More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sked_07460 on replicon NC_013521
Organism: Sanguibacter keddieii DSM 10542



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013521  Sked_07460  NADH dehydrogenase subunit I  100 
 
 
252 aa  516  1.0000000000000001e-145  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.0206751 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0547  NADH-quinone oxidoreductase, chain I  78.28 
 
 
226 aa  364  1e-100  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.481769 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2708  NADH-quinone oxidoreductase, chain I  76.67 
 
 
247 aa  334  7e-91  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0477  NADH-quinone oxidoreductase, chain I  76.44 
 
 
300 aa  333  1e-90  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.376416  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3221  NADH-quinone oxidoreductase, chain I  79.6 
 
 
254 aa  329  2e-89  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.129277 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0528  NADH dehydrogenase subunit I  70.72 
 
 
196 aa  268  5e-71  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0394  NADH-quinone oxidoreductase, chain I  69.05 
 
 
175 aa  244  9e-64  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0546  NADH dehydrogenase subunit I  57.14 
 
 
217 aa  243  1.9999999999999999e-63  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.175795  normal  0.434998 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1542  NADH dehydrogenase subunit I  66.86 
 
 
174 aa  240  2e-62  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.383544  normal  0.0726132 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1596  NADH dehydrogenase subunit I  66.86 
 
 
174 aa  239  2e-62  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.557888  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1572  NADH dehydrogenase subunit I  66.86 
 
 
174 aa  239  2e-62  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6086  NADH dehydrogenase subunit I  65.52 
 
 
211 aa  238  9e-62  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  decreased coverage  0.00224994  normal  0.0520295 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5061  NADH-quinone oxidoreductase, chain I  68.71 
 
 
185 aa  236  3e-61  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.451376  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4489  NADH dehydrogenase subunit I  67.86 
 
 
175 aa  235  6e-61  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.159742 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4410  NADH-quinone oxidoreductase, chain I  67.07 
 
 
194 aa  234  7e-61  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7683  NADH-quinone oxidoreductase, chain I  64.74 
 
 
203 aa  234  8e-61  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2687  NADH dehydrogenase subunit I  68.29 
 
 
183 aa  233  2.0000000000000002e-60  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0721276  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0289  NADH-quinone oxidoreductase, chain I  68.26 
 
 
171 aa  233  3e-60  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.998746  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13174  NADH dehydrogenase subunit I  68.05 
 
 
218 aa  231  9e-60  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6674  NADH dehydrogenase subunit I  64.41 
 
 
188 aa  230  2e-59  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0275  NADH dehydrogenase subunit I  70.12 
 
 
199 aa  229  2e-59  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0592  Formate hydrogenlyase subunit 6/NADH:ubiquinone oxidoreductase 23 kD subunit (chain I)-like protein  66.47 
 
 
171 aa  229  4e-59  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1877  NADH dehydrogenase subunit I  65.87 
 
 
174 aa  228  5e-59  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4057  NADH dehydrogenase subunit I  63.91 
 
 
211 aa  223  3e-57  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.819652  normal  0.545712 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0982  NADH-quinone oxidoreductase, chain I  55.05 
 
 
214 aa  223  3e-57  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4455  NADH dehydrogenase subunit I  66.26 
 
 
211 aa  222  4e-57  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.829117  normal  0.833546 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3176  NADH-quinone oxidoreductase, chain I  66.67 
 
 
167 aa  221  8e-57  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_03240  NADH dehydrogenase subunit I  63.31 
 
 
187 aa  221  9.999999999999999e-57  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4550  NADH-quinone oxidoreductase, chain I  63.16 
 
 
211 aa  220  1.9999999999999999e-56  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1282  NADH-quinone oxidoreductase chain I  60.95 
 
 
185 aa  220  1.9999999999999999e-56  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.425102 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0371  NADH-quinone oxidoreductase, chain I  55 
 
 
229 aa  157  2e-37  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.839117  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2235  NADH-quinone oxidoreductase, chain I  52.17 
 
 
165 aa  145  5e-34  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.272952  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0917  NADH-quinone oxidoreductase, chain I  53.73 
 
 
179 aa  144  1e-33  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.5865  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3387  NADH-quinone oxidoreductase, chain I  50.72 
 
 
165 aa  144  1e-33  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.533197  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1275  NADH-quinone oxidoreductase, chain I  52.21 
 
 
199 aa  140  1.9999999999999998e-32  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1869  NADH-quinone oxidoreductase chain I  49.64 
 
 
177 aa  140  1.9999999999999998e-32  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3216  NADH-quinone oxidoreductase, chain I  46.85 
 
 
168 aa  137  2e-31  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1157  NADH-quinone oxidoreductase, chain I  48.72 
 
 
177 aa  136  3.0000000000000003e-31  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1845  NADH-quinone oxidoreductase, chain I  44.22 
 
 
175 aa  133  1.9999999999999998e-30  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3336  NADH dehydrogenase subunit I  45.32 
 
 
162 aa  126  4.0000000000000003e-28  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.463064  normal  0.437664 
 
 
-
 
NC_002978  WD0980  NADH dehydrogenase subunit I  41.29 
 
 
169 aa  121  9.999999999999999e-27  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006681  CNL05770  conserved hypothetical protein  38.33 
 
 
273 aa  119  3.9999999999999996e-26  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4625  NADH dehydrogenase subunit I  42.45 
 
 
162 aa  119  4.9999999999999996e-26  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.11536 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0211  NADH dehydrogenase subunit I  43.57 
 
 
176 aa  117  9.999999999999999e-26  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1238  NADH-quinone oxidoreductase, chain I  41.26 
 
 
181 aa  117  1.9999999999999998e-25  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1563  NADH dehydrogenase subunit I  42.96 
 
 
162 aa  116  3e-25  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.339949  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2212  NADH dehydrogenase subunit I  42.45 
 
 
162 aa  116  3e-25  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.199823  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1879  NADH dehydrogenase subunit I  41.73 
 
 
162 aa  115  5e-25  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.508831  normal  0.262119 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3818  NADH-quinone oxidoreductase, chain I  40.58 
 
 
171 aa  115  6e-25  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.121238  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3218  NADH dehydrogenase subunit I  42.45 
 
 
163 aa  115  6.9999999999999995e-25  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1041  NADH-quinone oxidoreductase, chain I  51.75 
 
 
165 aa  115  6.9999999999999995e-25  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0898  NADH dehydrogenase subunit I  42.22 
 
 
163 aa  115  7.999999999999999e-25  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0404509  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4134  NADH dehydrogenase subunit I  40.74 
 
 
162 aa  115  7.999999999999999e-25  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.181277  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4398  NADH dehydrogenase subunit I  40.74 
 
 
162 aa  115  8.999999999999998e-25  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0829  NADH dehydrogenase subunit I  43.88 
 
 
163 aa  114  1.0000000000000001e-24  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.260339  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2412  NADH dehydrogenase subunit I  41.73 
 
 
162 aa  114  1.0000000000000001e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0701412  normal  0.0109704 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2877  NADH dehydrogenase subunit I  42.45 
 
 
162 aa  114  1.0000000000000001e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.670141  normal  0.245456 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3125  NADH dehydrogenase subunit I  44.27 
 
 
179 aa  114  1.0000000000000001e-24  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3627  NADH dehydrogenase subunit I  38 
 
 
164 aa  114  1.0000000000000001e-24  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.0704772 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7011  NADH-quinone oxidoreductase, chain I  40 
 
 
169 aa  114  2.0000000000000002e-24  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1043  NADH dehydrogenase subunit I  44.44 
 
 
163 aa  114  2.0000000000000002e-24  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0163  NADH dehydrogenase subunit I  41.84 
 
 
184 aa  114  2.0000000000000002e-24  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2582  NADH dehydrogenase subunit I  41.73 
 
 
162 aa  113  2.0000000000000002e-24  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.561308  normal  0.2116 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3434  NADH dehydrogenase subunit I  43.88 
 
 
176 aa  113  3e-24  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.460482  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4553  NADH dehydrogenase subunit I  42.22 
 
 
162 aa  113  3e-24  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.128776 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3290  NADH dehydrogenase subunit I  41.01 
 
 
162 aa  112  4.0000000000000004e-24  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.221287  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1020  NADH dehydrogenase subunit I  43.41 
 
 
171 aa  112  7.000000000000001e-24  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.755319  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0323  NADH dehydrogenase subunit I  42.45 
 
 
176 aa  112  7.000000000000001e-24  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0691  NADH dehydrogenase subunit I  33.15 
 
 
169 aa  111  9e-24  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.438917  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05703  hypothetical protein similar to : Formate hydrogenlyase subunit 6/NADH:ubiquinone oxidoreductase 23 kD subunit (Broad)  42.86 
 
 
224 aa  111  1.0000000000000001e-23  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.803618 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4126  NADH dehydrogenase subunit I  44.78 
 
 
182 aa  111  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1077  NADH dehydrogenase subunit I  40.3 
 
 
162 aa  111  1.0000000000000001e-23  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.280148 
 
 
-
 
NC_004310  BR0810  NADH dehydrogenase subunit I  40.3 
 
 
163 aa  111  1.0000000000000001e-23  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.719018  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3372  NADH dehydrogenase I, I subunit  45.74 
 
 
182 aa  111  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.675448  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0154  NADH dehydrogenase subunit I  34.72 
 
 
176 aa  111  1.0000000000000001e-23  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.947551 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1739  NADH dehydrogenase subunit I  44.78 
 
 
182 aa  111  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.235938  normal  0.220023 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0805  NADH dehydrogenase subunit I  40.3 
 
 
163 aa  111  1.0000000000000001e-23  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1866  NADH dehydrogenase subunit I  44.78 
 
 
182 aa  111  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.0422789 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3698  NADH dehydrogenase subunit I  44.78 
 
 
182 aa  111  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.380267  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1206  NADH dehydrogenase subunit I  40.3 
 
 
162 aa  111  1.0000000000000001e-23  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1014  NADH dehydrogenase subunit I  42.54 
 
 
180 aa  110  2.0000000000000002e-23  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3204  NADH dehydrogenase subunit I  45.74 
 
 
182 aa  110  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0843328  normal  0.169624 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2993  NADH dehydrogenase subunit I  42.22 
 
 
161 aa  110  2.0000000000000002e-23  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3610  NADH dehydrogenase subunit I  44.06 
 
 
182 aa  110  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.487333  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0107  NADH dehydrogenase subunit I  50 
 
 
164 aa  110  2.0000000000000002e-23  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.807538  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0172  NADH dehydrogenase subunit I  34.72 
 
 
176 aa  110  2.0000000000000002e-23  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2415  NADH dehydrogenase subunit I  40.74 
 
 
163 aa  110  2.0000000000000002e-23  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.87535  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1743  NADH dehydrogenase subunit I  50 
 
 
164 aa  110  2.0000000000000002e-23  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  decreased coverage  0.00386762  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1723  NADH dehydrogenase subunit I  39.31 
 
 
163 aa  110  3e-23  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.341479  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2292  NADH dehydrogenase subunit I  40.74 
 
 
161 aa  110  3e-23  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3248  NADH dehydrogenase subunit I  41.73 
 
 
165 aa  109  3e-23  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.779883  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1301  NADH dehydrogenase subunit I  40.74 
 
 
162 aa  110  3e-23  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  decreased coverage  0.00320411  normal  0.488956 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_28510  NADH dehydrogenase subunit I  41.96 
 
 
182 aa  110  3e-23  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.559317  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2419  NADH dehydrogenase subunit I  44.76 
 
 
182 aa  109  4.0000000000000004e-23  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.193406 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1322  NADH dehydrogenase subunit I  40.58 
 
 
164 aa  109  5e-23  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.323962  normal  0.0547108 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1120  NADH dehydrogenase subunit I  39.86 
 
 
180 aa  109  5e-23  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.311189  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0929  NADH dehydrogenase subunit I  40.29 
 
 
163 aa  109  5e-23  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1361  NADH dehydrogenase subunit I  41.04 
 
 
163 aa  109  5e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.182164  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1363  NADH dehydrogenase subunit I  40.58 
 
 
162 aa  109  5e-23  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.353821  normal  0.140777 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0825  NADH dehydrogenase subunit I  39.57 
 
 
163 aa  108  6e-23  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>