More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppro_3185 on replicon NC_008609
Organism: Pelobacter propionicus DSM 2379



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008609  Ppro_0636  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  100 
 
 		 186 aa  396  1e-109  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1631  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  100 
 
 		 186 aa  396  1e-109  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3185  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  100 
 
 		 186 aa  396  1e-109  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2564  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding protein  40.88 
 
 		 239 aa  125  3e-28  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1385  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  40.88 
 
 		 239 aa  125  3e-28  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.236148  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1284  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  40.88 
 
 		 239 aa  125  3e-28  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1296  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  41.71 
 
 		 238 aa  122  3e-27  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.109179  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4515  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  38.24 
 
 		 204 aa  101  6e-21  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.203354  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1238  NADH-quinone oxidoreductase, chain I  35.54 
 
 		 181 aa  100  9e-21  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7011  NADH-quinone oxidoreductase, chain I  36.65 
 
 		 169 aa  97.8  8e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0164  NADH-ubiquinone oxidoreductase subunit 8  34.71 
 
 		 165 aa  97.4  9e-20  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3918  NADH-quinone oxidoreductase, chain I  39.46 
 
 		 132 aa  95.9  3e-19  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4002  NADH-quinone oxidoreductase, chain I  39.46 
 
 		 132 aa  95.9  3e-19  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.89067e-17 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4236  NADH-quinone oxidoreductase, chain I  38.1 
 
 		 132 aa  95.1  5e-19  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000114859  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1043  NADH dehydrogenase subunit I  34.19 
 
 		 163 aa  93.6  1e-18  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0829  NADH dehydrogenase subunit I  33.55 
 
 		 163 aa  92  5e-18  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.260339  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0917  NADH-quinone oxidoreductase, chain I  33.33 
 
 		 179 aa  91.7  6e-18  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.5865  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2765  NADH dehydrogenase subunit I  34.39 
 
 		 180 aa  90.9  1e-17  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.128685  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3130  NADH-quinone oxidoreductase, chain I  37.24 
 
 		 135 aa  90.5  1e-17  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4736  NADH dehydrogenase subunit I  36.73 
 
 		 173 aa  90.5  1e-17  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.161018  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1020  NADH dehydrogenase subunit I  37.06 
 
 		 171 aa  90.5  1e-17  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.755319  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0935  NADH dehydrogenase subunit I  33.77 
 
 		 163 aa  90.5  1e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.13658  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2054  NADH dehydrogenase subunit I  32.53 
 
 		 163 aa  89.7  2e-17  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.151951 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1499  NADH dehydrogenase subunit I  34.66 
 
 		 180 aa  90.1  2e-17  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1883  NADH dehydrogenase subunit I  32.53 
 
 		 163 aa  89.7  2e-17  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.604396 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2206  NADH dehydrogenase subunit I  32.53 
 
 		 163 aa  89.7  2e-17  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3502  NADH dehydrogenase subunit I  33.77 
 
 		 181 aa  90.1  2e-17  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2543  NADH dehydrogenase subunit I  34.39 
 
 		 180 aa  89.7  2e-17  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.879169  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1401  NADH dehydrogenase subunit I  34.39 
 
 		 180 aa  89  3e-17  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.590324  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2867  NADH-quinone oxidoreductase, chain I  35.33 
 
 		 171 aa  89.4  3e-17  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.708253  normal  0.0292468 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1750  NADH dehydrogenase subunit I  33.11 
 
 		 161 aa  89.4  3e-17  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0346  NADH dehydrogenase I, I subunit  37.41 
 
 		 132 aa  89  4e-17  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3372  NADH dehydrogenase I, I subunit  32.96 
 
 		 182 aa  88.6  4e-17  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.675448  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3204  NADH dehydrogenase subunit I  32.96 
 
 		 182 aa  89  4e-17  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0843328  normal  0.169624 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2631  NADH-quinone oxidoreductase, chain I  38.24 
 
 		 230 aa  89  4e-17  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.87866  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0957  NADH dehydrogenase subunit I  30.46 
 
 		 162 aa  89  4e-17  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0765322  normal  0.470027 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3610  NADH dehydrogenase subunit I  32.96 
 
 		 182 aa  89  4e-17  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.487333  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3125  NADH dehydrogenase subunit I  35.71 
 
 		 179 aa  88.6  4e-17  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2249  NADH dehydrogenase subunit I  33.56 
 
 		 163 aa  89  4e-17  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.650546  hitchhiker  0.0000391532 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2622  NADH dehydrogenase subunit I  33.56 
 
 		 163 aa  89  4e-17  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1333  NADH dehydrogenase subunit I  36.57 
 
 		 171 aa  88.6  5e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0969  NADH dehydrogenase subunit I  32.68 
 
 		 163 aa  88.2  6e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0765514  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1120  NADH dehydrogenase subunit I  39.23 
 
 		 180 aa  88.2  6e-17  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.311189  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3865  NADH-quinone oxidoreductase, chain I  34.36 
 
 		 222 aa  87.8  7e-17  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1352  NADH dehydrogenase subunit I  38.62 
 
 		 171 aa  87.8  8e-17  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1099  NADH dehydrogenase subunit I  31.79 
 
 		 162 aa  87.8  8e-17  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1138  NADH dehydrogenase subunit I  31.33 
 
 		 162 aa  87.8  9e-17  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.299701  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1298  NADH dehydrogenase subunit I  31.33 
 
 		 162 aa  87.8  9e-17  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1821  NADH dehydrogenase subunit I  31.33 
 
 		 162 aa  87.8  9e-17  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0421  NADH dehydrogenase subunit I  31.33 
 
 		 162 aa  87.8  9e-17  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.735915  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1307  NADH dehydrogenase subunit I  31.33 
 
 		 162 aa  87.8  9e-17  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.91191  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1443  NADH dehydrogenase subunit I  31.33 
 
 		 162 aa  87.8  9e-17  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.798759  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0729  NADH dehydrogenase subunit I  31.33 
 
 		 162 aa  87.8  9e-17  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.384636  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_28510  NADH dehydrogenase subunit I  33.71 
 
 		 182 aa  87  1e-16  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.559317  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2001  NADH dehydrogenase subunit I  30.46 
 
 		 162 aa  87  1e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0496982 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1501  NADH dehydrogenase subunit I  32.1 
 
 		 177 aa  87  1e-16  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0649483  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3615  NADH-quinone oxidoreductase, chain I  34.06 
 
 		 211 aa  87  1e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1036  NADH dehydrogenase subunit I  31.33 
 
 		 162 aa  86.3  2e-16  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.160572  normal  0.248767 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3347  NADH-quinone oxidoreductase, chain I  37.24 
 
 		 131 aa  86.7  2e-16  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.715886  normal  0.525186 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1354  NADH dehydrogenase subunit I  44.79 
 
 		 171 aa  86.7  2e-16  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.253044  normal  0.161644 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1351  NADH dehydrogenase subunit I  30.46 
 
 		 162 aa  86.7  2e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0309776  hitchhiker  0.0086006 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2053  NADH dehydrogenase subunit I  31.13 
 
 		 163 aa  86.3  2e-16  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.330204  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3206  NADH dehydrogenase subunit I  30.46 
 
 		 162 aa  87  2e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00643522  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3301  NADH dehydrogenase subunit I  36.67 
 
 		 180 aa  86.7  2e-16  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.9572 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2279  NADH dehydrogenase subunit I  31.33 
 
 		 162 aa  86.3  2e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.336058  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2158  NADH dehydrogenase subunit I  31.33 
 
 		 162 aa  86.3  2e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.394971  normal  0.941111 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1411  NADH dehydrogenase subunit I  30.46 
 
 		 165 aa  86.7  2e-16  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0328529 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4126  NADH dehydrogenase subunit I  34.97 
 
 		 182 aa  85.9  3e-16  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1696  NADH dehydrogenase subunit I  34.59 
 
 		 164 aa  85.9  3e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  hitchhiker  0.00251501  normal  1 
 
 
-
 
NC_006681  CNL05770  conserved hypothetical protein  31.08 
 
 		 273 aa  85.9  3e-16  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0107  NADH dehydrogenase subunit I  35.34 
 
 		 164 aa  85.9  3e-16  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.807538  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5569  NADH dehydrogenase subunit I  30.67 
 
 		 162 aa  85.9  3e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.156755 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1866  NADH dehydrogenase subunit I  34.97 
 
 		 182 aa  85.9  3e-16  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0422789 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1069  NADH dehydrogenase subunit I  30.46 
 
 		 162 aa  85.9  3e-16  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.74272  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1739  NADH dehydrogenase subunit I  34.97 
 
 		 182 aa  85.9  3e-16  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.235938  normal  0.220023 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3698  NADH dehydrogenase subunit I  34.97 
 
 		 182 aa  85.9  3e-16  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.380267  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1629  NADH dehydrogenase subunit I  30.67 
 
 		 162 aa  86.3  3e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2265  NADH dehydrogenase subunit I  30.67 
 
 		 162 aa  86.3  3e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.477325  normal  0.254179 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2241  NADH dehydrogenase subunit I  30.67 
 
 		 162 aa  86.3  3e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.493495  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1743  NADH dehydrogenase subunit I  38.14 
 
 		 164 aa  85.9  3e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  decreased coverage  0.00386762  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1809  NADH dehydrogenase subunit I  35.81 
 
 		 180 aa  85.5  4e-16  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.693845 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1567  NADH dehydrogenase subunit I  35.81 
 
 		 180 aa  85.5  4e-16  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.997394  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1461  NADH dehydrogenase subunit I  35.81 
 
 		 180 aa  85.5  4e-16  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0965  NADH dehydrogenase subunit I  33.33 
 
 		 170 aa  85.5  4e-16  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.837483  normal  0.0693949 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2235  NADH-quinone oxidoreductase, chain I  38.03 
 
 		 165 aa  85.5  4e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.272952  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3818  NADH-quinone oxidoreductase, chain I  38.28 
 
 		 171 aa  85.1  5e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.121238  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3248  NADH dehydrogenase subunit I  32.45 
 
 		 165 aa  84.7  7e-16  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.779883  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2562  NADH dehydrogenase subunit I  35.81 
 
 		 182 aa  84.3  8e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_29920  NADH dehydrogenase subunit I  35.81 
 
 		 182 aa  84.3  8e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.546828  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2549  NADH dehydrogenase subunit I  35.14 
 
 		 180 aa  84.3  9e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2460  NADH dehydrogenase subunit I  35.14 
 
 		 180 aa  84.3  9e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2560  NADH dehydrogenase subunit I  35.14 
 
 		 180 aa  84.3  9e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0213368  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2505  NADH dehydrogenase subunit I  35.14 
 
 		 180 aa  84.3  9e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1376  NADH-quinone oxidoreductase, chain I  36 
 
 		 180 aa  84  0.000000000000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00237006  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1014  NADH dehydrogenase subunit I  32.24 
 
 		 180 aa  84  0.000000000000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1432  NADH dehydrogenase subunit I  31.13 
 
 		 165 aa  83.6  0.000000000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.277545  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0880  NADH dehydrogenase subunit I  31.79 
 
 		 170 aa  84  0.000000000000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2430  NADH dehydrogenase subunit I  36 
 
 		 180 aa  84  0.000000000000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4064  NADH dehydrogenase subunit I  41.05 
 
 		 171 aa  84  0.000000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0149353  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2657  NADH dehydrogenase subunit I  36 
 
 		 180 aa  84  0.000000000000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>