More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Jden_0547 on replicon NC_013174
Organism: Jonesia denitrificans DSM 20603



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013174  Jden_0547  NADH-quinone oxidoreductase, chain I  100 
 
 
226 aa  470  1e-132  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.481769 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_07460  NADH dehydrogenase subunit I  78.28 
 
 
252 aa  362  2e-99  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.0206751 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0477  NADH-quinone oxidoreductase, chain I  77.07 
 
 
300 aa  335  2.9999999999999997e-91  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.376416  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3221  NADH-quinone oxidoreductase, chain I  79.17 
 
 
254 aa  320  8e-87  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.129277 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2708  NADH-quinone oxidoreductase, chain I  78.95 
 
 
247 aa  313  9.999999999999999e-85  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0528  NADH dehydrogenase subunit I  68.36 
 
 
196 aa  258  4e-68  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0394  NADH-quinone oxidoreductase, chain I  71.01 
 
 
175 aa  252  4.0000000000000004e-66  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1542  NADH dehydrogenase subunit I  68.36 
 
 
174 aa  244  8e-64  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.383544  normal  0.0726132 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1596  NADH dehydrogenase subunit I  68.36 
 
 
174 aa  244  9.999999999999999e-64  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.557888  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1572  NADH dehydrogenase subunit I  68.36 
 
 
174 aa  244  9.999999999999999e-64  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13174  NADH dehydrogenase subunit I  68.36 
 
 
218 aa  240  1e-62  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0546  NADH dehydrogenase subunit I  65.68 
 
 
217 aa  239  2e-62  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.175795  normal  0.434998 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2687  NADH dehydrogenase subunit I  67.47 
 
 
183 aa  237  9e-62  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0721276  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4489  NADH dehydrogenase subunit I  68 
 
 
175 aa  236  2e-61  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.159742 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0289  NADH-quinone oxidoreductase, chain I  70.24 
 
 
171 aa  236  2e-61  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.998746  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6086  NADH dehydrogenase subunit I  63.79 
 
 
211 aa  235  3e-61  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  decreased coverage  0.00224994  normal  0.0520295 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1877  NADH dehydrogenase subunit I  67.65 
 
 
174 aa  234  8e-61  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6674  NADH dehydrogenase subunit I  66.27 
 
 
188 aa  233  2.0000000000000002e-60  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4410  NADH-quinone oxidoreductase, chain I  66.27 
 
 
194 aa  232  3e-60  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7683  NADH-quinone oxidoreductase, chain I  64.88 
 
 
203 aa  231  8.000000000000001e-60  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0592  Formate hydrogenlyase subunit 6/NADH:ubiquinone oxidoreductase 23 kD subunit (chain I)-like protein  65.12 
 
 
171 aa  230  1e-59  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0275  NADH dehydrogenase subunit I  69.7 
 
 
199 aa  228  5e-59  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5061  NADH-quinone oxidoreductase, chain I  64.85 
 
 
185 aa  228  7e-59  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.451376  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3176  NADH-quinone oxidoreductase, chain I  67.48 
 
 
167 aa  227  1e-58  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_03240  NADH dehydrogenase subunit I  64.5 
 
 
187 aa  226  2e-58  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4550  NADH-quinone oxidoreductase, chain I  60.5 
 
 
211 aa  226  2e-58  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0982  NADH-quinone oxidoreductase, chain I  56.28 
 
 
214 aa  226  3e-58  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4057  NADH dehydrogenase subunit I  60.92 
 
 
211 aa  223  2e-57  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.819652  normal  0.545712 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4455  NADH dehydrogenase subunit I  60.92 
 
 
211 aa  223  2e-57  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.829117  normal  0.833546 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1282  NADH-quinone oxidoreductase chain I  59.65 
 
 
185 aa  222  4e-57  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.425102 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0371  NADH-quinone oxidoreductase, chain I  58.57 
 
 
229 aa  164  8e-40  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.839117  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1275  NADH-quinone oxidoreductase, chain I  55.24 
 
 
199 aa  152  2.9999999999999998e-36  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1869  NADH-quinone oxidoreductase chain I  53.96 
 
 
177 aa  149  3e-35  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0917  NADH-quinone oxidoreductase, chain I  54.29 
 
 
179 aa  149  4e-35  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.5865  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2235  NADH-quinone oxidoreductase, chain I  51.45 
 
 
165 aa  140  1.9999999999999998e-32  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.272952  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3387  NADH-quinone oxidoreductase, chain I  50.72 
 
 
165 aa  138  6e-32  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.533197  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3216  NADH-quinone oxidoreductase, chain I  49.66 
 
 
168 aa  137  2e-31  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1845  NADH-quinone oxidoreductase, chain I  42.28 
 
 
175 aa  130  1.0000000000000001e-29  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1157  NADH-quinone oxidoreductase, chain I  46.21 
 
 
177 aa  129  4.0000000000000003e-29  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3336  NADH dehydrogenase subunit I  45.19 
 
 
162 aa  123  2e-27  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.463064  normal  0.437664 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2212  NADH dehydrogenase subunit I  44.44 
 
 
162 aa  123  2e-27  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.199823  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4625  NADH dehydrogenase subunit I  43.7 
 
 
162 aa  123  2e-27  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.11536 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1879  NADH dehydrogenase subunit I  43.7 
 
 
162 aa  122  5e-27  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.508831  normal  0.262119 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3218  NADH dehydrogenase subunit I  44.44 
 
 
163 aa  121  7e-27  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002978  WD0980  NADH dehydrogenase subunit I  43.28 
 
 
169 aa  121  9.999999999999999e-27  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2412  NADH dehydrogenase subunit I  43.7 
 
 
162 aa  120  9.999999999999999e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0701412  normal  0.0109704 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0211  NADH dehydrogenase subunit I  45.21 
 
 
176 aa  120  1.9999999999999998e-26  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4553  NADH dehydrogenase subunit I  43.7 
 
 
162 aa  120  1.9999999999999998e-26  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.128776 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1743  NADH dehydrogenase subunit I  48.23 
 
 
164 aa  120  1.9999999999999998e-26  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  decreased coverage  0.00386762  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2582  NADH dehydrogenase subunit I  43.7 
 
 
162 aa  120  1.9999999999999998e-26  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.561308  normal  0.2116 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0107  NADH dehydrogenase subunit I  48.23 
 
 
164 aa  120  3e-26  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.807538  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2877  NADH dehydrogenase subunit I  43.7 
 
 
162 aa  119  3e-26  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.670141  normal  0.245456 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0805  NADH dehydrogenase subunit I  41.79 
 
 
163 aa  119  3.9999999999999996e-26  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0810  NADH dehydrogenase subunit I  41.79 
 
 
163 aa  119  3.9999999999999996e-26  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.719018  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3290  NADH dehydrogenase subunit I  42.96 
 
 
162 aa  119  3.9999999999999996e-26  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.221287  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0929  NADH dehydrogenase subunit I  42.45 
 
 
163 aa  118  6e-26  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006681  CNL05770  conserved hypothetical protein  42.54 
 
 
273 aa  118  6e-26  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2415  NADH dehydrogenase subunit I  42.22 
 
 
163 aa  119  6e-26  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.87535  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4398  NADH dehydrogenase subunit I  41.48 
 
 
162 aa  118  7e-26  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4134  NADH dehydrogenase subunit I  41.48 
 
 
162 aa  118  7.999999999999999e-26  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.181277  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3627  NADH dehydrogenase subunit I  41.22 
 
 
164 aa  118  7.999999999999999e-26  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.0704772 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2292  NADH dehydrogenase subunit I  42.45 
 
 
161 aa  117  9.999999999999999e-26  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3818  NADH-quinone oxidoreductase, chain I  41.3 
 
 
171 aa  117  9.999999999999999e-26  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.121238  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0898  NADH dehydrogenase subunit I  41.48 
 
 
163 aa  117  9.999999999999999e-26  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0404509  normal 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05703  hypothetical protein similar to : Formate hydrogenlyase subunit 6/NADH:ubiquinone oxidoreductase 23 kD subunit (Broad)  43.61 
 
 
224 aa  116  1.9999999999999998e-25  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.803618 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1238  NADH-quinone oxidoreductase, chain I  41.26 
 
 
181 aa  117  1.9999999999999998e-25  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1077  NADH dehydrogenase subunit I  41.79 
 
 
162 aa  117  1.9999999999999998e-25  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.280148 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1696  NADH dehydrogenase subunit I  46.81 
 
 
164 aa  116  1.9999999999999998e-25  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  hitchhiker  0.00251501  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1301  NADH dehydrogenase subunit I  44.6 
 
 
162 aa  117  1.9999999999999998e-25  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  decreased coverage  0.00320411  normal  0.488956 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1206  NADH dehydrogenase subunit I  41.79 
 
 
162 aa  117  1.9999999999999998e-25  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3434  NADH dehydrogenase subunit I  42.86 
 
 
176 aa  116  3e-25  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.460482  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0163  NADH dehydrogenase subunit I  38.8 
 
 
184 aa  116  3e-25  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2238  NADH dehydrogenase subunit I  42.96 
 
 
163 aa  115  5e-25  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.180184 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2993  NADH dehydrogenase subunit I  44.6 
 
 
161 aa  115  6.9999999999999995e-25  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1322  NADH dehydrogenase subunit I  42.03 
 
 
164 aa  115  6.9999999999999995e-25  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.323962  normal  0.0547108 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1185  NADH dehydrogenase subunit I  41.3 
 
 
167 aa  115  7.999999999999999e-25  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0684834  normal  0.389473 
 
 
-
 
NC_009370  OSTLU_18502  predicted protein  41.01 
 
 
167 aa  115  7.999999999999999e-25  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.0613487 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2523  NADH dehydrogenase subunit I  41.3 
 
 
167 aa  115  7.999999999999999e-25  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.208294  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1187  NADH dehydrogenase subunit I  42.86 
 
 
164 aa  115  7.999999999999999e-25  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.438944  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1997  NADH dehydrogenase subunit I  41.3 
 
 
167 aa  114  7.999999999999999e-25  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0446418  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1030  NADH dehydrogenase subunit I  42.31 
 
 
163 aa  114  8.999999999999998e-25  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.206882  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3372  NADH dehydrogenase I, I subunit  41.92 
 
 
182 aa  114  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.675448  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3204  NADH dehydrogenase subunit I  41.92 
 
 
182 aa  114  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0843328  normal  0.169624 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3610  NADH dehydrogenase subunit I  41.92 
 
 
182 aa  114  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.487333  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2390  NADH dehydrogenase subunit I  42.54 
 
 
162 aa  114  1.0000000000000001e-24  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  hitchhiker  0.0000573568  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1011  NADH dehydrogenase subunit I  41.04 
 
 
162 aa  114  1.0000000000000001e-24  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.210818  normal  0.566427 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0754  NADH dehydrogenase subunit I  42.86 
 
 
164 aa  114  1.0000000000000001e-24  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.180315  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4126  NADH dehydrogenase subunit I  41.92 
 
 
182 aa  113  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1014  NADH dehydrogenase subunit I  41.1 
 
 
180 aa  113  2.0000000000000002e-24  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2460  NADH dehydrogenase subunit I  43.92 
 
 
180 aa  113  2.0000000000000002e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3698  NADH dehydrogenase subunit I  41.92 
 
 
182 aa  113  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.380267  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1866  NADH dehydrogenase subunit I  41.92 
 
 
182 aa  113  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.0422789 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2560  NADH dehydrogenase subunit I  43.92 
 
 
180 aa  113  2.0000000000000002e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0213368  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2667  NADH dehydrogenase subunit I  43.92 
 
 
180 aa  113  2.0000000000000002e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7011  NADH-quinone oxidoreductase, chain I  43.97 
 
 
169 aa  113  2.0000000000000002e-24  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2549  NADH dehydrogenase subunit I  43.92 
 
 
180 aa  113  2.0000000000000002e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1401  NADH dehydrogenase subunit I  41.22 
 
 
180 aa  113  2.0000000000000002e-24  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.590324  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1361  NADH dehydrogenase subunit I  41.04 
 
 
163 aa  114  2.0000000000000002e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.182164  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1739  NADH dehydrogenase subunit I  41.92 
 
 
182 aa  113  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.235938  normal  0.220023 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1723  NADH dehydrogenase subunit I  40 
 
 
163 aa  114  2.0000000000000002e-24  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.341479  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>