More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene EcolC_1371 on replicon NC_010468
Organism: Escherichia coli ATCC 8739



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
CP001509  ECD_02206  NADH dehydrogenase subunit I  100 
 
 
180 aa  372  1e-102  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1376  NADH-quinone oxidoreductase, chain I  100 
 
 
180 aa  372  1e-102  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00237006  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2435  NADH dehydrogenase subunit I  100 
 
 
180 aa  372  1e-102  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2574  NADH dehydrogenase subunit I  100 
 
 
180 aa  372  1e-102  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2549  NADH dehydrogenase subunit I  99.44 
 
 
180 aa  371  1e-102  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2460  NADH dehydrogenase subunit I  99.44 
 
 
180 aa  371  1e-102  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1371  NADH dehydrogenase subunit I  100 
 
 
180 aa  372  1e-102  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.583652  normal  0.392913 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2560  NADH dehydrogenase subunit I  99.44 
 
 
180 aa  371  1e-102  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0213368  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2505  NADH dehydrogenase subunit I  99.44 
 
 
180 aa  371  1e-102  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02166  hypothetical protein  100 
 
 
180 aa  372  1e-102  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2657  NADH dehydrogenase subunit I  100 
 
 
180 aa  372  1e-102  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3420  NADH dehydrogenase subunit I  100 
 
 
180 aa  372  1e-102  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2430  NADH dehydrogenase subunit I  100 
 
 
180 aa  372  1e-102  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2667  NADH dehydrogenase subunit I  98.89 
 
 
180 aa  369  1e-101  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2825  NADH dehydrogenase subunit I  97.78 
 
 
180 aa  367  1e-101  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.339444  normal  0.999371 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3301  NADH dehydrogenase subunit I  97.22 
 
 
180 aa  363  1e-100  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.9572 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1461  NADH dehydrogenase subunit I  95 
 
 
180 aa  358  3e-98  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1809  NADH dehydrogenase subunit I  95 
 
 
180 aa  358  3e-98  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.693845 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1567  NADH dehydrogenase subunit I  95 
 
 
180 aa  358  3e-98  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.997394  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1499  NADH dehydrogenase subunit I  92.78 
 
 
180 aa  348  2e-95  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2765  NADH dehydrogenase subunit I  92.22 
 
 
180 aa  347  5e-95  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.128685  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2543  NADH dehydrogenase subunit I  91.11 
 
 
180 aa  343  5e-94  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.879169  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1401  NADH dehydrogenase subunit I  90.56 
 
 
180 aa  343  8.999999999999999e-94  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.590324  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2419  NADH dehydrogenase subunit I  86.36 
 
 
182 aa  317  6e-86  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.193406 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4126  NADH dehydrogenase subunit I  83.15 
 
 
182 aa  313  9e-85  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1739  NADH dehydrogenase subunit I  83.15 
 
 
182 aa  313  9e-85  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.235938  normal  0.220023 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1014  NADH dehydrogenase subunit I  82.78 
 
 
180 aa  313  9e-85  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1866  NADH dehydrogenase subunit I  83.15 
 
 
182 aa  313  9e-85  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.0422789 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3698  NADH dehydrogenase subunit I  83.15 
 
 
182 aa  313  9e-85  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.380267  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_28510  NADH dehydrogenase subunit I  83.15 
 
 
182 aa  310  4.999999999999999e-84  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.559317  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2562  NADH dehydrogenase subunit I  84.09 
 
 
182 aa  309  1e-83  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_29920  NADH dehydrogenase subunit I  84.09 
 
 
182 aa  309  1e-83  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.546828  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3204  NADH dehydrogenase subunit I  82.02 
 
 
182 aa  308  4e-83  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0843328  normal  0.169624 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3610  NADH dehydrogenase subunit I  81.46 
 
 
182 aa  307  5.9999999999999995e-83  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.487333  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3372  NADH dehydrogenase I, I subunit  81.46 
 
 
182 aa  306  1.0000000000000001e-82  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.675448  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0374  NADH dehydrogenase subunit I  79.44 
 
 
180 aa  301  2.0000000000000002e-81  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1692  NADH dehydrogenase subunit I  77.09 
 
 
182 aa  300  8.000000000000001e-81  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3125  NADH dehydrogenase subunit I  79.21 
 
 
179 aa  299  2e-80  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0580  NADH dehydrogenase subunit I  75.98 
 
 
182 aa  281  3.0000000000000004e-75  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0627884  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0591  NADH dehydrogenase subunit I  75.42 
 
 
182 aa  279  1e-74  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0623179  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1120  NADH dehydrogenase subunit I  73.41 
 
 
180 aa  279  1e-74  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.311189  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1352  NADH dehydrogenase subunit I  73.37 
 
 
171 aa  263  1e-69  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1113  NADH-quinone oxidoreductase, chain I  73.37 
 
 
170 aa  260  8e-69  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.182151  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3818  NADH-quinone oxidoreductase, chain I  71.01 
 
 
171 aa  257  5.0000000000000005e-68  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.121238  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2867  NADH-quinone oxidoreductase, chain I  69.23 
 
 
171 aa  252  2.0000000000000002e-66  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.708253  normal  0.0292468 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1020  NADH dehydrogenase subunit I  69.82 
 
 
171 aa  251  5.000000000000001e-66  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.755319  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0711  NADH-quinone oxidoreductase, chain I  70.66 
 
 
170 aa  250  1e-65  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0425782  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1333  NADH dehydrogenase subunit I  70.81 
 
 
171 aa  241  3e-63  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1354  NADH dehydrogenase subunit I  67.66 
 
 
171 aa  238  4e-62  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.253044  normal  0.161644 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4736  NADH dehydrogenase subunit I  63.79 
 
 
173 aa  234  6e-61  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.161018  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4064  NADH dehydrogenase subunit I  65.87 
 
 
171 aa  231  6e-60  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0149353  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1696  NADH dehydrogenase subunit I  63.64 
 
 
164 aa  211  3.9999999999999995e-54  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  hitchhiker  0.00251501  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0107  NADH dehydrogenase subunit I  64.24 
 
 
164 aa  211  4.9999999999999996e-54  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.807538  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1743  NADH dehydrogenase subunit I  63.64 
 
 
164 aa  209  1e-53  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  decreased coverage  0.00386762  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0323  NADH dehydrogenase subunit I  56.18 
 
 
176 aa  195  3e-49  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3434  NADH dehydrogenase subunit I  55.43 
 
 
176 aa  191  4e-48  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.460482  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1940  NADH dehydrogenase subunit I  55.31 
 
 
178 aa  191  5e-48  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.509162 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0163  NADH dehydrogenase subunit I  53.71 
 
 
184 aa  191  7e-48  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0172  NADH dehydrogenase subunit I  55.56 
 
 
176 aa  189  2.9999999999999997e-47  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0211  NADH dehydrogenase subunit I  56.1 
 
 
176 aa  186  1e-46  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0154  NADH dehydrogenase subunit I  52.25 
 
 
176 aa  185  3e-46  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.947551 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1275  NADH-quinone oxidoreductase, chain I  44.08 
 
 
199 aa  128  4.0000000000000003e-29  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1869  NADH-quinone oxidoreductase chain I  42.48 
 
 
177 aa  127  9.000000000000001e-29  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0917  NADH-quinone oxidoreductase, chain I  50.77 
 
 
179 aa  127  1.0000000000000001e-28  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.5865  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7011  NADH-quinone oxidoreductase, chain I  42.75 
 
 
169 aa  117  7e-26  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4550  NADH-quinone oxidoreductase, chain I  44.06 
 
 
211 aa  116  9.999999999999999e-26  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1282  NADH-quinone oxidoreductase chain I  42.96 
 
 
185 aa  116  1.9999999999999998e-25  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.425102 
 
 
-
 
NC_011682  PHATRDRAFT_14260  predicted protein  42.22 
 
 
163 aa  115  3e-25  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7683  NADH-quinone oxidoreductase, chain I  42.03 
 
 
203 aa  114  6e-25  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4455  NADH dehydrogenase subunit I  43.44 
 
 
211 aa  114  7.999999999999999e-25  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.829117  normal  0.833546 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4057  NADH dehydrogenase subunit I  43.44 
 
 
211 aa  114  8.999999999999998e-25  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.819652  normal  0.545712 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0547  NADH-quinone oxidoreductase, chain I  43.24 
 
 
226 aa  112  2.0000000000000002e-24  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.481769 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0546  NADH dehydrogenase subunit I  40.97 
 
 
217 aa  112  3e-24  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.175795  normal  0.434998 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2292  NADH dehydrogenase subunit I  39.16 
 
 
161 aa  111  6e-24  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009370  OSTLU_18502  predicted protein  40.43 
 
 
167 aa  111  6e-24  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.0613487 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2054  NADH dehydrogenase subunit I  39.75 
 
 
163 aa  110  7.000000000000001e-24  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.151951 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2206  NADH dehydrogenase subunit I  39.75 
 
 
163 aa  110  7.000000000000001e-24  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1883  NADH dehydrogenase subunit I  39.75 
 
 
163 aa  110  7.000000000000001e-24  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.604396 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4080  NADH-quinone oxidoreductase, chain I  41.29 
 
 
197 aa  110  8.000000000000001e-24  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.0562629 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13174  NADH dehydrogenase subunit I  42.25 
 
 
218 aa  110  8.000000000000001e-24  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6086  NADH dehydrogenase subunit I  40.28 
 
 
211 aa  110  8.000000000000001e-24  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  decreased coverage  0.00224994  normal  0.0520295 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0592  Formate hydrogenlyase subunit 6/NADH:ubiquinone oxidoreductase 23 kD subunit (chain I)-like protein  43.66 
 
 
171 aa  110  8.000000000000001e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0394  NADH-quinone oxidoreductase, chain I  45.16 
 
 
175 aa  110  9e-24  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3176  NADH-quinone oxidoreductase, chain I  39.38 
 
 
167 aa  110  1.0000000000000001e-23  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0275  NADH dehydrogenase subunit I  35.98 
 
 
199 aa  110  1.0000000000000001e-23  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0528  NADH dehydrogenase subunit I  41.55 
 
 
196 aa  110  1.0000000000000001e-23  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2993  NADH dehydrogenase subunit I  38.46 
 
 
161 aa  110  2.0000000000000002e-23  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5106  NADH-quinone oxidoreductase, chain I  45.8 
 
 
188 aa  109  2.0000000000000002e-23  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1877  NADH dehydrogenase subunit I  42.14 
 
 
174 aa  109  2.0000000000000002e-23  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0969  NADH dehydrogenase subunit I  39.46 
 
 
163 aa  108  4.0000000000000004e-23  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0765514  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3336  NADH dehydrogenase subunit I  39.57 
 
 
162 aa  108  4.0000000000000004e-23  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.463064  normal  0.437664 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0929  NADH dehydrogenase subunit I  39.57 
 
 
163 aa  108  4.0000000000000004e-23  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3615  NADH-quinone oxidoreductase, chain I  45.53 
 
 
211 aa  108  5e-23  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2053  NADH dehydrogenase subunit I  39.46 
 
 
163 aa  108  5e-23  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.330204  normal 
 
 
-
 
NC_002978  WD0980  NADH dehydrogenase subunit I  40.71 
 
 
169 aa  107  8.000000000000001e-23  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0935  NADH dehydrogenase subunit I  40.14 
 
 
163 aa  107  8.000000000000001e-23  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.13658  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1536  NADH-quinone oxidoreductase, chain I  45.38 
 
 
170 aa  107  9.000000000000001e-23  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1157  NADH-quinone oxidoreductase, chain I  43.8 
 
 
177 aa  107  9.000000000000001e-23  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1150  NADH dehydrogenase subunit I  40.62 
 
 
162 aa  107  1e-22  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0477  NADH-quinone oxidoreductase, chain I  40.28 
 
 
300 aa  107  1e-22  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.376416  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>