More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rsph17025_1696 on replicon NC_009428
Organism: Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009428  Rsph17025_1696  NADH dehydrogenase subunit I  100 
 
 
164 aa  335  9.999999999999999e-92  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  hitchhiker  0.00251501  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0107  NADH dehydrogenase subunit I  96.34 
 
 
164 aa  325  1.0000000000000001e-88  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.807538  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1743  NADH dehydrogenase subunit I  95.73 
 
 
164 aa  324  4.0000000000000003e-88  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  decreased coverage  0.00386762  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4064  NADH dehydrogenase subunit I  70.18 
 
 
171 aa  238  2e-62  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0149353  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1333  NADH dehydrogenase subunit I  69.01 
 
 
171 aa  234  4e-61  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1354  NADH dehydrogenase subunit I  69.01 
 
 
171 aa  233  6e-61  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.253044  normal  0.161644 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4736  NADH dehydrogenase subunit I  66.86 
 
 
173 aa  227  6e-59  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.161018  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2549  NADH dehydrogenase subunit I  64.24 
 
 
180 aa  212  1.9999999999999998e-54  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2505  NADH dehydrogenase subunit I  64.24 
 
 
180 aa  212  1.9999999999999998e-54  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2560  NADH dehydrogenase subunit I  64.24 
 
 
180 aa  212  1.9999999999999998e-54  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0213368  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2667  NADH dehydrogenase subunit I  64.24 
 
 
180 aa  212  1.9999999999999998e-54  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2460  NADH dehydrogenase subunit I  64.24 
 
 
180 aa  212  1.9999999999999998e-54  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02206  NADH dehydrogenase subunit I  63.64 
 
 
180 aa  211  2.9999999999999995e-54  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1376  NADH-quinone oxidoreductase, chain I  63.64 
 
 
180 aa  211  2.9999999999999995e-54  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00237006  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2419  NADH dehydrogenase subunit I  62.87 
 
 
182 aa  211  2.9999999999999995e-54  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.193406 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4126  NADH dehydrogenase subunit I  62.87 
 
 
182 aa  211  2.9999999999999995e-54  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3372  NADH dehydrogenase I, I subunit  62.28 
 
 
182 aa  211  2.9999999999999995e-54  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.675448  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2430  NADH dehydrogenase subunit I  63.64 
 
 
180 aa  211  2.9999999999999995e-54  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1371  NADH dehydrogenase subunit I  63.64 
 
 
180 aa  211  2.9999999999999995e-54  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.583652  normal  0.392913 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_28510  NADH dehydrogenase subunit I  61.68 
 
 
182 aa  211  2.9999999999999995e-54  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.559317  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3698  NADH dehydrogenase subunit I  62.87 
 
 
182 aa  211  2.9999999999999995e-54  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.380267  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1866  NADH dehydrogenase subunit I  62.87 
 
 
182 aa  211  2.9999999999999995e-54  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.0422789 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02166  hypothetical protein  63.64 
 
 
180 aa  211  2.9999999999999995e-54  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2657  NADH dehydrogenase subunit I  63.64 
 
 
180 aa  211  2.9999999999999995e-54  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2574  NADH dehydrogenase subunit I  63.64 
 
 
180 aa  211  2.9999999999999995e-54  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2435  NADH dehydrogenase subunit I  63.64 
 
 
180 aa  211  2.9999999999999995e-54  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1739  NADH dehydrogenase subunit I  62.87 
 
 
182 aa  211  2.9999999999999995e-54  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.235938  normal  0.220023 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3420  NADH dehydrogenase subunit I  63.64 
 
 
180 aa  211  2.9999999999999995e-54  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3610  NADH dehydrogenase subunit I  61.68 
 
 
182 aa  211  3.9999999999999995e-54  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.487333  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2825  NADH dehydrogenase subunit I  62.28 
 
 
180 aa  211  3.9999999999999995e-54  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.339444  normal  0.999371 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2562  NADH dehydrogenase subunit I  61.68 
 
 
182 aa  211  3.9999999999999995e-54  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_29920  NADH dehydrogenase subunit I  61.68 
 
 
182 aa  211  3.9999999999999995e-54  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.546828  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3204  NADH dehydrogenase subunit I  61.68 
 
 
182 aa  210  5.999999999999999e-54  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0843328  normal  0.169624 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2765  NADH dehydrogenase subunit I  62.28 
 
 
180 aa  209  1e-53  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.128685  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1499  NADH dehydrogenase subunit I  62.28 
 
 
180 aa  209  1e-53  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1692  NADH dehydrogenase subunit I  61.4 
 
 
182 aa  209  1e-53  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3301  NADH dehydrogenase subunit I  62.42 
 
 
180 aa  208  2e-53  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.9572 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1461  NADH dehydrogenase subunit I  61.82 
 
 
180 aa  208  3e-53  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1567  NADH dehydrogenase subunit I  61.82 
 
 
180 aa  208  3e-53  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.997394  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1809  NADH dehydrogenase subunit I  61.82 
 
 
180 aa  208  3e-53  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.693845 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2867  NADH-quinone oxidoreductase, chain I  58.48 
 
 
171 aa  207  4e-53  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.708253  normal  0.0292468 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1120  NADH dehydrogenase subunit I  59.88 
 
 
180 aa  207  5e-53  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.311189  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1352  NADH dehydrogenase subunit I  61.4 
 
 
171 aa  207  6e-53  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3125  NADH dehydrogenase subunit I  60.11 
 
 
179 aa  207  6e-53  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2543  NADH dehydrogenase subunit I  62.42 
 
 
180 aa  206  8e-53  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.879169  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1014  NADH dehydrogenase subunit I  62.28 
 
 
180 aa  206  1e-52  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1401  NADH dehydrogenase subunit I  61.82 
 
 
180 aa  205  2e-52  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.590324  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0711  NADH-quinone oxidoreductase, chain I  60.82 
 
 
170 aa  201  3e-51  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0425782  normal 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0374  NADH dehydrogenase subunit I  57.74 
 
 
180 aa  199  1.9999999999999998e-50  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3818  NADH-quinone oxidoreductase, chain I  57.89 
 
 
171 aa  197  7e-50  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.121238  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1113  NADH-quinone oxidoreductase, chain I  56.73 
 
 
170 aa  194  5.000000000000001e-49  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.182151  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1020  NADH dehydrogenase subunit I  56.73 
 
 
171 aa  192  2e-48  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.755319  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0591  NADH dehydrogenase subunit I  58.93 
 
 
182 aa  191  4e-48  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0623179  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0580  NADH dehydrogenase subunit I  58.93 
 
 
182 aa  191  5e-48  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0627884  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3434  NADH dehydrogenase subunit I  54.12 
 
 
176 aa  170  7.999999999999999e-42  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.460482  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0163  NADH dehydrogenase subunit I  52.35 
 
 
184 aa  170  1e-41  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0172  NADH dehydrogenase subunit I  48.24 
 
 
176 aa  160  1e-38  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0323  NADH dehydrogenase subunit I  50 
 
 
176 aa  159  2e-38  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0154  NADH dehydrogenase subunit I  48.24 
 
 
176 aa  158  3e-38  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.947551 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0211  NADH dehydrogenase subunit I  50.59 
 
 
176 aa  157  6e-38  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1940  NADH dehydrogenase subunit I  54.14 
 
 
178 aa  157  6e-38  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.509162 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1275  NADH-quinone oxidoreductase, chain I  46 
 
 
199 aa  128  3e-29  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1869  NADH-quinone oxidoreductase chain I  45.33 
 
 
177 aa  127  5.0000000000000004e-29  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0917  NADH-quinone oxidoreductase, chain I  44.05 
 
 
179 aa  124  8.000000000000001e-28  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.5865  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2235  NADH-quinone oxidoreductase, chain I  50 
 
 
165 aa  118  3.9999999999999996e-26  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.272952  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3387  NADH-quinone oxidoreductase, chain I  50.77 
 
 
165 aa  117  7.999999999999999e-26  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.533197  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0547  NADH-quinone oxidoreductase, chain I  46.81 
 
 
226 aa  116  9.999999999999999e-26  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.481769 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0394  NADH-quinone oxidoreductase, chain I  51.24 
 
 
175 aa  116  9.999999999999999e-26  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1157  NADH-quinone oxidoreductase, chain I  52.38 
 
 
177 aa  116  9.999999999999999e-26  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0592  Formate hydrogenlyase subunit 6/NADH:ubiquinone oxidoreductase 23 kD subunit (chain I)-like protein  51.24 
 
 
171 aa  115  3e-25  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4410  NADH-quinone oxidoreductase, chain I  48.78 
 
 
194 aa  114  3.9999999999999997e-25  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0969  NADH dehydrogenase subunit I  40.88 
 
 
163 aa  114  7.999999999999999e-25  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0765514  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2687  NADH dehydrogenase subunit I  49.59 
 
 
183 aa  113  1.0000000000000001e-24  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0721276  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2054  NADH dehydrogenase subunit I  41.61 
 
 
163 aa  112  2.0000000000000002e-24  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.151951 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1282  NADH-quinone oxidoreductase chain I  44.44 
 
 
185 aa  112  2.0000000000000002e-24  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.425102 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1883  NADH dehydrogenase subunit I  41.61 
 
 
163 aa  112  2.0000000000000002e-24  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.604396 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1043  NADH dehydrogenase subunit I  42.86 
 
 
163 aa  112  2.0000000000000002e-24  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2206  NADH dehydrogenase subunit I  41.61 
 
 
163 aa  112  2.0000000000000002e-24  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0275  NADH dehydrogenase subunit I  47.93 
 
 
199 aa  112  2.0000000000000002e-24  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1187  NADH dehydrogenase subunit I  44.63 
 
 
164 aa  112  3e-24  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.438944  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3216  NADH-quinone oxidoreductase, chain I  45.45 
 
 
168 aa  112  3e-24  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5061  NADH-quinone oxidoreductase, chain I  48.78 
 
 
185 aa  112  3e-24  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.451376  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0935  NADH dehydrogenase subunit I  40.88 
 
 
163 aa  112  3e-24  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.13658  normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0829  NADH dehydrogenase subunit I  42.86 
 
 
163 aa  111  4.0000000000000004e-24  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.260339  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0754  NADH dehydrogenase subunit I  43.8 
 
 
164 aa  110  8.000000000000001e-24  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.180315  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0528  NADH dehydrogenase subunit I  48.03 
 
 
196 aa  109  1.0000000000000001e-23  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2708  NADH-quinone oxidoreductase, chain I  47.11 
 
 
247 aa  110  1.0000000000000001e-23  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_03240  NADH dehydrogenase subunit I  45.59 
 
 
187 aa  108  2.0000000000000002e-23  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7011  NADH-quinone oxidoreductase, chain I  41.48 
 
 
169 aa  109  2.0000000000000002e-23  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6086  NADH dehydrogenase subunit I  46.32 
 
 
211 aa  109  2.0000000000000002e-23  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  decreased coverage  0.00224994  normal  0.0520295 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4550  NADH-quinone oxidoreductase, chain I  46.72 
 
 
211 aa  108  2.0000000000000002e-23  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6674  NADH dehydrogenase subunit I  45.59 
 
 
188 aa  109  2.0000000000000002e-23  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2523  NADH dehydrogenase subunit I  42.42 
 
 
167 aa  108  3e-23  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.208294  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1185  NADH dehydrogenase subunit I  42.42 
 
 
167 aa  108  3e-23  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0684834  normal  0.389473 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1030  NADH dehydrogenase subunit I  40.3 
 
 
163 aa  108  3e-23  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.206882  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1997  NADH dehydrogenase subunit I  42.11 
 
 
167 aa  108  3e-23  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0446418  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0546  NADH dehydrogenase subunit I  46.72 
 
 
217 aa  108  4.0000000000000004e-23  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.175795  normal  0.434998 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1150  NADH dehydrogenase subunit I  41.54 
 
 
162 aa  108  5e-23  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0825  NADH dehydrogenase subunit I  39.31 
 
 
163 aa  108  5e-23  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1099  NADH dehydrogenase subunit I  40.77 
 
 
162 aa  107  5e-23  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>