More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Glov_3130 on replicon NC_010814
Organism: Geobacter lovleyi SZ



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010814  Glov_3130  NADH-quinone oxidoreductase, chain I  100 
 
 
135 aa  279  7.000000000000001e-75  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3918  NADH-quinone oxidoreductase, chain I  81.4 
 
 
132 aa  230  5e-60  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4002  NADH-quinone oxidoreductase, chain I  81.4 
 
 
132 aa  230  5e-60  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.89067e-17 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0346  NADH dehydrogenase I, I subunit  82.95 
 
 
132 aa  229  8.000000000000001e-60  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4236  NADH-quinone oxidoreductase, chain I  80.62 
 
 
132 aa  228  2e-59  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000114859  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3347  NADH-quinone oxidoreductase, chain I  82.03 
 
 
131 aa  223  5.0000000000000005e-58  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.715886  normal  0.525186 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0917  NADH-quinone oxidoreductase, chain I  48.87 
 
 
179 aa  130  6.999999999999999e-30  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.5865  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7011  NADH-quinone oxidoreductase, chain I  45.86 
 
 
169 aa  125  2.0000000000000002e-28  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0829  NADH dehydrogenase subunit I  46.83 
 
 
163 aa  125  2.0000000000000002e-28  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.260339  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1660  NADH-quinone oxidoreductase, chain I  45.74 
 
 
234 aa  124  3e-28  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1043  NADH dehydrogenase subunit I  46.03 
 
 
163 aa  124  6e-28  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009370  OSTLU_18502  predicted protein  44.19 
 
 
167 aa  123  8.000000000000001e-28  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.0613487 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1157  NADH-quinone oxidoreductase, chain I  44.85 
 
 
177 aa  122  1e-27  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05703  hypothetical protein similar to : Formate hydrogenlyase subunit 6/NADH:ubiquinone oxidoreductase 23 kD subunit (Broad)  44.44 
 
 
224 aa  122  2e-27  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.803618 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5569  NADH dehydrogenase subunit I  43.41 
 
 
162 aa  122  2e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.156755 
 
 
-
 
NC_006681  CNL05770  conserved hypothetical protein  42.64 
 
 
273 aa  121  3e-27  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0691  NADH dehydrogenase subunit I  46.77 
 
 
169 aa  121  3e-27  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.438917  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0980  NADH dehydrogenase subunit I  44.96 
 
 
169 aa  121  4e-27  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0361  NADH dehydrogenase subunit I  46.77 
 
 
167 aa  120  6e-27  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.326031  n/a   
 
 
-
 
NC_009043  PICST_88630  mitochondrial complex I NUIM TYKY subunit (proton translocation)  42.31 
 
 
226 aa  119  9.999999999999999e-27  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.970128  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1020  NADH dehydrogenase subunit I  42.4 
 
 
171 aa  119  1.9999999999999998e-26  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.755319  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1069  NADH dehydrogenase subunit I  41.86 
 
 
162 aa  119  1.9999999999999998e-26  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.74272  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3248  NADH dehydrogenase subunit I  43.41 
 
 
165 aa  119  1.9999999999999998e-26  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.779883  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2805  NADH dehydrogenase subunit I  43.65 
 
 
169 aa  118  3e-26  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.166718 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2265  NADH dehydrogenase subunit I  41.86 
 
 
162 aa  118  3e-26  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.477325  normal  0.254179 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3206  NADH dehydrogenase subunit I  41.09 
 
 
162 aa  118  3e-26  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00643522  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1629  NADH dehydrogenase subunit I  41.86 
 
 
162 aa  118  3e-26  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2241  NADH dehydrogenase subunit I  41.86 
 
 
162 aa  118  3e-26  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.493495  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1351  NADH dehydrogenase subunit I  41.09 
 
 
162 aa  117  3.9999999999999996e-26  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0309776  hitchhiker  0.0086006 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1869  NADH-quinone oxidoreductase chain I  48.48 
 
 
177 aa  117  3.9999999999999996e-26  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1432  NADH dehydrogenase subunit I  41.09 
 
 
165 aa  117  3.9999999999999996e-26  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.277545  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0275  NADH dehydrogenase subunit I  40.29 
 
 
199 aa  117  3.9999999999999996e-26  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2001  NADH dehydrogenase subunit I  40.31 
 
 
162 aa  117  4.9999999999999996e-26  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0496982 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1821  NADH dehydrogenase subunit I  41.09 
 
 
162 aa  117  4.9999999999999996e-26  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1443  NADH dehydrogenase subunit I  41.09 
 
 
162 aa  117  4.9999999999999996e-26  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.798759  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1238  NADH-quinone oxidoreductase, chain I  44.93 
 
 
181 aa  117  4.9999999999999996e-26  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1138  NADH dehydrogenase subunit I  41.09 
 
 
162 aa  117  4.9999999999999996e-26  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.299701  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1307  NADH dehydrogenase subunit I  41.09 
 
 
162 aa  117  4.9999999999999996e-26  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.91191  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0820  NADH dehydrogenase subunit I  43.51 
 
 
160 aa  117  4.9999999999999996e-26  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0929  NADH dehydrogenase subunit I  43.65 
 
 
163 aa  117  4.9999999999999996e-26  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2158  NADH dehydrogenase subunit I  41.09 
 
 
162 aa  117  4.9999999999999996e-26  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.394971  normal  0.941111 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1298  NADH dehydrogenase subunit I  41.09 
 
 
162 aa  117  4.9999999999999996e-26  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0729  NADH dehydrogenase subunit I  41.09 
 
 
162 aa  117  4.9999999999999996e-26  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.384636  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2279  NADH dehydrogenase subunit I  41.09 
 
 
162 aa  117  4.9999999999999996e-26  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.336058  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0421  NADH dehydrogenase subunit I  41.09 
 
 
162 aa  117  4.9999999999999996e-26  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.735915  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1036  NADH dehydrogenase subunit I  41.09 
 
 
162 aa  117  4.9999999999999996e-26  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.160572  normal  0.248767 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0825  NADH dehydrogenase subunit I  43.65 
 
 
163 aa  117  6e-26  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1750  NADH dehydrogenase subunit I  41.27 
 
 
161 aa  117  6e-26  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0546  NADH dehydrogenase subunit I  43.08 
 
 
217 aa  117  7e-26  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.175795  normal  0.434998 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1845  NADH-quinone oxidoreductase, chain I  44.68 
 
 
175 aa  117  7e-26  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1962  NADH dehydrogenase subunit I  45.67 
 
 
163 aa  116  9e-26  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.528282  normal  0.0448739 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3387  NADH-quinone oxidoreductase, chain I  42.42 
 
 
165 aa  116  9.999999999999999e-26  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.533197  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0965  NADH dehydrogenase subunit I  42.86 
 
 
170 aa  116  9.999999999999999e-26  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.837483  normal  0.0693949 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0289  NADH-quinone oxidoreductase, chain I  43.51 
 
 
171 aa  115  9.999999999999999e-26  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.998746  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1374  NADH dehydrogenase I chain I  44.78 
 
 
175 aa  116  9.999999999999999e-26  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  decreased coverage  0.00228535  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4074  NADH-quinone oxidoreductase, chain I  43.28 
 
 
165 aa  115  1.9999999999999998e-25  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.138304  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1501  NADH dehydrogenase subunit I  40.31 
 
 
177 aa  115  1.9999999999999998e-25  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0649483  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4057  NADH dehydrogenase subunit I  42.96 
 
 
211 aa  115  1.9999999999999998e-25  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.819652  normal  0.545712 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2053  NADH dehydrogenase subunit I  41.27 
 
 
163 aa  115  1.9999999999999998e-25  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.330204  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1271  NADH dehydrogenase subunit I  42.06 
 
 
171 aa  115  1.9999999999999998e-25  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.400573  normal  0.480107 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6086  NADH dehydrogenase subunit I  42.31 
 
 
211 aa  114  3e-25  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  decreased coverage  0.00224994  normal  0.0520295 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1411  NADH dehydrogenase subunit I  42.06 
 
 
165 aa  114  3e-25  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.0328529 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0880  NADH dehydrogenase subunit I  42.06 
 
 
170 aa  115  3e-25  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5172  NADH dehydrogenase subunit I  42.06 
 
 
169 aa  115  3e-25  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.950727  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0994  NADH dehydrogenase subunit I  42.06 
 
 
163 aa  114  3e-25  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0957  NADH dehydrogenase subunit I  42.86 
 
 
162 aa  114  3.9999999999999997e-25  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0765322  normal  0.470027 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0969  NADH dehydrogenase subunit I  43.65 
 
 
163 aa  114  3.9999999999999997e-25  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0765514  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3818  NADH-quinone oxidoreductase, chain I  43.2 
 
 
171 aa  114  3.9999999999999997e-25  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.121238  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3615  NADH-quinone oxidoreductase, chain I  41.67 
 
 
211 aa  114  5e-25  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4455  NADH dehydrogenase subunit I  43.18 
 
 
211 aa  114  5e-25  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.829117  normal  0.833546 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2235  NADH-quinone oxidoreductase, chain I  43.18 
 
 
165 aa  114  5e-25  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.272952  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3216  NADH-quinone oxidoreductase, chain I  43.85 
 
 
168 aa  114  6e-25  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1150  NADH dehydrogenase subunit I  41.27 
 
 
162 aa  114  6e-25  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1883  NADH dehydrogenase subunit I  41.27 
 
 
163 aa  113  7.999999999999999e-25  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.604396 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2054  NADH dehydrogenase subunit I  41.27 
 
 
163 aa  113  7.999999999999999e-25  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.151951 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3502  NADH dehydrogenase subunit I  41.27 
 
 
181 aa  113  7.999999999999999e-25  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2206  NADH dehydrogenase subunit I  41.27 
 
 
163 aa  113  7.999999999999999e-25  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1322  NADH dehydrogenase subunit I  42.19 
 
 
164 aa  113  8.999999999999998e-25  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.323962  normal  0.0547108 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1563  NADH dehydrogenase subunit I  41.27 
 
 
162 aa  113  8.999999999999998e-25  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.339949  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1509  NADH dehydrogenase subunit I  44.83 
 
 
165 aa  113  8.999999999999998e-25  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00304735 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1956  NADH-quinone oxidoreductase, chain I  40.94 
 
 
162 aa  112  1.0000000000000001e-24  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.198639  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3865  NADH-quinone oxidoreductase, chain I  43.7 
 
 
222 aa  112  1.0000000000000001e-24  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0754  NADH dehydrogenase subunit I  42.06 
 
 
164 aa  112  1.0000000000000001e-24  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.180315  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1282  NADH-quinone oxidoreductase chain I  44.44 
 
 
185 aa  112  2.0000000000000002e-24  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.425102 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5061  NADH-quinone oxidoreductase, chain I  42.75 
 
 
185 aa  112  2.0000000000000002e-24  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.451376  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4625  NADH dehydrogenase subunit I  43.08 
 
 
162 aa  112  2.0000000000000002e-24  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.11536 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1361  NADH dehydrogenase subunit I  43.9 
 
 
163 aa  111  3e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.182164  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1284  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  46.51 
 
 
239 aa  110  5e-24  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1385  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  46.51 
 
 
239 aa  110  5e-24  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.236148  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1269  NADH dehydrogenase subunit I  43.9 
 
 
163 aa  110  5e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.142775  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1099  NADH dehydrogenase subunit I  39.68 
 
 
162 aa  110  5e-24  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2564  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding protein  46.51 
 
 
239 aa  110  5e-24  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1187  NADH dehydrogenase subunit I  41.27 
 
 
164 aa  110  5e-24  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.438944  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1363  NADH dehydrogenase subunit I  40.62 
 
 
162 aa  110  5e-24  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.353821  normal  0.140777 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0592  Formate hydrogenlyase subunit 6/NADH:ubiquinone oxidoreductase 23 kD subunit (chain I)-like protein  42.75 
 
 
171 aa  110  6e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0172  NADH dehydrogenase subunit I  42.06 
 
 
176 aa  110  6e-24  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0935  NADH dehydrogenase subunit I  41.27 
 
 
163 aa  110  6e-24  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.13658  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1275  NADH-quinone oxidoreductase, chain I  43.94 
 
 
199 aa  110  7.000000000000001e-24  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2292  NADH dehydrogenase subunit I  42.86 
 
 
161 aa  110  8.000000000000001e-24  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4489  NADH dehydrogenase subunit I  39.26 
 
 
175 aa  109  1.0000000000000001e-23  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.159742 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>