More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tter_1536 on replicon NC_013525
Organism: Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013525  Tter_1536  NADH-quinone oxidoreductase, chain I  100 
 
 		 170 aa  355  9.999999999999999e-98  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6086  NADH dehydrogenase subunit I  44.2 
 
 		 211 aa  117  6e-26  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  decreased coverage  0.00224994  normal  0.0520295 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0546  NADH dehydrogenase subunit I  42.03 
 
 		 217 aa  116  1.9999999999999998e-25  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.175795  normal  0.434998 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1322  NADH dehydrogenase subunit I  42.11 
 
 		 164 aa  115  3e-25  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.323962  normal  0.0547108 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1187  NADH dehydrogenase subunit I  42.86 
 
 		 164 aa  114  5e-25  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.438944  normal  1 
 
 
-
 
NC_002978  WD0980  NADH dehydrogenase subunit I  39.01 
 
 		 169 aa  113  1.0000000000000001e-24  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3918  NADH-quinone oxidoreductase, chain I  44.09 
 
 		 132 aa  113  1.0000000000000001e-24  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4002  NADH-quinone oxidoreductase, chain I  44.09 
 
 		 132 aa  113  1.0000000000000001e-24  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.89067e-17 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1020  NADH dehydrogenase subunit I  40.88 
 
 		 171 aa  112  2.0000000000000002e-24  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.755319  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05703  hypothetical protein similar to : Formate hydrogenlyase subunit 6/NADH:ubiquinone oxidoreductase 23 kD subunit (Broad)  43.41 
 
 		 224 aa  112  3e-24  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.803618 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2523  NADH dehydrogenase subunit I  42.11 
 
 		 167 aa  112  3e-24  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.208294  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1185  NADH dehydrogenase subunit I  42.11 
 
 		 167 aa  112  3e-24  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0684834  normal  0.389473 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0820  NADH dehydrogenase subunit I  42.65 
 
 		 160 aa  112  3e-24  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1120  NADH dehydrogenase subunit I  40.29 
 
 		 180 aa  111  4.0000000000000004e-24  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.311189  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0754  NADH dehydrogenase subunit I  41.35 
 
 		 164 aa  110  7.000000000000001e-24  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.180315  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0917  NADH-quinone oxidoreductase, chain I  40.58 
 
 		 179 aa  110  8.000000000000001e-24  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.5865  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2238  NADH dehydrogenase subunit I  41.35 
 
 		 163 aa  110  9e-24  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.180184 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0786  NADH dehydrogenase subunit I  41.18 
 
 		 163 aa  110  1.0000000000000001e-23  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.079686  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4236  NADH-quinone oxidoreductase, chain I  44.09 
 
 		 132 aa  110  1.0000000000000001e-23  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000114859  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2292  NADH dehydrogenase subunit I  40.74 
 
 		 161 aa  110  1.0000000000000001e-23  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006681  CNL05770  conserved hypothetical protein  39.07 
 
 		 273 aa  109  2.0000000000000002e-23  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1845  NADH-quinone oxidoreductase, chain I  44.12 
 
 		 175 aa  109  2.0000000000000002e-23  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_28510  NADH dehydrogenase subunit I  41.18 
 
 		 182 aa  108  3e-23  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.559317  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0361  NADH dehydrogenase subunit I  41.09 
 
 		 167 aa  108  3e-23  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.326031  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2824  NADH dehydrogenase subunit I  42.22 
 
 		 164 aa  108  3e-23  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.704342  normal  0.0688011 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3130  NADH-quinone oxidoreductase, chain I  42.06 
 
 		 135 aa  108  3e-23  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0289  NADH-quinone oxidoreductase, chain I  42.96 
 
 		 171 aa  108  3e-23  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.998746  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1011  NADH dehydrogenase subunit I  42.96 
 
 		 162 aa  108  3e-23  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.210818  normal  0.566427 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0691  NADH dehydrogenase subunit I  40.43 
 
 		 169 aa  108  4.0000000000000004e-23  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.438917  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2549  NADH dehydrogenase subunit I  46.22 
 
 		 180 aa  108  5e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7683  NADH-quinone oxidoreductase, chain I  44.62 
 
 		 203 aa  108  5e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2415  NADH dehydrogenase subunit I  42.22 
 
 		 163 aa  107  5e-23  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.87535  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1997  NADH dehydrogenase subunit I  40.6 
 
 		 167 aa  108  5e-23  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0446418  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2667  NADH dehydrogenase subunit I  46.22 
 
 		 180 aa  108  5e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2460  NADH dehydrogenase subunit I  46.22 
 
 		 180 aa  108  5e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2560  NADH dehydrogenase subunit I  46.22 
 
 		 180 aa  108  5e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0213368  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2505  NADH dehydrogenase subunit I  46.22 
 
 		 180 aa  108  5e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2212  NADH dehydrogenase subunit I  40.44 
 
 		 162 aa  107  6e-23  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.199823  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02206  NADH dehydrogenase subunit I  45.38 
 
 		 180 aa  107  8.000000000000001e-23  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1376  NADH-quinone oxidoreductase, chain I  45.38 
 
 		 180 aa  107  8.000000000000001e-23  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00237006  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1352  NADH dehydrogenase subunit I  39.42 
 
 		 171 aa  107  8.000000000000001e-23  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2430  NADH dehydrogenase subunit I  45.38 
 
 		 180 aa  107  8.000000000000001e-23  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1371  NADH dehydrogenase subunit I  45.38 
 
 		 180 aa  107  8.000000000000001e-23  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.583652  normal  0.392913 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2574  NADH dehydrogenase subunit I  45.38 
 
 		 180 aa  107  8.000000000000001e-23  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0982  NADH-quinone oxidoreductase, chain I  42.03 
 
 		 214 aa  107  8.000000000000001e-23  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3420  NADH dehydrogenase subunit I  45.38 
 
 		 180 aa  107  8.000000000000001e-23  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02166  hypothetical protein  45.38 
 
 		 180 aa  107  8.000000000000001e-23  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2657  NADH dehydrogenase subunit I  45.38 
 
 		 180 aa  107  8.000000000000001e-23  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1692  NADH dehydrogenase subunit I  41.04 
 
 		 182 aa  107  8.000000000000001e-23  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2435  NADH dehydrogenase subunit I  45.38 
 
 		 180 aa  107  8.000000000000001e-23  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3336  NADH dehydrogenase subunit I  40.6 
 
 		 162 aa  107  8.000000000000001e-23  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.463064  normal  0.437664 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0346  NADH dehydrogenase I, I subunit  43.2 
 
 		 132 aa  107  9.000000000000001e-23  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1877  NADH dehydrogenase subunit I  39.71 
 
 		 174 aa  107  9.000000000000001e-23  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4126  NADH dehydrogenase subunit I  41.67 
 
 		 182 aa  106  1e-22  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1866  NADH dehydrogenase subunit I  41.67 
 
 		 182 aa  106  1e-22  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0422789 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0211  NADH dehydrogenase subunit I  40.43 
 
 		 176 aa  106  1e-22  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1739  NADH dehydrogenase subunit I  41.67 
 
 		 182 aa  106  1e-22  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.235938  normal  0.220023 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1563  NADH dehydrogenase subunit I  40 
 
 		 162 aa  106  1e-22  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.339949  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3698  NADH dehydrogenase subunit I  41.67 
 
 		 182 aa  106  1e-22  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.380267  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0929  NADH dehydrogenase subunit I  40.6 
 
 		 163 aa  107  1e-22  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4553  NADH dehydrogenase subunit I  42.22 
 
 		 162 aa  106  1e-22  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.128776 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13174  NADH dehydrogenase subunit I  42.65 
 
 		 218 aa  106  1e-22  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3301  NADH dehydrogenase subunit I  44.54 
 
 		 180 aa  106  2e-22  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.9572 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2419  NADH dehydrogenase subunit I  40.91 
 
 		 182 aa  105  2e-22  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.193406 
 
 
-
 
NC_009370  OSTLU_18502  predicted protein  40.74 
 
 		 167 aa  105  2e-22  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.0613487 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4625  NADH dehydrogenase subunit I  38.97 
 
 		 162 aa  106  2e-22  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.11536 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2582  NADH dehydrogenase subunit I  40.44 
 
 		 162 aa  106  2e-22  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.561308  normal  0.2116 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2877  NADH dehydrogenase subunit I  40.44 
 
 		 162 aa  105  2e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.670141  normal  0.245456 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0374  NADH dehydrogenase subunit I  40.74 
 
 		 180 aa  106  2e-22  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4398  NADH dehydrogenase subunit I  42.22 
 
 		 162 aa  106  2e-22  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1301  NADH dehydrogenase subunit I  40 
 
 		 162 aa  106  2e-22  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  decreased coverage  0.00320411  normal  0.488956 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2765  NADH dehydrogenase subunit I  39.86 
 
 		 180 aa  105  3e-22  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.128685  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1879  NADH dehydrogenase subunit I  39.71 
 
 		 162 aa  105  3e-22  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.508831  normal  0.262119 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3290  NADH dehydrogenase subunit I  39.71 
 
 		 162 aa  105  3e-22  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.221287  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2412  NADH dehydrogenase subunit I  37.67 
 
 		 162 aa  105  3e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0701412  normal  0.0109704 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1206  NADH dehydrogenase subunit I  42.22 
 
 		 162 aa  105  3e-22  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1077  NADH dehydrogenase subunit I  42.22 
 
 		 162 aa  105  3e-22  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.280148 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2825  NADH dehydrogenase subunit I  44.54 
 
 		 180 aa  105  4e-22  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.339444  normal  0.999371 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1809  NADH dehydrogenase subunit I  44.54 
 
 		 180 aa  105  4e-22  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.693845 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1461  NADH dehydrogenase subunit I  44.54 
 
 		 180 aa  105  4e-22  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1499  NADH dehydrogenase subunit I  41.54 
 
 		 180 aa  105  4e-22  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1401  NADH dehydrogenase subunit I  41.54 
 
 		 180 aa  104  4e-22  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.590324  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1030  NADH dehydrogenase subunit I  42.22 
 
 		 163 aa  105  4e-22  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.206882  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1567  NADH dehydrogenase subunit I  44.54 
 
 		 180 aa  105  4e-22  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.997394  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4057  NADH dehydrogenase subunit I  40.88 
 
 		 211 aa  105  4e-22  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.819652  normal  0.545712 
 
 
-
 
NC_004310  BR0810  NADH dehydrogenase subunit I  41.48 
 
 		 163 aa  104  5e-22  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.719018  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4455  NADH dehydrogenase subunit I  40.88 
 
 		 211 aa  104  5e-22  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.829117  normal  0.833546 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2543  NADH dehydrogenase subunit I  41.54 
 
 		 180 aa  104  5e-22  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.879169  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4134  NADH dehydrogenase subunit I  41.48 
 
 		 162 aa  104  5e-22  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.181277  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0805  NADH dehydrogenase subunit I  41.48 
 
 		 163 aa  104  5e-22  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1014  NADH dehydrogenase subunit I  39.55 
 
 		 180 aa  104  6e-22  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2708  NADH-quinone oxidoreductase, chain I  39.71 
 
 		 247 aa  104  6e-22  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3218  NADH dehydrogenase subunit I  40.44 
 
 		 163 aa  104  6e-22  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2993  NADH dehydrogenase subunit I  38.52 
 
 		 161 aa  104  6e-22  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1363  NADH dehydrogenase subunit I  39.1 
 
 		 162 aa  104  6e-22  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.353821  normal  0.140777 
 
 
-
 
NC_011682  PHATRDRAFT_14260  predicted protein  39.84 
 
 		 163 aa  103  8e-22  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0371  NADH-quinone oxidoreductase, chain I  42.75 
 
 		 229 aa  103  9e-22  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.839117  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1269  NADH dehydrogenase subunit I  40 
 
 		 163 aa  103  1e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.142775  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1411  NADH dehydrogenase subunit I  36.05 
 
 		 165 aa  103  1e-21  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0328529 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3627  NADH dehydrogenase subunit I  40 
 
 		 164 aa  103  1e-21  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0704772 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>