More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hoch_4515 on replicon NC_013440
Organism: Haliangium ochraceum DSM 14365



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013440  Hoch_4515  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  100 
 
 
204 aa  420  1e-117  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.203354  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1385  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  51.53 
 
 
239 aa  166  2e-40  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.236148  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2564  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding protein  51.53 
 
 
239 aa  166  2e-40  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1284  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  51.53 
 
 
239 aa  166  2e-40  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1296  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  52.76 
 
 
238 aa  166  2e-40  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.109179  normal 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0164  NADH-ubiquinone oxidoreductase subunit 8  45.39 
 
 
165 aa  122  5e-27  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3918  NADH-quinone oxidoreductase, chain I  47.48 
 
 
132 aa  107  1e-22  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4002  NADH-quinone oxidoreductase, chain I  47.48 
 
 
132 aa  107  1e-22  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.89067e-17 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0825  NADH dehydrogenase subunit I  41.38 
 
 
163 aa  105  4e-22  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4236  NADH-quinone oxidoreductase, chain I  47.48 
 
 
132 aa  105  4e-22  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000114859  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0346  NADH dehydrogenase I, I subunit  49.29 
 
 
132 aa  104  7e-22  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4074  NADH-quinone oxidoreductase, chain I  40.52 
 
 
165 aa  104  8e-22  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.138304  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5106  NADH-quinone oxidoreductase, chain I  39.87 
 
 
188 aa  103  1e-21  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1238  NADH-quinone oxidoreductase, chain I  36.13 
 
 
181 aa  103  3e-21  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3130  NADH-quinone oxidoreductase, chain I  44.6 
 
 
135 aa  102  3e-21  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1411  NADH dehydrogenase subunit I  39.87 
 
 
165 aa  102  4e-21  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.0328529 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3347  NADH-quinone oxidoreductase, chain I  47.86 
 
 
131 aa  102  5e-21  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.715886  normal  0.525186 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0636  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  38.24 
 
 
186 aa  101  7e-21  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1631  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  38.24 
 
 
186 aa  101  7e-21  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3185  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  38.24 
 
 
186 aa  101  7e-21  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1956  NADH-quinone oxidoreductase, chain I  37.91 
 
 
162 aa  101  9e-21  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.198639  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3865  NADH-quinone oxidoreductase, chain I  39.26 
 
 
222 aa  100  1e-20  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0729  NADH dehydrogenase subunit I  39.22 
 
 
162 aa  99.4  3e-20  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.384636  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1821  NADH dehydrogenase subunit I  39.22 
 
 
162 aa  99.4  3e-20  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1443  NADH dehydrogenase subunit I  39.22 
 
 
162 aa  99.4  3e-20  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.798759  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1298  NADH dehydrogenase subunit I  39.22 
 
 
162 aa  99.4  3e-20  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0829  NADH dehydrogenase subunit I  37.18 
 
 
163 aa  99.8  3e-20  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.260339  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3502  NADH dehydrogenase subunit I  41.96 
 
 
181 aa  99.4  3e-20  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1307  NADH dehydrogenase subunit I  39.22 
 
 
162 aa  99.4  3e-20  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.91191  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1138  NADH dehydrogenase subunit I  39.22 
 
 
162 aa  99.4  3e-20  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.299701  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0421  NADH dehydrogenase subunit I  39.22 
 
 
162 aa  99.4  3e-20  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.735915  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1043  NADH dehydrogenase subunit I  37.75 
 
 
163 aa  99.4  4e-20  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4080  NADH-quinone oxidoreductase, chain I  38.51 
 
 
197 aa  98.6  6e-20  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.0562629 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1750  NADH dehydrogenase subunit I  37.41 
 
 
161 aa  98.2  8e-20  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1069  NADH dehydrogenase subunit I  38.56 
 
 
162 aa  97.8  9e-20  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.74272  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1351  NADH dehydrogenase subunit I  40.4 
 
 
162 aa  97.4  1e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0309776  hitchhiker  0.0086006 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2001  NADH dehydrogenase subunit I  39.74 
 
 
162 aa  97.1  2e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0496982 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3248  NADH dehydrogenase subunit I  38.67 
 
 
165 aa  96.3  2e-19  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.779883  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3206  NADH dehydrogenase subunit I  40.54 
 
 
162 aa  97.1  2e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00643522  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2265  NADH dehydrogenase subunit I  40.14 
 
 
162 aa  96.7  2e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.477325  normal  0.254179 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1629  NADH dehydrogenase subunit I  40.14 
 
 
162 aa  96.7  2e-19  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2241  NADH dehydrogenase subunit I  40.14 
 
 
162 aa  96.7  2e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.493495  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0957  NADH dehydrogenase subunit I  38.96 
 
 
162 aa  96.3  3e-19  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0765322  normal  0.470027 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1962  NADH dehydrogenase subunit I  37.25 
 
 
163 aa  96.3  3e-19  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.528282  normal  0.0448739 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3627  NADH dehydrogenase subunit I  34.73 
 
 
164 aa  95.9  3e-19  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.0704772 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3387  NADH-quinone oxidoreductase, chain I  38.89 
 
 
165 aa  95.9  4e-19  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.533197  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1036  NADH dehydrogenase subunit I  39.46 
 
 
162 aa  95.9  4e-19  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.160572  normal  0.248767 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2158  NADH dehydrogenase subunit I  39.46 
 
 
162 aa  95.9  4e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.394971  normal  0.941111 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2279  NADH dehydrogenase subunit I  39.46 
 
 
162 aa  95.9  4e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.336058  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1501  NADH dehydrogenase subunit I  41.33 
 
 
177 aa  95.1  5e-19  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0649483  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2054  NADH dehydrogenase subunit I  38.31 
 
 
163 aa  94.7  8e-19  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.151951 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2206  NADH dehydrogenase subunit I  38.31 
 
 
163 aa  94.7  8e-19  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1883  NADH dehydrogenase subunit I  38.31 
 
 
163 aa  94.7  8e-19  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.604396 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0716  NADH-quinone oxidoreductase, chain I  43.59 
 
 
162 aa  94.7  8e-19  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.479335  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0994  NADH dehydrogenase subunit I  43.59 
 
 
163 aa  94.7  9e-19  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5569  NADH dehydrogenase subunit I  39.19 
 
 
162 aa  94  1e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.156755 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2235  NADH-quinone oxidoreductase, chain I  38.89 
 
 
165 aa  94.4  1e-18  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.272952  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1432  NADH dehydrogenase subunit I  38.41 
 
 
165 aa  94.4  1e-18  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.277545  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2557  NADH dehydrogenase subunit I  42.5 
 
 
162 aa  93.6  2e-18  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.840778  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2823  NADH dehydrogenase subunit I  44.44 
 
 
162 aa  93.2  2e-18  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0530625  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2697  NADH dehydrogenase subunit I  43.48 
 
 
166 aa  92.8  3e-18  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5172  NADH dehydrogenase subunit I  37.25 
 
 
169 aa  93.2  3e-18  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.950727  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2805  NADH dehydrogenase subunit I  39.46 
 
 
169 aa  92.8  3e-18  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.166718 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2053  NADH dehydrogenase subunit I  37.5 
 
 
163 aa  92.8  3e-18  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.330204  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1609  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  32.95 
 
 
187 aa  92.4  4e-18  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.999472 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0277  NADH dehydrogenase subunit I  43.33 
 
 
162 aa  92.4  4e-18  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.587133  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1150  NADH dehydrogenase subunit I  38.41 
 
 
162 aa  92.4  4e-18  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1609  NADH dehydrogenase subunit I  34.93 
 
 
163 aa  92.4  4e-18  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0248  NADH dehydrogenase subunit I  43.33 
 
 
162 aa  92.4  4e-18  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1509  NADH dehydrogenase subunit I  44.07 
 
 
165 aa  92.4  4e-18  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00304735 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0554  NADH dehydrogenase subunit I  34.93 
 
 
168 aa  92  5e-18  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2249  NADH dehydrogenase subunit I  37.75 
 
 
163 aa  91.7  7e-18  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.650546  hitchhiker  0.0000391532 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1271  NADH dehydrogenase subunit I  39.19 
 
 
171 aa  91.7  7e-18  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.400573  normal  0.480107 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2622  NADH dehydrogenase subunit I  37.75 
 
 
163 aa  91.7  7e-18  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1374  NADH dehydrogenase I chain I  35.29 
 
 
175 aa  91.7  7e-18  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  decreased coverage  0.00228535  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7011  NADH-quinone oxidoreductase, chain I  39.33 
 
 
169 aa  91.3  9e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2828  NADH dehydrogenase subunit I  42.61 
 
 
166 aa  90.9  1e-17  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01295  NADH dehydrogenase subunit I  43.59 
 
 
162 aa  90.9  1e-17  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.356089  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0880  NADH dehydrogenase subunit I  42.74 
 
 
170 aa  90.9  1e-17  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0965  NADH dehydrogenase subunit I  37.42 
 
 
170 aa  90.5  2e-17  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.837483  normal  0.0693949 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1099  NADH dehydrogenase subunit I  39.19 
 
 
162 aa  90.1  2e-17  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0935  NADH dehydrogenase subunit I  35.71 
 
 
163 aa  89.4  3e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.13658  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1845  NADH-quinone oxidoreductase, chain I  35.1 
 
 
175 aa  89.4  4e-17  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0592  Formate hydrogenlyase subunit 6/NADH:ubiquinone oxidoreductase 23 kD subunit (chain I)-like protein  36.17 
 
 
171 aa  88.2  7e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0969  NADH dehydrogenase subunit I  36.36 
 
 
163 aa  88.2  7e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0765514  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3204  NADH dehydrogenase subunit I  38.62 
 
 
182 aa  88.2  8e-17  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0843328  normal  0.169624 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3610  NADH dehydrogenase subunit I  38.62 
 
 
182 aa  88.2  8e-17  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.487333  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3216  NADH-quinone oxidoreductase, chain I  34.39 
 
 
168 aa  88.2  8e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1866  NADH dehydrogenase subunit I  37.93 
 
 
182 aa  87.8  1e-16  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.0422789 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4126  NADH dehydrogenase subunit I  37.93 
 
 
182 aa  87.8  1e-16  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3698  NADH dehydrogenase subunit I  37.93 
 
 
182 aa  87.8  1e-16  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.380267  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3372  NADH dehydrogenase I, I subunit  38.62 
 
 
182 aa  87.8  1e-16  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.675448  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3615  NADH-quinone oxidoreductase, chain I  35.86 
 
 
211 aa  87.8  1e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1739  NADH dehydrogenase subunit I  37.93 
 
 
182 aa  87.8  1e-16  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.235938  normal  0.220023 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0394  NADH-quinone oxidoreductase, chain I  39.01 
 
 
175 aa  86.7  2e-16  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0289  NADH-quinone oxidoreductase, chain I  36.17 
 
 
171 aa  86.7  2e-16  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.998746  normal 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5061  NADH-quinone oxidoreductase, chain I  36.88 
 
 
185 aa  87  2e-16  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.451376  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3176  NADH-quinone oxidoreductase, chain I  37.93 
 
 
167 aa  86.7  2e-16  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1997  NADH dehydrogenase subunit I  38.62 
 
 
167 aa  86.3  3e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0446418  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1185  NADH dehydrogenase subunit I  35.15 
 
 
167 aa  86.3  3e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0684834  normal  0.389473 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>