More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noc_1120 on replicon NC_007484
Organism: Nitrosococcus oceani ATCC 19707



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007484  Noc_1120  NADH dehydrogenase subunit I  100 
 
 
180 aa  373  1e-103  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.311189  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1020  NADH dehydrogenase subunit I  80.12 
 
 
171 aa  286  1e-76  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.755319  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1461  NADH dehydrogenase subunit I  73.41 
 
 
180 aa  281  2.0000000000000002e-75  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1809  NADH dehydrogenase subunit I  73.41 
 
 
180 aa  281  2.0000000000000002e-75  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.693845 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1567  NADH dehydrogenase subunit I  73.41 
 
 
180 aa  281  2.0000000000000002e-75  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.997394  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2825  NADH dehydrogenase subunit I  73.99 
 
 
180 aa  280  6.000000000000001e-75  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.339444  normal  0.999371 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1113  NADH-quinone oxidoreductase, chain I  76.92 
 
 
170 aa  280  9e-75  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.182151  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02206  NADH dehydrogenase subunit I  73.41 
 
 
180 aa  279  1e-74  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1376  NADH-quinone oxidoreductase, chain I  73.41 
 
 
180 aa  279  1e-74  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00237006  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3420  NADH dehydrogenase subunit I  73.41 
 
 
180 aa  279  1e-74  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2430  NADH dehydrogenase subunit I  73.41 
 
 
180 aa  279  1e-74  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2435  NADH dehydrogenase subunit I  73.41 
 
 
180 aa  279  1e-74  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2574  NADH dehydrogenase subunit I  73.41 
 
 
180 aa  279  1e-74  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1371  NADH dehydrogenase subunit I  73.41 
 
 
180 aa  279  1e-74  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.583652  normal  0.392913 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2657  NADH dehydrogenase subunit I  73.41 
 
 
180 aa  279  1e-74  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02166  hypothetical protein  73.41 
 
 
180 aa  279  1e-74  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2549  NADH dehydrogenase subunit I  72.83 
 
 
180 aa  278  3e-74  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2560  NADH dehydrogenase subunit I  72.83 
 
 
180 aa  278  3e-74  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0213368  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2505  NADH dehydrogenase subunit I  72.83 
 
 
180 aa  278  3e-74  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2460  NADH dehydrogenase subunit I  72.83 
 
 
180 aa  278  3e-74  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3301  NADH dehydrogenase subunit I  72.25 
 
 
180 aa  278  4e-74  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.9572 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1014  NADH dehydrogenase subunit I  73.26 
 
 
180 aa  276  1e-73  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3204  NADH dehydrogenase subunit I  74.12 
 
 
182 aa  276  1e-73  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0843328  normal  0.169624 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2419  NADH dehydrogenase subunit I  73.99 
 
 
182 aa  276  1e-73  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.193406 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2667  NADH dehydrogenase subunit I  72.25 
 
 
180 aa  276  1e-73  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4126  NADH dehydrogenase subunit I  74.71 
 
 
182 aa  275  3e-73  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1352  NADH dehydrogenase subunit I  75.15 
 
 
171 aa  275  3e-73  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3372  NADH dehydrogenase I, I subunit  73.53 
 
 
182 aa  275  3e-73  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.675448  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1866  NADH dehydrogenase subunit I  74.71 
 
 
182 aa  275  3e-73  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.0422789 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1739  NADH dehydrogenase subunit I  74.71 
 
 
182 aa  275  3e-73  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.235938  normal  0.220023 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3698  NADH dehydrogenase subunit I  74.71 
 
 
182 aa  275  3e-73  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.380267  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3610  NADH dehydrogenase subunit I  73.53 
 
 
182 aa  274  5e-73  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.487333  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_28510  NADH dehydrogenase subunit I  74.56 
 
 
182 aa  274  6e-73  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.559317  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_29920  NADH dehydrogenase subunit I  69.78 
 
 
182 aa  273  8e-73  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.546828  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2562  NADH dehydrogenase subunit I  69.78 
 
 
182 aa  273  8e-73  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3818  NADH-quinone oxidoreductase, chain I  72.78 
 
 
171 aa  272  2.0000000000000002e-72  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.121238  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0711  NADH-quinone oxidoreductase, chain I  76.05 
 
 
170 aa  271  3e-72  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0425782  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1692  NADH dehydrogenase subunit I  70.33 
 
 
182 aa  270  8.000000000000001e-72  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3125  NADH dehydrogenase subunit I  72.78 
 
 
179 aa  266  8e-71  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1499  NADH dehydrogenase subunit I  70.52 
 
 
180 aa  265  2.9999999999999995e-70  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2765  NADH dehydrogenase subunit I  70.52 
 
 
180 aa  265  2.9999999999999995e-70  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.128685  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2543  NADH dehydrogenase subunit I  70.52 
 
 
180 aa  262  2e-69  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.879169  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1401  NADH dehydrogenase subunit I  69.94 
 
 
180 aa  261  3e-69  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.590324  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2867  NADH-quinone oxidoreductase, chain I  68.64 
 
 
171 aa  260  6e-69  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.708253  normal  0.0292468 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0580  NADH dehydrogenase subunit I  68.13 
 
 
182 aa  255  2e-67  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0627884  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0591  NADH dehydrogenase subunit I  67.58 
 
 
182 aa  253  1.0000000000000001e-66  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0623179  normal 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0374  NADH dehydrogenase subunit I  65.17 
 
 
180 aa  246  2e-64  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1333  NADH dehydrogenase subunit I  65.27 
 
 
171 aa  226  1e-58  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4064  NADH dehydrogenase subunit I  64.07 
 
 
171 aa  226  2e-58  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0149353  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1354  NADH dehydrogenase subunit I  64.07 
 
 
171 aa  221  4.9999999999999996e-57  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.253044  normal  0.161644 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4736  NADH dehydrogenase subunit I  61.08 
 
 
173 aa  214  4e-55  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.161018  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0323  NADH dehydrogenase subunit I  57.78 
 
 
176 aa  210  9e-54  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0107  NADH dehydrogenase subunit I  61.08 
 
 
164 aa  210  1e-53  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.807538  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1743  NADH dehydrogenase subunit I  60.48 
 
 
164 aa  208  3e-53  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  decreased coverage  0.00386762  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1696  NADH dehydrogenase subunit I  59.88 
 
 
164 aa  207  7e-53  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  hitchhiker  0.00251501  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0163  NADH dehydrogenase subunit I  55 
 
 
184 aa  204  5e-52  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3434  NADH dehydrogenase subunit I  55.56 
 
 
176 aa  203  1e-51  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.460482  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0154  NADH dehydrogenase subunit I  52.78 
 
 
176 aa  194  5.000000000000001e-49  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.947551 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0172  NADH dehydrogenase subunit I  51.67 
 
 
176 aa  192  2e-48  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0211  NADH dehydrogenase subunit I  50.85 
 
 
176 aa  189  2e-47  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1940  NADH dehydrogenase subunit I  55.56 
 
 
178 aa  188  2.9999999999999997e-47  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.509162 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0917  NADH-quinone oxidoreductase, chain I  43.57 
 
 
179 aa  125  4.0000000000000003e-28  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.5865  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1275  NADH-quinone oxidoreductase, chain I  41.38 
 
 
199 aa  124  9e-28  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7011  NADH-quinone oxidoreductase, chain I  42.07 
 
 
169 aa  123  1e-27  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2292  NADH dehydrogenase subunit I  43.07 
 
 
161 aa  123  2e-27  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1869  NADH-quinone oxidoreductase chain I  39.73 
 
 
177 aa  120  9.999999999999999e-27  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2993  NADH dehydrogenase subunit I  41.61 
 
 
161 aa  119  1.9999999999999998e-26  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1282  NADH-quinone oxidoreductase chain I  43.85 
 
 
185 aa  119  3e-26  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.425102 
 
 
-
 
NC_009370  OSTLU_18502  predicted protein  41.91 
 
 
167 aa  118  3.9999999999999996e-26  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.0613487 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4057  NADH dehydrogenase subunit I  40.44 
 
 
211 aa  118  6e-26  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.819652  normal  0.545712 
 
 
-
 
NC_011682  PHATRDRAFT_14260  predicted protein  41.55 
 
 
163 aa  117  6e-26  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4455  NADH dehydrogenase subunit I  39.71 
 
 
211 aa  117  7.999999999999999e-26  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.829117  normal  0.833546 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1563  NADH dehydrogenase subunit I  39.01 
 
 
162 aa  117  9e-26  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.339949  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0394  NADH-quinone oxidoreductase, chain I  44.27 
 
 
175 aa  117  9.999999999999999e-26  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2708  NADH-quinone oxidoreductase, chain I  44.27 
 
 
247 aa  117  9.999999999999999e-26  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1157  NADH-quinone oxidoreductase, chain I  41.38 
 
 
177 aa  115  1.9999999999999998e-25  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5106  NADH-quinone oxidoreductase, chain I  43.07 
 
 
188 aa  115  1.9999999999999998e-25  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1301  NADH dehydrogenase subunit I  40.88 
 
 
162 aa  115  1.9999999999999998e-25  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  decreased coverage  0.00320411  normal  0.488956 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0275  NADH dehydrogenase subunit I  42.14 
 
 
199 aa  116  1.9999999999999998e-25  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0754  NADH dehydrogenase subunit I  43.18 
 
 
164 aa  115  3e-25  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.180315  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4236  NADH-quinone oxidoreductase, chain I  44.8 
 
 
132 aa  115  3e-25  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000114859  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4550  NADH-quinone oxidoreductase, chain I  41.96 
 
 
211 aa  115  3.9999999999999997e-25  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3336  NADH dehydrogenase subunit I  38.69 
 
 
162 aa  115  3.9999999999999997e-25  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.463064  normal  0.437664 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2235  NADH-quinone oxidoreductase, chain I  41.1 
 
 
165 aa  115  3.9999999999999997e-25  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.272952  normal 
 
 
-
 
NC_002978  WD0980  NADH dehydrogenase subunit I  42.97 
 
 
169 aa  115  5e-25  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1374  NADH dehydrogenase I chain I  38.56 
 
 
175 aa  114  6e-25  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  decreased coverage  0.00228535  normal 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0820  NADH dehydrogenase subunit I  39.86 
 
 
160 aa  114  6.9999999999999995e-25  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0289  NADH-quinone oxidoreductase, chain I  41.22 
 
 
171 aa  114  7.999999999999999e-25  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.998746  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1187  NADH dehydrogenase subunit I  41.91 
 
 
164 aa  114  7.999999999999999e-25  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.438944  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4410  NADH-quinone oxidoreductase, chain I  43.51 
 
 
194 aa  114  8.999999999999998e-25  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0546  NADH dehydrogenase subunit I  41.54 
 
 
217 aa  113  1.0000000000000001e-24  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.175795  normal  0.434998 
 
 
-
 
NC_006681  CNL05770  conserved hypothetical protein  41.41 
 
 
273 aa  112  2.0000000000000002e-24  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3387  NADH-quinone oxidoreductase, chain I  40.41 
 
 
165 aa  113  2.0000000000000002e-24  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.533197  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7683  NADH-quinone oxidoreductase, chain I  42.22 
 
 
203 aa  113  2.0000000000000002e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4080  NADH-quinone oxidoreductase, chain I  39.13 
 
 
197 aa  113  2.0000000000000002e-24  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.0562629 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1322  NADH dehydrogenase subunit I  44.54 
 
 
164 aa  112  3e-24  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.323962  normal  0.0547108 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0361  NADH dehydrogenase subunit I  38.46 
 
 
167 aa  112  3e-24  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.326031  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3615  NADH-quinone oxidoreductase, chain I  43.9 
 
 
211 aa  112  3e-24  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0691  NADH dehydrogenase subunit I  38.03 
 
 
169 aa  112  3e-24  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.438917  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6086  NADH dehydrogenase subunit I  43.08 
 
 
211 aa  112  3e-24  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  decreased coverage  0.00224994  normal  0.0520295 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>