More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dgeo_0917 on replicon NC_008025
Organism: Deinococcus geothermalis DSM 11300



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008025  Dgeo_0917  NADH-quinone oxidoreductase, chain I  100 
 
 
179 aa  364  1e-100  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.5865  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1869  NADH-quinone oxidoreductase chain I  72.63 
 
 
177 aa  265  2e-70  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1275  NADH-quinone oxidoreductase, chain I  71.59 
 
 
199 aa  255  2e-67  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0546  NADH dehydrogenase subunit I  54.04 
 
 
217 aa  178  4e-44  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.175795  normal  0.434998 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6086  NADH dehydrogenase subunit I  52.8 
 
 
211 aa  172  1.9999999999999998e-42  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  decreased coverage  0.00224994  normal  0.0520295 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3216  NADH-quinone oxidoreductase, chain I  55.06 
 
 
168 aa  166  1e-40  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2235  NADH-quinone oxidoreductase, chain I  60.45 
 
 
165 aa  166  2e-40  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.272952  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3387  NADH-quinone oxidoreductase, chain I  60.45 
 
 
165 aa  166  2e-40  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.533197  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1157  NADH-quinone oxidoreductase, chain I  53.1 
 
 
177 aa  162  2.0000000000000002e-39  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0275  NADH dehydrogenase subunit I  57.58 
 
 
199 aa  162  2.0000000000000002e-39  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0289  NADH-quinone oxidoreductase, chain I  58.39 
 
 
171 aa  161  6e-39  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.998746  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1877  NADH dehydrogenase subunit I  55.71 
 
 
174 aa  160  7e-39  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0371  NADH-quinone oxidoreductase, chain I  55.03 
 
 
229 aa  159  2e-38  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.839117  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4410  NADH-quinone oxidoreductase, chain I  52.44 
 
 
194 aa  159  2e-38  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2687  NADH dehydrogenase subunit I  51.9 
 
 
183 aa  158  4e-38  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0721276  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1542  NADH dehydrogenase subunit I  52.45 
 
 
174 aa  158  5e-38  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.383544  normal  0.0726132 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4489  NADH dehydrogenase subunit I  55.4 
 
 
175 aa  157  5e-38  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.159742 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1572  NADH dehydrogenase subunit I  52.45 
 
 
174 aa  158  5e-38  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1596  NADH dehydrogenase subunit I  52.45 
 
 
174 aa  158  5e-38  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.557888  normal 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5061  NADH-quinone oxidoreductase, chain I  46.86 
 
 
185 aa  157  6e-38  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.451376  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1282  NADH-quinone oxidoreductase chain I  49.06 
 
 
185 aa  157  7e-38  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.425102 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4550  NADH-quinone oxidoreductase, chain I  55.3 
 
 
211 aa  157  7e-38  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6674  NADH dehydrogenase subunit I  50.64 
 
 
188 aa  157  7e-38  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7683  NADH-quinone oxidoreductase, chain I  56.39 
 
 
203 aa  157  8e-38  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2708  NADH-quinone oxidoreductase, chain I  54.74 
 
 
247 aa  155  2e-37  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4455  NADH dehydrogenase subunit I  51.35 
 
 
211 aa  155  3e-37  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.829117  normal  0.833546 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4057  NADH dehydrogenase subunit I  51.35 
 
 
211 aa  155  3e-37  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.819652  normal  0.545712 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_03240  NADH dehydrogenase subunit I  50.93 
 
 
187 aa  154  5.0000000000000005e-37  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0592  Formate hydrogenlyase subunit 6/NADH:ubiquinone oxidoreductase 23 kD subunit (chain I)-like protein  54.23 
 
 
171 aa  154  6e-37  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0394  NADH-quinone oxidoreductase, chain I  53.68 
 
 
175 aa  152  2.9999999999999998e-36  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13174  NADH dehydrogenase subunit I  54.74 
 
 
218 aa  151  4e-36  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3221  NADH-quinone oxidoreductase, chain I  52.08 
 
 
254 aa  150  8.999999999999999e-36  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.129277 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0528  NADH dehydrogenase subunit I  50 
 
 
196 aa  150  1e-35  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0547  NADH-quinone oxidoreductase, chain I  54.29 
 
 
226 aa  149  3e-35  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.481769 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3176  NADH-quinone oxidoreductase, chain I  53.73 
 
 
167 aa  147  6e-35  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0982  NADH-quinone oxidoreductase, chain I  48.39 
 
 
214 aa  147  7e-35  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0477  NADH-quinone oxidoreductase, chain I  53.33 
 
 
300 aa  147  1.0000000000000001e-34  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.376416  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1845  NADH-quinone oxidoreductase, chain I  53.19 
 
 
175 aa  144  6e-34  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_07460  NADH dehydrogenase subunit I  53.73 
 
 
252 aa  144  8.000000000000001e-34  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.0206751 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3818  NADH-quinone oxidoreductase, chain I  50.36 
 
 
171 aa  142  2e-33  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.121238  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3372  NADH dehydrogenase I, I subunit  49.33 
 
 
182 aa  136  1e-31  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.675448  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1041  NADH-quinone oxidoreductase, chain I  59.85 
 
 
165 aa  135  2e-31  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3204  NADH dehydrogenase subunit I  48.67 
 
 
182 aa  134  5e-31  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0843328  normal  0.169624 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3610  NADH dehydrogenase subunit I  48.67 
 
 
182 aa  134  5e-31  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.487333  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4126  NADH dehydrogenase subunit I  48.67 
 
 
182 aa  134  9.999999999999999e-31  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7011  NADH-quinone oxidoreductase, chain I  47.1 
 
 
169 aa  133  9.999999999999999e-31  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1866  NADH dehydrogenase subunit I  48.67 
 
 
182 aa  134  9.999999999999999e-31  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.0422789 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1739  NADH dehydrogenase subunit I  48.67 
 
 
182 aa  134  9.999999999999999e-31  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.235938  normal  0.220023 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3698  NADH dehydrogenase subunit I  48.67 
 
 
182 aa  134  9.999999999999999e-31  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.380267  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4236  NADH-quinone oxidoreductase, chain I  46.32 
 
 
132 aa  132  3.9999999999999996e-30  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000114859  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2419  NADH dehydrogenase subunit I  46.71 
 
 
182 aa  131  3.9999999999999996e-30  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.193406 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1014  NADH dehydrogenase subunit I  43.03 
 
 
180 aa  131  5e-30  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3130  NADH-quinone oxidoreductase, chain I  48.87 
 
 
135 aa  130  1.0000000000000001e-29  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009370  OSTLU_18502  predicted protein  46.32 
 
 
167 aa  130  1.0000000000000001e-29  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.0613487 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3125  NADH dehydrogenase subunit I  46.04 
 
 
179 aa  130  1.0000000000000001e-29  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4074  NADH-quinone oxidoreductase, chain I  50 
 
 
165 aa  130  1.0000000000000001e-29  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.138304  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1238  NADH-quinone oxidoreductase, chain I  43.24 
 
 
181 aa  129  2.0000000000000002e-29  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2562  NADH dehydrogenase subunit I  45.21 
 
 
182 aa  129  3e-29  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_29920  NADH dehydrogenase subunit I  45.21 
 
 
182 aa  129  3e-29  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.546828  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0346  NADH dehydrogenase I, I subunit  45.59 
 
 
132 aa  128  4.0000000000000003e-29  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0211  NADH dehydrogenase subunit I  43.48 
 
 
176 aa  127  8.000000000000001e-29  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2765  NADH dehydrogenase subunit I  44.16 
 
 
180 aa  127  9.000000000000001e-29  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.128685  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02206  NADH dehydrogenase subunit I  50.77 
 
 
180 aa  127  1.0000000000000001e-28  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1376  NADH-quinone oxidoreductase, chain I  50.77 
 
 
180 aa  127  1.0000000000000001e-28  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00237006  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2435  NADH dehydrogenase subunit I  50.77 
 
 
180 aa  127  1.0000000000000001e-28  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1743  NADH dehydrogenase subunit I  44.64 
 
 
164 aa  126  1.0000000000000001e-28  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  decreased coverage  0.00386762  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0107  NADH dehydrogenase subunit I  44.64 
 
 
164 aa  126  1.0000000000000001e-28  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.807538  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3347  NADH-quinone oxidoreductase, chain I  47.06 
 
 
131 aa  126  1.0000000000000001e-28  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.715886  normal  0.525186 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1020  NADH dehydrogenase subunit I  42.36 
 
 
171 aa  127  1.0000000000000001e-28  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.755319  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3420  NADH dehydrogenase subunit I  50.77 
 
 
180 aa  127  1.0000000000000001e-28  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1371  NADH dehydrogenase subunit I  50.77 
 
 
180 aa  127  1.0000000000000001e-28  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.583652  normal  0.392913 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_28510  NADH dehydrogenase subunit I  44.14 
 
 
182 aa  127  1.0000000000000001e-28  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.559317  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2574  NADH dehydrogenase subunit I  50.77 
 
 
180 aa  127  1.0000000000000001e-28  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2430  NADH dehydrogenase subunit I  50.77 
 
 
180 aa  127  1.0000000000000001e-28  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02166  hypothetical protein  50.77 
 
 
180 aa  127  1.0000000000000001e-28  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2657  NADH dehydrogenase subunit I  50.77 
 
 
180 aa  127  1.0000000000000001e-28  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3434  NADH dehydrogenase subunit I  48.51 
 
 
176 aa  126  2.0000000000000002e-28  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.460482  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2825  NADH dehydrogenase subunit I  50 
 
 
180 aa  125  2.0000000000000002e-28  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.339444  normal  0.999371 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0172  NADH dehydrogenase subunit I  38.98 
 
 
176 aa  126  2.0000000000000002e-28  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1461  NADH dehydrogenase subunit I  40.56 
 
 
180 aa  126  2.0000000000000002e-28  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1567  NADH dehydrogenase subunit I  40.56 
 
 
180 aa  126  2.0000000000000002e-28  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.997394  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1374  NADH dehydrogenase I chain I  47.41 
 
 
175 aa  126  2.0000000000000002e-28  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  decreased coverage  0.00228535  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3627  NADH dehydrogenase subunit I  43.57 
 
 
164 aa  126  2.0000000000000002e-28  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.0704772 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1809  NADH dehydrogenase subunit I  40.56 
 
 
180 aa  126  2.0000000000000002e-28  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.693845 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2460  NADH dehydrogenase subunit I  50 
 
 
180 aa  125  3e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2505  NADH dehydrogenase subunit I  50 
 
 
180 aa  125  3e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2667  NADH dehydrogenase subunit I  50 
 
 
180 aa  125  3e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1499  NADH dehydrogenase subunit I  49.23 
 
 
180 aa  125  3e-28  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1113  NADH-quinone oxidoreductase, chain I  43.62 
 
 
170 aa  125  3e-28  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.182151  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3918  NADH-quinone oxidoreductase, chain I  44.85 
 
 
132 aa  125  3e-28  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2560  NADH dehydrogenase subunit I  50 
 
 
180 aa  125  3e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0213368  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4002  NADH-quinone oxidoreductase, chain I  44.85 
 
 
132 aa  125  3e-28  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.89067e-17 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2549  NADH dehydrogenase subunit I  50 
 
 
180 aa  125  3e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1120  NADH dehydrogenase subunit I  43.57 
 
 
180 aa  125  4.0000000000000003e-28  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.311189  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0829  NADH dehydrogenase subunit I  45.64 
 
 
163 aa  125  4.0000000000000003e-28  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.260339  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1043  NADH dehydrogenase subunit I  48.18 
 
 
163 aa  125  4.0000000000000003e-28  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1352  NADH dehydrogenase subunit I  43.05 
 
 
171 aa  124  5e-28  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0154  NADH dehydrogenase subunit I  39.88 
 
 
176 aa  125  5e-28  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.947551 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0711  NADH-quinone oxidoreductase, chain I  42.76 
 
 
170 aa  125  5e-28  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0425782  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1692  NADH dehydrogenase subunit I  39.52 
 
 
182 aa  124  6e-28  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>