More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acid345_1291 on replicon NC_008009
Organism: Candidatus Koribacter versatilis Ellin345



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008009  Acid345_1291  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  100 
 
 		 152 aa  314  3e-85  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.68682  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1536  NADH-quinone oxidoreductase, chain I  40.46 
 
 		 170 aa  97.8  4e-20  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1120  NADH dehydrogenase subunit I  38.24 
 
 		 180 aa  96.3  1e-19  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.311189  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1563  NADH dehydrogenase subunit I  35.76 
 
 		 162 aa  94.7  4e-19  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.339949  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0825  NADH dehydrogenase subunit I  37.4 
 
 		 163 aa  94.4  5e-19  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1352  NADH dehydrogenase subunit I  35.38 
 
 		 171 aa  92.4  2e-18  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2041  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  43.22 
 
 		 165 aa  92.8  2e-18  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000212693  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3336  NADH dehydrogenase subunit I  36.5 
 
 		 162 aa  92  3e-18  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.463064  normal  0.437664 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3387  NADH-quinone oxidoreductase, chain I  36.36 
 
 		 165 aa  91.7  3e-18  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.533197  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0164  NADH-ubiquinone oxidoreductase subunit 8  31.29 
 
 		 165 aa  92  3e-18  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2235  NADH-quinone oxidoreductase, chain I  37.12 
 
 		 165 aa  91.7  4e-18  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.272952  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3502  NADH dehydrogenase subunit I  39.5 
 
 		 181 aa  91.3  4e-18  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3615  NADH-quinone oxidoreductase, chain I  36.84 
 
 		 211 aa  91.3  4e-18  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1020  NADH dehydrogenase subunit I  39.45 
 
 		 171 aa  91.3  4e-18  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.755319  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7011  NADH-quinone oxidoreductase, chain I  32.03 
 
 		 169 aa  90.5  7e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1238  NADH-quinone oxidoreductase, chain I  35.42 
 
 		 181 aa  90.5  7e-18  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3627  NADH dehydrogenase subunit I  33.33 
 
 		 164 aa  90.5  7e-18  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0704772 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0829  NADH dehydrogenase subunit I  40.34 
 
 		 163 aa  90.1  9e-18  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.260339  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2993  NADH dehydrogenase subunit I  31.79 
 
 		 161 aa  90.1  1e-17  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0929  NADH dehydrogenase subunit I  32.12 
 
 		 163 aa  90.1  1e-17  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1879  NADH dehydrogenase subunit I  34.04 
 
 		 162 aa  90.1  1e-17  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.508831  normal  0.262119 
 
 
-
 
NC_009370  OSTLU_18502  predicted protein  32.84 
 
 		 167 aa  89.7  1e-17  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.0613487 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1069  NADH dehydrogenase subunit I  36.75 
 
 		 162 aa  89.7  1e-17  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.74272  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2292  NADH dehydrogenase subunit I  32.87 
 
 		 161 aa  89.7  1e-17  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3206  NADH dehydrogenase subunit I  36.75 
 
 		 162 aa  89.4  1e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00643522  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1351  NADH dehydrogenase subunit I  36.75 
 
 		 162 aa  89.7  1e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0309776  hitchhiker  0.0086006 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1043  NADH dehydrogenase subunit I  40.68 
 
 		 163 aa  90.1  1e-17  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1307  NADH dehydrogenase subunit I  36.75 
 
 		 162 aa  89.4  2e-17  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.91191  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0729  NADH dehydrogenase subunit I  36.75 
 
 		 162 aa  89.4  2e-17  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.384636  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0980  NADH dehydrogenase subunit I  35.11 
 
 		 169 aa  89  2e-17  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1014  NADH dehydrogenase subunit I  37.01 
 
 		 180 aa  89  2e-17  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1821  NADH dehydrogenase subunit I  36.75 
 
 		 162 aa  89.4  2e-17  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3818  NADH-quinone oxidoreductase, chain I  34.62 
 
 		 171 aa  89  2e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.121238  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1443  NADH dehydrogenase subunit I  36.75 
 
 		 162 aa  89.4  2e-17  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.798759  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2867  NADH-quinone oxidoreductase, chain I  32.06 
 
 		 171 aa  89  2e-17  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.708253  normal  0.0292468 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0820  NADH dehydrogenase subunit I  34.43 
 
 		 160 aa  89  2e-17  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2212  NADH dehydrogenase subunit I  33.8 
 
 		 162 aa  89  2e-17  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.199823  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2001  NADH dehydrogenase subunit I  36.75 
 
 		 162 aa  89.4  2e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0496982 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1629  NADH dehydrogenase subunit I  36.75 
 
 		 162 aa  89  2e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1036  NADH dehydrogenase subunit I  36.75 
 
 		 162 aa  89  2e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.160572  normal  0.248767 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0421  NADH dehydrogenase subunit I  36.75 
 
 		 162 aa  89.4  2e-17  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.735915  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1298  NADH dehydrogenase subunit I  36.75 
 
 		 162 aa  89.4  2e-17  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3216  NADH-quinone oxidoreductase, chain I  37.4 
 
 		 168 aa  89.4  2e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2279  NADH dehydrogenase subunit I  36.75 
 
 		 162 aa  89  2e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.336058  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2265  NADH dehydrogenase subunit I  36.75 
 
 		 162 aa  89  2e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.477325  normal  0.254179 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2241  NADH dehydrogenase subunit I  36.75 
 
 		 162 aa  89  2e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.493495  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2158  NADH dehydrogenase subunit I  36.75 
 
 		 162 aa  89  2e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.394971  normal  0.941111 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1138  NADH dehydrogenase subunit I  36.75 
 
 		 162 aa  89.4  2e-17  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.299701  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1723  NADH dehydrogenase subunit I  30.71 
 
 		 163 aa  88.6  3e-17  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.341479  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1185  NADH dehydrogenase subunit I  33.58 
 
 		 167 aa  88.2  3e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0684834  normal  0.389473 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2523  NADH dehydrogenase subunit I  33.58 
 
 		 167 aa  88.2  3e-17  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.208294  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0711  NADH-quinone oxidoreductase, chain I  32.82 
 
 		 170 aa  88.6  3e-17  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0425782  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5569  NADH dehydrogenase subunit I  35.9 
 
 		 162 aa  88.6  3e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.156755 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3125  NADH dehydrogenase subunit I  37.01 
 
 		 179 aa  88.6  3e-17  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1997  NADH dehydrogenase subunit I  32.85 
 
 		 167 aa  88.2  3e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0446418  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5172  NADH dehydrogenase subunit I  36.97 
 
 		 169 aa  88.2  4e-17  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.950727  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1301  NADH dehydrogenase subunit I  32.62 
 
 		 162 aa  87.8  4e-17  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  decreased coverage  0.00320411  normal  0.488956 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1660  NADH-quinone oxidoreductase, chain I  33.58 
 
 		 234 aa  87.4  6e-17  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1845  NADH-quinone oxidoreductase, chain I  34.31 
 
 		 175 aa  87.4  6e-17  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0346  NADH dehydrogenase I, I subunit  37.69 
 
 		 132 aa  87.4  7e-17  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1187  NADH dehydrogenase subunit I  35.29 
 
 		 164 aa  87  8e-17  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.438944  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2238  NADH dehydrogenase subunit I  36.03 
 
 		 163 aa  87  8e-17  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.180184 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3130  NADH-quinone oxidoreductase, chain I  36.22 
 
 		 135 aa  87  9e-17  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4126  NADH dehydrogenase subunit I  34.06 
 
 		 182 aa  86.7  1e-16  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4625  NADH dehydrogenase subunit I  31.69 
 
 		 162 aa  86.3  1e-16  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.11536 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1866  NADH dehydrogenase subunit I  34.06 
 
 		 182 aa  86.7  1e-16  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0422789 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0361  NADH dehydrogenase subunit I  35.66 
 
 		 167 aa  86.7  1e-16  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.326031  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0805  NADH dehydrogenase subunit I  31.21 
 
 		 163 aa  86.3  1e-16  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0289  NADH-quinone oxidoreductase, chain I  34.07 
 
 		 171 aa  86.7  1e-16  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.998746  normal  1 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0691  NADH dehydrogenase subunit I  34.27 
 
 		 169 aa  86.7  1e-16  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.438917  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1322  NADH dehydrogenase subunit I  32.17 
 
 		 164 aa  86.3  1e-16  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.323962  normal  0.0547108 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4553  NADH dehydrogenase subunit I  32.39 
 
 		 162 aa  86.7  1e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.128776 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0754  NADH dehydrogenase subunit I  34.56 
 
 		 164 aa  86.3  1e-16  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.180315  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1739  NADH dehydrogenase subunit I  34.06 
 
 		 182 aa  86.7  1e-16  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.235938  normal  0.220023 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3698  NADH dehydrogenase subunit I  34.06 
 
 		 182 aa  86.7  1e-16  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.380267  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4002  NADH-quinone oxidoreductase, chain I  35.38 
 
 		 132 aa  85.5  2e-16  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.89067e-17 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3918  NADH-quinone oxidoreductase, chain I  35.38 
 
 		 132 aa  85.5  2e-16  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3372  NADH dehydrogenase I, I subunit  32.12 
 
 		 182 aa  85.5  2e-16  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.675448  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0478  NADH-quinone oxidoreductase, chain I  30.5 
 
 		 180 aa  85.5  2e-16  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.195582 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3204  NADH dehydrogenase subunit I  32.12 
 
 		 182 aa  85.5  2e-16  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0843328  normal  0.169624 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4455  NADH dehydrogenase subunit I  33.59 
 
 		 211 aa  85.5  2e-16  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.829117  normal  0.833546 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3610  NADH dehydrogenase subunit I  34.06 
 
 		 182 aa  86.3  2e-16  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.487333  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2419  NADH dehydrogenase subunit I  36.22 
 
 		 182 aa  85.5  2e-16  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.193406 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4057  NADH dehydrogenase subunit I  32.59 
 
 		 211 aa  85.5  2e-16  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.819652  normal  0.545712 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2582  NADH dehydrogenase subunit I  31.91 
 
 		 162 aa  86.3  2e-16  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.561308  normal  0.2116 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1501  NADH dehydrogenase subunit I  34.04 
 
 		 177 aa  85.9  2e-16  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0649483  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2412  NADH dehydrogenase subunit I  31.69 
 
 		 162 aa  85.5  2e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0701412  normal  0.0109704 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1411  NADH dehydrogenase subunit I  36.97 
 
 		 165 aa  85.5  2e-16  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0328529 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2053  NADH dehydrogenase subunit I  36.21 
 
 		 163 aa  85.9  2e-16  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.330204  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2877  NADH dehydrogenase subunit I  32.39 
 
 		 162 aa  85.9  2e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.670141  normal  0.245456 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0917  NADH-quinone oxidoreductase, chain I  37.5 
 
 		 179 aa  85.5  2e-16  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.5865  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0204  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  36 
 
 		 149 aa  85.5  2e-16  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.891239  normal  0.656565 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2708  NADH-quinone oxidoreductase, chain I  37.04 
 
 		 247 aa  85.9  2e-16  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1432  NADH dehydrogenase subunit I  36.44 
 
 		 165 aa  86.3  2e-16  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.277545  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_28510  NADH dehydrogenase subunit I  35.43 
 
 		 182 aa  85.5  2e-16  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.559317  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1113  NADH-quinone oxidoreductase, chain I  35.78 
 
 		 170 aa  85.1  3e-16  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.182151  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1282  NADH-quinone oxidoreductase chain I  33.33 
 
 		 185 aa  85.5  3e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.425102 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3290  NADH dehydrogenase subunit I  30.5 
 
 		 162 aa  85.1  3e-16  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.221287  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0546  NADH dehydrogenase subunit I  35.56 
 
 		 217 aa  85.1  3e-16  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.175795  normal  0.434998 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1363  NADH dehydrogenase subunit I  31.69 
 
 		 162 aa  85.5  3e-16  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.353821  normal  0.140777 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>