More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cfla_2708 on replicon NC_014151
Organism: Cellulomonas flavigena DSM 20109



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014151  Cfla_2708  NADH-quinone oxidoreductase, chain I  100 
 
 
247 aa  511  1e-144  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3221  NADH-quinone oxidoreductase, chain I  80.21 
 
 
254 aa  334  7.999999999999999e-91  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.129277 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_07460  NADH dehydrogenase subunit I  79.1 
 
 
252 aa  332  3e-90  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.0206751 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0477  NADH-quinone oxidoreductase, chain I  74.88 
 
 
300 aa  318  3e-86  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.376416  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0547  NADH-quinone oxidoreductase, chain I  78.95 
 
 
226 aa  313  9.999999999999999e-85  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.481769 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1542  NADH dehydrogenase subunit I  70.69 
 
 
174 aa  262  4e-69  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.383544  normal  0.0726132 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1596  NADH dehydrogenase subunit I  70.11 
 
 
174 aa  260  1e-68  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.557888  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1572  NADH dehydrogenase subunit I  70.11 
 
 
174 aa  260  1e-68  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0394  NADH-quinone oxidoreductase, chain I  70.06 
 
 
175 aa  253  2.0000000000000002e-66  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4410  NADH-quinone oxidoreductase, chain I  71.34 
 
 
194 aa  253  2.0000000000000002e-66  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2687  NADH dehydrogenase subunit I  71.17 
 
 
183 aa  251  7e-66  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0721276  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0546  NADH dehydrogenase subunit I  72.96 
 
 
217 aa  251  8.000000000000001e-66  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.175795  normal  0.434998 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0289  NADH-quinone oxidoreductase, chain I  72.56 
 
 
171 aa  250  2e-65  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.998746  normal 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5061  NADH-quinone oxidoreductase, chain I  71.6 
 
 
185 aa  249  4e-65  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.451376  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6086  NADH dehydrogenase subunit I  70.44 
 
 
211 aa  246  3e-64  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  decreased coverage  0.00224994  normal  0.0520295 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13174  NADH dehydrogenase subunit I  68.36 
 
 
218 aa  245  4.9999999999999997e-64  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0528  NADH dehydrogenase subunit I  67.63 
 
 
196 aa  244  8e-64  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7683  NADH-quinone oxidoreductase, chain I  69.33 
 
 
203 aa  244  9e-64  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0592  Formate hydrogenlyase subunit 6/NADH:ubiquinone oxidoreductase 23 kD subunit (chain I)-like protein  68.9 
 
 
171 aa  244  9e-64  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1877  NADH dehydrogenase subunit I  66.67 
 
 
174 aa  244  9.999999999999999e-64  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4489  NADH dehydrogenase subunit I  67.84 
 
 
175 aa  243  1.9999999999999999e-63  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.159742 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0275  NADH dehydrogenase subunit I  71.43 
 
 
199 aa  241  1e-62  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6674  NADH dehydrogenase subunit I  69.81 
 
 
188 aa  239  2e-62  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_03240  NADH dehydrogenase subunit I  68.55 
 
 
187 aa  238  6.999999999999999e-62  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1282  NADH-quinone oxidoreductase chain I  65.64 
 
 
185 aa  234  1.0000000000000001e-60  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.425102 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4550  NADH-quinone oxidoreductase, chain I  67.47 
 
 
211 aa  234  1.0000000000000001e-60  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0982  NADH-quinone oxidoreductase, chain I  68.94 
 
 
214 aa  233  3e-60  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4057  NADH dehydrogenase subunit I  65.06 
 
 
211 aa  231  9e-60  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.819652  normal  0.545712 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4455  NADH dehydrogenase subunit I  68.79 
 
 
211 aa  231  1e-59  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.829117  normal  0.833546 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3176  NADH-quinone oxidoreductase, chain I  66.04 
 
 
167 aa  227  2e-58  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0371  NADH-quinone oxidoreductase, chain I  55.88 
 
 
229 aa  165  6.9999999999999995e-40  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.839117  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0917  NADH-quinone oxidoreductase, chain I  54.74 
 
 
179 aa  155  4e-37  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.5865  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1869  NADH-quinone oxidoreductase chain I  55.81 
 
 
177 aa  155  4e-37  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1275  NADH-quinone oxidoreductase, chain I  44.81 
 
 
199 aa  152  2.9999999999999998e-36  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2235  NADH-quinone oxidoreductase, chain I  49.66 
 
 
165 aa  149  3e-35  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.272952  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3387  NADH-quinone oxidoreductase, chain I  49.66 
 
 
165 aa  147  2.0000000000000003e-34  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.533197  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1157  NADH-quinone oxidoreductase, chain I  51.06 
 
 
177 aa  143  2e-33  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3216  NADH-quinone oxidoreductase, chain I  46.31 
 
 
168 aa  140  1.9999999999999998e-32  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1845  NADH-quinone oxidoreductase, chain I  45.14 
 
 
175 aa  138  8.999999999999999e-32  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3336  NADH dehydrogenase subunit I  46.15 
 
 
162 aa  124  2e-27  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.463064  normal  0.437664 
 
 
-
 
NC_002978  WD0980  NADH dehydrogenase subunit I  36.69 
 
 
169 aa  122  7e-27  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0211  NADH dehydrogenase subunit I  40.68 
 
 
176 aa  121  9e-27  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0154  NADH dehydrogenase subunit I  35.64 
 
 
176 aa  121  9.999999999999999e-27  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.947551 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0172  NADH dehydrogenase subunit I  35.64 
 
 
176 aa  121  9.999999999999999e-27  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0163  NADH dehydrogenase subunit I  36.9 
 
 
184 aa  121  9.999999999999999e-27  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3434  NADH dehydrogenase subunit I  37.97 
 
 
176 aa  120  1.9999999999999998e-26  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.460482  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3818  NADH-quinone oxidoreductase, chain I  41.48 
 
 
171 aa  118  9e-26  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.121238  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3627  NADH dehydrogenase subunit I  39.46 
 
 
164 aa  118  9.999999999999999e-26  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.0704772 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1120  NADH dehydrogenase subunit I  44.27 
 
 
180 aa  117  1.9999999999999998e-25  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.311189  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3372  NADH dehydrogenase I, I subunit  45.24 
 
 
182 aa  114  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.675448  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1020  NADH dehydrogenase subunit I  43.65 
 
 
171 aa  114  1.0000000000000001e-24  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.755319  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3204  NADH dehydrogenase subunit I  45.24 
 
 
182 aa  114  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0843328  normal  0.169624 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1238  NADH-quinone oxidoreductase, chain I  40.43 
 
 
181 aa  114  2.0000000000000002e-24  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3610  NADH dehydrogenase subunit I  41.4 
 
 
182 aa  114  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.487333  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1041  NADH-quinone oxidoreductase, chain I  49.66 
 
 
165 aa  114  2.0000000000000002e-24  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4625  NADH dehydrogenase subunit I  42.45 
 
 
162 aa  113  2.0000000000000002e-24  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.11536 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0323  NADH dehydrogenase subunit I  38.01 
 
 
176 aa  113  3e-24  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0107  NADH dehydrogenase subunit I  48.76 
 
 
164 aa  113  3e-24  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.807538  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1743  NADH dehydrogenase subunit I  48.76 
 
 
164 aa  113  3e-24  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  decreased coverage  0.00386762  normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0829  NADH dehydrogenase subunit I  42.42 
 
 
163 aa  112  5e-24  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.260339  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4126  NADH dehydrogenase subunit I  43.75 
 
 
182 aa  112  5e-24  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1739  NADH dehydrogenase subunit I  43.75 
 
 
182 aa  112  5e-24  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.235938  normal  0.220023 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0711  NADH-quinone oxidoreductase, chain I  43.65 
 
 
170 aa  112  5e-24  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0425782  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1866  NADH dehydrogenase subunit I  43.75 
 
 
182 aa  112  5e-24  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.0422789 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3698  NADH dehydrogenase subunit I  43.75 
 
 
182 aa  112  5e-24  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.380267  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7011  NADH-quinone oxidoreductase, chain I  39.39 
 
 
169 aa  112  5e-24  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1043  NADH dehydrogenase subunit I  42.42 
 
 
163 aa  112  6e-24  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4398  NADH dehydrogenase subunit I  41.67 
 
 
162 aa  112  7.000000000000001e-24  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_28510  NADH dehydrogenase subunit I  44.44 
 
 
182 aa  112  7.000000000000001e-24  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.559317  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4134  NADH dehydrogenase subunit I  41.67 
 
 
162 aa  112  7.000000000000001e-24  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.181277  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3125  NADH dehydrogenase subunit I  40.43 
 
 
179 aa  112  8.000000000000001e-24  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1113  NADH-quinone oxidoreductase, chain I  35.87 
 
 
170 aa  111  9e-24  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.182151  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1879  NADH dehydrogenase subunit I  42.42 
 
 
162 aa  111  1.0000000000000001e-23  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.508831  normal  0.262119 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2562  NADH dehydrogenase subunit I  41.18 
 
 
182 aa  110  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2212  NADH dehydrogenase subunit I  42.42 
 
 
162 aa  111  1.0000000000000001e-23  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.199823  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3218  NADH dehydrogenase subunit I  42.66 
 
 
163 aa  110  1.0000000000000001e-23  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_29920  NADH dehydrogenase subunit I  41.18 
 
 
182 aa  110  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.546828  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1401  NADH dehydrogenase subunit I  41.38 
 
 
180 aa  110  2.0000000000000002e-23  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.590324  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1499  NADH dehydrogenase subunit I  41.38 
 
 
180 aa  110  2.0000000000000002e-23  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2765  NADH dehydrogenase subunit I  41.3 
 
 
180 aa  110  2.0000000000000002e-23  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.128685  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2543  NADH dehydrogenase subunit I  41.38 
 
 
180 aa  110  2.0000000000000002e-23  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.879169  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1099  NADH dehydrogenase subunit I  40.44 
 
 
162 aa  110  2.0000000000000002e-23  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1563  NADH dehydrogenase subunit I  42.42 
 
 
162 aa  110  2.0000000000000002e-23  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.339949  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2412  NADH dehydrogenase subunit I  42.42 
 
 
162 aa  110  2.0000000000000002e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0701412  normal  0.0109704 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2419  NADH dehydrogenase subunit I  43.65 
 
 
182 aa  110  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.193406 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1374  NADH dehydrogenase I chain I  38.82 
 
 
175 aa  110  2.0000000000000002e-23  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  decreased coverage  0.00228535  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0825  NADH dehydrogenase subunit I  39.86 
 
 
163 aa  110  3e-23  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1696  NADH dehydrogenase subunit I  47.11 
 
 
164 aa  110  3e-23  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  hitchhiker  0.00251501  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0805  NADH dehydrogenase subunit I  38.16 
 
 
163 aa  109  3e-23  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0810  NADH dehydrogenase subunit I  40.46 
 
 
163 aa  109  4.0000000000000004e-23  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.719018  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1014  NADH dehydrogenase subunit I  41.09 
 
 
180 aa  109  5e-23  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006681  CNL05770  conserved hypothetical protein  38.36 
 
 
273 aa  109  5e-23  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1322  NADH dehydrogenase subunit I  40 
 
 
164 aa  109  5e-23  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.323962  normal  0.0547108 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2582  NADH dehydrogenase subunit I  42.42 
 
 
162 aa  109  5e-23  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.561308  normal  0.2116 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2415  NADH dehydrogenase subunit I  40.91 
 
 
163 aa  109  5e-23  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.87535  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4553  NADH dehydrogenase subunit I  41.73 
 
 
162 aa  108  6e-23  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.128776 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3290  NADH dehydrogenase subunit I  41.67 
 
 
162 aa  108  9.000000000000001e-23  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.221287  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1187  NADH dehydrogenase subunit I  37.82 
 
 
164 aa  108  9.000000000000001e-23  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.438944  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2292  NADH dehydrogenase subunit I  40.91 
 
 
161 aa  107  1e-22  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1077  NADH dehydrogenase subunit I  41.22 
 
 
162 aa  108  1e-22  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.280148 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>