More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gobs_4550 on replicon NC_013757
Organism: Geodermatophilus obscurus DSM 43160



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013757  Gobs_4550  NADH-quinone oxidoreductase, chain I  100 
 
 		 211 aa  436  1e-121  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0275  NADH dehydrogenase subunit I  84.28 
 
 		 199 aa  286  2e-76  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4057  NADH dehydrogenase subunit I  78.75 
 
 		 211 aa  278  4e-74  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.819652  normal  0.545712 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4455  NADH dehydrogenase subunit I  78.12 
 
 		 211 aa  278  5e-74  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.829117  normal  0.833546 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0546  NADH dehydrogenase subunit I  80.5 
 
 		 217 aa  278  5e-74  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.175795  normal  0.434998 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6674  NADH dehydrogenase subunit I  80.89 
 
 		 188 aa  276  2e-73  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6086  NADH dehydrogenase subunit I  75.76 
 
 		 211 aa  273  1.0000000000000001e-72  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  decreased coverage  0.00224994  normal  0.0520295 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1282  NADH-quinone oxidoreductase chain I  77.99 
 
 		 185 aa  273  2.0000000000000002e-72  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.425102 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_03240  NADH dehydrogenase subunit I  79.75 
 
 		 187 aa  271  7e-72  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2687  NADH dehydrogenase subunit I  77.64 
 
 		 183 aa  269  2e-71  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0721276  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0982  NADH-quinone oxidoreductase, chain I  77.85 
 
 		 214 aa  265  5e-70  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4410  NADH-quinone oxidoreductase, chain I  76.28 
 
 		 194 aa  261  4e-69  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5061  NADH-quinone oxidoreductase, chain I  75 
 
 		 185 aa  261  6.999999999999999e-69  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.451376  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13174  NADH dehydrogenase subunit I  71.18 
 
 		 218 aa  258  3e-68  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7683  NADH-quinone oxidoreductase, chain I  71.69 
 
 		 203 aa  256  1e-67  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0289  NADH-quinone oxidoreductase, chain I  74.07 
 
 		 171 aa  256  1e-67  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.998746  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0528  NADH dehydrogenase subunit I  73.37 
 
 		 196 aa  257  1e-67  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0592  Formate hydrogenlyase subunit 6/NADH:ubiquinone oxidoreductase 23 kD subunit (chain I)-like protein  73.46 
 
 		 171 aa  256  2e-67  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1877  NADH dehydrogenase subunit I  73.91 
 
 		 174 aa  255  3e-67  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4489  NADH dehydrogenase subunit I  76.47 
 
 		 175 aa  253  2.0000000000000002e-66  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.159742 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1572  NADH dehydrogenase subunit I  75.32 
 
 		 174 aa  249  2e-65  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1596  NADH dehydrogenase subunit I  75.32 
 
 		 174 aa  249  2e-65  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.557888  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1542  NADH dehydrogenase subunit I  75.32 
 
 		 174 aa  249  3e-65  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.383544  normal  0.0726132 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0394  NADH-quinone oxidoreductase, chain I  73.72 
 
 		 175 aa  248  4e-65  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3221  NADH-quinone oxidoreductase, chain I  64.84 
 
 		 254 aa  238  5e-62  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.129277 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2708  NADH-quinone oxidoreductase, chain I  67.47 
 
 		 247 aa  234  9e-61  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3176  NADH-quinone oxidoreductase, chain I  69.93 
 
 		 167 aa  233  1.0000000000000001e-60  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0547  NADH-quinone oxidoreductase, chain I  60.5 
 
 		 226 aa  226  2e-58  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.481769 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_07460  NADH dehydrogenase subunit I  63.16 
 
 		 252 aa  219  3e-56  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.0206751 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0477  NADH-quinone oxidoreductase, chain I  63.64 
 
 		 300 aa  215  4e-55  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.376416  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1869  NADH-quinone oxidoreductase chain I  56.06 
 
 		 177 aa  165  4e-40  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0371  NADH-quinone oxidoreductase, chain I  58.46 
 
 		 229 aa  163  1.0000000000000001e-39  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.839117  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1275  NADH-quinone oxidoreductase, chain I  56.06 
 
 		 199 aa  160  2e-38  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0917  NADH-quinone oxidoreductase, chain I  55.3 
 
 		 179 aa  157  1e-37  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.5865  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1845  NADH-quinone oxidoreductase, chain I  50.74 
 
 		 175 aa  152  2e-36  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1157  NADH-quinone oxidoreductase, chain I  53.03 
 
 		 177 aa  141  8e-33  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2235  NADH-quinone oxidoreductase, chain I  48.48 
 
 		 165 aa  139  3e-32  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.272952  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3216  NADH-quinone oxidoreductase, chain I  46 
 
 		 168 aa  137  1e-31  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3387  NADH-quinone oxidoreductase, chain I  48.48 
 
 		 165 aa  137  1e-31  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.533197  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3434  NADH dehydrogenase subunit I  47.33 
 
 		 176 aa  129  3e-29  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.460482  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0163  NADH dehydrogenase subunit I  48.09 
 
 		 184 aa  127  9.000000000000001e-29  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4126  NADH dehydrogenase subunit I  47.69 
 
 		 182 aa  125  6e-28  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1739  NADH dehydrogenase subunit I  47.69 
 
 		 182 aa  125  6e-28  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.235938  normal  0.220023 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3698  NADH dehydrogenase subunit I  47.69 
 
 		 182 aa  125  6e-28  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.380267  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1866  NADH dehydrogenase subunit I  47.69 
 
 		 182 aa  125  6e-28  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0422789 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1238  NADH-quinone oxidoreductase, chain I  36.59 
 
 		 181 aa  122  3e-27  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3818  NADH-quinone oxidoreductase, chain I  46.04 
 
 		 171 aa  122  3e-27  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.121238  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3125  NADH dehydrogenase subunit I  45.31 
 
 		 179 aa  122  4e-27  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3372  NADH dehydrogenase I, I subunit  49.21 
 
 		 182 aa  122  5e-27  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.675448  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2419  NADH dehydrogenase subunit I  47.62 
 
 		 182 aa  120  9.999999999999999e-27  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.193406 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0211  NADH dehydrogenase subunit I  45.31 
 
 		 176 aa  120  9.999999999999999e-27  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2562  NADH dehydrogenase subunit I  47.62 
 
 		 182 aa  120  9.999999999999999e-27  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1374  NADH dehydrogenase I chain I  38.82 
 
 		 175 aa  120  9.999999999999999e-27  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  decreased coverage  0.00228535  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_29920  NADH dehydrogenase subunit I  47.62 
 
 		 182 aa  120  9.999999999999999e-27  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.546828  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3204  NADH dehydrogenase subunit I  48.41 
 
 		 182 aa  120  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0843328  normal  0.169624 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3610  NADH dehydrogenase subunit I  48.41 
 
 		 182 aa  120  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.487333  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_28510  NADH dehydrogenase subunit I  46.03 
 
 		 182 aa  119  3e-26  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.559317  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2825  NADH dehydrogenase subunit I  44.44 
 
 		 180 aa  119  3e-26  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.339444  normal  0.999371 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0374  NADH dehydrogenase subunit I  42.55 
 
 		 180 aa  119  3e-26  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5106  NADH-quinone oxidoreductase, chain I  38.2 
 
 		 188 aa  119  3.9999999999999996e-26  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2667  NADH dehydrogenase subunit I  41.11 
 
 		 180 aa  118  7e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2549  NADH dehydrogenase subunit I  44.76 
 
 		 180 aa  117  9.999999999999999e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2505  NADH dehydrogenase subunit I  44.76 
 
 		 180 aa  117  9.999999999999999e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1020  NADH dehydrogenase subunit I  45.24 
 
 		 171 aa  117  9.999999999999999e-26  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.755319  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2560  NADH dehydrogenase subunit I  44.76 
 
 		 180 aa  117  9.999999999999999e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0213368  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2460  NADH dehydrogenase subunit I  44.76 
 
 		 180 aa  117  9.999999999999999e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02206  NADH dehydrogenase subunit I  44.06 
 
 		 180 aa  116  1.9999999999999998e-25  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1376  NADH-quinone oxidoreductase, chain I  44.06 
 
 		 180 aa  116  1.9999999999999998e-25  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00237006  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0323  NADH dehydrogenase subunit I  42.64 
 
 		 176 aa  116  1.9999999999999998e-25  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1499  NADH dehydrogenase subunit I  44.85 
 
 		 180 aa  116  1.9999999999999998e-25  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3301  NADH dehydrogenase subunit I  38.89 
 
 		 180 aa  117  1.9999999999999998e-25  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.9572 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2765  NADH dehydrogenase subunit I  44.85 
 
 		 180 aa  116  1.9999999999999998e-25  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.128685  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2430  NADH dehydrogenase subunit I  44.06 
 
 		 180 aa  116  1.9999999999999998e-25  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2574  NADH dehydrogenase subunit I  44.06 
 
 		 180 aa  116  1.9999999999999998e-25  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1371  NADH dehydrogenase subunit I  44.06 
 
 		 180 aa  116  1.9999999999999998e-25  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.583652  normal  0.392913 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2435  NADH dehydrogenase subunit I  44.06 
 
 		 180 aa  116  1.9999999999999998e-25  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02166  hypothetical protein  44.06 
 
 		 180 aa  116  1.9999999999999998e-25  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2657  NADH dehydrogenase subunit I  44.06 
 
 		 180 aa  116  1.9999999999999998e-25  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3420  NADH dehydrogenase subunit I  44.06 
 
 		 180 aa  116  1.9999999999999998e-25  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4074  NADH-quinone oxidoreductase, chain I  41.13 
 
 		 165 aa  116  3e-25  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.138304  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1809  NADH dehydrogenase subunit I  42.66 
 
 		 180 aa  115  5e-25  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.693845 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1461  NADH dehydrogenase subunit I  42.66 
 
 		 180 aa  115  5e-25  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1120  NADH dehydrogenase subunit I  41.96 
 
 		 180 aa  115  5e-25  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.311189  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1567  NADH dehydrogenase subunit I  42.66 
 
 		 180 aa  115  5e-25  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.997394  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1113  NADH-quinone oxidoreductase, chain I  45.6 
 
 		 170 aa  114  6.9999999999999995e-25  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.182151  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1401  NADH dehydrogenase subunit I  42.65 
 
 		 180 aa  114  1.0000000000000001e-24  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.590324  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4080  NADH-quinone oxidoreductase, chain I  39.57 
 
 		 197 aa  114  1.0000000000000001e-24  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.0562629 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2543  NADH dehydrogenase subunit I  42.65 
 
 		 180 aa  114  1.0000000000000001e-24  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.879169  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7011  NADH-quinone oxidoreductase, chain I  39.72 
 
 		 169 aa  113  2.0000000000000002e-24  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1940  NADH dehydrogenase subunit I  39.01 
 
 		 178 aa  111  6e-24  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.509162 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1352  NADH dehydrogenase subunit I  42.06 
 
 		 171 aa  111  9e-24  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1014  NADH dehydrogenase subunit I  41.54 
 
 		 180 aa  110  1.0000000000000001e-23  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1692  NADH dehydrogenase subunit I  41.84 
 
 		 182 aa  110  1.0000000000000001e-23  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0172  NADH dehydrogenase subunit I  40.31 
 
 		 176 aa  110  1.0000000000000001e-23  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0154  NADH dehydrogenase subunit I  36.81 
 
 		 176 aa  110  1.0000000000000001e-23  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.947551 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1696  NADH dehydrogenase subunit I  46.72 
 
 		 164 aa  108  4.0000000000000004e-23  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  hitchhiker  0.00251501  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0711  NADH-quinone oxidoreductase, chain I  41.13 
 
 		 170 aa  108  6e-23  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0425782  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4236  NADH-quinone oxidoreductase, chain I  44.27 
 
 		 132 aa  107  1e-22  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000114859  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4002  NADH-quinone oxidoreductase, chain I  41.22 
 
 		 132 aa  107  2e-22  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.89067e-17 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3918  NADH-quinone oxidoreductase, chain I  41.22 
 
 		 132 aa  107  2e-22  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>