More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CHAB381_0189 on replicon NC_009714
Organism: Campylobacter hominis ATCC BAA-381



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009714  CHAB381_0189  NADH dehydrogenase subunit I  100 
 
 
200 aa  410  1e-114  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1521  NADH dehydrogenase subunit I  67.37 
 
 
231 aa  276  2e-73  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.00088837  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1437  NADH dehydrogenase subunit I  65.79 
 
 
210 aa  266  1e-70  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1556  NADH dehydrogenase subunit I  59.07 
 
 
213 aa  249  2e-65  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  hitchhiker  0.0000101443  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1742  NADH dehydrogenase subunit I  59.07 
 
 
213 aa  248  3e-65  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1922  NADH dehydrogenase subunit I  59.07 
 
 
213 aa  247  7e-65  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  decreased coverage  0.000283263  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1664  NADH dehydrogenase subunit I  59.69 
 
 
212 aa  245  4e-64  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.910659  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0146  NADH-quinone oxidoreductase, chain I  57.59 
 
 
204 aa  237  8e-62  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00110619  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1820  NADH dehydrogenase subunit I  53.12 
 
 
211 aa  217  8.999999999999998e-56  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.000000189199  n/a   
 
 
-
 
NC_006681  CNL05770  conserved hypothetical protein  39.73 
 
 
273 aa  116  1.9999999999999998e-25  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3336  NADH dehydrogenase subunit I  41.43 
 
 
162 aa  111  6e-24  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.463064  normal  0.437664 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1043  NADH dehydrogenase subunit I  39.16 
 
 
163 aa  111  9e-24  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0829  NADH dehydrogenase subunit I  38.46 
 
 
163 aa  109  3e-23  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.260339  normal 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05703  hypothetical protein similar to : Formate hydrogenlyase subunit 6/NADH:ubiquinone oxidoreductase 23 kD subunit (Broad)  36.49 
 
 
224 aa  108  5e-23  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.803618 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0691  NADH dehydrogenase subunit I  42.4 
 
 
169 aa  108  5e-23  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.438917  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0361  NADH dehydrogenase subunit I  42.4 
 
 
167 aa  107  8.000000000000001e-23  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.326031  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0980  NADH dehydrogenase subunit I  42.22 
 
 
169 aa  107  1e-22  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0929  NADH dehydrogenase subunit I  39.01 
 
 
163 aa  107  1e-22  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1660  NADH-quinone oxidoreductase, chain I  38.32 
 
 
234 aa  107  1e-22  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1363  NADH dehydrogenase subunit I  40.77 
 
 
162 aa  105  3e-22  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.353821  normal  0.140777 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1563  NADH dehydrogenase subunit I  42.75 
 
 
162 aa  105  6e-22  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.339949  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1411  NADH dehydrogenase subunit I  37.24 
 
 
165 aa  104  7e-22  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.0328529 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1883  NADH dehydrogenase subunit I  38.85 
 
 
163 aa  103  1e-21  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.604396 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2054  NADH dehydrogenase subunit I  38.85 
 
 
163 aa  103  1e-21  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.151951 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2206  NADH dehydrogenase subunit I  38.85 
 
 
163 aa  103  1e-21  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1322  NADH dehydrogenase subunit I  40.31 
 
 
164 aa  103  2e-21  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.323962  normal  0.0547108 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3502  NADH dehydrogenase subunit I  35.95 
 
 
181 aa  102  3e-21  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2523  NADH dehydrogenase subunit I  42.73 
 
 
167 aa  102  3e-21  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.208294  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1185  NADH dehydrogenase subunit I  42.73 
 
 
167 aa  102  3e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0684834  normal  0.389473 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1501  NADH dehydrogenase subunit I  38.36 
 
 
177 aa  102  3e-21  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0649483  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3248  NADH dehydrogenase subunit I  35.86 
 
 
165 aa  102  3e-21  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.779883  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0825  NADH dehydrogenase subunit I  40.15 
 
 
163 aa  102  4e-21  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2292  NADH dehydrogenase subunit I  40.34 
 
 
161 aa  101  6e-21  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0754  NADH dehydrogenase subunit I  44.04 
 
 
164 aa  101  7e-21  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.180315  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1301  NADH dehydrogenase subunit I  46.46 
 
 
162 aa  101  7e-21  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  decreased coverage  0.00320411  normal  0.488956 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2824  NADH dehydrogenase subunit I  44.95 
 
 
164 aa  100  1e-20  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.704342  normal  0.0688011 
 
 
-
 
NC_011682  PHATRDRAFT_14260  predicted protein  39.44 
 
 
163 aa  100  1e-20  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2993  NADH dehydrogenase subunit I  39.5 
 
 
161 aa  100  1e-20  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5172  NADH dehydrogenase subunit I  36.69 
 
 
169 aa  99.8  2e-20  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.950727  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1187  NADH dehydrogenase subunit I  44.04 
 
 
164 aa  100  2e-20  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.438944  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1956  NADH-quinone oxidoreductase, chain I  38 
 
 
162 aa  99.8  2e-20  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.198639  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3627  NADH dehydrogenase subunit I  41.13 
 
 
164 aa  100  2e-20  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.0704772 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4625  NADH dehydrogenase subunit I  40.6 
 
 
162 aa  100  2e-20  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.11536 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1750  NADH dehydrogenase subunit I  37.41 
 
 
161 aa  99.4  3e-20  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2805  NADH dehydrogenase subunit I  37.98 
 
 
169 aa  99  4e-20  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.166718 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2582  NADH dehydrogenase subunit I  40 
 
 
162 aa  98.6  5e-20  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.561308  normal  0.2116 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1997  NADH dehydrogenase subunit I  40.83 
 
 
167 aa  98.6  5e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0446418  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1030  NADH dehydrogenase subunit I  40 
 
 
163 aa  98.6  5e-20  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.206882  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1879  NADH dehydrogenase subunit I  40.83 
 
 
162 aa  98.2  6e-20  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.508831  normal  0.262119 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0935  NADH dehydrogenase subunit I  35.97 
 
 
163 aa  98.6  6e-20  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.13658  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1269  NADH dehydrogenase subunit I  40 
 
 
163 aa  98.2  7e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.142775  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2415  NADH dehydrogenase subunit I  38.57 
 
 
163 aa  98.2  7e-20  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.87535  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2412  NADH dehydrogenase subunit I  40.83 
 
 
162 aa  98.2  7e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0701412  normal  0.0109704 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2877  NADH dehydrogenase subunit I  39.23 
 
 
162 aa  97.8  9e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.670141  normal  0.245456 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1361  NADH dehydrogenase subunit I  39.26 
 
 
163 aa  97.8  9e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.182164  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1138  NADH dehydrogenase subunit I  36.69 
 
 
162 aa  97.4  1e-19  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.299701  n/a   
 
 
-
 
NC_009043  PICST_88630  mitochondrial complex I NUIM TYKY subunit (proton translocation)  36.36 
 
 
226 aa  97.4  1e-19  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.970128  normal 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0421  NADH dehydrogenase subunit I  36.69 
 
 
162 aa  97.4  1e-19  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.735915  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0810  NADH dehydrogenase subunit I  43.64 
 
 
163 aa  97.1  1e-19  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.719018  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0805  NADH dehydrogenase subunit I  43.64 
 
 
163 aa  97.1  1e-19  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1821  NADH dehydrogenase subunit I  36.69 
 
 
162 aa  97.4  1e-19  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1298  NADH dehydrogenase subunit I  36.69 
 
 
162 aa  97.4  1e-19  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0969  NADH dehydrogenase subunit I  35.25 
 
 
163 aa  97.4  1e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0765514  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1443  NADH dehydrogenase subunit I  36.69 
 
 
162 aa  97.4  1e-19  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.798759  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1723  NADH dehydrogenase subunit I  37.41 
 
 
163 aa  97.4  1e-19  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.341479  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0729  NADH dehydrogenase subunit I  36.69 
 
 
162 aa  97.4  1e-19  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.384636  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1307  NADH dehydrogenase subunit I  36.69 
 
 
162 aa  97.4  1e-19  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.91191  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2212  NADH dehydrogenase subunit I  47 
 
 
162 aa  97.8  1e-19  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.199823  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3290  NADH dehydrogenase subunit I  40 
 
 
162 aa  97.1  2e-19  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.221287  n/a   
 
 
-
 
NC_009370  OSTLU_18502  predicted protein  41.38 
 
 
167 aa  97.1  2e-19  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.0613487 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3218  NADH dehydrogenase subunit I  38.85 
 
 
163 aa  97.1  2e-19  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2238  NADH dehydrogenase subunit I  41.28 
 
 
163 aa  96.7  2e-19  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.180184 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0880  NADH dehydrogenase subunit I  35.92 
 
 
170 aa  96.3  2e-19  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1432  NADH dehydrogenase subunit I  35.17 
 
 
165 aa  97.1  2e-19  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.277545  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0965  NADH dehydrogenase subunit I  36.62 
 
 
170 aa  96.7  2e-19  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.837483  normal  0.0693949 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4553  NADH dehydrogenase subunit I  38.84 
 
 
162 aa  95.9  3e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.128776 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1509  NADH dehydrogenase subunit I  40.37 
 
 
165 aa  96.3  3e-19  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00304735 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1069  NADH dehydrogenase subunit I  35.97 
 
 
162 aa  96.3  3e-19  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.74272  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0820  NADH dehydrogenase subunit I  39.53 
 
 
160 aa  95.5  4e-19  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0786  NADH dehydrogenase subunit I  38.46 
 
 
163 aa  94.7  8e-19  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.079686  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2390  NADH dehydrogenase subunit I  41.09 
 
 
162 aa  94.4  1e-18  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  hitchhiker  0.0000573568  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0211  NADH dehydrogenase subunit I  37.01 
 
 
176 aa  94.4  1e-18  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5569  NADH dehydrogenase subunit I  35.25 
 
 
162 aa  94  1e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.156755 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3206  NADH dehydrogenase subunit I  35.25 
 
 
162 aa  94  1e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00643522  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1351  NADH dehydrogenase subunit I  35.25 
 
 
162 aa  94  1e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0309776  hitchhiker  0.0086006 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1271  NADH dehydrogenase subunit I  37.21 
 
 
171 aa  94.4  1e-18  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.400573  normal  0.480107 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2926  NADH dehydrogenase subunit I  40.31 
 
 
162 aa  93.6  2e-18  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2265  NADH dehydrogenase subunit I  35.25 
 
 
162 aa  93.6  2e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.477325  normal  0.254179 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0957  NADH dehydrogenase subunit I  35 
 
 
162 aa  93.2  2e-18  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0765322  normal  0.470027 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2001  NADH dehydrogenase subunit I  35.25 
 
 
162 aa  93.6  2e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0496982 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0898  NADH dehydrogenase subunit I  41.82 
 
 
163 aa  93.6  2e-18  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0404509  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1629  NADH dehydrogenase subunit I  35.25 
 
 
162 aa  93.6  2e-18  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2241  NADH dehydrogenase subunit I  35.25 
 
 
162 aa  93.6  2e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.493495  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4134  NADH dehydrogenase subunit I  35.53 
 
 
162 aa  92.8  3e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.181277  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1036  NADH dehydrogenase subunit I  34.53 
 
 
162 aa  92.4  4e-18  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.160572  normal  0.248767 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2158  NADH dehydrogenase subunit I  34.53 
 
 
162 aa  92.4  4e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.394971  normal  0.941111 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4398  NADH dehydrogenase subunit I  35.92 
 
 
162 aa  92.4  4e-18  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2279  NADH dehydrogenase subunit I  34.53 
 
 
162 aa  92.4  4e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.336058  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2631  NADH-quinone oxidoreductase, chain I  35.19 
 
 
230 aa  92  5e-18  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.87866  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0323  NADH dehydrogenase subunit I  41.59 
 
 
176 aa  92  5e-18  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>