More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CFF8240_0164 on replicon NC_008599
Organism: Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008599  CFF8240_0164  NADH-ubiquinone oxidoreductase subunit 8  100 
 
 
165 aa  339  8e-93  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1296  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  45.91 
 
 
238 aa  130  1.0000000000000001e-29  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.109179  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1385  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  43.4 
 
 
239 aa  126  1.0000000000000001e-28  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.236148  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2564  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding protein  43.4 
 
 
239 aa  126  1.0000000000000001e-28  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1284  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  43.4 
 
 
239 aa  126  1.0000000000000001e-28  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4515  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  45.39 
 
 
204 aa  122  3e-27  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.203354  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3865  NADH-quinone oxidoreductase, chain I  42.96 
 
 
222 aa  120  9e-27  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0478  NADH-quinone oxidoreductase, chain I  36.31 
 
 
180 aa  108  5e-23  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.195582 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7011  NADH-quinone oxidoreductase, chain I  37.66 
 
 
169 aa  106  1e-22  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1238  NADH-quinone oxidoreductase, chain I  36.77 
 
 
181 aa  106  2e-22  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4074  NADH-quinone oxidoreductase, chain I  39.44 
 
 
165 aa  105  2e-22  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.138304  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1374  NADH dehydrogenase I chain I  36.42 
 
 
175 aa  103  1e-21  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  decreased coverage  0.00228535  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1609  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  39.87 
 
 
187 aa  102  2e-21  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.999472 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5106  NADH-quinone oxidoreductase, chain I  35.06 
 
 
188 aa  100  6e-21  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4080  NADH-quinone oxidoreductase, chain I  35.06 
 
 
197 aa  99  3e-20  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.0562629 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1043  NADH dehydrogenase subunit I  40.58 
 
 
163 aa  97.4  7e-20  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0636  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  34.71 
 
 
186 aa  97.4  7e-20  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1631  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  34.71 
 
 
186 aa  97.4  7e-20  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3185  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  34.71 
 
 
186 aa  97.4  7e-20  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0346  NADH dehydrogenase I, I subunit  42.75 
 
 
132 aa  96.7  1e-19  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3130  NADH-quinone oxidoreductase, chain I  43.18 
 
 
135 aa  96.7  1e-19  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2631  NADH-quinone oxidoreductase, chain I  36.84 
 
 
230 aa  96.3  2e-19  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.87866  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0829  NADH dehydrogenase subunit I  39.1 
 
 
163 aa  95.9  2e-19  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.260339  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1501  NADH dehydrogenase subunit I  39.85 
 
 
177 aa  94.7  5e-19  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0649483  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4002  NADH-quinone oxidoreductase, chain I  42.31 
 
 
132 aa  94  8e-19  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.89067e-17 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3918  NADH-quinone oxidoreductase, chain I  42.31 
 
 
132 aa  94  8e-19  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1333  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  38.1 
 
 
176 aa  94  9e-19  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1660  NADH-quinone oxidoreductase, chain I  36.55 
 
 
234 aa  92.8  2e-18  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3347  NADH-quinone oxidoreductase, chain I  41.98 
 
 
131 aa  92.4  2e-18  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.715886  normal  0.525186 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4236  NADH-quinone oxidoreductase, chain I  41.41 
 
 
132 aa  92.8  2e-18  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000114859  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1291  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  31.29 
 
 
152 aa  92  3e-18  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.68682  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3615  NADH-quinone oxidoreductase, chain I  41.28 
 
 
211 aa  91.7  4e-18  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3248  NADH dehydrogenase subunit I  38.35 
 
 
165 aa  91.7  4e-18  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.779883  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2867  NADH-quinone oxidoreductase, chain I  47.78 
 
 
171 aa  90.9  8e-18  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.708253  normal  0.0292468 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1750  NADH dehydrogenase subunit I  37.59 
 
 
161 aa  90.1  1e-17  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2805  NADH dehydrogenase subunit I  38.71 
 
 
169 aa  90.5  1e-17  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.166718 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3627  NADH dehydrogenase subunit I  40.18 
 
 
164 aa  90.1  1e-17  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.0704772 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1411  NADH dehydrogenase subunit I  36.84 
 
 
165 aa  89.4  2e-17  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.0328529 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1536  NADH-quinone oxidoreductase, chain I  41.53 
 
 
170 aa  88.6  4e-17  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4126  NADH dehydrogenase subunit I  42.59 
 
 
182 aa  87.8  6e-17  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3698  NADH dehydrogenase subunit I  42.59 
 
 
182 aa  87.8  6e-17  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.380267  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1866  NADH dehydrogenase subunit I  42.59 
 
 
182 aa  87.8  6e-17  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.0422789 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1739  NADH dehydrogenase subunit I  42.59 
 
 
182 aa  87.8  6e-17  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.235938  normal  0.220023 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0969  NADH dehydrogenase subunit I  36.09 
 
 
163 aa  86.7  1e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0765514  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0965  NADH dehydrogenase subunit I  36.09 
 
 
170 aa  86.7  1e-16  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.837483  normal  0.0693949 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0820  NADH dehydrogenase subunit I  34.27 
 
 
160 aa  86.7  1e-16  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5172  NADH dehydrogenase subunit I  36.09 
 
 
169 aa  87  1e-16  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.950727  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5569  NADH dehydrogenase subunit I  35.34 
 
 
162 aa  86.3  2e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.156755 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3221  NADH-quinone oxidoreductase, chain I  37.12 
 
 
254 aa  85.9  2e-16  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.129277 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1036  NADH dehydrogenase subunit I  36.09 
 
 
162 aa  86.3  2e-16  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.160572  normal  0.248767 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0935  NADH dehydrogenase subunit I  36.84 
 
 
163 aa  85.9  2e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.13658  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2158  NADH dehydrogenase subunit I  36.09 
 
 
162 aa  86.3  2e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.394971  normal  0.941111 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1845  NADH-quinone oxidoreductase, chain I  38.89 
 
 
175 aa  86.3  2e-16  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2279  NADH dehydrogenase subunit I  36.09 
 
 
162 aa  86.3  2e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.336058  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3387  NADH-quinone oxidoreductase, chain I  31.03 
 
 
165 aa  85.9  2e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.533197  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1069  NADH dehydrogenase subunit I  35.34 
 
 
162 aa  85.5  3e-16  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.74272  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1432  NADH dehydrogenase subunit I  35.34 
 
 
165 aa  85.5  3e-16  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.277545  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3206  NADH dehydrogenase subunit I  35.34 
 
 
162 aa  85.1  3e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00643522  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1509  NADH dehydrogenase subunit I  37.61 
 
 
165 aa  85.5  3e-16  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00304735 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2562  NADH dehydrogenase subunit I  41.67 
 
 
182 aa  85.5  3e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_28510  NADH dehydrogenase subunit I  41.67 
 
 
182 aa  85.5  3e-16  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.559317  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_29920  NADH dehydrogenase subunit I  41.67 
 
 
182 aa  85.5  3e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.546828  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1298  NADH dehydrogenase subunit I  35.34 
 
 
162 aa  85.1  4e-16  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2001  NADH dehydrogenase subunit I  35.34 
 
 
162 aa  85.1  4e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0496982 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3372  NADH dehydrogenase I, I subunit  41.67 
 
 
182 aa  84.7  4e-16  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.675448  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0421  NADH dehydrogenase subunit I  35.34 
 
 
162 aa  85.1  4e-16  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.735915  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1307  NADH dehydrogenase subunit I  35.34 
 
 
162 aa  85.1  4e-16  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.91191  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0729  NADH dehydrogenase subunit I  35.34 
 
 
162 aa  85.1  4e-16  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.384636  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1821  NADH dehydrogenase subunit I  35.34 
 
 
162 aa  85.1  4e-16  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3204  NADH dehydrogenase subunit I  41.67 
 
 
182 aa  85.1  4e-16  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0843328  normal  0.169624 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1443  NADH dehydrogenase subunit I  35.34 
 
 
162 aa  85.1  4e-16  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.798759  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1138  NADH dehydrogenase subunit I  35.34 
 
 
162 aa  85.1  4e-16  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.299701  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1351  NADH dehydrogenase subunit I  35.34 
 
 
162 aa  85.1  4e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0309776  hitchhiker  0.0086006 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2053  NADH dehydrogenase subunit I  35.94 
 
 
163 aa  85.1  4e-16  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.330204  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2054  NADH dehydrogenase subunit I  36.84 
 
 
163 aa  84.7  5e-16  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.151951 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2419  NADH dehydrogenase subunit I  40.74 
 
 
182 aa  84.7  5e-16  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.193406 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1020  NADH dehydrogenase subunit I  40.74 
 
 
171 aa  84.7  5e-16  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.755319  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0880  NADH dehydrogenase subunit I  35.34 
 
 
170 aa  84.7  5e-16  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2265  NADH dehydrogenase subunit I  35.34 
 
 
162 aa  84.7  5e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.477325  normal  0.254179 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2206  NADH dehydrogenase subunit I  36.84 
 
 
163 aa  84.7  5e-16  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1629  NADH dehydrogenase subunit I  35.34 
 
 
162 aa  84.7  5e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1883  NADH dehydrogenase subunit I  36.84 
 
 
163 aa  84.7  5e-16  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.604396 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2241  NADH dehydrogenase subunit I  35.34 
 
 
162 aa  84.7  5e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.493495  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3502  NADH dehydrogenase subunit I  35.82 
 
 
181 aa  84.3  7e-16  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0825  NADH dehydrogenase subunit I  35.9 
 
 
163 aa  84.3  7e-16  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0957  NADH dehydrogenase subunit I  37.69 
 
 
162 aa  84  8e-16  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0765322  normal  0.470027 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1271  NADH dehydrogenase subunit I  36.29 
 
 
171 aa  84  8e-16  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.400573  normal  0.480107 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0163  NADH dehydrogenase subunit I  41.96 
 
 
184 aa  84  9e-16  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2235  NADH-quinone oxidoreductase, chain I  30.34 
 
 
165 aa  84  9e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.272952  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_07460  NADH dehydrogenase subunit I  35.46 
 
 
252 aa  83.6  0.000000000000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.0206751 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0154  NADH dehydrogenase subunit I  38.46 
 
 
176 aa  83.2  0.000000000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.947551 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1956  NADH-quinone oxidoreductase, chain I  35.43 
 
 
162 aa  83.6  0.000000000000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.198639  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4550  NADH-quinone oxidoreductase, chain I  34.35 
 
 
211 aa  83.2  0.000000000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3610  NADH dehydrogenase subunit I  40.74 
 
 
182 aa  83.6  0.000000000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.487333  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0172  NADH dehydrogenase subunit I  38.46 
 
 
176 aa  83.2  0.000000000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2708  NADH-quinone oxidoreductase, chain I  34.53 
 
 
247 aa  83.2  0.000000000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1877  NADH dehydrogenase subunit I  33.57 
 
 
174 aa  83.6  0.000000000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1352  NADH dehydrogenase subunit I  40.91 
 
 
171 aa  82.8  0.000000000000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0929  NADH dehydrogenase subunit I  34.75 
 
 
163 aa  82.8  0.000000000000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3125  NADH dehydrogenase subunit I  39.81 
 
 
179 aa  83.2  0.000000000000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>