More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GSU3434 on replicon NC_002939
Organism: Geobacter sulfurreducens PCA



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002939  GSU3434  NADH dehydrogenase subunit I  100 
 
 		 176 aa  359  1e-98  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.460482  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0163  NADH dehydrogenase subunit I  93.18 
 
 		 184 aa  337  7e-92  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0323  NADH dehydrogenase subunit I  82.95 
 
 		 176 aa  305  3e-82  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0172  NADH dehydrogenase subunit I  71.59 
 
 		 176 aa  270  7e-72  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0154  NADH dehydrogenase subunit I  71.59 
 
 		 176 aa  267  7e-71  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.947551 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0211  NADH dehydrogenase subunit I  67.61 
 
 		 176 aa  254  5e-67  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1940  NADH dehydrogenase subunit I  65.88 
 
 		 178 aa  233  1.0000000000000001e-60  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.509162 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3818  NADH-quinone oxidoreductase, chain I  60.37 
 
 		 171 aa  211  3.9999999999999995e-54  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.121238  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_28510  NADH dehydrogenase subunit I  61.21 
 
 		 182 aa  207  6e-53  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.559317  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3610  NADH dehydrogenase subunit I  61.21 
 
 		 182 aa  206  1e-52  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.487333  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1020  NADH dehydrogenase subunit I  59.76 
 
 		 171 aa  205  3e-52  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.755319  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4126  NADH dehydrogenase subunit I  60 
 
 		 182 aa  204  5e-52  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1866  NADH dehydrogenase subunit I  60 
 
 		 182 aa  204  5e-52  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0422789 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1739  NADH dehydrogenase subunit I  60 
 
 		 182 aa  204  5e-52  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.235938  normal  0.220023 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3698  NADH dehydrogenase subunit I  60 
 
 		 182 aa  204  5e-52  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.380267  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2419  NADH dehydrogenase subunit I  60 
 
 		 182 aa  203  9e-52  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.193406 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1120  NADH dehydrogenase subunit I  55.56 
 
 		 180 aa  203  1e-51  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.311189  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3372  NADH dehydrogenase I, I subunit  59.15 
 
 		 182 aa  202  2e-51  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.675448  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3204  NADH dehydrogenase subunit I  59.15 
 
 		 182 aa  202  2e-51  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0843328  normal  0.169624 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2562  NADH dehydrogenase subunit I  59.39 
 
 		 182 aa  202  2e-51  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_29920  NADH dehydrogenase subunit I  59.39 
 
 		 182 aa  202  2e-51  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.546828  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3125  NADH dehydrogenase subunit I  60.37 
 
 		 179 aa  202  3e-51  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1352  NADH dehydrogenase subunit I  60.37 
 
 		 171 aa  201  5e-51  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1113  NADH-quinone oxidoreductase, chain I  59.76 
 
 		 170 aa  200  9.999999999999999e-51  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.182151  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1567  NADH dehydrogenase subunit I  56.57 
 
 		 180 aa  197  9e-50  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.997394  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1809  NADH dehydrogenase subunit I  56.57 
 
 		 180 aa  197  9e-50  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.693845 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1461  NADH dehydrogenase subunit I  56.57 
 
 		 180 aa  197  9e-50  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1014  NADH dehydrogenase subunit I  55 
 
 		 180 aa  196  1.0000000000000001e-49  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2543  NADH dehydrogenase subunit I  54.86 
 
 		 180 aa  195  3e-49  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.879169  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1401  NADH dehydrogenase subunit I  55.43 
 
 		 180 aa  195  3e-49  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.590324  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3301  NADH dehydrogenase subunit I  56 
 
 		 180 aa  194  6e-49  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.9572 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1692  NADH dehydrogenase subunit I  56.21 
 
 		 182 aa  193  1e-48  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2560  NADH dehydrogenase subunit I  55.43 
 
 		 180 aa  192  3e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0213368  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2549  NADH dehydrogenase subunit I  55.43 
 
 		 180 aa  192  3e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0711  NADH-quinone oxidoreductase, chain I  58.33 
 
 		 170 aa  192  3e-48  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0425782  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2460  NADH dehydrogenase subunit I  55.43 
 
 		 180 aa  192  3e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2505  NADH dehydrogenase subunit I  55.43 
 
 		 180 aa  192  3e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2765  NADH dehydrogenase subunit I  53.71 
 
 		 180 aa  191  3e-48  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.128685  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1499  NADH dehydrogenase subunit I  53.71 
 
 		 180 aa  192  3e-48  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02206  NADH dehydrogenase subunit I  55.43 
 
 		 180 aa  191  4e-48  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1376  NADH-quinone oxidoreductase, chain I  55.43 
 
 		 180 aa  191  4e-48  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00237006  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2435  NADH dehydrogenase subunit I  55.43 
 
 		 180 aa  191  4e-48  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02166  hypothetical protein  55.43 
 
 		 180 aa  191  4e-48  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3420  NADH dehydrogenase subunit I  55.43 
 
 		 180 aa  191  4e-48  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2657  NADH dehydrogenase subunit I  55.43 
 
 		 180 aa  191  4e-48  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2574  NADH dehydrogenase subunit I  55.43 
 
 		 180 aa  191  4e-48  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1371  NADH dehydrogenase subunit I  55.43 
 
 		 180 aa  191  4e-48  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.583652  normal  0.392913 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2430  NADH dehydrogenase subunit I  55.43 
 
 		 180 aa  191  4e-48  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2667  NADH dehydrogenase subunit I  54.86 
 
 		 180 aa  189  1e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2867  NADH-quinone oxidoreductase, chain I  58.54 
 
 		 171 aa  190  1e-47  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.708253  normal  0.0292468 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2825  NADH dehydrogenase subunit I  59.49 
 
 		 180 aa  188  2.9999999999999997e-47  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.339444  normal  0.999371 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0591  NADH dehydrogenase subunit I  55.49 
 
 		 182 aa  186  1e-46  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0623179  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0580  NADH dehydrogenase subunit I  55.49 
 
 		 182 aa  186  2e-46  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0627884  normal  1 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0374  NADH dehydrogenase subunit I  53.37 
 
 		 180 aa  182  2.0000000000000003e-45  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4064  NADH dehydrogenase subunit I  54.55 
 
 		 171 aa  172  1.9999999999999998e-42  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0149353  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1696  NADH dehydrogenase subunit I  54.12 
 
 		 164 aa  170  1e-41  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  hitchhiker  0.00251501  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4736  NADH dehydrogenase subunit I  52.44 
 
 		 173 aa  168  4e-41  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.161018  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1354  NADH dehydrogenase subunit I  54.72 
 
 		 171 aa  167  6e-41  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.253044  normal  0.161644 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1333  NADH dehydrogenase subunit I  54.72 
 
 		 171 aa  167  6e-41  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0107  NADH dehydrogenase subunit I  53.53 
 
 		 164 aa  165  2.9999999999999998e-40  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.807538  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1743  NADH dehydrogenase subunit I  53.53 
 
 		 164 aa  164  4e-40  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  decreased coverage  0.00386762  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0289  NADH-quinone oxidoreductase, chain I  48.18 
 
 		 171 aa  132  1.9999999999999998e-30  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.998746  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4410  NADH-quinone oxidoreductase, chain I  46.38 
 
 		 194 aa  130  1.0000000000000001e-29  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4550  NADH-quinone oxidoreductase, chain I  47.33 
 
 		 211 aa  129  2.0000000000000002e-29  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0546  NADH dehydrogenase subunit I  46.1 
 
 		 217 aa  129  3e-29  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.175795  normal  0.434998 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0394  NADH-quinone oxidoreductase, chain I  46.38 
 
 		 175 aa  129  3e-29  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1282  NADH-quinone oxidoreductase chain I  45.11 
 
 		 185 aa  127  9.000000000000001e-29  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.425102 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1869  NADH-quinone oxidoreductase chain I  45.93 
 
 		 177 aa  127  1.0000000000000001e-28  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6674  NADH dehydrogenase subunit I  48.06 
 
 		 188 aa  127  1.0000000000000001e-28  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6086  NADH dehydrogenase subunit I  45.39 
 
 		 211 aa  126  1.0000000000000001e-28  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  decreased coverage  0.00224994  normal  0.0520295 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4455  NADH dehydrogenase subunit I  44.96 
 
 		 211 aa  125  2.0000000000000002e-28  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.829117  normal  0.833546 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0917  NADH-quinone oxidoreductase, chain I  48.51 
 
 		 179 aa  126  2.0000000000000002e-28  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.5865  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4057  NADH dehydrogenase subunit I  44.96 
 
 		 211 aa  125  3e-28  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.819652  normal  0.545712 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0275  NADH dehydrogenase subunit I  47.29 
 
 		 199 aa  125  3e-28  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0592  Formate hydrogenlyase subunit 6/NADH:ubiquinone oxidoreductase 23 kD subunit (chain I)-like protein  46.38 
 
 		 171 aa  124  6e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1275  NADH-quinone oxidoreductase, chain I  42.14 
 
 		 199 aa  123  1e-27  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2687  NADH dehydrogenase subunit I  48.06 
 
 		 183 aa  123  2e-27  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0721276  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1877  NADH dehydrogenase subunit I  45.65 
 
 		 174 aa  122  2e-27  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5061  NADH-quinone oxidoreductase, chain I  47.29 
 
 		 185 aa  122  3e-27  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.451376  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4080  NADH-quinone oxidoreductase, chain I  42.42 
 
 		 197 aa  121  5e-27  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.0562629 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2708  NADH-quinone oxidoreductase, chain I  37.97 
 
 		 247 aa  120  8e-27  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4489  NADH dehydrogenase subunit I  44.93 
 
 		 175 aa  120  9.999999999999999e-27  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.159742 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_03240  NADH dehydrogenase subunit I  46.51 
 
 		 187 aa  120  9.999999999999999e-27  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1572  NADH dehydrogenase subunit I  45.39 
 
 		 174 aa  120  9.999999999999999e-27  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1542  NADH dehydrogenase subunit I  45.39 
 
 		 174 aa  120  9.999999999999999e-27  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.383544  normal  0.0726132 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0528  NADH dehydrogenase subunit I  45.86 
 
 		 196 aa  120  9.999999999999999e-27  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1596  NADH dehydrogenase subunit I  45.39 
 
 		 174 aa  120  9.999999999999999e-27  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.557888  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2235  NADH-quinone oxidoreductase, chain I  47.76 
 
 		 165 aa  119  1.9999999999999998e-26  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.272952  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13174  NADH dehydrogenase subunit I  45.99 
 
 		 218 aa  119  3e-26  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7683  NADH-quinone oxidoreductase, chain I  43.61 
 
 		 203 aa  118  3.9999999999999996e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3387  NADH-quinone oxidoreductase, chain I  47.01 
 
 		 165 aa  117  6e-26  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.533197  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0982  NADH-quinone oxidoreductase, chain I  43.7 
 
 		 214 aa  117  7e-26  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3176  NADH-quinone oxidoreductase, chain I  44.96 
 
 		 167 aa  117  9e-26  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1845  NADH-quinone oxidoreductase, chain I  45.58 
 
 		 175 aa  117  9.999999999999999e-26  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0547  NADH-quinone oxidoreductase, chain I  42.86 
 
 		 226 aa  116  9.999999999999999e-26  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.481769 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7011  NADH-quinone oxidoreductase, chain I  44.78 
 
 		 169 aa  115  1.9999999999999998e-25  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3347  NADH-quinone oxidoreductase, chain I  42.06 
 
 		 131 aa  114  7.999999999999999e-25  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.715886  normal  0.525186 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5106  NADH-quinone oxidoreductase, chain I  45.32 
 
 		 188 aa  113  1.0000000000000001e-24  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009370  OSTLU_18502  predicted protein  44.44 
 
 		 167 aa  113  1.0000000000000001e-24  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.0613487 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3221  NADH-quinone oxidoreductase, chain I  42.75 
 
 		 254 aa  113  1.0000000000000001e-24  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.129277 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>