More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpop_1011 on replicon NC_010725
Organism: Methylobacterium populi BJ001



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010725  Mpop_1011  NADH dehydrogenase subunit I  100 
 
 
162 aa  337  5.9999999999999996e-92  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.210818  normal  0.566427 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1206  NADH dehydrogenase subunit I  98.15 
 
 
162 aa  332  1e-90  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1077  NADH dehydrogenase subunit I  98.15 
 
 
162 aa  332  1e-90  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.280148 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2051  NADH dehydrogenase subunit I  95.06 
 
 
162 aa  323  7e-88  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.100158  normal  0.722093 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4134  NADH dehydrogenase subunit I  95.06 
 
 
162 aa  322  1e-87  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.181277  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4398  NADH dehydrogenase subunit I  93.83 
 
 
162 aa  321  3e-87  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4625  NADH dehydrogenase subunit I  87.65 
 
 
162 aa  299  1e-80  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.11536 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3218  NADH dehydrogenase subunit I  85 
 
 
163 aa  291  4e-78  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4553  NADH dehydrogenase subunit I  82.72 
 
 
162 aa  288  2e-77  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.128776 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2412  NADH dehydrogenase subunit I  83.33 
 
 
162 aa  288  3e-77  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0701412  normal  0.0109704 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2582  NADH dehydrogenase subunit I  83.33 
 
 
162 aa  287  4e-77  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.561308  normal  0.2116 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2926  NADH dehydrogenase subunit I  83.33 
 
 
162 aa  286  6e-77  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1723  NADH dehydrogenase subunit I  83.23 
 
 
163 aa  286  7e-77  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.341479  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2212  NADH dehydrogenase subunit I  82.72 
 
 
162 aa  286  8e-77  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.199823  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2877  NADH dehydrogenase subunit I  82.72 
 
 
162 aa  286  9e-77  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.670141  normal  0.245456 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1879  NADH dehydrogenase subunit I  82.1 
 
 
162 aa  285  1e-76  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.508831  normal  0.262119 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2415  NADH dehydrogenase subunit I  85.44 
 
 
163 aa  285  2e-76  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.87535  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3290  NADH dehydrogenase subunit I  82.72 
 
 
162 aa  285  2e-76  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.221287  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0898  NADH dehydrogenase subunit I  83.12 
 
 
163 aa  284  2.9999999999999996e-76  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0404509  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR0810  NADH dehydrogenase subunit I  83.23 
 
 
163 aa  283  5e-76  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.719018  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0805  NADH dehydrogenase subunit I  83.23 
 
 
163 aa  283  5.999999999999999e-76  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1361  NADH dehydrogenase subunit I  82.61 
 
 
163 aa  282  1.0000000000000001e-75  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.182164  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2390  NADH dehydrogenase subunit I  80.25 
 
 
162 aa  279  9e-75  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  hitchhiker  0.0000573568  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1030  NADH dehydrogenase subunit I  82.5 
 
 
163 aa  279  1e-74  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.206882  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0786  NADH dehydrogenase subunit I  82.5 
 
 
163 aa  275  1e-73  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.079686  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1269  NADH dehydrogenase subunit I  85.33 
 
 
163 aa  272  1.0000000000000001e-72  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.142775  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2292  NADH dehydrogenase subunit I  75.31 
 
 
161 aa  259  1e-68  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1363  NADH dehydrogenase subunit I  76.4 
 
 
162 aa  258  3e-68  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.353821  normal  0.140777 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1322  NADH dehydrogenase subunit I  75.31 
 
 
164 aa  257  5.0000000000000005e-68  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.323962  normal  0.0547108 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1997  NADH dehydrogenase subunit I  76.58 
 
 
167 aa  256  1e-67  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0446418  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2523  NADH dehydrogenase subunit I  75.95 
 
 
167 aa  253  6e-67  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.208294  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1185  NADH dehydrogenase subunit I  75.95 
 
 
167 aa  253  6e-67  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0684834  normal  0.389473 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1187  NADH dehydrogenase subunit I  75.95 
 
 
164 aa  252  1.0000000000000001e-66  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.438944  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0754  NADH dehydrogenase subunit I  75.95 
 
 
164 aa  253  1.0000000000000001e-66  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.180315  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0929  NADH dehydrogenase subunit I  72.67 
 
 
163 aa  252  1.0000000000000001e-66  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2238  NADH dehydrogenase subunit I  74.05 
 
 
163 aa  252  2.0000000000000002e-66  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.180184 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2824  NADH dehydrogenase subunit I  73.29 
 
 
164 aa  250  6e-66  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.704342  normal  0.0688011 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1563  NADH dehydrogenase subunit I  77.42 
 
 
162 aa  247  6e-65  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.339949  n/a   
 
 
-
 
NC_009370  OSTLU_18502  predicted protein  72.5 
 
 
167 aa  244  3e-64  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.0613487 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3336  NADH dehydrogenase subunit I  71.25 
 
 
162 aa  244  4e-64  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.463064  normal  0.437664 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1301  NADH dehydrogenase subunit I  76.25 
 
 
162 aa  243  8e-64  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  decreased coverage  0.00320411  normal  0.488956 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2993  NADH dehydrogenase subunit I  74.69 
 
 
161 aa  241  3.9999999999999997e-63  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011682  PHATRDRAFT_14260  predicted protein  70.62 
 
 
163 aa  239  1e-62  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0980  NADH dehydrogenase subunit I  67.3 
 
 
169 aa  227  5e-59  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009043  PICST_88630  mitochondrial complex I NUIM TYKY subunit (proton translocation)  65.62 
 
 
226 aa  222  2e-57  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.970128  normal 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05703  hypothetical protein similar to : Formate hydrogenlyase subunit 6/NADH:ubiquinone oxidoreductase 23 kD subunit (Broad)  66.46 
 
 
224 aa  219  9.999999999999999e-57  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.803618 
 
 
-
 
NC_006681  CNL05770  conserved hypothetical protein  69.93 
 
 
273 aa  219  9.999999999999999e-57  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0820  NADH dehydrogenase subunit I  67.35 
 
 
160 aa  215  2.9999999999999998e-55  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0691  NADH dehydrogenase subunit I  64.15 
 
 
169 aa  213  9.999999999999999e-55  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.438917  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0361  NADH dehydrogenase subunit I  68.06 
 
 
167 aa  211  3.9999999999999995e-54  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.326031  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1962  NADH dehydrogenase subunit I  61.88 
 
 
163 aa  207  4e-53  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.528282  normal  0.0448739 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0957  NADH dehydrogenase subunit I  61.25 
 
 
162 aa  199  1.9999999999999998e-50  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0765322  normal  0.470027 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1043  NADH dehydrogenase subunit I  59.01 
 
 
163 aa  194  6e-49  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0829  NADH dehydrogenase subunit I  57.76 
 
 
163 aa  192  2e-48  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.260339  normal 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1609  NADH dehydrogenase subunit I  59.01 
 
 
163 aa  190  6e-48  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0554  NADH dehydrogenase subunit I  59.01 
 
 
168 aa  190  6e-48  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2054  NADH dehydrogenase subunit I  59.26 
 
 
163 aa  188  2e-47  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.151951 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2206  NADH dehydrogenase subunit I  59.26 
 
 
163 aa  188  2e-47  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1883  NADH dehydrogenase subunit I  59.26 
 
 
163 aa  188  2e-47  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.604396 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1956  NADH-quinone oxidoreductase, chain I  59.38 
 
 
162 aa  187  5e-47  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.198639  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1750  NADH dehydrogenase subunit I  61.69 
 
 
161 aa  186  1e-46  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1099  NADH dehydrogenase subunit I  56.52 
 
 
162 aa  185  3e-46  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3248  NADH dehydrogenase subunit I  59.74 
 
 
165 aa  184  3e-46  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.779883  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3502  NADH dehydrogenase subunit I  58.44 
 
 
181 aa  181  4.0000000000000006e-45  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1432  NADH dehydrogenase subunit I  58.44 
 
 
165 aa  181  4.0000000000000006e-45  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.277545  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0716  NADH-quinone oxidoreductase, chain I  65.94 
 
 
162 aa  181  4.0000000000000006e-45  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.479335  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1411  NADH dehydrogenase subunit I  55.28 
 
 
165 aa  181  4.0000000000000006e-45  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.0328529 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1150  NADH dehydrogenase subunit I  57.14 
 
 
162 aa  180  6e-45  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3206  NADH dehydrogenase subunit I  57.42 
 
 
162 aa  180  7e-45  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00643522  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1351  NADH dehydrogenase subunit I  57.42 
 
 
162 aa  180  8.000000000000001e-45  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0309776  hitchhiker  0.0086006 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0994  NADH dehydrogenase subunit I  60.65 
 
 
163 aa  180  9.000000000000001e-45  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2622  NADH dehydrogenase subunit I  56.33 
 
 
163 aa  179  1e-44  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2249  NADH dehydrogenase subunit I  56.33 
 
 
163 aa  179  1e-44  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.650546  hitchhiker  0.0000391532 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2001  NADH dehydrogenase subunit I  57.42 
 
 
162 aa  179  1e-44  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0496982 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0969  NADH dehydrogenase subunit I  61.04 
 
 
163 aa  179  2e-44  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0765514  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0825  NADH dehydrogenase subunit I  55.62 
 
 
163 aa  179  2e-44  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0935  NADH dehydrogenase subunit I  61.04 
 
 
163 aa  177  4.999999999999999e-44  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.13658  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2053  NADH dehydrogenase subunit I  56.52 
 
 
163 aa  177  7e-44  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.330204  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1757  NADH dehydrogenase subunit I  55.28 
 
 
163 aa  176  8e-44  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2823  NADH dehydrogenase subunit I  63.31 
 
 
162 aa  176  9e-44  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0530625  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0277  NADH dehydrogenase subunit I  60.99 
 
 
162 aa  176  2e-43  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.587133  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01295  NADH dehydrogenase subunit I  62.59 
 
 
162 aa  176  2e-43  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.356089  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0248  NADH dehydrogenase subunit I  60.99 
 
 
162 aa  176  2e-43  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1509  NADH dehydrogenase subunit I  55.62 
 
 
165 aa  174  5e-43  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00304735 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2557  NADH dehydrogenase subunit I  59.71 
 
 
162 aa  174  6e-43  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.840778  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1501  NADH dehydrogenase subunit I  56.17 
 
 
177 aa  172  1.9999999999999998e-42  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0649483  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0965  NADH dehydrogenase subunit I  58.06 
 
 
170 aa  171  2.9999999999999996e-42  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.837483  normal  0.0693949 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1069  NADH dehydrogenase subunit I  55.62 
 
 
162 aa  171  2.9999999999999996e-42  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.74272  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5172  NADH dehydrogenase subunit I  57.42 
 
 
169 aa  171  5.999999999999999e-42  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.950727  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1138  NADH dehydrogenase subunit I  55.62 
 
 
162 aa  170  9e-42  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.299701  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0421  NADH dehydrogenase subunit I  55.62 
 
 
162 aa  170  9e-42  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.735915  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1307  NADH dehydrogenase subunit I  55.62 
 
 
162 aa  170  9e-42  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.91191  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1821  NADH dehydrogenase subunit I  55.62 
 
 
162 aa  170  9e-42  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1443  NADH dehydrogenase subunit I  55.62 
 
 
162 aa  170  9e-42  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.798759  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0729  NADH dehydrogenase subunit I  55.62 
 
 
162 aa  170  9e-42  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.384636  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1298  NADH dehydrogenase subunit I  55 
 
 
162 aa  169  1e-41  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0880  NADH dehydrogenase subunit I  57.42 
 
 
170 aa  169  1e-41  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3627  NADH dehydrogenase subunit I  51.25 
 
 
164 aa  169  1e-41  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.0704772 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5569  NADH dehydrogenase subunit I  55 
 
 
162 aa  168  3e-41  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.156755 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2265  NADH dehydrogenase subunit I  55 
 
 
162 aa  167  8e-41  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.477325  normal  0.254179 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>