More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rsph17029_1743 on replicon NC_009049
Organism: Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009049  Rsph17029_1743  NADH dehydrogenase subunit I  100 
 
 
164 aa  337  5e-92  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  decreased coverage  0.00386762  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0107  NADH dehydrogenase subunit I  99.39 
 
 
164 aa  335  1.9999999999999998e-91  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.807538  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1696  NADH dehydrogenase subunit I  95.73 
 
 
164 aa  324  4.0000000000000003e-88  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  hitchhiker  0.00251501  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4064  NADH dehydrogenase subunit I  69.59 
 
 
171 aa  234  5.0000000000000005e-61  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0149353  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1333  NADH dehydrogenase subunit I  68.42 
 
 
171 aa  232  1.0000000000000001e-60  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1354  NADH dehydrogenase subunit I  68.42 
 
 
171 aa  231  2.0000000000000002e-60  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.253044  normal  0.161644 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4736  NADH dehydrogenase subunit I  66.27 
 
 
173 aa  225  3e-58  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.161018  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4126  NADH dehydrogenase subunit I  63.47 
 
 
182 aa  211  3.9999999999999995e-54  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3372  NADH dehydrogenase I, I subunit  62.87 
 
 
182 aa  211  3.9999999999999995e-54  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.675448  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1866  NADH dehydrogenase subunit I  63.47 
 
 
182 aa  211  3.9999999999999995e-54  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.0422789 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1739  NADH dehydrogenase subunit I  63.47 
 
 
182 aa  211  3.9999999999999995e-54  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.235938  normal  0.220023 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3698  NADH dehydrogenase subunit I  63.47 
 
 
182 aa  211  3.9999999999999995e-54  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.380267  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2419  NADH dehydrogenase subunit I  63.47 
 
 
182 aa  211  4.9999999999999996e-54  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.193406 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3610  NADH dehydrogenase subunit I  62.28 
 
 
182 aa  210  4.9999999999999996e-54  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.487333  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2560  NADH dehydrogenase subunit I  64.24 
 
 
180 aa  210  7e-54  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0213368  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_28510  NADH dehydrogenase subunit I  62.28 
 
 
182 aa  210  7e-54  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.559317  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2505  NADH dehydrogenase subunit I  64.24 
 
 
180 aa  210  7e-54  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2460  NADH dehydrogenase subunit I  64.24 
 
 
180 aa  210  7e-54  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2667  NADH dehydrogenase subunit I  64.24 
 
 
180 aa  210  7e-54  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2562  NADH dehydrogenase subunit I  62.28 
 
 
182 aa  210  7e-54  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2549  NADH dehydrogenase subunit I  64.24 
 
 
180 aa  210  7e-54  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_29920  NADH dehydrogenase subunit I  62.28 
 
 
182 aa  210  7e-54  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.546828  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02206  NADH dehydrogenase subunit I  63.64 
 
 
180 aa  209  1e-53  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1376  NADH-quinone oxidoreductase, chain I  63.64 
 
 
180 aa  209  1e-53  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00237006  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3204  NADH dehydrogenase subunit I  62.28 
 
 
182 aa  209  1e-53  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0843328  normal  0.169624 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1371  NADH dehydrogenase subunit I  63.64 
 
 
180 aa  209  1e-53  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.583652  normal  0.392913 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2574  NADH dehydrogenase subunit I  63.64 
 
 
180 aa  209  1e-53  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02166  hypothetical protein  63.64 
 
 
180 aa  209  1e-53  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2430  NADH dehydrogenase subunit I  63.64 
 
 
180 aa  209  1e-53  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2657  NADH dehydrogenase subunit I  63.64 
 
 
180 aa  209  1e-53  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3420  NADH dehydrogenase subunit I  63.64 
 
 
180 aa  209  1e-53  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2435  NADH dehydrogenase subunit I  63.64 
 
 
180 aa  209  1e-53  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3301  NADH dehydrogenase subunit I  63.03 
 
 
180 aa  208  2e-53  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.9572 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2825  NADH dehydrogenase subunit I  62.28 
 
 
180 aa  209  2e-53  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.339444  normal  0.999371 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3125  NADH dehydrogenase subunit I  60.67 
 
 
179 aa  209  2e-53  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1120  NADH dehydrogenase subunit I  60.48 
 
 
180 aa  208  3e-53  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.311189  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1692  NADH dehydrogenase subunit I  62.65 
 
 
182 aa  207  4e-53  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1499  NADH dehydrogenase subunit I  62.28 
 
 
180 aa  207  4e-53  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2765  NADH dehydrogenase subunit I  62.28 
 
 
180 aa  207  5e-53  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.128685  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1352  NADH dehydrogenase subunit I  61.4 
 
 
171 aa  205  2e-52  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2867  NADH-quinone oxidoreductase, chain I  57.89 
 
 
171 aa  206  2e-52  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.708253  normal  0.0292468 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1809  NADH dehydrogenase subunit I  61.21 
 
 
180 aa  205  2e-52  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.693845 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1567  NADH dehydrogenase subunit I  61.21 
 
 
180 aa  205  2e-52  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.997394  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1461  NADH dehydrogenase subunit I  61.21 
 
 
180 aa  205  2e-52  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2543  NADH dehydrogenase subunit I  62.42 
 
 
180 aa  205  3e-52  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.879169  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1014  NADH dehydrogenase subunit I  61.68 
 
 
180 aa  204  4e-52  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1401  NADH dehydrogenase subunit I  61.82 
 
 
180 aa  204  4e-52  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.590324  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3818  NADH-quinone oxidoreductase, chain I  59.65 
 
 
171 aa  199  9.999999999999999e-51  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.121238  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0711  NADH-quinone oxidoreductase, chain I  60.23 
 
 
170 aa  198  3e-50  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0425782  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1113  NADH-quinone oxidoreductase, chain I  57.31 
 
 
170 aa  194  3e-49  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.182151  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0374  NADH dehydrogenase subunit I  57.74 
 
 
180 aa  192  1e-48  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1020  NADH dehydrogenase subunit I  57.31 
 
 
171 aa  192  2e-48  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.755319  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0591  NADH dehydrogenase subunit I  60.12 
 
 
182 aa  188  2.9999999999999997e-47  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0623179  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0580  NADH dehydrogenase subunit I  60.12 
 
 
182 aa  188  2.9999999999999997e-47  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0627884  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3434  NADH dehydrogenase subunit I  53.53 
 
 
176 aa  164  4e-40  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.460482  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0163  NADH dehydrogenase subunit I  52.94 
 
 
184 aa  164  5e-40  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0172  NADH dehydrogenase subunit I  50.59 
 
 
176 aa  164  5.9999999999999996e-40  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0154  NADH dehydrogenase subunit I  50.59 
 
 
176 aa  162  2.0000000000000002e-39  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.947551 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0323  NADH dehydrogenase subunit I  52.94 
 
 
176 aa  161  4.0000000000000004e-39  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0211  NADH dehydrogenase subunit I  51.52 
 
 
176 aa  156  1e-37  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1940  NADH dehydrogenase subunit I  53.5 
 
 
178 aa  152  2.9999999999999998e-36  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.509162 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1275  NADH-quinone oxidoreductase, chain I  47.55 
 
 
199 aa  127  9.000000000000001e-29  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0917  NADH-quinone oxidoreductase, chain I  44.64 
 
 
179 aa  126  1.0000000000000001e-28  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.5865  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1869  NADH-quinone oxidoreductase chain I  46.15 
 
 
177 aa  125  2.0000000000000002e-28  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0547  NADH-quinone oxidoreductase, chain I  48.23 
 
 
226 aa  120  9.999999999999999e-27  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.481769 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0394  NADH-quinone oxidoreductase, chain I  52.07 
 
 
175 aa  118  3.9999999999999996e-26  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1157  NADH-quinone oxidoreductase, chain I  52.8 
 
 
177 aa  116  9.999999999999999e-26  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0969  NADH dehydrogenase subunit I  42.34 
 
 
163 aa  116  9.999999999999999e-26  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0765514  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0592  Formate hydrogenlyase subunit 6/NADH:ubiquinone oxidoreductase 23 kD subunit (chain I)-like protein  51.24 
 
 
171 aa  115  3e-25  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0275  NADH dehydrogenase subunit I  49.59 
 
 
199 aa  115  3e-25  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1043  NADH dehydrogenase subunit I  44.36 
 
 
163 aa  115  3e-25  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0935  NADH dehydrogenase subunit I  42.34 
 
 
163 aa  114  3.9999999999999997e-25  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.13658  normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0829  NADH dehydrogenase subunit I  44.36 
 
 
163 aa  114  6e-25  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.260339  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2054  NADH dehydrogenase subunit I  42.34 
 
 
163 aa  114  6.9999999999999995e-25  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.151951 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2206  NADH dehydrogenase subunit I  42.34 
 
 
163 aa  114  6.9999999999999995e-25  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1883  NADH dehydrogenase subunit I  42.34 
 
 
163 aa  114  6.9999999999999995e-25  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.604396 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2708  NADH-quinone oxidoreductase, chain I  48.76 
 
 
247 aa  113  1.0000000000000001e-24  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1187  NADH dehydrogenase subunit I  45.45 
 
 
164 aa  113  1.0000000000000001e-24  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.438944  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2235  NADH-quinone oxidoreductase, chain I  47.69 
 
 
165 aa  112  3e-24  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.272952  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0754  NADH dehydrogenase subunit I  44.63 
 
 
164 aa  112  3e-24  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.180315  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0528  NADH dehydrogenase subunit I  48.82 
 
 
196 aa  111  4.0000000000000004e-24  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3387  NADH-quinone oxidoreductase, chain I  48.46 
 
 
165 aa  111  4.0000000000000004e-24  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.533197  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4410  NADH-quinone oxidoreductase, chain I  47.97 
 
 
194 aa  111  5e-24  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0546  NADH dehydrogenase subunit I  48.18 
 
 
217 aa  111  5e-24  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.175795  normal  0.434998 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1150  NADH dehydrogenase subunit I  43.08 
 
 
162 aa  110  6e-24  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_07460  NADH dehydrogenase subunit I  50 
 
 
252 aa  110  7.000000000000001e-24  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.0206751 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0289  NADH-quinone oxidoreductase, chain I  49.59 
 
 
171 aa  110  8.000000000000001e-24  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.998746  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6086  NADH dehydrogenase subunit I  47.06 
 
 
211 aa  110  9e-24  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  decreased coverage  0.00224994  normal  0.0520295 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1185  NADH dehydrogenase subunit I  43.18 
 
 
167 aa  110  1.0000000000000001e-23  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0684834  normal  0.389473 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0957  NADH dehydrogenase subunit I  41.5 
 
 
162 aa  109  1.0000000000000001e-23  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0765322  normal  0.470027 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7011  NADH-quinone oxidoreductase, chain I  42.22 
 
 
169 aa  110  1.0000000000000001e-23  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2523  NADH dehydrogenase subunit I  43.18 
 
 
167 aa  110  1.0000000000000001e-23  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.208294  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1997  NADH dehydrogenase subunit I  42.86 
 
 
167 aa  110  1.0000000000000001e-23  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0446418  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1030  NADH dehydrogenase subunit I  41.04 
 
 
163 aa  110  1.0000000000000001e-23  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.206882  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05703  hypothetical protein similar to : Formate hydrogenlyase subunit 6/NADH:ubiquinone oxidoreductase 23 kD subunit (Broad)  41.61 
 
 
224 aa  109  2.0000000000000002e-23  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.803618 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3336  NADH dehydrogenase subunit I  43.8 
 
 
162 aa  108  2.0000000000000002e-23  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.463064  normal  0.437664 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0825  NADH dehydrogenase subunit I  40.74 
 
 
163 aa  108  2.0000000000000002e-23  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1099  NADH dehydrogenase subunit I  41.54 
 
 
162 aa  109  2.0000000000000002e-23  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3248  NADH dehydrogenase subunit I  42.31 
 
 
165 aa  109  2.0000000000000002e-23  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.779883  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1322  NADH dehydrogenase subunit I  44.63 
 
 
164 aa  108  2.0000000000000002e-23  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.323962  normal  0.0547108 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>