More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfum_0204 on replicon NC_008554
Organism: Syntrophobacter fumaroxidans MPOB



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008554  Sfum_0204  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  100 
 
 		 149 aa  310  3.9999999999999997e-84  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.891239  normal  0.656565 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0748  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  41.73 
 
 		 183 aa  121  3e-27  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.492726 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1563  NADH dehydrogenase subunit I  42.98 
 
 		 162 aa  106  9.000000000000001e-23  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.339949  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1411  NADH dehydrogenase subunit I  37.31 
 
 		 165 aa  100  6e-21  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0328529 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5172  NADH dehydrogenase subunit I  39.39 
 
 		 169 aa  99.4  1e-20  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.950727  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0917  NADH-quinone oxidoreductase, chain I  38.36 
 
 		 179 aa  99.8  1e-20  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.5865  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2708  NADH-quinone oxidoreductase, chain I  39.39 
 
 		 247 aa  99.4  2e-20  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0880  NADH dehydrogenase subunit I  41.32 
 
 		 170 aa  99.4  2e-20  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3336  NADH dehydrogenase subunit I  39.83 
 
 		 162 aa  97.8  4e-20  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.463064  normal  0.437664 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0528  NADH dehydrogenase subunit I  37.23 
 
 		 196 aa  97.4  6e-20  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0965  NADH dehydrogenase subunit I  40.5 
 
 		 170 aa  97.1  8e-20  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.837483  normal  0.0693949 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3221  NADH-quinone oxidoreductase, chain I  38.13 
 
 		 254 aa  96.7  9e-20  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.129277 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_07460  NADH dehydrogenase subunit I  39.53 
 
 		 252 aa  96.7  1e-19  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.0206751 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2805  NADH dehydrogenase subunit I  41.18 
 
 		 169 aa  95.1  3e-19  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.166718 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0289  NADH-quinone oxidoreductase, chain I  39.67 
 
 		 171 aa  93.6  9e-19  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.998746  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1271  NADH dehydrogenase subunit I  41.18 
 
 		 171 aa  92.8  1e-18  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.400573  normal  0.480107 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_01771  NADH dehydrogenase subunit I  40.6 
 
 		 208 aa  92  2e-18  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.351878  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1536  NADH-quinone oxidoreductase, chain I  39.23 
 
 		 170 aa  92  2e-18  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0547  NADH-quinone oxidoreductase, chain I  38.03 
 
 		 226 aa  92  2e-18  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.481769 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2292  NADH dehydrogenase subunit I  35.43 
 
 		 161 aa  92.4  2e-18  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1301  NADH dehydrogenase subunit I  35.43 
 
 		 162 aa  92  2e-18  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  decreased coverage  0.00320411  normal  0.488956 
 
 
-
 
NC_002978  WD0980  NADH dehydrogenase subunit I  36.89 
 
 		 169 aa  92  3e-18  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1011  NADH dehydrogenase subunit I  40.91 
 
 		 193 aa  91.7  3e-18  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1040  NADH dehydrogenase subunit I  40.91 
 
 		 193 aa  91.7  3e-18  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000326556 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0161  NADH dehydrogenase subunit I  40.6 
 
 		 208 aa  92  3e-18  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.646634  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0592  Formate hydrogenlyase subunit 6/NADH:ubiquinone oxidoreductase 23 kD subunit (chain I)-like protein  38.84 
 
 		 171 aa  91.7  3e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0994  NADH dehydrogenase subunit I  36.29 
 
 		 163 aa  91.3  4e-18  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0829  NADH dehydrogenase subunit I  34.85 
 
 		 163 aa  91.3  4e-18  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.260339  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4625  NADH dehydrogenase subunit I  34.68 
 
 		 162 aa  91.3  4e-18  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.11536 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_01791  NADH dehydrogenase subunit I  40.6 
 
 		 208 aa  91.3  4e-18  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_01881  NADH dehydrogenase subunit I  40.6 
 
 		 208 aa  91.3  4e-18  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1043  NADH dehydrogenase subunit I  35.83 
 
 		 163 aa  90.9  5e-18  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0820  NADH dehydrogenase subunit I  35.83 
 
 		 160 aa  90.9  5e-18  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0957  NADH dehydrogenase subunit I  37.5 
 
 		 162 aa  90.5  6e-18  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0765322  normal  0.470027 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2715  NADH dehydrogenase subunit I  40.15 
 
 		 194 aa  90.9  6e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.451197 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1962  NADH dehydrogenase subunit I  36.29 
 
 		 163 aa  90.5  6e-18  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.528282  normal  0.0448739 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1501  NADH dehydrogenase subunit I  35.61 
 
 		 177 aa  90.5  7e-18  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0649483  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3125  NADH dehydrogenase subunit I  35.34 
 
 		 179 aa  90.5  7e-18  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3347  NADH-quinone oxidoreductase, chain I  39.34 
 
 		 131 aa  90.5  8e-18  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.715886  normal  0.525186 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1660  NADH-quinone oxidoreductase, chain I  35.77 
 
 		 234 aa  90.1  9e-18  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0346  NADH dehydrogenase I, I subunit  38.52 
 
 		 132 aa  89.7  1e-17  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2993  NADH dehydrogenase subunit I  33.6 
 
 		 161 aa  89.7  1e-17  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3248  NADH dehydrogenase subunit I  36.97 
 
 		 165 aa  90.1  1e-17  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.779883  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5061  NADH-quinone oxidoreductase, chain I  39.67 
 
 		 185 aa  89.7  1e-17  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.451376  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3218  NADH dehydrogenase subunit I  34.96 
 
 		 163 aa  90.1  1e-17  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2238  NADH dehydrogenase subunit I  35.43 
 
 		 163 aa  89.7  1e-17  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.180184 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_02321  NADH dehydrogenase subunit I  39.55 
 
 		 218 aa  89  2e-17  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1526  NADH dehydrogenase subunit I  39.55 
 
 		 218 aa  89  2e-17  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4398  NADH dehydrogenase subunit I  33.06 
 
 		 162 aa  88.6  2e-17  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4455  NADH dehydrogenase subunit I  39.02 
 
 		 211 aa  89  2e-17  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.829117  normal  0.833546 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0825  NADH dehydrogenase subunit I  34.62 
 
 		 163 aa  89.4  2e-17  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1344  NADH dehydrogenase subunit I  39.39 
 
 		 202 aa  89  2e-17  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0554  NADH dehydrogenase subunit I  32.85 
 
 		 168 aa  89  2e-17  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0546  NADH dehydrogenase subunit I  39.34 
 
 		 217 aa  89  2e-17  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.175795  normal  0.434998 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0477  NADH-quinone oxidoreductase, chain I  40.16 
 
 		 300 aa  89.4  2e-17  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.376416  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4134  NADH dehydrogenase subunit I  33.06 
 
 		 162 aa  89  2e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.181277  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3502  NADH dehydrogenase subunit I  36.36 
 
 		 181 aa  89.4  2e-17  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1609  NADH dehydrogenase subunit I  32.85 
 
 		 163 aa  89  2e-17  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_26891  NADH dehydrogenase subunit I  38.89 
 
 		 218 aa  88.6  3e-17  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2687  NADH dehydrogenase subunit I  38.84 
 
 		 183 aa  88.2  3e-17  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0721276  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0982  NADH-quinone oxidoreductase, chain I  36.36 
 
 		 214 aa  88.6  3e-17  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1322  NADH dehydrogenase subunit I  32.19 
 
 		 164 aa  88.6  3e-17  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.323962  normal  0.0547108 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4057  NADH dehydrogenase subunit I  37.4 
 
 		 211 aa  88.6  3e-17  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.819652  normal  0.545712 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0929  NADH dehydrogenase subunit I  34.13 
 
 		 163 aa  88.2  3e-17  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1187  NADH dehydrogenase subunit I  34.92 
 
 		 164 aa  88.6  3e-17  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.438944  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1542  NADH dehydrogenase subunit I  34.13 
 
 		 174 aa  88.2  3e-17  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.383544  normal  0.0726132 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1572  NADH dehydrogenase subunit I  34.13 
 
 		 174 aa  88.2  3e-17  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1578  NADH dehydrogenase subunit I  39.39 
 
 		 209 aa  88.6  3e-17  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.116678  normal  0.902926 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3627  NADH dehydrogenase subunit I  34.59 
 
 		 164 aa  88.6  3e-17  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0704772 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1596  NADH dehydrogenase subunit I  34.13 
 
 		 174 aa  88.2  3e-17  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.557888  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0281  NADH dehydrogenase subunit I  38.89 
 
 		 210 aa  87.8  4e-17  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0401  NADH-plastoquinone oxidoreductase subunit I  39.39 
 
 		 194 aa  87.8  4e-17  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1820  NADH dehydrogenase subunit I  36.97 
 
 		 211 aa  87.8  4e-17  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.000000189199  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0691  NADH dehydrogenase subunit I  33.58 
 
 		 169 aa  88.2  4e-17  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.438917  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2053  NADH dehydrogenase subunit I  34.56 
 
 		 163 aa  87.8  4e-17  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.330204  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1509  NADH dehydrogenase subunit I  39.29 
 
 		 165 aa  87.8  5e-17  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00304735 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2411  NADH dehydrogenase subunit I  38.89 
 
 		 215 aa  87.8  5e-17  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2528  NADH dehydrogenase subunit I  42.15 
 
 		 200 aa  87.8  5e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1432  NADH dehydrogenase subunit I  36.13 
 
 		 165 aa  87.4  5e-17  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.277545  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6086  NADH dehydrogenase subunit I  36 
 
 		 211 aa  87.4  6e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  decreased coverage  0.00224994  normal  0.0520295 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4236  NADH-quinone oxidoreductase, chain I  36.07 
 
 		 132 aa  87.4  6e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000114859  n/a   
 
 
-
 
NC_006681  CNL05770  conserved hypothetical protein  36.75 
 
 		 273 aa  87.4  6e-17  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0361  NADH dehydrogenase subunit I  36.52 
 
 		 167 aa  87.4  6e-17  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.326031  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1150  NADH dehydrogenase subunit I  39.17 
 
 		 162 aa  87.4  6e-17  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009370  OSTLU_18502  predicted protein  35.77 
 
 		 167 aa  87.4  6e-17  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.0613487 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0754  NADH dehydrogenase subunit I  34.09 
 
 		 164 aa  87.4  6e-17  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.180315  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_01761  NADH dehydrogenase subunit I  38.89 
 
 		 215 aa  87  7e-17  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.273282  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2622  NADH dehydrogenase subunit I  37.19 
 
 		 163 aa  87  7e-17  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2041  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  36.72 
 
 		 165 aa  87  7e-17  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000212693  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0211  NADH dehydrogenase subunit I  39.5 
 
 		 176 aa  87.4  7e-17  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0257  NADH-plastoquinone oxidoreductase subunit I  38.84 
 
 		 207 aa  87  7e-17  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2249  NADH dehydrogenase subunit I  37.19 
 
 		 163 aa  87  7e-17  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.650546  hitchhiker  0.0000391532 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0394  NADH-quinone oxidoreductase, chain I  35.77 
 
 		 175 aa  87  7e-17  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1099  NADH dehydrogenase subunit I  36.36 
 
 		 162 aa  87  8e-17  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2212  NADH dehydrogenase subunit I  32.26 
 
 		 162 aa  87  8e-17  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.199823  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1598  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  36.02 
 
 		 207 aa  87  9e-17  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3918  NADH-quinone oxidoreductase, chain I  36.97 
 
 		 132 aa  87  9e-17  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0935  NADH dehydrogenase subunit I  37.5 
 
 		 163 aa  86.7  9e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.13658  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4002  NADH-quinone oxidoreductase, chain I  36.97 
 
 		 132 aa  87  9e-17  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.89067e-17 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0969  NADH dehydrogenase subunit I  38.33 
 
 		 163 aa  86.7  1e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0765514  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>