174 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daci_6054 on replicon NC_010002
Organism: Delftia acidovorans SPH-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010002  Daci_6054  cyclic nucleotide-binding protein  100 
 
 		 159 aa  318  9.999999999999999e-87  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.507117  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3494  cyclic nucleotide-binding protein  60.9 
 
 		 173 aa  199  1.9999999999999998e-50  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4137  cyclic nucleotide-binding protein  60.26 
 
 		 177 aa  198  3e-50  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.252066 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4790  cyclic nucleotide-binding protein  64.47 
 
 		 170 aa  174  3e-43  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4903  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  50 
 
 		 163 aa  167  6e-41  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.533642 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4111  cyclic nucleotide-binding protein  42.11 
 
 		 163 aa  141  3e-33  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.670984  normal  0.130991 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5297  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  43.59 
 
 		 154 aa  137  4.999999999999999e-32  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.390031  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3813  cAMP-dependent protein kinase - catabolite gene activator and regulatory subunit  37.96 
 
 		 172 aa  85.5  3e-16  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.510827 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0179  cyclic nucleotide-binding protein  33.33 
 
 		 155 aa  80.9  0.000000000000006  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2419  cyclic nucleotide-binding protein  36.27 
 
 		 563 aa  60.5  0.00000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.871595  normal  1 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03665  sulfate transporter family protein (AFU_orthologue; AFUA_4G12440)  33.04 
 
 		 1053 aa  58.2  0.00000005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0056  cyclic nucleotide-binding  32.2 
 
 		 739 aa  57.4  0.00000007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18160  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  33.33 
 
 		 219 aa  56.2  0.0000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000607267  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3395  Crp/FNR family transcriptional regulator  35.77 
 
 		 225 aa  55.5  0.0000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1814  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  33.08 
 
 		 242 aa  55.1  0.0000004  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.38579  normal  0.245711 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3176  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  35.54 
 
 		 225 aa  55.1  0.0000004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.231761 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4167  cyclic nucleotide-binding protein  37.89 
 
 		 570 aa  54.3  0.0000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1056  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  30.83 
 
 		 287 aa  52.4  0.000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0718  cyclic nucleotide-binding  32 
 
 		 747 aa  52.4  0.000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.00567448  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5808  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  30.47 
 
 		 231 aa  52  0.000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.254135  normal  0.0101482 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8335  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  35.19 
 
 		 209 aa  52  0.000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.339186  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0079  hypothetical protein  36.56 
 
 		 169 aa  51.6  0.000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.26747 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1521  cyclic nucleotide-binding protein  29.66 
 
 		 153 aa  51.2  0.000005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  hitchhiker  0.000183504  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3425  cyclic nucleotide-binding protein  30.56 
 
 		 151 aa  51.2  0.000006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1954  putative Crp/Fnr family transcriptional regulator  30.21 
 
 		 141 aa  51.2  0.000006  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3038  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  30.09 
 
 		 225 aa  50.4  0.000009  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0452  cAMP-binding protein  31.54 
 
 		 160 aa  50.4  0.00001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000045265  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4763  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  32.43 
 
 		 237 aa  50.1  0.00001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0362  Crp/FNR family transcriptional regulator  30.17 
 
 		 234 aa  49.7  0.00001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.74387  normal  0.571703 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7320  cyclic nucleotide-binding protein  36.78 
 
 		 169 aa  50.1  0.00001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.376819  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0424  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  33.03 
 
 		 242 aa  49.3  0.00002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.24952 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2725  cyclic nucleotide binding/GGDEF domain-containing protein  27.36 
 
 		 322 aa  48.9  0.00003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.792666  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp3069  hypothetical protein  25.23 
 
 		 721 aa  48.9  0.00003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0522  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  27.62 
 
 		 224 aa  48.9  0.00003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.192194  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1612  cyclic nucleotide-binding protein  27.52 
 
 		 154 aa  48.5  0.00003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2118  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  32.41 
 
 		 227 aa  48.5  0.00003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.545546  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4730  cyclic nucleotide-binding protein  30.36 
 
 		 286 aa  48.5  0.00004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.813554  normal  0.722063 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1342  cyclic nucleotide-binding  33.65 
 
 		 731 aa  48.5  0.00004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0631571 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1127  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  23.14 
 
 		 163 aa  48.1  0.00005  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.871772  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2352  cyclic nucleotide-binding protein  27.52 
 
 		 154 aa  48.1  0.00005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.674498  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2350  cyclic nucleotide-binding protein  33.61 
 
 		 832 aa  47.8  0.00005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5745  transcriptional regulator  30.19 
 
 		 243 aa  47.8  0.00005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.810963  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0979  cAMP-binding protein  27.56 
 
 		 239 aa  48.1  0.00005  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05940  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  29.59 
 
 		 231 aa  47.8  0.00006  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.558941  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3195  cyclic nucleotide-binding protein  32.17 
 
 		 598 aa  47.8  0.00006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1915  cyclic nucleotide-binding protein  32.79 
 
 		 329 aa  47.8  0.00006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.379435  normal  0.183424 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3032  Crp family transcriptional regulator  31.25 
 
 		 224 aa  47.4  0.00007  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0461942  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4187  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  27.87 
 
 		 254 aa  47.4  0.00007  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.338954  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0435  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  31.82 
 
 		 226 aa  47.4  0.00008  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.376669 
 
 
-
 
NC_004310  BR2005  cyclic nucleotide-binding protein  30.7 
 
 		 153 aa  47.4  0.00008  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006670  CNA00680  vacuole protein, putative  26.92 
 
 		 1177 aa  47.4  0.00008  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0220987  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0173  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  28.03 
 
 		 211 aa  47.4  0.00008  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.106244  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2905  cyclic nucleotide-binding protein  25.83 
 
 		 157 aa  47.4  0.00008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0600936 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1928  cyclic nucleotide-binding protein  30.7 
 
 		 153 aa  47.4  0.00008  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5783  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  32.03 
 
 		 212 aa  47.4  0.00008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00268451  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3421  Crp/Fnr family transcriptional regulator  26.63 
 
 		 232 aa  47  0.00009  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1256  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  30 
 
 		 215 aa  46.6  0.0001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4596  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  31.58 
 
 		 230 aa  47  0.0001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3957  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  33.33 
 
 		 289 aa  47  0.0001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1111  cyclic nucleotide-binding  25.2 
 
 		 729 aa  46.6  0.0001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.804267  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0718  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  31 
 
 		 224 aa  47  0.0001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1517  cyclic nucleotide-binding protein  27.36 
 
 		 154 aa  46.6  0.0001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0629843  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0841  cyclic nucleotide-binding protein  29.73 
 
 		 160 aa  46.6  0.0001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.108052 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_18280  cAMP-binding protein  30.51 
 
 		 225 aa  47  0.0001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.186071  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2926  hypothetical protein  24.3 
 
 		 721 aa  45.8  0.0002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0117  cyclic nucleotide-binding: regulatory protein, Crp  33.03 
 
 		 228 aa  46.2  0.0002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0468  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  34.91 
 
 		 226 aa  46.2  0.0002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.974187 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1005  cyclic nucleotide-binding  31.91 
 
 		 226 aa  46.2  0.0002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.184599  normal  0.14907 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0964  cyclic nucleotide-binding protein  31.58 
 
 		 152 aa  45.8  0.0002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1838  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  31.25 
 
 		 225 aa  46.6  0.0002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0983527  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2700  cyclic nucleotide-binding protein  28.18 
 
 		 215 aa  46.2  0.0002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  hitchhiker  0.00108848  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2129  Crp/Fnr family transcriptional regulator  30.1 
 
 		 225 aa  46.6  0.0002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.185639  normal  0.344505 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0611  hypothetical protein  30.38 
 
 		 738 aa  45.4  0.0003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0840  cyclic nucleotide-binding protein  35.63 
 
 		 350 aa  45.4  0.0003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.126759 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2016  Crp/FNR family transcriptional regulator  36.19 
 
 		 229 aa  45.8  0.0003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0776172  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1358  Ion transport protein  32.95 
 
 		 419 aa  45.8  0.0003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4027  cyclic nucleotide-binding protein  32.26 
 
 		 413 aa  45.4  0.0003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2455  cyclic nucleotide-binding protein  35.48 
 
 		 594 aa  45.4  0.0003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7131  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  29.52 
 
 		 155 aa  45.4  0.0003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.331754 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1866  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  27.05 
 
 		 182 aa  45.1  0.0004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0893  Crp/FNR family transcriptional regulator  30.85 
 
 		 226 aa  45.1  0.0004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1378  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  34.09 
 
 		 408 aa  45.4  0.0004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0608  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  35.85 
 
 		 225 aa  45.1  0.0004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.847542  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4850  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  32.08 
 
 		 228 aa  45.1  0.0004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0407  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  29.09 
 
 		 243 aa  45.1  0.0004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2063  hypothetical protein  26.32 
 
 		 153 aa  44.7  0.0005  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2053  hypothetical protein  26.32 
 
 		 153 aa  44.7  0.0005  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4020  cyclic nucleotide-binding  33.33 
 
 		 367 aa  44.7  0.0005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.109231  normal  0.727114 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2607  cyclic nucleotide-binding protein  28.18 
 
 		 215 aa  44.7  0.0005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0559  Crp/FNR family transcriptional regulator  28.85 
 
 		 225 aa  44.7  0.0005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.338488  normal  0.42035 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5447  voltage-dependent potassium channel  32.22 
 
 		 409 aa  44.7  0.0005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.532768  normal  0.0697598 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0517  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  34.31 
 
 		 224 aa  44.7  0.0005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3692  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  29.03 
 
 		 146 aa  44.7  0.0006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4038  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  33.33 
 
 		 409 aa  44.7  0.0006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2074  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  32.58 
 
 		 225 aa  44.7  0.0006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.971908 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3626  cyclic nucleotide-regulated small mechanosensitive ion channel  29.75 
 
 		 489 aa  44.3  0.0006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13268  transmembrane transport protein  35.09 
 
 		 1048 aa  44.3  0.0007  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.321047 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6804  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  29.17 
 
 		 238 aa  43.9  0.0009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.743669  normal  0.223692 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0426  Na+/H+ antiporter  31.31 
 
 		 832 aa  43.9  0.0009  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0981  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  36.59 
 
 		 246 aa  43.9  0.0009  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.0154476 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>