More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Psyr_3204 on replicon NC_007005
Organism: Pseudomonas syringae pv. syringae B728a



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007005  Psyr_3204  NADH dehydrogenase subunit I  100 
 
 		 182 aa  378  1e-104  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0843328  normal  0.169624 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3372  NADH dehydrogenase I, I subunit  98.9 
 
 		 182 aa  376  1e-103  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.675448  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3610  NADH dehydrogenase subunit I  97.8 
 
 		 182 aa  374  1e-103  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.487333  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4126  NADH dehydrogenase subunit I  96.7 
 
 		 182 aa  367  1e-101  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1739  NADH dehydrogenase subunit I  96.7 
 
 		 182 aa  367  1e-101  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.235938  normal  0.220023 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1866  NADH dehydrogenase subunit I  96.7 
 
 		 182 aa  367  1e-101  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0422789 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3698  NADH dehydrogenase subunit I  96.7 
 
 		 182 aa  367  1e-101  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.380267  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2419  NADH dehydrogenase subunit I  92.86 
 
 		 182 aa  357  7e-98  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.193406 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2562  NADH dehydrogenase subunit I  90.66 
 
 		 182 aa  348  3e-95  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_29920  NADH dehydrogenase subunit I  90.66 
 
 		 182 aa  348  3e-95  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.546828  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_28510  NADH dehydrogenase subunit I  89.56 
 
 		 182 aa  345  2e-94  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.559317  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1014  NADH dehydrogenase subunit I  82.29 
 
 		 180 aa  311  2.9999999999999996e-84  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1809  NADH dehydrogenase subunit I  82.02 
 
 		 180 aa  309  2e-83  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.693845 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1461  NADH dehydrogenase subunit I  82.02 
 
 		 180 aa  309  2e-83  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1567  NADH dehydrogenase subunit I  82.02 
 
 		 180 aa  309  2e-83  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.997394  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2825  NADH dehydrogenase subunit I  81.46 
 
 		 180 aa  308  2.9999999999999997e-83  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.339444  normal  0.999371 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02206  NADH dehydrogenase subunit I  82.02 
 
 		 180 aa  308  4e-83  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1376  NADH-quinone oxidoreductase, chain I  82.02 
 
 		 180 aa  308  4e-83  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00237006  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2574  NADH dehydrogenase subunit I  82.02 
 
 		 180 aa  308  4e-83  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3420  NADH dehydrogenase subunit I  82.02 
 
 		 180 aa  308  4e-83  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2657  NADH dehydrogenase subunit I  82.02 
 
 		 180 aa  308  4e-83  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2435  NADH dehydrogenase subunit I  82.02 
 
 		 180 aa  308  4e-83  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2430  NADH dehydrogenase subunit I  82.02 
 
 		 180 aa  308  4e-83  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02166  hypothetical protein  82.02 
 
 		 180 aa  308  4e-83  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1371  NADH dehydrogenase subunit I  82.02 
 
 		 180 aa  308  4e-83  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.583652  normal  0.392913 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3125  NADH dehydrogenase subunit I  79.78 
 
 		 179 aa  307  5.9999999999999995e-83  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2460  NADH dehydrogenase subunit I  81.46 
 
 		 180 aa  306  1.0000000000000001e-82  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2549  NADH dehydrogenase subunit I  81.46 
 
 		 180 aa  306  1.0000000000000001e-82  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2505  NADH dehydrogenase subunit I  81.46 
 
 		 180 aa  306  1.0000000000000001e-82  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2560  NADH dehydrogenase subunit I  81.46 
 
 		 180 aa  306  1.0000000000000001e-82  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0213368  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2667  NADH dehydrogenase subunit I  81.46 
 
 		 180 aa  305  2.0000000000000002e-82  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3301  NADH dehydrogenase subunit I  81.46 
 
 		 180 aa  305  2.0000000000000002e-82  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.9572 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2765  NADH dehydrogenase subunit I  79.78 
 
 		 180 aa  299  1e-80  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.128685  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1499  NADH dehydrogenase subunit I  79.21 
 
 		 180 aa  298  4e-80  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1692  NADH dehydrogenase subunit I  75.82 
 
 		 182 aa  296  8e-80  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2543  NADH dehydrogenase subunit I  78.65 
 
 		 180 aa  296  1e-79  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.879169  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1401  NADH dehydrogenase subunit I  78.09 
 
 		 180 aa  295  2e-79  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.590324  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0591  NADH dehydrogenase subunit I  75.82 
 
 		 182 aa  281  3.0000000000000004e-75  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0623179  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0580  NADH dehydrogenase subunit I  75.82 
 
 		 182 aa  281  5.000000000000001e-75  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0627884  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1120  NADH dehydrogenase subunit I  74.12 
 
 		 180 aa  276  1e-73  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.311189  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0374  NADH dehydrogenase subunit I  72.47 
 
 		 180 aa  268  2e-71  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1352  NADH dehydrogenase subunit I  72.19 
 
 		 171 aa  259  2e-68  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2867  NADH-quinone oxidoreductase, chain I  69.82 
 
 		 171 aa  258  2e-68  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.708253  normal  0.0292468 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3818  NADH-quinone oxidoreductase, chain I  69.82 
 
 		 171 aa  253  1.0000000000000001e-66  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.121238  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1113  NADH-quinone oxidoreductase, chain I  71.01 
 
 		 170 aa  252  3e-66  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.182151  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1020  NADH dehydrogenase subunit I  70.41 
 
 		 171 aa  251  4.0000000000000004e-66  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.755319  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0711  NADH-quinone oxidoreductase, chain I  69.46 
 
 		 170 aa  246  1e-64  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0425782  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4064  NADH dehydrogenase subunit I  65.27 
 
 		 171 aa  228  4e-59  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0149353  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1333  NADH dehydrogenase subunit I  65.27 
 
 		 171 aa  228  5e-59  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1354  NADH dehydrogenase subunit I  65.27 
 
 		 171 aa  226  1e-58  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.253044  normal  0.161644 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4736  NADH dehydrogenase subunit I  63.47 
 
 		 173 aa  223  1e-57  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.161018  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0107  NADH dehydrogenase subunit I  62.87 
 
 		 164 aa  211  4.9999999999999996e-54  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.807538  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1696  NADH dehydrogenase subunit I  61.68 
 
 		 164 aa  210  7.999999999999999e-54  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  hitchhiker  0.00251501  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1743  NADH dehydrogenase subunit I  62.28 
 
 		 164 aa  209  1e-53  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  decreased coverage  0.00386762  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0323  NADH dehydrogenase subunit I  60.37 
 
 		 176 aa  205  2e-52  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0172  NADH dehydrogenase subunit I  60.36 
 
 		 176 aa  203  9e-52  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3434  NADH dehydrogenase subunit I  59.15 
 
 		 176 aa  202  2e-51  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.460482  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0154  NADH dehydrogenase subunit I  58.08 
 
 		 176 aa  202  2e-51  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.947551 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0163  NADH dehydrogenase subunit I  57.32 
 
 		 184 aa  199  1.9999999999999998e-50  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0211  NADH dehydrogenase subunit I  55.75 
 
 		 176 aa  194  5.000000000000001e-49  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1940  NADH dehydrogenase subunit I  57.93 
 
 		 178 aa  192  3e-48  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.509162 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0917  NADH-quinone oxidoreductase, chain I  48.67 
 
 		 179 aa  134  5e-31  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.5865  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1275  NADH-quinone oxidoreductase, chain I  43.71 
 
 		 199 aa  129  2.0000000000000002e-29  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7011  NADH-quinone oxidoreductase, chain I  41.72 
 
 		 169 aa  129  3e-29  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1869  NADH-quinone oxidoreductase chain I  42.38 
 
 		 177 aa  127  8.000000000000001e-29  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0275  NADH dehydrogenase subunit I  46.43 
 
 		 199 aa  124  1e-27  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5106  NADH-quinone oxidoreductase, chain I  42.86 
 
 		 188 aa  122  3e-27  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009370  OSTLU_18502  predicted protein  45.31 
 
 		 167 aa  122  3e-27  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.0613487 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3615  NADH-quinone oxidoreductase, chain I  43.15 
 
 		 211 aa  122  4e-27  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1282  NADH-quinone oxidoreductase chain I  43.85 
 
 		 185 aa  120  8e-27  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.425102 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4550  NADH-quinone oxidoreductase, chain I  48.41 
 
 		 211 aa  120  9.999999999999999e-27  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0546  NADH dehydrogenase subunit I  48.41 
 
 		 217 aa  120  9.999999999999999e-27  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.175795  normal  0.434998 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4057  NADH dehydrogenase subunit I  43.7 
 
 		 211 aa  118  4.9999999999999996e-26  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.819652  normal  0.545712 
 
 
-
 
NC_002978  WD0980  NADH dehydrogenase subunit I  44.53 
 
 		 169 aa  117  7.999999999999999e-26  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4455  NADH dehydrogenase subunit I  42.75 
 
 		 211 aa  117  9e-26  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.829117  normal  0.833546 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0592  Formate hydrogenlyase subunit 6/NADH:ubiquinone oxidoreductase 23 kD subunit (chain I)-like protein  44.44 
 
 		 171 aa  117  9.999999999999999e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1374  NADH dehydrogenase I chain I  41.67 
 
 		 175 aa  117  9.999999999999999e-26  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  decreased coverage  0.00228535  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6086  NADH dehydrogenase subunit I  43.66 
 
 		 211 aa  116  1.9999999999999998e-25  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  decreased coverage  0.00224994  normal  0.0520295 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7683  NADH-quinone oxidoreductase, chain I  46.83 
 
 		 203 aa  116  1.9999999999999998e-25  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1157  NADH-quinone oxidoreductase, chain I  42 
 
 		 177 aa  116  1.9999999999999998e-25  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011682  PHATRDRAFT_14260  predicted protein  44.27 
 
 		 163 aa  116  1.9999999999999998e-25  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0289  NADH-quinone oxidoreductase, chain I  44.53 
 
 		 171 aa  115  3e-25  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.998746  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3336  NADH dehydrogenase subunit I  39.57 
 
 		 162 aa  115  3.9999999999999997e-25  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.463064  normal  0.437664 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0394  NADH-quinone oxidoreductase, chain I  44.44 
 
 		 175 aa  115  3.9999999999999997e-25  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0528  NADH dehydrogenase subunit I  42 
 
 		 196 aa  115  3.9999999999999997e-25  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4080  NADH-quinone oxidoreductase, chain I  45.38 
 
 		 197 aa  115  5e-25  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.0562629 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0929  NADH dehydrogenase subunit I  42.19 
 
 		 163 aa  114  6e-25  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2708  NADH-quinone oxidoreductase, chain I  45.24 
 
 		 247 aa  114  7.999999999999999e-25  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0547  NADH-quinone oxidoreductase, chain I  41.92 
 
 		 226 aa  114  8.999999999999998e-25  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.481769 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1301  NADH dehydrogenase subunit I  38.03 
 
 		 162 aa  114  8.999999999999998e-25  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  decreased coverage  0.00320411  normal  0.488956 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6674  NADH dehydrogenase subunit I  45 
 
 		 188 aa  114  1.0000000000000001e-24  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2993  NADH dehydrogenase subunit I  37.67 
 
 		 161 aa  114  1.0000000000000001e-24  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0477  NADH-quinone oxidoreductase, chain I  43.75 
 
 		 300 aa  113  2.0000000000000002e-24  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.376416  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2292  NADH dehydrogenase subunit I  38.3 
 
 		 161 aa  112  2.0000000000000002e-24  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2238  NADH dehydrogenase subunit I  41.01 
 
 		 163 aa  112  2.0000000000000002e-24  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.180184 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1238  NADH-quinone oxidoreductase, chain I  40.14 
 
 		 181 aa  112  2.0000000000000002e-24  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4410  NADH-quinone oxidoreductase, chain I  42.75 
 
 		 194 aa  112  3e-24  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1563  NADH dehydrogenase subunit I  40.46 
 
 		 162 aa  112  3e-24  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.339949  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13174  NADH dehydrogenase subunit I  45.71 
 
 		 218 aa  112  3e-24  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2687  NADH dehydrogenase subunit I  42.75 
 
 		 183 aa  111  4.0000000000000004e-24  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0721276  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>