More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Namu_0982 on replicon NC_013235
Organism: Nakamurella multipartita DSM 44233



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013235  Namu_0982  NADH-quinone oxidoreductase, chain I  100 
 
 
214 aa  443  1.0000000000000001e-124  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6674  NADH dehydrogenase subunit I  84.21 
 
 
188 aa  307  9e-83  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_03240  NADH dehydrogenase subunit I  81.01 
 
 
187 aa  304  7e-82  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0546  NADH dehydrogenase subunit I  72.87 
 
 
217 aa  278  3e-74  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.175795  normal  0.434998 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6086  NADH dehydrogenase subunit I  72.78 
 
 
211 aa  272  3e-72  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  decreased coverage  0.00224994  normal  0.0520295 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0592  Formate hydrogenlyase subunit 6/NADH:ubiquinone oxidoreductase 23 kD subunit (chain I)-like protein  79.63 
 
 
171 aa  271  4.0000000000000004e-72  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5061  NADH-quinone oxidoreductase, chain I  76.22 
 
 
185 aa  266  1e-70  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.451376  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4410  NADH-quinone oxidoreductase, chain I  71.51 
 
 
194 aa  267  1e-70  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4057  NADH dehydrogenase subunit I  80.13 
 
 
211 aa  266  2e-70  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.819652  normal  0.545712 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4455  NADH dehydrogenase subunit I  79.49 
 
 
211 aa  265  4e-70  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.829117  normal  0.833546 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4550  NADH-quinone oxidoreductase, chain I  77.85 
 
 
211 aa  264  5.999999999999999e-70  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2687  NADH dehydrogenase subunit I  75.61 
 
 
183 aa  265  5.999999999999999e-70  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0721276  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1282  NADH-quinone oxidoreductase chain I  69.89 
 
 
185 aa  264  5.999999999999999e-70  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.425102 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0275  NADH dehydrogenase subunit I  76.73 
 
 
199 aa  264  1e-69  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0528  NADH dehydrogenase subunit I  71.98 
 
 
196 aa  263  1e-69  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0289  NADH-quinone oxidoreductase, chain I  77.78 
 
 
171 aa  262  3e-69  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.998746  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1877  NADH dehydrogenase subunit I  74.69 
 
 
174 aa  255  4e-67  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4489  NADH dehydrogenase subunit I  74.07 
 
 
175 aa  253  1.0000000000000001e-66  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.159742 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0394  NADH-quinone oxidoreductase, chain I  73.29 
 
 
175 aa  253  2.0000000000000002e-66  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13174  NADH dehydrogenase subunit I  73.75 
 
 
218 aa  250  1e-65  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1542  NADH dehydrogenase subunit I  71.6 
 
 
174 aa  245  3e-64  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.383544  normal  0.0726132 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1572  NADH dehydrogenase subunit I  71.6 
 
 
174 aa  245  3e-64  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7683  NADH-quinone oxidoreductase, chain I  74.05 
 
 
203 aa  246  3e-64  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1596  NADH dehydrogenase subunit I  71.6 
 
 
174 aa  245  3e-64  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.557888  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3176  NADH-quinone oxidoreductase, chain I  70.7 
 
 
167 aa  236  2e-61  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2708  NADH-quinone oxidoreductase, chain I  68.94 
 
 
247 aa  232  3e-60  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3221  NADH-quinone oxidoreductase, chain I  67.08 
 
 
254 aa  231  9e-60  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.129277 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0547  NADH-quinone oxidoreductase, chain I  56.68 
 
 
226 aa  223  1e-57  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.481769 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_07460  NADH dehydrogenase subunit I  65.85 
 
 
252 aa  220  9.999999999999999e-57  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.0206751 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0477  NADH-quinone oxidoreductase, chain I  62.42 
 
 
300 aa  209  3e-53  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.376416  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0371  NADH-quinone oxidoreductase, chain I  52.9 
 
 
229 aa  157  2e-37  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.839117  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0917  NADH-quinone oxidoreductase, chain I  53.24 
 
 
179 aa  147  2.0000000000000003e-34  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.5865  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1869  NADH-quinone oxidoreductase chain I  49.28 
 
 
177 aa  141  9e-33  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2235  NADH-quinone oxidoreductase, chain I  49.24 
 
 
165 aa  138  7e-32  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.272952  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1275  NADH-quinone oxidoreductase, chain I  51.91 
 
 
199 aa  138  7e-32  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1157  NADH-quinone oxidoreductase, chain I  46.79 
 
 
177 aa  136  2e-31  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1845  NADH-quinone oxidoreductase, chain I  47.06 
 
 
175 aa  136  2e-31  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3387  NADH-quinone oxidoreductase, chain I  49.24 
 
 
165 aa  135  3.0000000000000003e-31  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.533197  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3216  NADH-quinone oxidoreductase, chain I  46.67 
 
 
168 aa  134  7.000000000000001e-31  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0211  NADH dehydrogenase subunit I  47.52 
 
 
176 aa  130  2.0000000000000002e-29  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3434  NADH dehydrogenase subunit I  43.7 
 
 
176 aa  118  7e-26  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.460482  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0163  NADH dehydrogenase subunit I  42.96 
 
 
184 aa  117  9e-26  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002978  WD0980  NADH dehydrogenase subunit I  41.18 
 
 
169 aa  117  9.999999999999999e-26  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3336  NADH dehydrogenase subunit I  43.88 
 
 
162 aa  116  1.9999999999999998e-25  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.463064  normal  0.437664 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1238  NADH-quinone oxidoreductase, chain I  38.93 
 
 
181 aa  114  1.0000000000000001e-24  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3125  NADH dehydrogenase subunit I  42.75 
 
 
179 aa  114  2.0000000000000002e-24  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2765  NADH dehydrogenase subunit I  40.97 
 
 
180 aa  112  4.0000000000000004e-24  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.128685  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1499  NADH dehydrogenase subunit I  40.28 
 
 
180 aa  110  1.0000000000000001e-23  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1113  NADH-quinone oxidoreductase, chain I  41.79 
 
 
170 aa  110  2.0000000000000002e-23  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.182151  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1041  NADH-quinone oxidoreductase, chain I  50 
 
 
165 aa  109  4.0000000000000004e-23  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1401  NADH dehydrogenase subunit I  38.89 
 
 
180 aa  108  7.000000000000001e-23  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.590324  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4126  NADH dehydrogenase subunit I  41.22 
 
 
182 aa  108  8.000000000000001e-23  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3698  NADH dehydrogenase subunit I  41.22 
 
 
182 aa  108  8.000000000000001e-23  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.380267  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7011  NADH-quinone oxidoreductase, chain I  39.04 
 
 
169 aa  108  8.000000000000001e-23  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1739  NADH dehydrogenase subunit I  41.22 
 
 
182 aa  108  8.000000000000001e-23  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.235938  normal  0.220023 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1866  NADH dehydrogenase subunit I  41.22 
 
 
182 aa  108  8.000000000000001e-23  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.0422789 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2543  NADH dehydrogenase subunit I  38.89 
 
 
180 aa  108  9.000000000000001e-23  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.879169  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1020  NADH dehydrogenase subunit I  39.85 
 
 
171 aa  107  1e-22  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.755319  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1536  NADH-quinone oxidoreductase, chain I  42.03 
 
 
170 aa  107  1e-22  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0323  NADH dehydrogenase subunit I  39.01 
 
 
176 aa  107  1e-22  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1014  NADH dehydrogenase subunit I  40.46 
 
 
180 aa  106  2e-22  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1043  NADH dehydrogenase subunit I  40.3 
 
 
163 aa  107  2e-22  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1563  NADH dehydrogenase subunit I  38.41 
 
 
162 aa  106  2e-22  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.339949  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0829  NADH dehydrogenase subunit I  40.3 
 
 
163 aa  107  2e-22  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.260339  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_28510  NADH dehydrogenase subunit I  40.46 
 
 
182 aa  106  2e-22  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.559317  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3372  NADH dehydrogenase I, I subunit  42.14 
 
 
182 aa  106  3e-22  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.675448  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3918  NADH-quinone oxidoreductase, chain I  41.22 
 
 
132 aa  106  3e-22  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4002  NADH-quinone oxidoreductase, chain I  41.22 
 
 
132 aa  106  3e-22  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.89067e-17 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1374  NADH dehydrogenase I chain I  39.46 
 
 
175 aa  106  3e-22  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  decreased coverage  0.00228535  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1352  NADH dehydrogenase subunit I  38.52 
 
 
171 aa  105  4e-22  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4398  NADH dehydrogenase subunit I  38.64 
 
 
162 aa  105  4e-22  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4134  NADH dehydrogenase subunit I  38.64 
 
 
162 aa  105  4e-22  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.181277  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1120  NADH dehydrogenase subunit I  39.42 
 
 
180 aa  105  5e-22  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.311189  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2419  NADH dehydrogenase subunit I  40.46 
 
 
182 aa  104  8e-22  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.193406 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3301  NADH dehydrogenase subunit I  38.89 
 
 
180 aa  104  8e-22  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.9572 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2667  NADH dehydrogenase subunit I  39.58 
 
 
180 aa  104  8e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2460  NADH dehydrogenase subunit I  39.58 
 
 
180 aa  104  9e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2505  NADH dehydrogenase subunit I  39.58 
 
 
180 aa  104  9e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2549  NADH dehydrogenase subunit I  39.58 
 
 
180 aa  104  9e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1692  NADH dehydrogenase subunit I  40.46 
 
 
182 aa  104  9e-22  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2560  NADH dehydrogenase subunit I  39.58 
 
 
180 aa  104  9e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0213368  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3204  NADH dehydrogenase subunit I  41.43 
 
 
182 aa  104  1e-21  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0843328  normal  0.169624 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1809  NADH dehydrogenase subunit I  39.58 
 
 
180 aa  104  1e-21  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.693845 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1185  NADH dehydrogenase subunit I  37.78 
 
 
167 aa  104  1e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0684834  normal  0.389473 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2523  NADH dehydrogenase subunit I  37.78 
 
 
167 aa  104  1e-21  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.208294  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3818  NADH-quinone oxidoreductase, chain I  38.81 
 
 
171 aa  103  1e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.121238  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2562  NADH dehydrogenase subunit I  39.85 
 
 
182 aa  104  1e-21  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2867  NADH-quinone oxidoreductase, chain I  38.52 
 
 
171 aa  104  1e-21  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.708253  normal  0.0292468 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1567  NADH dehydrogenase subunit I  39.58 
 
 
180 aa  104  1e-21  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.997394  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_29920  NADH dehydrogenase subunit I  39.85 
 
 
182 aa  104  1e-21  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.546828  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1461  NADH dehydrogenase subunit I  39.58 
 
 
180 aa  104  1e-21  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1376  NADH-quinone oxidoreductase, chain I  38.89 
 
 
180 aa  103  2e-21  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00237006  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2825  NADH dehydrogenase subunit I  44.35 
 
 
180 aa  103  2e-21  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.339444  normal  0.999371 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1371  NADH dehydrogenase subunit I  38.89 
 
 
180 aa  103  2e-21  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.583652  normal  0.392913 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1879  NADH dehydrogenase subunit I  39.39 
 
 
162 aa  103  2e-21  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.508831  normal  0.262119 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02166  hypothetical protein  38.89 
 
 
180 aa  103  2e-21  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2574  NADH dehydrogenase subunit I  38.89 
 
 
180 aa  103  2e-21  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4625  NADH dehydrogenase subunit I  37.68 
 
 
162 aa  103  2e-21  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.11536 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2435  NADH dehydrogenase subunit I  38.89 
 
 
180 aa  103  2e-21  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3627  NADH dehydrogenase subunit I  37.68 
 
 
164 aa  103  2e-21  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.0704772 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>