More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dd703_2543 on replicon NC_012880
Organism: Dickeya dadantii Ech703



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012880  Dd703_2543  NADH dehydrogenase subunit I  100 
 
 		 180 aa  371  1e-102  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.879169  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1401  NADH dehydrogenase subunit I  98.33 
 
 		 180 aa  367  1e-101  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.590324  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1499  NADH dehydrogenase subunit I  93.33 
 
 		 180 aa  356  9e-98  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2765  NADH dehydrogenase subunit I  92.78 
 
 		 180 aa  355  1.9999999999999998e-97  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.128685  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02206  NADH dehydrogenase subunit I  91.11 
 
 		 180 aa  343  5e-94  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1376  NADH-quinone oxidoreductase, chain I  91.11 
 
 		 180 aa  343  5e-94  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00237006  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2574  NADH dehydrogenase subunit I  91.11 
 
 		 180 aa  343  5e-94  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3301  NADH dehydrogenase subunit I  91.67 
 
 		 180 aa  343  5e-94  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.9572 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2430  NADH dehydrogenase subunit I  91.11 
 
 		 180 aa  343  5e-94  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2657  NADH dehydrogenase subunit I  91.11 
 
 		 180 aa  343  5e-94  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2435  NADH dehydrogenase subunit I  91.11 
 
 		 180 aa  343  5e-94  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1371  NADH dehydrogenase subunit I  91.11 
 
 		 180 aa  343  5e-94  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.583652  normal  0.392913 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02166  hypothetical protein  91.11 
 
 		 180 aa  343  5e-94  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3420  NADH dehydrogenase subunit I  91.11 
 
 		 180 aa  343  5e-94  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2505  NADH dehydrogenase subunit I  90.56 
 
 		 180 aa  342  1e-93  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2549  NADH dehydrogenase subunit I  90.56 
 
 		 180 aa  342  1e-93  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2460  NADH dehydrogenase subunit I  90.56 
 
 		 180 aa  342  1e-93  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2560  NADH dehydrogenase subunit I  90.56 
 
 		 180 aa  342  1e-93  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0213368  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2667  NADH dehydrogenase subunit I  90 
 
 		 180 aa  340  4e-93  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1809  NADH dehydrogenase subunit I  90 
 
 		 180 aa  340  5.999999999999999e-93  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.693845 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1461  NADH dehydrogenase subunit I  90 
 
 		 180 aa  340  5.999999999999999e-93  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1567  NADH dehydrogenase subunit I  90 
 
 		 180 aa  340  5.999999999999999e-93  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.997394  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2825  NADH dehydrogenase subunit I  89.44 
 
 		 180 aa  339  1e-92  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.339444  normal  0.999371 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2419  NADH dehydrogenase subunit I  80.9 
 
 		 182 aa  305  2.0000000000000002e-82  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.193406 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1014  NADH dehydrogenase subunit I  80 
 
 		 180 aa  305  3e-82  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_28510  NADH dehydrogenase subunit I  80.9 
 
 		 182 aa  304  4.0000000000000004e-82  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.559317  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3698  NADH dehydrogenase subunit I  80.34 
 
 		 182 aa  302  1.0000000000000001e-81  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.380267  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1866  NADH dehydrogenase subunit I  80.34 
 
 		 182 aa  302  1.0000000000000001e-81  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0422789 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4126  NADH dehydrogenase subunit I  80.34 
 
 		 182 aa  302  1.0000000000000001e-81  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1739  NADH dehydrogenase subunit I  80.34 
 
 		 182 aa  302  1.0000000000000001e-81  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.235938  normal  0.220023 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2562  NADH dehydrogenase subunit I  80 
 
 		 182 aa  297  5e-80  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_29920  NADH dehydrogenase subunit I  80 
 
 		 182 aa  297  5e-80  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.546828  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3204  NADH dehydrogenase subunit I  78.65 
 
 		 182 aa  296  1e-79  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0843328  normal  0.169624 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3610  NADH dehydrogenase subunit I  78.09 
 
 		 182 aa  295  2e-79  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.487333  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3372  NADH dehydrogenase I, I subunit  78.09 
 
 		 182 aa  295  3e-79  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.675448  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1692  NADH dehydrogenase subunit I  76.54 
 
 		 182 aa  295  3e-79  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0374  NADH dehydrogenase subunit I  78.89 
 
 		 180 aa  294  5e-79  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3125  NADH dehydrogenase subunit I  75.28 
 
 		 179 aa  285  2e-76  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0580  NADH dehydrogenase subunit I  75.42 
 
 		 182 aa  276  8e-74  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0627884  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0591  NADH dehydrogenase subunit I  74.86 
 
 		 182 aa  275  3e-73  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0623179  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1120  NADH dehydrogenase subunit I  70.52 
 
 		 180 aa  262  2e-69  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.311189  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1352  NADH dehydrogenase subunit I  69.23 
 
 		 171 aa  250  9.000000000000001e-66  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3818  NADH-quinone oxidoreductase, chain I  68.05 
 
 		 171 aa  244  4.9999999999999997e-64  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.121238  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1333  NADH dehydrogenase subunit I  67.24 
 
 		 171 aa  244  6.999999999999999e-64  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1113  NADH-quinone oxidoreductase, chain I  72.78 
 
 		 170 aa  242  1.9999999999999999e-63  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.182151  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2867  NADH-quinone oxidoreductase, chain I  65.09 
 
 		 171 aa  239  1e-62  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.708253  normal  0.0292468 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1020  NADH dehydrogenase subunit I  67.46 
 
 		 171 aa  239  1e-62  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.755319  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0711  NADH-quinone oxidoreductase, chain I  67.66 
 
 		 170 aa  239  1e-62  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0425782  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1354  NADH dehydrogenase subunit I  66.67 
 
 		 171 aa  239  2e-62  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.253044  normal  0.161644 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4736  NADH dehydrogenase subunit I  65.52 
 
 		 173 aa  238  5e-62  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.161018  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4064  NADH dehydrogenase subunit I  64.94 
 
 		 171 aa  234  7e-61  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0149353  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0107  NADH dehydrogenase subunit I  63.03 
 
 		 164 aa  206  1e-52  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.807538  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1696  NADH dehydrogenase subunit I  62.42 
 
 		 164 aa  206  1e-52  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  hitchhiker  0.00251501  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1743  NADH dehydrogenase subunit I  62.42 
 
 		 164 aa  205  3e-52  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  decreased coverage  0.00386762  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0323  NADH dehydrogenase subunit I  56.74 
 
 		 176 aa  199  1.9999999999999998e-50  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3434  NADH dehydrogenase subunit I  54.86 
 
 		 176 aa  195  3e-49  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.460482  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0163  NADH dehydrogenase subunit I  53.14 
 
 		 184 aa  194  7e-49  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0172  NADH dehydrogenase subunit I  55.56 
 
 		 176 aa  186  1e-46  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0211  NADH dehydrogenase subunit I  56.41 
 
 		 176 aa  185  3e-46  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1940  NADH dehydrogenase subunit I  52.51 
 
 		 178 aa  184  8e-46  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.509162 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0154  NADH dehydrogenase subunit I  53.89 
 
 		 176 aa  182  3e-45  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.947551 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1869  NADH-quinone oxidoreductase chain I  42.48 
 
 		 177 aa  127  9.000000000000001e-29  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0917  NADH-quinone oxidoreductase, chain I  48.46 
 
 		 179 aa  124  1e-27  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.5865  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1275  NADH-quinone oxidoreductase, chain I  41.45 
 
 		 199 aa  123  2e-27  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7683  NADH-quinone oxidoreductase, chain I  46.34 
 
 		 203 aa  118  3.9999999999999996e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7011  NADH-quinone oxidoreductase, chain I  42.75 
 
 		 169 aa  118  4.9999999999999996e-26  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0546  NADH dehydrogenase subunit I  46.67 
 
 		 217 aa  116  1.9999999999999998e-25  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.175795  normal  0.434998 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1282  NADH-quinone oxidoreductase chain I  41.48 
 
 		 185 aa  115  3.9999999999999997e-25  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.425102 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6086  NADH dehydrogenase subunit I  45.53 
 
 		 211 aa  115  5e-25  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  decreased coverage  0.00224994  normal  0.0520295 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4550  NADH-quinone oxidoreductase, chain I  42.65 
 
 		 211 aa  114  7.999999999999999e-25  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0547  NADH-quinone oxidoreductase, chain I  41.22 
 
 		 226 aa  113  1.0000000000000001e-24  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.481769 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0592  Formate hydrogenlyase subunit 6/NADH:ubiquinone oxidoreductase 23 kD subunit (chain I)-like protein  44.37 
 
 		 171 aa  114  1.0000000000000001e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4455  NADH dehydrogenase subunit I  42.28 
 
 		 211 aa  113  2.0000000000000002e-24  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.829117  normal  0.833546 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4057  NADH dehydrogenase subunit I  42.28 
 
 		 211 aa  113  2.0000000000000002e-24  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.819652  normal  0.545712 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0528  NADH dehydrogenase subunit I  42.25 
 
 		 196 aa  113  2.0000000000000002e-24  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0275  NADH dehydrogenase subunit I  36.11 
 
 		 199 aa  112  4.0000000000000004e-24  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0394  NADH-quinone oxidoreductase, chain I  41.01 
 
 		 175 aa  111  6e-24  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13174  NADH dehydrogenase subunit I  41.55 
 
 		 218 aa  110  8.000000000000001e-24  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2708  NADH-quinone oxidoreductase, chain I  41.38 
 
 		 247 aa  110  9e-24  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009370  OSTLU_18502  predicted protein  40.43 
 
 		 167 aa  110  1.0000000000000001e-23  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.0613487 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4410  NADH-quinone oxidoreductase, chain I  40.58 
 
 		 194 aa  110  1.0000000000000001e-23  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1157  NADH-quinone oxidoreductase, chain I  43.8 
 
 		 177 aa  109  2.0000000000000002e-23  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011682  PHATRDRAFT_14260  predicted protein  41.48 
 
 		 163 aa  108  3e-23  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1877  NADH dehydrogenase subunit I  41.43 
 
 		 174 aa  108  3e-23  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6674  NADH dehydrogenase subunit I  41.61 
 
 		 188 aa  108  4.0000000000000004e-23  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0289  NADH-quinone oxidoreductase, chain I  41.61 
 
 		 171 aa  108  5e-23  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.998746  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1099  NADH dehydrogenase subunit I  39.84 
 
 		 162 aa  108  6e-23  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0982  NADH-quinone oxidoreductase, chain I  39.42 
 
 		 214 aa  107  7.000000000000001e-23  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3176  NADH-quinone oxidoreductase, chain I  39.46 
 
 		 167 aa  107  9.000000000000001e-23  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2054  NADH dehydrogenase subunit I  39.46 
 
 		 163 aa  107  1e-22  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.151951 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0477  NADH-quinone oxidoreductase, chain I  38.89 
 
 		 300 aa  107  1e-22  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.376416  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3336  NADH dehydrogenase subunit I  38.85 
 
 		 162 aa  107  1e-22  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.463064  normal  0.437664 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1883  NADH dehydrogenase subunit I  39.46 
 
 		 163 aa  107  1e-22  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.604396 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2206  NADH dehydrogenase subunit I  39.46 
 
 		 163 aa  107  1e-22  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1845  NADH-quinone oxidoreductase, chain I  39.6 
 
 		 175 aa  106  1e-22  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_03240  NADH dehydrogenase subunit I  39.42 
 
 		 187 aa  106  1e-22  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2687  NADH dehydrogenase subunit I  40.44 
 
 		 183 aa  105  2e-22  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0721276  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4398  NADH dehydrogenase subunit I  39.44 
 
 		 162 aa  106  2e-22  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4489  NADH dehydrogenase subunit I  40.71 
 
 		 175 aa  105  2e-22  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.159742 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4134  NADH dehydrogenase subunit I  39.44 
 
 		 162 aa  106  2e-22  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.181277  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>