More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cla_1437 on replicon NC_012039
Organism: Campylobacter lari RM2100



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012039  Cla_1437  NADH dehydrogenase subunit I  100 
 
 		 210 aa  432  1e-120  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1556  NADH dehydrogenase subunit I  79.29 
 
 		 213 aa  331  5e-90  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  hitchhiker  0.0000101443  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1922  NADH dehydrogenase subunit I  78.79 
 
 		 213 aa  325  2.0000000000000001e-88  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  decreased coverage  0.000283263  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1742  NADH dehydrogenase subunit I  79.19 
 
 		 213 aa  326  2.0000000000000001e-88  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0189  NADH dehydrogenase subunit I  65.79 
 
 		 200 aa  266  1e-70  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1521  NADH dehydrogenase subunit I  60.68 
 
 		 231 aa  250  8.000000000000001e-66  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.00088837  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1664  NADH dehydrogenase subunit I  60 
 
 		 212 aa  236  3e-61  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.910659  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0146  NADH-quinone oxidoreductase, chain I  59.24 
 
 		 204 aa  229  3e-59  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00110619  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1820  NADH dehydrogenase subunit I  55.73 
 
 		 211 aa  219  1.9999999999999999e-56  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.000000189199  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1563  NADH dehydrogenase subunit I  40.51 
 
 		 162 aa  101  7e-21  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.339949  n/a   
 
 
-
 
NC_006681  CNL05770  conserved hypothetical protein  40.74 
 
 		 273 aa  101  1e-20  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0980  NADH dehydrogenase subunit I  35.39 
 
 		 169 aa  100  2e-20  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1660  NADH-quinone oxidoreductase, chain I  38.85 
 
 		 234 aa  100  2e-20  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1043  NADH dehydrogenase subunit I  34.46 
 
 		 163 aa  99.8  2e-20  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0691  NADH dehydrogenase subunit I  37.34 
 
 		 169 aa  100  2e-20  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.438917  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0825  NADH dehydrogenase subunit I  36.36 
 
 		 163 aa  99  5e-20  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3336  NADH dehydrogenase subunit I  37.86 
 
 		 162 aa  98.6  6e-20  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.463064  normal  0.437664 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2292  NADH dehydrogenase subunit I  39.84 
 
 		 161 aa  98.6  6e-20  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0929  NADH dehydrogenase subunit I  39.84 
 
 		 163 aa  97.4  1e-19  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0361  NADH dehydrogenase subunit I  42.61 
 
 		 167 aa  97.8  1e-19  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.326031  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0829  NADH dehydrogenase subunit I  33.11 
 
 		 163 aa  97.4  1e-19  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.260339  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4625  NADH dehydrogenase subunit I  40.91 
 
 		 162 aa  97.8  1e-19  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.11536 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05703  hypothetical protein similar to : Formate hydrogenlyase subunit 6/NADH:ubiquinone oxidoreductase 23 kD subunit (Broad)  38.13 
 
 		 224 aa  96.7  2e-19  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.803618 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1322  NADH dehydrogenase subunit I  38.46 
 
 		 164 aa  96.7  2e-19  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.323962  normal  0.0547108 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1363  NADH dehydrogenase subunit I  38.28 
 
 		 162 aa  95.9  4e-19  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.353821  normal  0.140777 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1956  NADH-quinone oxidoreductase, chain I  35.76 
 
 		 162 aa  95.9  4e-19  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.198639  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2993  NADH dehydrogenase subunit I  37.5 
 
 		 161 aa  94  1e-18  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0754  NADH dehydrogenase subunit I  37.69 
 
 		 164 aa  94  1e-18  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.180315  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1301  NADH dehydrogenase subunit I  37.69 
 
 		 162 aa  94.4  1e-18  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  decreased coverage  0.00320411  normal  0.488956 
 
 
-
 
NC_009370  OSTLU_18502  predicted protein  41.88 
 
 		 167 aa  94.4  1e-18  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.0613487 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1187  NADH dehydrogenase subunit I  37.69 
 
 		 164 aa  93.6  2e-18  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.438944  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2238  NADH dehydrogenase subunit I  36.62 
 
 		 163 aa  94  2e-18  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.180184 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0820  NADH dehydrogenase subunit I  42.15 
 
 		 160 aa  93.2  3e-18  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3248  NADH dehydrogenase subunit I  37.21 
 
 		 165 aa  92.8  3e-18  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.779883  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1411  NADH dehydrogenase subunit I  33.77 
 
 		 165 aa  92  6e-18  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0328529 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1432  NADH dehydrogenase subunit I  34.18 
 
 		 165 aa  92  6e-18  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.277545  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1750  NADH dehydrogenase subunit I  37.14 
 
 		 161 aa  91.7  8e-18  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2415  NADH dehydrogenase subunit I  38.17 
 
 		 163 aa  90.9  1e-17  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.87535  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1501  NADH dehydrogenase subunit I  36.3 
 
 		 177 aa  90.9  1e-17  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0649483  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1030  NADH dehydrogenase subunit I  38.93 
 
 		 163 aa  90.5  1e-17  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.206882  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2805  NADH dehydrogenase subunit I  35.07 
 
 		 169 aa  91.3  1e-17  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.166718 
 
 
-
 
NC_011682  PHATRDRAFT_14260  predicted protein  36.88 
 
 		 163 aa  90.1  2e-17  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3502  NADH dehydrogenase subunit I  34.33 
 
 		 181 aa  90.1  2e-17  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1269  NADH dehydrogenase subunit I  40 
 
 		 163 aa  90.5  2e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.142775  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1361  NADH dehydrogenase subunit I  40.8 
 
 		 163 aa  89.7  3e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.182164  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2523  NADH dehydrogenase subunit I  40.37 
 
 		 167 aa  89.7  3e-17  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.208294  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1185  NADH dehydrogenase subunit I  40.37 
 
 		 167 aa  89.7  3e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0684834  normal  0.389473 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0786  NADH dehydrogenase subunit I  38.17 
 
 		 163 aa  89.7  3e-17  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.079686  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3290  NADH dehydrogenase subunit I  39.02 
 
 		 162 aa  89.7  3e-17  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.221287  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1723  NADH dehydrogenase subunit I  39.68 
 
 		 163 aa  89  4e-17  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.341479  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1997  NADH dehydrogenase subunit I  38.33 
 
 		 167 aa  89.4  4e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0446418  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0880  NADH dehydrogenase subunit I  33.1 
 
 		 170 aa  89.4  4e-17  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2054  NADH dehydrogenase subunit I  35.77 
 
 		 163 aa  89  5e-17  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.151951 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0969  NADH dehydrogenase subunit I  33.58 
 
 		 163 aa  89  5e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0765514  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2206  NADH dehydrogenase subunit I  35.77 
 
 		 163 aa  89  5e-17  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1883  NADH dehydrogenase subunit I  35.77 
 
 		 163 aa  89  5e-17  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.604396 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0935  NADH dehydrogenase subunit I  34.31 
 
 		 163 aa  89  5e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.13658  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2212  NADH dehydrogenase subunit I  39.02 
 
 		 162 aa  88.2  7e-17  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.199823  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5172  NADH dehydrogenase subunit I  32.39 
 
 		 169 aa  88.6  7e-17  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.950727  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2582  NADH dehydrogenase subunit I  38.93 
 
 		 162 aa  88.2  9e-17  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.561308  normal  0.2116 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1509  NADH dehydrogenase subunit I  34.68 
 
 		 165 aa  87.8  1e-16  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00304735 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0957  NADH dehydrogenase subunit I  35 
 
 		 162 aa  87.8  1e-16  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0765322  normal  0.470027 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1879  NADH dehydrogenase subunit I  38.17 
 
 		 162 aa  87.8  1e-16  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.508831  normal  0.262119 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2412  NADH dehydrogenase subunit I  38.21 
 
 		 162 aa  87.4  1e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0701412  normal  0.0109704 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0994  NADH dehydrogenase subunit I  33.11 
 
 		 163 aa  86.7  2e-16  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1011  NADH dehydrogenase subunit I  34.64 
 
 		 162 aa  86.7  2e-16  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.210818  normal  0.566427 
 
 
-
 
NC_004310  BR0810  NADH dehydrogenase subunit I  37.98 
 
 		 163 aa  87  2e-16  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.719018  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0805  NADH dehydrogenase subunit I  37.98 
 
 		 163 aa  86.7  2e-16  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1821  NADH dehydrogenase subunit I  33.57 
 
 		 162 aa  87  2e-16  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1443  NADH dehydrogenase subunit I  33.57 
 
 		 162 aa  87  2e-16  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.798759  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1138  NADH dehydrogenase subunit I  33.57 
 
 		 162 aa  87  2e-16  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.299701  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1298  NADH dehydrogenase subunit I  33.57 
 
 		 162 aa  87  2e-16  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1307  NADH dehydrogenase subunit I  33.57 
 
 		 162 aa  87  2e-16  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.91191  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2877  NADH dehydrogenase subunit I  38.17 
 
 		 162 aa  87  2e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.670141  normal  0.245456 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0421  NADH dehydrogenase subunit I  33.57 
 
 		 162 aa  87  2e-16  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.735915  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0729  NADH dehydrogenase subunit I  33.57 
 
 		 162 aa  87  2e-16  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.384636  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1962  NADH dehydrogenase subunit I  38.58 
 
 		 163 aa  86.7  2e-16  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.528282  normal  0.0448739 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3627  NADH dehydrogenase subunit I  37.41 
 
 		 164 aa  87  2e-16  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0704772 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0965  NADH dehydrogenase subunit I  32.39 
 
 		 170 aa  87.4  2e-16  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.837483  normal  0.0693949 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4134  NADH dehydrogenase subunit I  34.67 
 
 		 162 aa  86.3  3e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.181277  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2235  NADH-quinone oxidoreductase, chain I  33.14 
 
 		 165 aa  86.3  3e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.272952  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1069  NADH dehydrogenase subunit I  35.66 
 
 		 162 aa  86.3  3e-16  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.74272  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0898  NADH dehydrogenase subunit I  39.2 
 
 		 163 aa  86.3  3e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0404509  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3387  NADH-quinone oxidoreductase, chain I  33.14 
 
 		 165 aa  86.3  3e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.533197  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0917  NADH-quinone oxidoreductase, chain I  34.42 
 
 		 179 aa  85.9  4e-16  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.5865  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1271  NADH dehydrogenase subunit I  33.58 
 
 		 171 aa  85.9  4e-16  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.400573  normal  0.480107 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5569  NADH dehydrogenase subunit I  34.56 
 
 		 162 aa  85.5  5e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.156755 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4398  NADH dehydrogenase subunit I  34 
 
 		 162 aa  85.1  6e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2051  NADH dehydrogenase subunit I  35.29 
 
 		 162 aa  85.5  6e-16  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.100158  normal  0.722093 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2390  NADH dehydrogenase subunit I  38.24 
 
 		 162 aa  85.1  7e-16  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  hitchhiker  0.0000573568  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3218  NADH dehydrogenase subunit I  39.68 
 
 		 163 aa  85.1  7e-16  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4553  NADH dehydrogenase subunit I  36.64 
 
 		 162 aa  85.1  8e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.128776 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1099  NADH dehydrogenase subunit I  35 
 
 		 162 aa  84.7  9e-16  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3206  NADH dehydrogenase subunit I  33.33 
 
 		 162 aa  84.3  0.000000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00643522  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2265  NADH dehydrogenase subunit I  34.88 
 
 		 162 aa  84.3  0.000000000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.477325  normal  0.254179 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1629  NADH dehydrogenase subunit I  34.88 
 
 		 162 aa  84.3  0.000000000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2241  NADH dehydrogenase subunit I  34.88 
 
 		 162 aa  84.3  0.000000000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.493495  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1351  NADH dehydrogenase subunit I  33.33 
 
 		 162 aa  84.3  0.000000000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0309776  hitchhiker  0.0086006 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1077  NADH dehydrogenase subunit I  33.99 
 
 		 162 aa  83.6  0.000000000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.280148 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2158  NADH dehydrogenase subunit I  33.82 
 
 		 162 aa  83.6  0.000000000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.394971  normal  0.941111 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>