More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oter_0478 on replicon NC_010571
Organism: Opitutus terrae PB90-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010571  Oter_0478  NADH-quinone oxidoreductase, chain I  100 
 
 		 180 aa  375  1e-103  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.195582 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1609  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  49.47 
 
 		 187 aa  176  1e-43  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.999472 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3865  NADH-quinone oxidoreductase, chain I  43.87 
 
 		 222 aa  134  9.999999999999999e-31  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7011  NADH-quinone oxidoreductase, chain I  39.19 
 
 		 169 aa  126  2.0000000000000002e-28  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4074  NADH-quinone oxidoreductase, chain I  39.33 
 
 		 165 aa  123  1e-27  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.138304  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1238  NADH-quinone oxidoreductase, chain I  41.33 
 
 		 181 aa  124  1e-27  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5106  NADH-quinone oxidoreductase, chain I  39.74 
 
 		 188 aa  121  5e-27  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2631  NADH-quinone oxidoreductase, chain I  42.41 
 
 		 230 aa  119  1.9999999999999998e-26  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.87866  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1374  NADH dehydrogenase I chain I  38.31 
 
 		 175 aa  119  1.9999999999999998e-26  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  decreased coverage  0.00228535  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4080  NADH-quinone oxidoreductase, chain I  35.23 
 
 		 197 aa  117  7e-26  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.0562629 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0929  NADH dehydrogenase subunit I  34.94 
 
 		 163 aa  113  2.0000000000000002e-24  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3387  NADH-quinone oxidoreductase, chain I  41.04 
 
 		 165 aa  111  7.000000000000001e-24  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.533197  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4236  NADH-quinone oxidoreductase, chain I  40.6 
 
 		 132 aa  110  9e-24  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000114859  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2235  NADH-quinone oxidoreductase, chain I  40.3 
 
 		 165 aa  109  2.0000000000000002e-23  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.272952  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1757  NADH dehydrogenase subunit I  39.31 
 
 		 163 aa  107  6e-23  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0164  NADH-ubiquinone oxidoreductase subunit 8  36.31 
 
 		 165 aa  108  6e-23  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_28510  NADH dehydrogenase subunit I  38.71 
 
 		 182 aa  107  9.000000000000001e-23  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.559317  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1296  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  32.64 
 
 		 238 aa  106  1e-22  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.109179  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0346  NADH dehydrogenase I, I subunit  41.35 
 
 		 132 aa  107  1e-22  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0711  NADH-quinone oxidoreductase, chain I  39.31 
 
 		 170 aa  105  2e-22  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0425782  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1361  NADH dehydrogenase subunit I  33.12 
 
 		 163 aa  106  2e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.182164  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4398  NADH dehydrogenase subunit I  34.34 
 
 		 162 aa  105  2e-22  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1275  NADH-quinone oxidoreductase, chain I  38.41 
 
 		 199 aa  105  3e-22  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3372  NADH dehydrogenase I, I subunit  37.42 
 
 		 182 aa  105  3e-22  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.675448  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1120  NADH dehydrogenase subunit I  40.56 
 
 		 180 aa  105  3e-22  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.311189  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3610  NADH dehydrogenase subunit I  38.06 
 
 		 182 aa  105  3e-22  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.487333  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4002  NADH-quinone oxidoreductase, chain I  38.35 
 
 		 132 aa  105  3e-22  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.89067e-17 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3918  NADH-quinone oxidoreductase, chain I  38.35 
 
 		 132 aa  105  3e-22  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0898  NADH dehydrogenase subunit I  33.12 
 
 		 163 aa  105  4e-22  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0404509  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3216  NADH-quinone oxidoreductase, chain I  39.84 
 
 		 168 aa  105  5e-22  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2419  NADH dehydrogenase subunit I  38.71 
 
 		 182 aa  104  6e-22  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.193406 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3204  NADH dehydrogenase subunit I  37.42 
 
 		 182 aa  104  6e-22  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0843328  normal  0.169624 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1962  NADH dehydrogenase subunit I  37.5 
 
 		 163 aa  104  7e-22  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.528282  normal  0.0448739 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2926  NADH dehydrogenase subunit I  33.54 
 
 		 162 aa  104  8e-22  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1020  NADH dehydrogenase subunit I  37.76 
 
 		 171 aa  104  8e-22  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.755319  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4134  NADH dehydrogenase subunit I  33.13 
 
 		 162 aa  104  9e-22  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.181277  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1563  NADH dehydrogenase subunit I  33.75 
 
 		 162 aa  103  9e-22  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.339949  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1269  NADH dehydrogenase subunit I  33.77 
 
 		 163 aa  104  9e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.142775  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0917  NADH-quinone oxidoreductase, chain I  35.8 
 
 		 179 aa  103  9e-22  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.5865  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4126  NADH dehydrogenase subunit I  37.42 
 
 		 182 aa  103  1e-21  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1866  NADH dehydrogenase subunit I  37.42 
 
 		 182 aa  103  1e-21  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0422789 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1739  NADH dehydrogenase subunit I  37.42 
 
 		 182 aa  103  1e-21  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.235938  normal  0.220023 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3347  NADH-quinone oxidoreductase, chain I  40.6 
 
 		 131 aa  103  1e-21  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.715886  normal  0.525186 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3698  NADH dehydrogenase subunit I  37.42 
 
 		 182 aa  103  1e-21  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.380267  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2390  NADH dehydrogenase subunit I  32.52 
 
 		 162 aa  103  1e-21  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  hitchhiker  0.0000573568  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1113  NADH-quinone oxidoreductase, chain I  39.16 
 
 		 170 aa  103  2e-21  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.182151  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3130  NADH-quinone oxidoreductase, chain I  38.35 
 
 		 135 aa  102  2e-21  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0980  NADH dehydrogenase subunit I  35.46 
 
 		 169 aa  102  2e-21  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3336  NADH dehydrogenase subunit I  35.51 
 
 		 162 aa  103  2e-21  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.463064  normal  0.437664 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4625  NADH dehydrogenase subunit I  31.52 
 
 		 162 aa  102  2e-21  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.11536 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1956  NADH-quinone oxidoreductase, chain I  34.48 
 
 		 162 aa  102  3e-21  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.198639  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1011  NADH dehydrogenase subunit I  32.72 
 
 		 162 aa  102  3e-21  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.210818  normal  0.566427 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1660  NADH-quinone oxidoreductase, chain I  40.6 
 
 		 234 aa  102  3e-21  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2523  NADH dehydrogenase subunit I  35.22 
 
 		 167 aa  102  4e-21  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.208294  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1077  NADH dehydrogenase subunit I  32.53 
 
 		 162 aa  102  4e-21  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.280148 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1869  NADH-quinone oxidoreductase chain I  35.86 
 
 		 177 aa  102  4e-21  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3125  NADH dehydrogenase subunit I  34.64 
 
 		 179 aa  102  4e-21  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1185  NADH dehydrogenase subunit I  35.22 
 
 		 167 aa  102  4e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0684834  normal  0.389473 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1206  NADH dehydrogenase subunit I  32.53 
 
 		 162 aa  102  4e-21  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009370  OSTLU_18502  predicted protein  30.54 
 
 		 167 aa  101  5e-21  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.0613487 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1723  NADH dehydrogenase subunit I  31.06 
 
 		 163 aa  101  5e-21  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.341479  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2877  NADH dehydrogenase subunit I  32.73 
 
 		 162 aa  101  6e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.670141  normal  0.245456 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1879  NADH dehydrogenase subunit I  34.15 
 
 		 162 aa  101  7e-21  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.508831  normal  0.262119 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2562  NADH dehydrogenase subunit I  37.76 
 
 		 182 aa  100  8e-21  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4550  NADH-quinone oxidoreductase, chain I  35.29 
 
 		 211 aa  100  8e-21  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_29920  NADH dehydrogenase subunit I  37.76 
 
 		 182 aa  100  8e-21  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.546828  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1322  NADH dehydrogenase subunit I  35.77 
 
 		 164 aa  100  8e-21  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.323962  normal  0.0547108 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2051  NADH dehydrogenase subunit I  32.53 
 
 		 162 aa  100  9e-21  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.100158  normal  0.722093 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2415  NADH dehydrogenase subunit I  31.52 
 
 		 163 aa  100  1e-20  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.87535  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3218  NADH dehydrogenase subunit I  31.68 
 
 		 163 aa  100  1e-20  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2582  NADH dehydrogenase subunit I  32.12 
 
 		 162 aa  100  1e-20  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.561308  normal  0.2116 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2212  NADH dehydrogenase subunit I  33.96 
 
 		 162 aa  100  1e-20  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.199823  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1030  NADH dehydrogenase subunit I  32.28 
 
 		 163 aa  100  1e-20  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.206882  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0994  NADH dehydrogenase subunit I  35.21 
 
 		 163 aa  100  1e-20  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1036  NADH dehydrogenase subunit I  36.69 
 
 		 162 aa  100  2e-20  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.160572  normal  0.248767 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0825  NADH dehydrogenase subunit I  34.72 
 
 		 163 aa  99.8  2e-20  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2412  NADH dehydrogenase subunit I  32.54 
 
 		 162 aa  99.8  2e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0701412  normal  0.0109704 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0554  NADH dehydrogenase subunit I  36.62 
 
 		 168 aa  99.4  2e-20  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3290  NADH dehydrogenase subunit I  32.73 
 
 		 162 aa  99.8  2e-20  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.221287  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2279  NADH dehydrogenase subunit I  36.69 
 
 		 162 aa  100  2e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.336058  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2158  NADH dehydrogenase subunit I  36.69 
 
 		 162 aa  100  2e-20  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.394971  normal  0.941111 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2238  NADH dehydrogenase subunit I  37.96 
 
 		 163 aa  99.4  2e-20  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.180184 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1542  NADH dehydrogenase subunit I  37.69 
 
 		 174 aa  99.4  3e-20  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.383544  normal  0.0726132 
 
 
-
 
NC_006681  CNL05770  conserved hypothetical protein  31.76 
 
 		 273 aa  99  3e-20  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1609  NADH dehydrogenase subunit I  36.62 
 
 		 163 aa  99  3e-20  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1069  NADH dehydrogenase subunit I  35.97 
 
 		 162 aa  99  3e-20  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.74272  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2805  NADH dehydrogenase subunit I  34.06 
 
 		 169 aa  99  3e-20  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.166718 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1572  NADH dehydrogenase subunit I  37.69 
 
 		 174 aa  99.4  3e-20  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1596  NADH dehydrogenase subunit I  37.69 
 
 		 174 aa  99.4  3e-20  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.557888  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1385  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  32.12 
 
 		 239 aa  98.6  4e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.236148  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2265  NADH dehydrogenase subunit I  35.97 
 
 		 162 aa  98.6  4e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.477325  normal  0.254179 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1284  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  32.12 
 
 		 239 aa  98.6  4e-20  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5569  NADH dehydrogenase subunit I  35.97 
 
 		 162 aa  99  4e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.156755 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2564  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding protein  32.12 
 
 		 239 aa  98.6  4e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1629  NADH dehydrogenase subunit I  35.97 
 
 		 162 aa  98.6  4e-20  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2241  NADH dehydrogenase subunit I  35.97 
 
 		 162 aa  98.6  4e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.493495  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2292  NADH dehydrogenase subunit I  34.67 
 
 		 161 aa  98.2  5e-20  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1501  NADH dehydrogenase subunit I  34.06 
 
 		 177 aa  98.2  5e-20  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0649483  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3615  NADH-quinone oxidoreductase, chain I  35.04 
 
 		 211 aa  98.6  5e-20  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1443  NADH dehydrogenase subunit I  35.97 
 
 		 162 aa  98.2  6e-20  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.798759  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>