More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfum_1940 on replicon NC_008554
Organism: Syntrophobacter fumaroxidans MPOB



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008554  Sfum_1940  NADH dehydrogenase subunit I  100 
 
 
178 aa  370  1e-102  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.509162 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0323  NADH dehydrogenase subunit I  64.91 
 
 
176 aa  234  4e-61  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3434  NADH dehydrogenase subunit I  65.88 
 
 
176 aa  233  1.0000000000000001e-60  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.460482  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0163  NADH dehydrogenase subunit I  64.91 
 
 
184 aa  227  6e-59  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0172  NADH dehydrogenase subunit I  59.06 
 
 
176 aa  222  2e-57  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0154  NADH dehydrogenase subunit I  57.89 
 
 
176 aa  218  1.9999999999999999e-56  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.947551 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0211  NADH dehydrogenase subunit I  57.39 
 
 
176 aa  212  1.9999999999999998e-54  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3818  NADH-quinone oxidoreductase, chain I  62.11 
 
 
171 aa  203  1e-51  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.121238  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3125  NADH dehydrogenase subunit I  55.62 
 
 
179 aa  201  4e-51  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4126  NADH dehydrogenase subunit I  58.54 
 
 
182 aa  193  1e-48  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3698  NADH dehydrogenase subunit I  58.54 
 
 
182 aa  193  1e-48  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.380267  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1866  NADH dehydrogenase subunit I  58.54 
 
 
182 aa  193  1e-48  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.0422789 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1739  NADH dehydrogenase subunit I  58.54 
 
 
182 aa  193  1e-48  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.235938  normal  0.220023 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3301  NADH dehydrogenase subunit I  55.06 
 
 
180 aa  192  3e-48  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.9572 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3204  NADH dehydrogenase subunit I  57.93 
 
 
182 aa  192  3e-48  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0843328  normal  0.169624 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2667  NADH dehydrogenase subunit I  55.62 
 
 
180 aa  191  4e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3610  NADH dehydrogenase subunit I  57.93 
 
 
182 aa  191  4e-48  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.487333  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02206  NADH dehydrogenase subunit I  55.31 
 
 
180 aa  191  5e-48  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1376  NADH-quinone oxidoreductase, chain I  55.31 
 
 
180 aa  191  5e-48  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00237006  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2657  NADH dehydrogenase subunit I  55.31 
 
 
180 aa  191  5e-48  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2435  NADH dehydrogenase subunit I  55.31 
 
 
180 aa  191  5e-48  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02166  hypothetical protein  55.31 
 
 
180 aa  191  5e-48  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1371  NADH dehydrogenase subunit I  55.31 
 
 
180 aa  191  5e-48  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.583652  normal  0.392913 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2574  NADH dehydrogenase subunit I  55.31 
 
 
180 aa  191  5e-48  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2430  NADH dehydrogenase subunit I  55.31 
 
 
180 aa  191  5e-48  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3420  NADH dehydrogenase subunit I  55.31 
 
 
180 aa  191  5e-48  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2505  NADH dehydrogenase subunit I  55.31 
 
 
180 aa  191  7e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2560  NADH dehydrogenase subunit I  55.31 
 
 
180 aa  191  7e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0213368  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2460  NADH dehydrogenase subunit I  55.31 
 
 
180 aa  191  7e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2549  NADH dehydrogenase subunit I  55.31 
 
 
180 aa  191  7e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3372  NADH dehydrogenase I, I subunit  57.32 
 
 
182 aa  190  9e-48  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.675448  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2825  NADH dehydrogenase subunit I  59.12 
 
 
180 aa  189  1e-47  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.339444  normal  0.999371 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1020  NADH dehydrogenase subunit I  54.02 
 
 
171 aa  189  1e-47  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.755319  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_28510  NADH dehydrogenase subunit I  56.71 
 
 
182 aa  189  2e-47  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.559317  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2419  NADH dehydrogenase subunit I  57.32 
 
 
182 aa  189  2e-47  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.193406 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1809  NADH dehydrogenase subunit I  54.19 
 
 
180 aa  189  2e-47  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.693845 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1567  NADH dehydrogenase subunit I  54.19 
 
 
180 aa  189  2e-47  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.997394  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1461  NADH dehydrogenase subunit I  54.19 
 
 
180 aa  189  2e-47  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1120  NADH dehydrogenase subunit I  55.56 
 
 
180 aa  188  2.9999999999999997e-47  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.311189  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2562  NADH dehydrogenase subunit I  56.71 
 
 
182 aa  187  8e-47  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_29920  NADH dehydrogenase subunit I  56.71 
 
 
182 aa  187  8e-47  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.546828  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1401  NADH dehydrogenase subunit I  53.07 
 
 
180 aa  185  3e-46  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.590324  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1113  NADH-quinone oxidoreductase, chain I  57.14 
 
 
170 aa  185  4e-46  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.182151  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2543  NADH dehydrogenase subunit I  52.51 
 
 
180 aa  184  8e-46  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.879169  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1692  NADH dehydrogenase subunit I  58.23 
 
 
182 aa  183  1.0000000000000001e-45  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2765  NADH dehydrogenase subunit I  51.96 
 
 
180 aa  182  2.0000000000000003e-45  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.128685  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1499  NADH dehydrogenase subunit I  51.96 
 
 
180 aa  182  2.0000000000000003e-45  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1014  NADH dehydrogenase subunit I  52.02 
 
 
180 aa  181  6e-45  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0711  NADH-quinone oxidoreductase, chain I  57.14 
 
 
170 aa  181  7e-45  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0425782  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2867  NADH-quinone oxidoreductase, chain I  56.1 
 
 
171 aa  179  2e-44  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.708253  normal  0.0292468 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1352  NADH dehydrogenase subunit I  56.96 
 
 
171 aa  175  3e-43  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1333  NADH dehydrogenase subunit I  57.96 
 
 
171 aa  172  1.9999999999999998e-42  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0374  NADH dehydrogenase subunit I  52.83 
 
 
180 aa  169  2e-41  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0591  NADH dehydrogenase subunit I  56.33 
 
 
182 aa  168  3e-41  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0623179  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4064  NADH dehydrogenase subunit I  55.06 
 
 
171 aa  168  4e-41  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0149353  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0580  NADH dehydrogenase subunit I  56.33 
 
 
182 aa  168  4e-41  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0627884  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1354  NADH dehydrogenase subunit I  56.33 
 
 
171 aa  168  5e-41  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.253044  normal  0.161644 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4736  NADH dehydrogenase subunit I  54.14 
 
 
173 aa  166  2e-40  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.161018  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1696  NADH dehydrogenase subunit I  54.14 
 
 
164 aa  157  8e-38  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  hitchhiker  0.00251501  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1743  NADH dehydrogenase subunit I  53.5 
 
 
164 aa  152  2.9999999999999998e-36  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  decreased coverage  0.00386762  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0107  NADH dehydrogenase subunit I  52.87 
 
 
164 aa  151  5e-36  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.807538  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1275  NADH-quinone oxidoreductase, chain I  41.51 
 
 
199 aa  120  9.999999999999999e-27  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0917  NADH-quinone oxidoreductase, chain I  46.48 
 
 
179 aa  119  1.9999999999999998e-26  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.5865  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1869  NADH-quinone oxidoreductase chain I  38.1 
 
 
177 aa  116  1.9999999999999998e-25  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6674  NADH dehydrogenase subunit I  44.27 
 
 
188 aa  115  1.9999999999999998e-25  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1282  NADH-quinone oxidoreductase chain I  40.91 
 
 
185 aa  113  1.0000000000000001e-24  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.425102 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3615  NADH-quinone oxidoreductase, chain I  43.7 
 
 
211 aa  112  2.0000000000000002e-24  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3387  NADH-quinone oxidoreductase, chain I  46.32 
 
 
165 aa  112  2.0000000000000002e-24  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.533197  normal 
 
 
-
 
NC_002978  WD0980  NADH dehydrogenase subunit I  42.14 
 
 
169 aa  112  3e-24  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4550  NADH-quinone oxidoreductase, chain I  39.01 
 
 
211 aa  111  4.0000000000000004e-24  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4080  NADH-quinone oxidoreductase, chain I  46.81 
 
 
197 aa  112  4.0000000000000004e-24  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.0562629 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7011  NADH-quinone oxidoreductase, chain I  40.14 
 
 
169 aa  111  6e-24  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2235  NADH-quinone oxidoreductase, chain I  45.59 
 
 
165 aa  111  6e-24  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.272952  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5106  NADH-quinone oxidoreductase, chain I  44.6 
 
 
188 aa  111  6e-24  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009370  OSTLU_18502  predicted protein  42.96 
 
 
167 aa  110  7.000000000000001e-24  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.0613487 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_03240  NADH dehydrogenase subunit I  41.54 
 
 
187 aa  110  1.0000000000000001e-23  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0929  NADH dehydrogenase subunit I  42.97 
 
 
163 aa  110  2.0000000000000002e-23  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3336  NADH dehydrogenase subunit I  42.19 
 
 
162 aa  108  3e-23  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.463064  normal  0.437664 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1542  NADH dehydrogenase subunit I  37.29 
 
 
174 aa  109  3e-23  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.383544  normal  0.0726132 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1572  NADH dehydrogenase subunit I  41.1 
 
 
174 aa  108  4.0000000000000004e-23  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3216  NADH-quinone oxidoreductase, chain I  43.88 
 
 
168 aa  108  4.0000000000000004e-23  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1596  NADH dehydrogenase subunit I  41.1 
 
 
174 aa  108  4.0000000000000004e-23  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.557888  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1238  NADH-quinone oxidoreductase, chain I  42.25 
 
 
181 aa  108  5e-23  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6086  NADH dehydrogenase subunit I  40.77 
 
 
211 aa  107  8.000000000000001e-23  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  decreased coverage  0.00224994  normal  0.0520295 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0289  NADH-quinone oxidoreductase, chain I  41.22 
 
 
171 aa  107  8.000000000000001e-23  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.998746  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1845  NADH-quinone oxidoreductase, chain I  40.71 
 
 
175 aa  107  1e-22  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1877  NADH dehydrogenase subunit I  40.46 
 
 
174 aa  107  1e-22  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0825  NADH dehydrogenase subunit I  43.65 
 
 
163 aa  106  2e-22  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1660  NADH-quinone oxidoreductase, chain I  42.52 
 
 
234 aa  106  2e-22  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0546  NADH dehydrogenase subunit I  40 
 
 
217 aa  106  2e-22  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.175795  normal  0.434998 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1187  NADH dehydrogenase subunit I  42.19 
 
 
164 aa  106  2e-22  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.438944  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4455  NADH dehydrogenase subunit I  36.5 
 
 
211 aa  105  2e-22  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.829117  normal  0.833546 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1301  NADH dehydrogenase subunit I  41.18 
 
 
162 aa  106  2e-22  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  decreased coverage  0.00320411  normal  0.488956 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1043  NADH dehydrogenase subunit I  39.44 
 
 
163 aa  105  3e-22  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7683  NADH-quinone oxidoreductase, chain I  39.55 
 
 
203 aa  105  3e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1563  NADH dehydrogenase subunit I  41.91 
 
 
162 aa  105  3e-22  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.339949  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4057  NADH dehydrogenase subunit I  36.5 
 
 
211 aa  105  3e-22  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.819652  normal  0.545712 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3176  NADH-quinone oxidoreductase, chain I  40.3 
 
 
167 aa  105  3e-22  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0957  NADH dehydrogenase subunit I  37.67 
 
 
162 aa  105  4e-22  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0765322  normal  0.470027 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1374  NADH dehydrogenase I chain I  38.97 
 
 
175 aa  104  5e-22  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  decreased coverage  0.00228535  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>