More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tcur_4410 on replicon NC_013510
Organism: Thermomonospora curvata DSM 43183



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013510  Tcur_4410  NADH-quinone oxidoreductase, chain I  100 
 
 
194 aa  405  1.0000000000000001e-112  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0289  NADH-quinone oxidoreductase, chain I  88.02 
 
 
171 aa  317  6e-86  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.998746  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0592  Formate hydrogenlyase subunit 6/NADH:ubiquinone oxidoreductase 23 kD subunit (chain I)-like protein  88.02 
 
 
171 aa  317  7e-86  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2687  NADH dehydrogenase subunit I  83.52 
 
 
183 aa  316  1e-85  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0721276  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5061  NADH-quinone oxidoreductase, chain I  77.3 
 
 
185 aa  308  2.9999999999999997e-83  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.451376  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0546  NADH dehydrogenase subunit I  82.39 
 
 
217 aa  285  4e-76  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.175795  normal  0.434998 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6086  NADH dehydrogenase subunit I  80.5 
 
 
211 aa  280  8.000000000000001e-75  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  decreased coverage  0.00224994  normal  0.0520295 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0275  NADH dehydrogenase subunit I  80.89 
 
 
199 aa  269  2e-71  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0528  NADH dehydrogenase subunit I  76.83 
 
 
196 aa  267  8.999999999999999e-71  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6674  NADH dehydrogenase subunit I  75.93 
 
 
188 aa  265  2e-70  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0394  NADH-quinone oxidoreductase, chain I  76.07 
 
 
175 aa  265  2.9999999999999995e-70  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_03240  NADH dehydrogenase subunit I  73.05 
 
 
187 aa  262  2e-69  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0982  NADH-quinone oxidoreductase, chain I  75.93 
 
 
214 aa  262  3e-69  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4550  NADH-quinone oxidoreductase, chain I  76.28 
 
 
211 aa  261  3e-69  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4489  NADH dehydrogenase subunit I  71.1 
 
 
175 aa  261  6e-69  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.159742 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1282  NADH-quinone oxidoreductase chain I  66.67 
 
 
185 aa  260  1e-68  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.425102 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1877  NADH dehydrogenase subunit I  73.05 
 
 
174 aa  259  1e-68  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3221  NADH-quinone oxidoreductase, chain I  73.17 
 
 
254 aa  259  2e-68  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.129277 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4057  NADH dehydrogenase subunit I  70.18 
 
 
211 aa  257  7e-68  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.819652  normal  0.545712 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4455  NADH dehydrogenase subunit I  69.59 
 
 
211 aa  256  1e-67  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.829117  normal  0.833546 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7683  NADH-quinone oxidoreductase, chain I  77.85 
 
 
203 aa  256  2e-67  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13174  NADH dehydrogenase subunit I  74.53 
 
 
218 aa  254  6e-67  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2708  NADH-quinone oxidoreductase, chain I  71.34 
 
 
247 aa  253  1.0000000000000001e-66  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1542  NADH dehydrogenase subunit I  71.26 
 
 
174 aa  253  1.0000000000000001e-66  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.383544  normal  0.0726132 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1572  NADH dehydrogenase subunit I  69.77 
 
 
174 aa  253  1.0000000000000001e-66  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1596  NADH dehydrogenase subunit I  69.77 
 
 
174 aa  253  1.0000000000000001e-66  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.557888  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3176  NADH-quinone oxidoreductase, chain I  72.44 
 
 
167 aa  243  1.9999999999999999e-63  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_07460  NADH dehydrogenase subunit I  67.07 
 
 
252 aa  233  9e-61  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.0206751 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0547  NADH-quinone oxidoreductase, chain I  66.27 
 
 
226 aa  232  2.0000000000000002e-60  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.481769 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0477  NADH-quinone oxidoreductase, chain I  65.09 
 
 
300 aa  227  8e-59  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.376416  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0371  NADH-quinone oxidoreductase, chain I  58.16 
 
 
229 aa  170  1e-41  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.839117  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0917  NADH-quinone oxidoreductase, chain I  52.44 
 
 
179 aa  159  2e-38  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.5865  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2235  NADH-quinone oxidoreductase, chain I  54.23 
 
 
165 aa  158  6e-38  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.272952  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3387  NADH-quinone oxidoreductase, chain I  54.23 
 
 
165 aa  156  2e-37  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.533197  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1869  NADH-quinone oxidoreductase chain I  55.73 
 
 
177 aa  154  6e-37  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3216  NADH-quinone oxidoreductase, chain I  51.01 
 
 
168 aa  154  6e-37  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1157  NADH-quinone oxidoreductase, chain I  54.74 
 
 
177 aa  153  1e-36  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1275  NADH-quinone oxidoreductase, chain I  52.67 
 
 
199 aa  146  1.0000000000000001e-34  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1845  NADH-quinone oxidoreductase, chain I  48.53 
 
 
175 aa  136  2e-31  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3434  NADH dehydrogenase subunit I  46.38 
 
 
176 aa  130  2.0000000000000002e-29  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.460482  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0163  NADH dehydrogenase subunit I  44.2 
 
 
184 aa  127  1.0000000000000001e-28  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1041  NADH-quinone oxidoreductase, chain I  54.23 
 
 
165 aa  127  1.0000000000000001e-28  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0211  NADH dehydrogenase subunit I  46.32 
 
 
176 aa  124  7e-28  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7011  NADH-quinone oxidoreductase, chain I  46.32 
 
 
169 aa  122  3e-27  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3818  NADH-quinone oxidoreductase, chain I  44.78 
 
 
171 aa  120  9.999999999999999e-27  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.121238  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3336  NADH dehydrogenase subunit I  44.7 
 
 
162 aa  119  3e-26  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.463064  normal  0.437664 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1374  NADH dehydrogenase I chain I  43.36 
 
 
175 aa  119  3e-26  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  decreased coverage  0.00228535  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1238  NADH-quinone oxidoreductase, chain I  40.14 
 
 
181 aa  118  4.9999999999999996e-26  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0980  NADH dehydrogenase subunit I  40.12 
 
 
169 aa  118  6e-26  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1020  NADH dehydrogenase subunit I  42.11 
 
 
171 aa  118  6e-26  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.755319  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0172  NADH dehydrogenase subunit I  42.03 
 
 
176 aa  117  7.999999999999999e-26  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0154  NADH dehydrogenase subunit I  41.3 
 
 
176 aa  116  1.9999999999999998e-25  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.947551 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2523  NADH dehydrogenase subunit I  42.22 
 
 
167 aa  115  3.9999999999999997e-25  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.208294  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1185  NADH dehydrogenase subunit I  42.22 
 
 
167 aa  115  3.9999999999999997e-25  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0684834  normal  0.389473 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4080  NADH-quinone oxidoreductase, chain I  43.51 
 
 
197 aa  115  3.9999999999999997e-25  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.0562629 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3125  NADH dehydrogenase subunit I  41.22 
 
 
179 aa  114  6e-25  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1352  NADH dehydrogenase subunit I  38.52 
 
 
171 aa  114  6.9999999999999995e-25  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1696  NADH dehydrogenase subunit I  48.78 
 
 
164 aa  114  6.9999999999999995e-25  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  hitchhiker  0.00251501  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR0810  NADH dehydrogenase subunit I  43.08 
 
 
163 aa  114  1.0000000000000001e-24  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.719018  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3372  NADH dehydrogenase I, I subunit  43.48 
 
 
182 aa  114  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.675448  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1120  NADH dehydrogenase subunit I  43.51 
 
 
180 aa  114  1.0000000000000001e-24  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.311189  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1043  NADH dehydrogenase subunit I  42.54 
 
 
163 aa  114  1.0000000000000001e-24  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4074  NADH-quinone oxidoreductase, chain I  43.7 
 
 
165 aa  114  1.0000000000000001e-24  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.138304  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0805  NADH dehydrogenase subunit I  43.08 
 
 
163 aa  114  1.0000000000000001e-24  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0935  NADH dehydrogenase subunit I  40.14 
 
 
163 aa  113  1.0000000000000001e-24  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.13658  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4126  NADH dehydrogenase subunit I  41.98 
 
 
182 aa  113  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1866  NADH dehydrogenase subunit I  41.98 
 
 
182 aa  113  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.0422789 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1997  NADH dehydrogenase subunit I  41.48 
 
 
167 aa  113  2.0000000000000002e-24  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0446418  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1739  NADH dehydrogenase subunit I  41.98 
 
 
182 aa  113  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.235938  normal  0.220023 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0829  NADH dehydrogenase subunit I  43.18 
 
 
163 aa  113  2.0000000000000002e-24  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.260339  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2412  NADH dehydrogenase subunit I  41.84 
 
 
162 aa  112  2.0000000000000002e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0701412  normal  0.0109704 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3698  NADH dehydrogenase subunit I  41.98 
 
 
182 aa  113  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.380267  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2415  NADH dehydrogenase subunit I  43.18 
 
 
163 aa  113  2.0000000000000002e-24  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.87535  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0969  NADH dehydrogenase subunit I  40.14 
 
 
163 aa  112  3e-24  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0765514  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2212  NADH dehydrogenase subunit I  41.84 
 
 
162 aa  112  3e-24  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.199823  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3627  NADH dehydrogenase subunit I  40.46 
 
 
164 aa  112  3e-24  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.0704772 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4625  NADH dehydrogenase subunit I  43.18 
 
 
162 aa  112  4.0000000000000004e-24  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.11536 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3290  NADH dehydrogenase subunit I  41.84 
 
 
162 aa  112  4.0000000000000004e-24  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.221287  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3204  NADH dehydrogenase subunit I  42.75 
 
 
182 aa  112  4.0000000000000004e-24  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0843328  normal  0.169624 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3610  NADH dehydrogenase subunit I  41.98 
 
 
182 aa  112  4.0000000000000004e-24  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.487333  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2582  NADH dehydrogenase subunit I  41.84 
 
 
162 aa  112  4.0000000000000004e-24  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.561308  normal  0.2116 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5106  NADH-quinone oxidoreductase, chain I  43.61 
 
 
188 aa  112  4.0000000000000004e-24  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2877  NADH dehydrogenase subunit I  41.84 
 
 
162 aa  112  4.0000000000000004e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.670141  normal  0.245456 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0711  NADH-quinone oxidoreductase, chain I  42.75 
 
 
170 aa  112  4.0000000000000004e-24  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0425782  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1113  NADH-quinone oxidoreductase, chain I  41.79 
 
 
170 aa  111  5e-24  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.182151  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0323  NADH dehydrogenase subunit I  39.86 
 
 
176 aa  111  6e-24  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4553  NADH dehydrogenase subunit I  43.18 
 
 
162 aa  111  6e-24  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.128776 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2053  NADH dehydrogenase subunit I  41.91 
 
 
163 aa  111  7.000000000000001e-24  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.330204  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1692  NADH dehydrogenase subunit I  41.22 
 
 
182 aa  111  7.000000000000001e-24  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1743  NADH dehydrogenase subunit I  47.97 
 
 
164 aa  111  8.000000000000001e-24  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  decreased coverage  0.00386762  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0107  NADH dehydrogenase subunit I  47.97 
 
 
164 aa  111  8.000000000000001e-24  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.807538  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05703  hypothetical protein similar to : Formate hydrogenlyase subunit 6/NADH:ubiquinone oxidoreductase 23 kD subunit (Broad)  41.98 
 
 
224 aa  110  1.0000000000000001e-23  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.803618 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2054  NADH dehydrogenase subunit I  38.78 
 
 
163 aa  110  1.0000000000000001e-23  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.151951 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0957  NADH dehydrogenase subunit I  44.7 
 
 
162 aa  110  1.0000000000000001e-23  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0765322  normal  0.470027 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1879  NADH dehydrogenase subunit I  40.43 
 
 
162 aa  110  1.0000000000000001e-23  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.508831  normal  0.262119 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2206  NADH dehydrogenase subunit I  38.78 
 
 
163 aa  110  1.0000000000000001e-23  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1099  NADH dehydrogenase subunit I  42.42 
 
 
162 aa  110  1.0000000000000001e-23  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4398  NADH dehydrogenase subunit I  41.67 
 
 
162 aa  110  1.0000000000000001e-23  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2543  NADH dehydrogenase subunit I  40.58 
 
 
180 aa  110  1.0000000000000001e-23  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.879169  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1883  NADH dehydrogenase subunit I  38.78 
 
 
163 aa  110  1.0000000000000001e-23  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.604396 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>