I  45.07 
 
 
181 aa  129  2.0000000000000002e-29  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1374  NADH dehydrogenase I chain I  44.59 
 
 
175 aa  123  1e-27  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  decreased coverage  0.00228535  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0211  NADH dehydrogenase subunit I  45 
 
 
176 aa  122  2e-27  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3336  NADH dehydrogenase subunit I  44.12 
 
 
162 aa  122  3e-27  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.463064  normal  0.437664 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3434  NADH dehydrogenase subunit I  45.39 
 
 
176 aa  120  9.999999999999999e-27  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.460482  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0980  NADH dehydrogenase subunit I  40.6 
 
 
169 aa  119  3e-26  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0994  NADH dehydrogenase subunit I  42.65 
 
 
163 aa  117  6e-26  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7011  NADH-quinone oxidoreductase, chain I  42.03 
 
 
169 aa  117  9.999999999999999e-26  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0163  NADH dehydrogenase subunit I  43.26 
 
 
184 aa  116  1.9999999999999998e-25  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1020  NADH dehydrogenase subunit I  38.52 
 
 
171 aa  115  3.9999999999999997e-25  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.755319  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1563  NADH dehydrogenase subunit I  41.18 
 
 
162 aa  114  6.9999999999999995e-25  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.339949  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3125  NADH dehydrogenase subunit I  41.79 
 
 
179 aa  114  6.9999999999999995e-25  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4126  NADH dehydrogenase subunit I  45.04 
 
 
182 aa  113  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR0810  NADH dehydrogenase subunit I  41.91 
 
 
163 aa  113  1.0000000000000001e-24  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.719018  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3698  NADH dehydrogenase subunit I  45.04 
 
 
182 aa  113  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.380267  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0805  NADH dehydrogenase subunit I  41.91 
 
 
163 aa  113  1.0000000000000001e-24  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1866  NADH dehydrogenase subunit I  45.04 
 
 
182 aa  113  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.0422789 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1043  NADH dehydrogenase subunit I  44.85 
 
 
163 aa  113  1.0000000000000001e-24  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1739  NADH dehydrogenase subunit I  45.04 
 
 
182 aa  113  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.235938  normal  0.220023 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5106  NADH-quinone oxidoreductase, chain I  42.75 
 
 
188 aa  112  2.0000000000000002e-24  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0825  NADH dehydrogenase subunit I  41.91 
 
 
163 aa  112  2.0000000000000002e-24  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2562  NADH dehydrogenase subunit I  43.28 
 
 
182 aa  113  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_29920  NADH dehydrogenase subunit I  43.28 
 
 
182 aa  113  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.546828  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3627  NADH dehydrogenase subunit I  42.86 
 
 
164 aa  112  2.0000000000000002e-24  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.0704772 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4625  NADH dehydrogenase subunit I  41.91 
 
 
162 aa  112  3e-24  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.11536 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3818  NADH-quinone oxidoreductase, chain I  46.15 
 
 
171 aa  112  3e-24  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.121238  normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0829  NADH dehydrogenase subunit I  44.12 
 
 
163 aa  112  3e-24  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.260339  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2419  NADH dehydrogenase subunit I  42.25 
 
 
182 aa  112  3e-24  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.193406 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2415  NADH dehydrogenase subunit I  41.91 
 
 
163 aa  112  3e-24  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.87535  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3372  NADH dehydrogenase I, I subunit  45.04 
 
 
182 aa  112  4.0000000000000004e-24  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.675448  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3218  NADH dehydrogenase subunit I  41.18 
 
 
163 aa  111  5e-24  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1113  NADH-quinone oxidoreductase, chain I  40 
 
 
170 aa  110  7.000000000000001e-24  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.182151  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1723  NADH dehydrogenase subunit I  41.18 
 
 
163 aa  110  7.000000000000001e-24  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.341479  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3610  NADH dehydrogenase subunit I  44.27 
 
 
182 aa  110  8.000000000000001e-24  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.487333  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1322  NADH dehydrogenase subunit I  40 
 
 
164 aa  110  8.000000000000001e-24  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.323962  normal  0.0547108 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5172  NADH dehydrogenase subunit I  38.97 
 
 
169 aa  110  8.000000000000001e-24  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.950727  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1301  NADH dehydrogenase subunit I  40.44 
 
 
162 aa  110  8.000000000000001e-24  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  decreased coverage  0.00320411  normal  0.488956 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2765  NADH dehydrogenase subunit I  42.96 
 
 
180 aa  110  8.000000000000001e-24  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.128685  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05703  hypothetical protein similar to : Formate hydrogenlyase subunit 6/NADH:ubiquinone oxidoreductase 23 kD subunit (Broad)  38.97 
 
 
224 aa  110  9e-24  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.803618 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0935  NADH dehydrogenase subunit I  41.91 
 
 
163 aa  110  9e-24  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.13658  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4134  NADH dehydrogenase subunit I  41.91 
 
 
162 aa  110  1.0000000000000001e-23  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.181277  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2054  NADH dehydrogenase subunit I  39.87 
 
 
163 aa  110  1.0000000000000001e-23  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.151951 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4080  NADH-quinone oxidoreductase, chain I  41.18 
 
 
197 aa  110  1.0000000000000001e-23  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.0562629 
 
 
-
 
NC_006681  CNL05770  conserved hypothetical protein  40 
 
 
273 aa  110  1.0000000000000001e-23  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3204  NADH dehydrogenase subunit I  44.27 
 
 
182 aa  110  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0843328  normal  0.169624 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1883  NADH dehydrogenase subunit I  39.87 
 
 
163 aa  110  1.0000000000000001e-23  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.604396 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0880  NADH dehydrogenase subunit I  38.97 
 
 
170 aa  110  1.0000000000000001e-23  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2206  NADH dehydrogenase subunit I  39.87 
 
 
163 aa  110  1.0000000000000001e-23  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0820  NADH dehydrogenase subunit I  40.44 
 
 
160 aa  110  1.0000000000000001e-23  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4398  NADH dehydrogenase subunit I  41.18 
 
 
162 aa  110  1.0000000000000001e-23  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4074  NADH-quinone oxidoreductase, chain I  44.03 
 
 
165 aa  109  2.0000000000000002e-23  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.138304  normal 
 
 
-
 
NC_009370  OSTLU_18502  predicted protein  40.44 
 
 
167 aa  109  2.0000000000000002e-23  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.0613487 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1499  NADH dehydrogenase subunit I  42.25 
 
 
180 aa  109  2.0000000000000002e-23  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1879  NADH dehydrogenase subunit I  41.18 
 
 
162 aa  109  2.0000000000000002e-23  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.508831  normal  0.262119 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4553  NADH dehydrogenase subunit I  41.18 
 
 
162 aa  109  2.0000000000000002e-23  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.128776 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_28510  NADH dehydrogenase subunit I  40.3 
 
 
182 aa  109  2.0000000000000002e-23  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.559317  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2212  NADH dehydrogenase subunit I  41.18 
 
 
162 aa  109  2.0000000000000002e-23  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.199823  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0965  NADH dehydrogenase subunit I  38.97 
 
 
170 aa  109  2.0000000000000002e-23  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.837483  normal  0.0693949 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1940  NADH dehydrogenase subunit I  37.29 
 
 
178 aa  109  2.0000000000000002e-23  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.509162 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0969  NADH dehydrogenase subunit I  41.18 
 
 
163 aa  108  3e-23  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0765514  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0898  NADH dehydrogenase subunit I  39.71 
 
 
163 aa  108  3e-23  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0404509  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>