More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cagg_1041 on replicon NC_011831
Organism: Chloroflexus aggregans DSM 9485



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011831  Cagg_1041  NADH-quinone oxidoreductase, chain I  100 
 
 
165 aa  337  2.9999999999999998e-92  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3387  NADH-quinone oxidoreductase, chain I  86.67 
 
 
165 aa  298  2e-80  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.533197  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2235  NADH-quinone oxidoreductase, chain I  85.45 
 
 
165 aa  295  2e-79  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.272952  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3216  NADH-quinone oxidoreductase, chain I  83.02 
 
 
168 aa  282  1.0000000000000001e-75  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0289  NADH-quinone oxidoreductase, chain I  57.04 
 
 
171 aa  168  2e-41  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.998746  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1275  NADH-quinone oxidoreductase, chain I  59.56 
 
 
199 aa  167  5e-41  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0917  NADH-quinone oxidoreductase, chain I  59.85 
 
 
179 aa  167  7e-41  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.5865  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1157  NADH-quinone oxidoreductase, chain I  59.12 
 
 
177 aa  166  2e-40  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1869  NADH-quinone oxidoreductase chain I  58.09 
 
 
177 aa  164  5.9999999999999996e-40  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5061  NADH-quinone oxidoreductase, chain I  54.93 
 
 
185 aa  164  5.9999999999999996e-40  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.451376  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4410  NADH-quinone oxidoreductase, chain I  54.23 
 
 
194 aa  161  3e-39  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2687  NADH dehydrogenase subunit I  54.23 
 
 
183 aa  159  2e-38  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0721276  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0592  Formate hydrogenlyase subunit 6/NADH:ubiquinone oxidoreductase 23 kD subunit (chain I)-like protein  53.52 
 
 
171 aa  157  7e-38  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4489  NADH dehydrogenase subunit I  52.78 
 
 
175 aa  156  1e-37  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.159742 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0546  NADH dehydrogenase subunit I  53.19 
 
 
217 aa  154  7e-37  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.175795  normal  0.434998 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3221  NADH-quinone oxidoreductase, chain I  52.17 
 
 
254 aa  153  9e-37  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.129277 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0371  NADH-quinone oxidoreductase, chain I  54.23 
 
 
229 aa  153  1e-36  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.839117  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3176  NADH-quinone oxidoreductase, chain I  53.15 
 
 
167 aa  153  1e-36  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0275  NADH dehydrogenase subunit I  53.15 
 
 
199 aa  151  5e-36  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6086  NADH dehydrogenase subunit I  51.37 
 
 
211 aa  150  5.9999999999999996e-36  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  decreased coverage  0.00224994  normal  0.0520295 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1877  NADH dehydrogenase subunit I  50.69 
 
 
174 aa  150  8e-36  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_07460  NADH dehydrogenase subunit I  51.75 
 
 
252 aa  149  1e-35  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.0206751 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0477  NADH-quinone oxidoreductase, chain I  52.45 
 
 
300 aa  149  1e-35  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.376416  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1282  NADH-quinone oxidoreductase chain I  47.68 
 
 
185 aa  150  1e-35  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.425102 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2708  NADH-quinone oxidoreductase, chain I  49.66 
 
 
247 aa  149  2e-35  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6674  NADH dehydrogenase subunit I  50.7 
 
 
188 aa  147  5e-35  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0394  NADH-quinone oxidoreductase, chain I  52.78 
 
 
175 aa  147  6e-35  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1043  NADH dehydrogenase subunit I  50.7 
 
 
163 aa  147  6e-35  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0829  NADH dehydrogenase subunit I  50 
 
 
163 aa  145  2.0000000000000003e-34  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.260339  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13174  NADH dehydrogenase subunit I  52.59 
 
 
218 aa  143  1e-33  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0982  NADH-quinone oxidoreductase, chain I  50 
 
 
214 aa  143  1e-33  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0825  NADH dehydrogenase subunit I  49.28 
 
 
163 aa  143  1e-33  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0547  NADH-quinone oxidoreductase, chain I  53.28 
 
 
226 aa  143  1e-33  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.481769 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7683  NADH-quinone oxidoreductase, chain I  49.3 
 
 
203 aa  142  2e-33  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4455  NADH dehydrogenase subunit I  50.34 
 
 
211 aa  142  2e-33  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.829117  normal  0.833546 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4057  NADH dehydrogenase subunit I  50.34 
 
 
211 aa  142  2e-33  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.819652  normal  0.545712 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0528  NADH dehydrogenase subunit I  50.68 
 
 
196 aa  142  2e-33  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1596  NADH dehydrogenase subunit I  47.95 
 
 
174 aa  142  3e-33  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.557888  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_03240  NADH dehydrogenase subunit I  50 
 
 
187 aa  141  3e-33  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1572  NADH dehydrogenase subunit I  47.95 
 
 
174 aa  142  3e-33  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1542  NADH dehydrogenase subunit I  47.95 
 
 
174 aa  142  3e-33  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.383544  normal  0.0726132 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4550  NADH-quinone oxidoreductase, chain I  46.21 
 
 
211 aa  138  3e-32  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3248  NADH dehydrogenase subunit I  45.52 
 
 
165 aa  137  7e-32  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.779883  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3336  NADH dehydrogenase subunit I  45.39 
 
 
162 aa  135  3.0000000000000003e-31  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.463064  normal  0.437664 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4080  NADH-quinone oxidoreductase, chain I  50 
 
 
197 aa  135  3.0000000000000003e-31  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.0562629 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0994  NADH dehydrogenase subunit I  46.81 
 
 
163 aa  135  3.0000000000000003e-31  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0957  NADH dehydrogenase subunit I  46.81 
 
 
162 aa  134  4e-31  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0765322  normal  0.470027 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1432  NADH dehydrogenase subunit I  43.45 
 
 
165 aa  134  5e-31  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.277545  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5172  NADH dehydrogenase subunit I  45.39 
 
 
169 aa  134  7.000000000000001e-31  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.950727  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0935  NADH dehydrogenase subunit I  48.23 
 
 
163 aa  133  9e-31  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.13658  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1997  NADH dehydrogenase subunit I  43.45 
 
 
167 aa  133  9.999999999999999e-31  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0446418  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2054  NADH dehydrogenase subunit I  46.81 
 
 
163 aa  132  1.9999999999999998e-30  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.151951 
 
 
-
 
NC_006681  CNL05770  conserved hypothetical protein  41.72 
 
 
273 aa  132  1.9999999999999998e-30  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1883  NADH dehydrogenase subunit I  46.81 
 
 
163 aa  132  1.9999999999999998e-30  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.604396 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1563  NADH dehydrogenase subunit I  45.14 
 
 
162 aa  132  1.9999999999999998e-30  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.339949  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2206  NADH dehydrogenase subunit I  46.81 
 
 
163 aa  132  1.9999999999999998e-30  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1845  NADH-quinone oxidoreductase, chain I  47.14 
 
 
175 aa  132  1.9999999999999998e-30  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3502  NADH dehydrogenase subunit I  44.68 
 
 
181 aa  132  3e-30  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4074  NADH-quinone oxidoreductase, chain I  48.53 
 
 
165 aa  131  3.9999999999999996e-30  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.138304  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1750  NADH dehydrogenase subunit I  42.76 
 
 
161 aa  130  6e-30  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1374  NADH dehydrogenase I chain I  46.38 
 
 
175 aa  130  6e-30  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  decreased coverage  0.00228535  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0880  NADH dehydrogenase subunit I  44.68 
 
 
170 aa  130  6e-30  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1271  NADH dehydrogenase subunit I  45.39 
 
 
171 aa  130  6.999999999999999e-30  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.400573  normal  0.480107 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1351  NADH dehydrogenase subunit I  44.14 
 
 
162 aa  130  6.999999999999999e-30  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0309776  hitchhiker  0.0086006 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3627  NADH dehydrogenase subunit I  41.67 
 
 
164 aa  130  7.999999999999999e-30  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.0704772 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2805  NADH dehydrogenase subunit I  44.68 
 
 
169 aa  130  9e-30  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.166718 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0820  NADH dehydrogenase subunit I  42.76 
 
 
160 aa  130  9e-30  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3206  NADH dehydrogenase subunit I  44.14 
 
 
162 aa  130  9e-30  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00643522  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2001  NADH dehydrogenase subunit I  43.45 
 
 
162 aa  130  9e-30  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0496982 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0969  NADH dehydrogenase subunit I  46.1 
 
 
163 aa  130  1.0000000000000001e-29  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0765514  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1411  NADH dehydrogenase subunit I  42.76 
 
 
165 aa  130  1.0000000000000001e-29  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.0328529 
 
 
-
 
NC_009370  OSTLU_18502  predicted protein  41.45 
 
 
167 aa  129  1.0000000000000001e-29  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.0613487 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2292  NADH dehydrogenase subunit I  45.07 
 
 
161 aa  130  1.0000000000000001e-29  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0980  NADH dehydrogenase subunit I  46.62 
 
 
169 aa  129  2.0000000000000002e-29  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0965  NADH dehydrogenase subunit I  44.68 
 
 
170 aa  129  2.0000000000000002e-29  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.837483  normal  0.0693949 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1301  NADH dehydrogenase subunit I  45 
 
 
162 aa  129  2.0000000000000002e-29  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  decreased coverage  0.00320411  normal  0.488956 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1956  NADH-quinone oxidoreductase, chain I  45.39 
 
 
162 aa  128  3e-29  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.198639  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2053  NADH dehydrogenase subunit I  45.39 
 
 
163 aa  128  3e-29  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.330204  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7011  NADH-quinone oxidoreductase, chain I  48.15 
 
 
169 aa  128  4.0000000000000003e-29  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2523  NADH dehydrogenase subunit I  44.12 
 
 
167 aa  128  4.0000000000000003e-29  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.208294  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1185  NADH dehydrogenase subunit I  44.12 
 
 
167 aa  128  4.0000000000000003e-29  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0684834  normal  0.389473 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1069  NADH dehydrogenase subunit I  44.14 
 
 
162 aa  128  4.0000000000000003e-29  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.74272  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5569  NADH dehydrogenase subunit I  44.68 
 
 
162 aa  127  5.0000000000000004e-29  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.156755 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2993  NADH dehydrogenase subunit I  45 
 
 
161 aa  127  5.0000000000000004e-29  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1501  NADH dehydrogenase subunit I  43.26 
 
 
177 aa  127  6e-29  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0649483  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2265  NADH dehydrogenase subunit I  44.68 
 
 
162 aa  127  8.000000000000001e-29  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.477325  normal  0.254179 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1629  NADH dehydrogenase subunit I  44.68 
 
 
162 aa  127  8.000000000000001e-29  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2241  NADH dehydrogenase subunit I  44.68 
 
 
162 aa  127  8.000000000000001e-29  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.493495  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5106  NADH-quinone oxidoreductase, chain I  48.51 
 
 
188 aa  126  1.0000000000000001e-28  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1138  NADH dehydrogenase subunit I  43.45 
 
 
162 aa  127  1.0000000000000001e-28  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.299701  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0421  NADH dehydrogenase subunit I  43.45 
 
 
162 aa  127  1.0000000000000001e-28  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.735915  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1821  NADH dehydrogenase subunit I  43.45 
 
 
162 aa  127  1.0000000000000001e-28  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1443  NADH dehydrogenase subunit I  43.45 
 
 
162 aa  127  1.0000000000000001e-28  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.798759  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0729  NADH dehydrogenase subunit I  43.45 
 
 
162 aa  127  1.0000000000000001e-28  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.384636  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2622  NADH dehydrogenase subunit I  43.45 
 
 
163 aa  126  1.0000000000000001e-28  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1238  NADH-quinone oxidoreductase, chain I  46.72 
 
 
181 aa  126  1.0000000000000001e-28  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2249  NADH dehydrogenase subunit I  43.45 
 
 
163 aa  126  1.0000000000000001e-28  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.650546  hitchhiker  0.0000391532 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1307  NADH dehydrogenase subunit I  43.45 
 
 
162 aa  127  1.0000000000000001e-28  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.91191  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1298  NADH dehydrogenase subunit I  43.45 
 
 
162 aa  127  1.0000000000000001e-28  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1187  NADH dehydrogenase subunit I  41.84 
 
 
164 aa  125  2.0000000000000002e-28  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.438944  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>