More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_7011 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013132  Cpin_7011  NADH-quinone oxidoreductase, chain I  100 
 
 		 169 aa  350  4e-96  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1238  NADH-quinone oxidoreductase, chain I  67.7 
 
 		 181 aa  236  1e-61  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1374  NADH dehydrogenase I chain I  67.09 
 
 		 175 aa  231  3e-60  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  decreased coverage  0.00228535  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4074  NADH-quinone oxidoreductase, chain I  62.65 
 
 		 165 aa  215  2.9999999999999998e-55  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.138304  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4080  NADH-quinone oxidoreductase, chain I  65.19 
 
 		 197 aa  206  1e-52  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.0562629 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5106  NADH-quinone oxidoreductase, chain I  61.78 
 
 		 188 aa  205  3e-52  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4236  NADH-quinone oxidoreductase, chain I  49.26 
 
 		 132 aa  137  4.999999999999999e-32  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000114859  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1020  NADH dehydrogenase subunit I  47.45 
 
 		 171 aa  135  3.0000000000000003e-31  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.755319  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0917  NADH-quinone oxidoreductase, chain I  47.1 
 
 		 179 aa  133  9.999999999999999e-31  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.5865  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4002  NADH-quinone oxidoreductase, chain I  47.06 
 
 		 132 aa  132  1.9999999999999998e-30  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.89067e-17 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3918  NADH-quinone oxidoreductase, chain I  47.06 
 
 		 132 aa  132  1.9999999999999998e-30  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2235  NADH-quinone oxidoreductase, chain I  47.83 
 
 		 165 aa  132  3e-30  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.272952  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0711  NADH-quinone oxidoreductase, chain I  45.26 
 
 		 170 aa  130  6.999999999999999e-30  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0425782  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0346  NADH dehydrogenase I, I subunit  47.79 
 
 		 132 aa  130  1.0000000000000001e-29  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3372  NADH dehydrogenase I, I subunit  41.72 
 
 		 182 aa  130  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.675448  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3387  NADH-quinone oxidoreductase, chain I  48.15 
 
 		 165 aa  130  1.0000000000000001e-29  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.533197  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5172  NADH dehydrogenase subunit I  44.76 
 
 		 169 aa  129  2.0000000000000002e-29  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.950727  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0880  NADH dehydrogenase subunit I  44.76 
 
 		 170 aa  129  2.0000000000000002e-29  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3204  NADH dehydrogenase subunit I  41.72 
 
 		 182 aa  129  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0843328  normal  0.169624 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3125  NADH dehydrogenase subunit I  42.55 
 
 		 179 aa  129  2.0000000000000002e-29  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1869  NADH-quinone oxidoreductase chain I  45.52 
 
 		 177 aa  129  3e-29  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2419  NADH dehydrogenase subunit I  40.4 
 
 		 182 aa  128  3e-29  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.193406 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3347  NADH-quinone oxidoreductase, chain I  47.79 
 
 		 131 aa  128  3e-29  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.715886  normal  0.525186 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1043  NADH dehydrogenase subunit I  45.27 
 
 		 163 aa  128  3e-29  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1563  NADH dehydrogenase subunit I  46.1 
 
 		 162 aa  128  4.0000000000000003e-29  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.339949  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3610  NADH dehydrogenase subunit I  41.06 
 
 		 182 aa  127  5.0000000000000004e-29  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.487333  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_28510  NADH dehydrogenase subunit I  42.75 
 
 		 182 aa  128  5.0000000000000004e-29  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.559317  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3248  NADH dehydrogenase subunit I  45.77 
 
 		 165 aa  127  5.0000000000000004e-29  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.779883  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0829  NADH dehydrogenase subunit I  46.15 
 
 		 163 aa  127  6e-29  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.260339  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1150  NADH dehydrogenase subunit I  42.18 
 
 		 162 aa  127  8.000000000000001e-29  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0965  NADH dehydrogenase subunit I  44.76 
 
 		 170 aa  127  8.000000000000001e-29  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.837483  normal  0.0693949 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0478  NADH-quinone oxidoreductase, chain I  39.19 
 
 		 180 aa  126  1.0000000000000001e-28  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.195582 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1099  NADH dehydrogenase subunit I  45.07 
 
 		 162 aa  126  1.0000000000000001e-28  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0592  Formate hydrogenlyase subunit 6/NADH:ubiquinone oxidoreductase 23 kD subunit (chain I)-like protein  47.06 
 
 		 171 aa  126  1.0000000000000001e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4126  NADH dehydrogenase subunit I  41.06 
 
 		 182 aa  125  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1866  NADH dehydrogenase subunit I  41.06 
 
 		 182 aa  125  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0422789 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1014  NADH dehydrogenase subunit I  42.75 
 
 		 180 aa  125  2.0000000000000002e-28  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1739  NADH dehydrogenase subunit I  41.06 
 
 		 182 aa  125  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.235938  normal  0.220023 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0289  NADH-quinone oxidoreductase, chain I  47.06 
 
 		 171 aa  125  2.0000000000000002e-28  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.998746  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3698  NADH dehydrogenase subunit I  41.06 
 
 		 182 aa  125  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.380267  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3130  NADH-quinone oxidoreductase, chain I  45.86 
 
 		 135 aa  125  3e-28  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2292  NADH dehydrogenase subunit I  45.07 
 
 		 161 aa  125  4.0000000000000003e-28  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3502  NADH dehydrogenase subunit I  44.76 
 
 		 181 aa  124  5e-28  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1750  NADH dehydrogenase subunit I  44.37 
 
 		 161 aa  124  5e-28  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009370  OSTLU_18502  predicted protein  43.88 
 
 		 167 aa  124  5e-28  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.0613487 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1432  NADH dehydrogenase subunit I  42.96 
 
 		 165 aa  124  6e-28  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.277545  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1956  NADH-quinone oxidoreductase, chain I  44.37 
 
 		 162 aa  124  6e-28  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.198639  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1692  NADH dehydrogenase subunit I  41.67 
 
 		 182 aa  124  7e-28  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0994  NADH dehydrogenase subunit I  44.76 
 
 		 163 aa  124  7e-28  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0980  NADH dehydrogenase subunit I  46.62 
 
 		 169 aa  123  1e-27  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2993  NADH dehydrogenase subunit I  44.68 
 
 		 161 aa  123  1e-27  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0957  NADH dehydrogenase subunit I  47.48 
 
 		 162 aa  123  1e-27  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0765322  normal  0.470027 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1120  NADH dehydrogenase subunit I  42.07 
 
 		 180 aa  123  1e-27  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.311189  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0825  NADH dehydrogenase subunit I  43.26 
 
 		 163 aa  123  1e-27  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2562  NADH dehydrogenase subunit I  41.01 
 
 		 182 aa  123  1e-27  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1301  NADH dehydrogenase subunit I  43.66 
 
 		 162 aa  123  1e-27  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  decreased coverage  0.00320411  normal  0.488956 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_29920  NADH dehydrogenase subunit I  41.01 
 
 		 182 aa  123  1e-27  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.546828  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3818  NADH-quinone oxidoreductase, chain I  42.22 
 
 		 171 aa  122  2e-27  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.121238  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2054  NADH dehydrogenase subunit I  44.06 
 
 		 163 aa  122  2e-27  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.151951 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1883  NADH dehydrogenase subunit I  44.06 
 
 		 163 aa  122  2e-27  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.604396 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2867  NADH-quinone oxidoreductase, chain I  43.66 
 
 		 171 aa  122  2e-27  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.708253  normal  0.0292468 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2206  NADH dehydrogenase subunit I  44.06 
 
 		 163 aa  122  2e-27  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4410  NADH-quinone oxidoreductase, chain I  46.32 
 
 		 194 aa  122  2e-27  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2805  NADH dehydrogenase subunit I  45.26 
 
 		 169 aa  122  3e-27  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.166718 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0969  NADH dehydrogenase subunit I  44.06 
 
 		 163 aa  122  3e-27  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0765514  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5061  NADH-quinone oxidoreductase, chain I  44.85 
 
 		 185 aa  122  3e-27  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.451376  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2053  NADH dehydrogenase subunit I  43.88 
 
 		 163 aa  122  3e-27  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.330204  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0935  NADH dehydrogenase subunit I  44.06 
 
 		 163 aa  122  3e-27  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.13658  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0154  NADH dehydrogenase subunit I  44.03 
 
 		 176 aa  121  5e-27  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.947551 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1499  NADH dehydrogenase subunit I  41.72 
 
 		 180 aa  121  5e-27  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6086  NADH dehydrogenase subunit I  42.75 
 
 		 211 aa  121  5e-27  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  decreased coverage  0.00224994  normal  0.0520295 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1138  NADH dehydrogenase subunit I  41.96 
 
 		 162 aa  120  6e-27  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.299701  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1821  NADH dehydrogenase subunit I  41.96 
 
 		 162 aa  120  6e-27  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0172  NADH dehydrogenase subunit I  44.03 
 
 		 176 aa  121  6e-27  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1443  NADH dehydrogenase subunit I  41.96 
 
 		 162 aa  120  6e-27  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.798759  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1307  NADH dehydrogenase subunit I  41.96 
 
 		 162 aa  120  6e-27  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.91191  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0421  NADH dehydrogenase subunit I  41.96 
 
 		 162 aa  120  6e-27  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.735915  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0729  NADH dehydrogenase subunit I  41.96 
 
 		 162 aa  120  6e-27  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.384636  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1411  NADH dehydrogenase subunit I  42.66 
 
 		 165 aa  121  6e-27  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0328529 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2765  NADH dehydrogenase subunit I  43.48 
 
 		 180 aa  120  6e-27  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.128685  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1298  NADH dehydrogenase subunit I  41.96 
 
 		 162 aa  120  6e-27  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3216  NADH-quinone oxidoreductase, chain I  48.2 
 
 		 168 aa  120  9e-27  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2687  NADH dehydrogenase subunit I  46.32 
 
 		 183 aa  120  9e-27  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0721276  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0211  NADH dehydrogenase subunit I  43.36 
 
 		 176 aa  119  9.999999999999999e-27  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1271  NADH dehydrogenase subunit I  43.8 
 
 		 171 aa  119  9.999999999999999e-27  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.400573  normal  0.480107 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1069  NADH dehydrogenase subunit I  41.55 
 
 		 162 aa  120  9.999999999999999e-27  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.74272  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5569  NADH dehydrogenase subunit I  40.85 
 
 		 162 aa  119  1.9999999999999998e-26  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.156755 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1461  NADH dehydrogenase subunit I  42.03 
 
 		 180 aa  119  1.9999999999999998e-26  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3206  NADH dehydrogenase subunit I  41.26 
 
 		 162 aa  119  1.9999999999999998e-26  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00643522  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1567  NADH dehydrogenase subunit I  42.03 
 
 		 180 aa  119  1.9999999999999998e-26  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.997394  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1351  NADH dehydrogenase subunit I  41.26 
 
 		 162 aa  119  1.9999999999999998e-26  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0309776  hitchhiker  0.0086006 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2265  NADH dehydrogenase subunit I  41.55 
 
 		 162 aa  119  1.9999999999999998e-26  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.477325  normal  0.254179 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1629  NADH dehydrogenase subunit I  41.55 
 
 		 162 aa  119  1.9999999999999998e-26  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1275  NADH-quinone oxidoreductase, chain I  42.54 
 
 		 199 aa  119  1.9999999999999998e-26  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2241  NADH dehydrogenase subunit I  41.55 
 
 		 162 aa  119  1.9999999999999998e-26  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.493495  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1809  NADH dehydrogenase subunit I  42.03 
 
 		 180 aa  119  1.9999999999999998e-26  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.693845 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2158  NADH dehydrogenase subunit I  40.85 
 
 		 162 aa  118  3e-26  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.394971  normal  0.941111 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2825  NADH dehydrogenase subunit I  43.48 
 
 		 180 aa  119  3e-26  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.339444  normal  0.999371 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2001  NADH dehydrogenase subunit I  41.26 
 
 		 162 aa  119  3e-26  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0496982 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2279  NADH dehydrogenase subunit I  40.85 
 
 		 162 aa  118  3e-26  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.336058  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>