More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_5106 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013730  Slin_5106  NADH-quinone oxidoreductase, chain I  100 
 
 
188 aa  391  1e-108  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4080  NADH-quinone oxidoreductase, chain I  82.95 
 
 
197 aa  308  2e-83  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.0562629 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1374  NADH dehydrogenase I chain I  68.1 
 
 
175 aa  240  1e-62  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  decreased coverage  0.00228535  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1238  NADH-quinone oxidoreductase, chain I  66.88 
 
 
181 aa  229  2e-59  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4074  NADH-quinone oxidoreductase, chain I  65.64 
 
 
165 aa  223  1e-57  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.138304  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7011  NADH-quinone oxidoreductase, chain I  61.78 
 
 
169 aa  205  3e-52  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3387  NADH-quinone oxidoreductase, chain I  48.15 
 
 
165 aa  129  3e-29  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.533197  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4126  NADH dehydrogenase subunit I  44.81 
 
 
182 aa  125  3e-28  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1739  NADH dehydrogenase subunit I  44.81 
 
 
182 aa  125  3e-28  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.235938  normal  0.220023 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3698  NADH dehydrogenase subunit I  44.81 
 
 
182 aa  125  3e-28  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.380267  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1866  NADH dehydrogenase subunit I  44.81 
 
 
182 aa  125  3e-28  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.0422789 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2235  NADH-quinone oxidoreductase, chain I  46.67 
 
 
165 aa  125  4.0000000000000003e-28  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.272952  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3610  NADH dehydrogenase subunit I  44.16 
 
 
182 aa  123  1e-27  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.487333  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3372  NADH dehydrogenase I, I subunit  42.86 
 
 
182 aa  122  4e-27  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.675448  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2419  NADH dehydrogenase subunit I  43.51 
 
 
182 aa  122  4e-27  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.193406 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3204  NADH dehydrogenase subunit I  42.86 
 
 
182 aa  122  4e-27  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0843328  normal  0.169624 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_29920  NADH dehydrogenase subunit I  44.16 
 
 
182 aa  122  4e-27  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.546828  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2562  NADH dehydrogenase subunit I  44.16 
 
 
182 aa  122  4e-27  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0478  NADH-quinone oxidoreductase, chain I  39.74 
 
 
180 aa  121  6e-27  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.195582 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3125  NADH dehydrogenase subunit I  43.33 
 
 
179 aa  120  9e-27  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2631  NADH-quinone oxidoreductase, chain I  42.41 
 
 
230 aa  120  9.999999999999999e-27  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.87866  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3216  NADH-quinone oxidoreductase, chain I  46.67 
 
 
168 aa  119  1.9999999999999998e-26  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_28510  NADH dehydrogenase subunit I  42.86 
 
 
182 aa  119  3e-26  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.559317  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4550  NADH-quinone oxidoreductase, chain I  38.2 
 
 
211 aa  119  3e-26  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1869  NADH-quinone oxidoreductase chain I  46.1 
 
 
177 aa  119  3.9999999999999996e-26  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1275  NADH-quinone oxidoreductase, chain I  48.18 
 
 
199 aa  117  9.999999999999999e-26  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0917  NADH-quinone oxidoreductase, chain I  45.93 
 
 
179 aa  116  1.9999999999999998e-25  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.5865  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0394  NADH-quinone oxidoreductase, chain I  45.65 
 
 
175 aa  115  3e-25  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1120  NADH dehydrogenase subunit I  43.07 
 
 
180 aa  115  3e-25  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.311189  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0323  NADH dehydrogenase subunit I  45.99 
 
 
176 aa  115  3.9999999999999997e-25  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009370  OSTLU_18502  predicted protein  39.6 
 
 
167 aa  115  5e-25  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.0613487 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0154  NADH dehydrogenase subunit I  43.28 
 
 
176 aa  115  5e-25  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.947551 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6086  NADH dehydrogenase subunit I  44.27 
 
 
211 aa  114  6e-25  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  decreased coverage  0.00224994  normal  0.0520295 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2926  NADH dehydrogenase subunit I  40 
 
 
162 aa  114  6.9999999999999995e-25  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1461  NADH dehydrogenase subunit I  45 
 
 
180 aa  114  8.999999999999998e-25  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0172  NADH dehydrogenase subunit I  43.28 
 
 
176 aa  114  8.999999999999998e-25  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1809  NADH dehydrogenase subunit I  45 
 
 
180 aa  114  8.999999999999998e-25  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.693845 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1567  NADH dehydrogenase subunit I  45 
 
 
180 aa  114  8.999999999999998e-25  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.997394  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1609  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  36.36 
 
 
187 aa  114  1.0000000000000001e-24  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.999472 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2390  NADH dehydrogenase subunit I  38.78 
 
 
162 aa  114  1.0000000000000001e-24  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  hitchhiker  0.0000573568  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0275  NADH dehydrogenase subunit I  43.07 
 
 
199 aa  113  1.0000000000000001e-24  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3434  NADH dehydrogenase subunit I  45.32 
 
 
176 aa  113  2.0000000000000002e-24  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.460482  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0163  NADH dehydrogenase subunit I  44.6 
 
 
184 aa  113  2.0000000000000002e-24  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3615  NADH-quinone oxidoreductase, chain I  42.86 
 
 
211 aa  112  2.0000000000000002e-24  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1542  NADH dehydrogenase subunit I  42.75 
 
 
174 aa  112  2.0000000000000002e-24  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.383544  normal  0.0726132 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0929  NADH dehydrogenase subunit I  38.67 
 
 
163 aa  113  2.0000000000000002e-24  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3221  NADH-quinone oxidoreductase, chain I  37.5 
 
 
254 aa  112  2.0000000000000002e-24  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.129277 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1572  NADH dehydrogenase subunit I  42.75 
 
 
174 aa  112  2.0000000000000002e-24  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1596  NADH dehydrogenase subunit I  42.75 
 
 
174 aa  112  2.0000000000000002e-24  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.557888  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0211  NADH dehydrogenase subunit I  45.38 
 
 
176 aa  112  3e-24  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4410  NADH-quinone oxidoreductase, chain I  43.61 
 
 
194 aa  112  3e-24  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3301  NADH dehydrogenase subunit I  46.56 
 
 
180 aa  112  4.0000000000000004e-24  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.9572 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3865  NADH-quinone oxidoreductase, chain I  44.44 
 
 
222 aa  112  4.0000000000000004e-24  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0825  NADH dehydrogenase subunit I  39.33 
 
 
163 aa  112  5e-24  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2687  NADH dehydrogenase subunit I  42.86 
 
 
183 aa  111  7.000000000000001e-24  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0721276  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1940  NADH dehydrogenase subunit I  44.6 
 
 
178 aa  111  7.000000000000001e-24  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.509162 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1014  NADH dehydrogenase subunit I  42.34 
 
 
180 aa  110  9e-24  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2825  NADH dehydrogenase subunit I  45.8 
 
 
180 aa  110  1.0000000000000001e-23  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.339444  normal  0.999371 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4057  NADH dehydrogenase subunit I  42.03 
 
 
211 aa  110  1.0000000000000001e-23  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.819652  normal  0.545712 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7683  NADH-quinone oxidoreductase, chain I  39.86 
 
 
203 aa  110  1.0000000000000001e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3627  NADH dehydrogenase subunit I  36.84 
 
 
164 aa  110  1.0000000000000001e-23  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.0704772 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3420  NADH dehydrogenase subunit I  45.8 
 
 
180 aa  109  2.0000000000000002e-23  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02206  NADH dehydrogenase subunit I  45.8 
 
 
180 aa  109  2.0000000000000002e-23  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1376  NADH-quinone oxidoreductase, chain I  45.8 
 
 
180 aa  109  2.0000000000000002e-23  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00237006  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2505  NADH dehydrogenase subunit I  45.8 
 
 
180 aa  109  2.0000000000000002e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2560  NADH dehydrogenase subunit I  45.8 
 
 
180 aa  109  2.0000000000000002e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0213368  normal 
 
 
-
 
NC_002978  WD0980  NADH dehydrogenase subunit I  38.62 
 
 
169 aa  109  2.0000000000000002e-23  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2657  NADH dehydrogenase subunit I  45.8 
 
 
180 aa  109  2.0000000000000002e-23  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2867  NADH-quinone oxidoreductase, chain I  41.61 
 
 
171 aa  110  2.0000000000000002e-23  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.708253  normal  0.0292468 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02166  hypothetical protein  45.8 
 
 
180 aa  109  2.0000000000000002e-23  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4455  NADH dehydrogenase subunit I  41.22 
 
 
211 aa  109  2.0000000000000002e-23  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.829117  normal  0.833546 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2574  NADH dehydrogenase subunit I  45.8 
 
 
180 aa  109  2.0000000000000002e-23  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0289  NADH-quinone oxidoreductase, chain I  42.86 
 
 
171 aa  109  2.0000000000000002e-23  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.998746  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1371  NADH dehydrogenase subunit I  45.8 
 
 
180 aa  109  2.0000000000000002e-23  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.583652  normal  0.392913 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1563  NADH dehydrogenase subunit I  39.04 
 
 
162 aa  110  2.0000000000000002e-23  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.339949  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2430  NADH dehydrogenase subunit I  45.8 
 
 
180 aa  109  2.0000000000000002e-23  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0546  NADH dehydrogenase subunit I  42.75 
 
 
217 aa  109  2.0000000000000002e-23  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.175795  normal  0.434998 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2549  NADH dehydrogenase subunit I  45.8 
 
 
180 aa  109  2.0000000000000002e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2460  NADH dehydrogenase subunit I  45.8 
 
 
180 aa  109  2.0000000000000002e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2435  NADH dehydrogenase subunit I  45.8 
 
 
180 aa  109  2.0000000000000002e-23  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2667  NADH dehydrogenase subunit I  45.8 
 
 
180 aa  109  2.0000000000000002e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1157  NADH-quinone oxidoreductase, chain I  45.45 
 
 
177 aa  109  3e-23  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2292  NADH dehydrogenase subunit I  36.25 
 
 
161 aa  109  3e-23  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3336  NADH dehydrogenase subunit I  40.14 
 
 
162 aa  108  4.0000000000000004e-23  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.463064  normal  0.437664 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1692  NADH dehydrogenase subunit I  41.55 
 
 
182 aa  108  4.0000000000000004e-23  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5061  NADH-quinone oxidoreductase, chain I  40.6 
 
 
185 aa  108  4.0000000000000004e-23  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.451376  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_07460  NADH dehydrogenase subunit I  38.06 
 
 
252 aa  108  4.0000000000000004e-23  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.0206751 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1206  NADH dehydrogenase subunit I  37.91 
 
 
162 aa  108  4.0000000000000004e-23  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1077  NADH dehydrogenase subunit I  37.91 
 
 
162 aa  108  4.0000000000000004e-23  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.280148 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13174  NADH dehydrogenase subunit I  43.61 
 
 
218 aa  108  5e-23  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2523  NADH dehydrogenase subunit I  38.19 
 
 
167 aa  108  6e-23  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.208294  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1185  NADH dehydrogenase subunit I  38.19 
 
 
167 aa  108  6e-23  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0684834  normal  0.389473 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2877  NADH dehydrogenase subunit I  38.82 
 
 
162 aa  107  7.000000000000001e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.670141  normal  0.245456 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1043  NADH dehydrogenase subunit I  39.74 
 
 
163 aa  107  8.000000000000001e-23  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1877  NADH dehydrogenase subunit I  42.86 
 
 
174 aa  107  9.000000000000001e-23  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0829  NADH dehydrogenase subunit I  39.07 
 
 
163 aa  107  9.000000000000001e-23  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.260339  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2805  NADH dehydrogenase subunit I  39.19 
 
 
169 aa  107  1e-22  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.166718 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1020  NADH dehydrogenase subunit I  40.15 
 
 
171 aa  107  1e-22  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.755319  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1361  NADH dehydrogenase subunit I  37.33 
 
 
163 aa  107  1e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.182164  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1296  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  34.47 
 
 
238 aa  107  1e-22  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.109179  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>