More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daci_1416 on replicon NC_010002
Organism: Delftia acidovorans SPH-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010002  Daci_1416  AraC family transcriptional regulator  100 
 
 		 339 aa  669    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4871  AraC family transcriptional regulator  35.02 
 
 		 361 aa  161  2e-38  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2418  transcriptional regulator, AraC family  33.15 
 
 		 338 aa  122  9.999999999999999e-27  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2824  transcriptional regulator, AraC family  32.24 
 
 		 338 aa  120  4.9999999999999996e-26  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.60964 
 
 
-
 
NC_007488  RSP_3997  transcriptional regulator  37.09 
 
 		 316 aa  107  4e-22  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.564896  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2599  AraC family transcriptional regulator  29.63 
 
 		 343 aa  104  2e-21  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0564  AraC family transcriptional regulator  30.42 
 
 		 285 aa  103  3e-21  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.682443  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2955  transcriptional regulator, AraC family  25 
 
 		 317 aa  101  2e-20  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.012422  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5208  transcriptional regulator, AraC family  25.1 
 
 		 324 aa  99.8  6e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.0000934033  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2740  transcriptional activator FtrA  24.31 
 
 		 317 aa  99  9e-20  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.187912 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4083  AraC family transcriptional regulator  30.45 
 
 		 341 aa  97.8  2e-19  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0474473  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0072  transcriptional regulator  24.54 
 
 		 347 aa  98.2  2e-19  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000158985 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2846  AraC family transcriptional regulator  33.65 
 
 		 330 aa  97.1  4e-19  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0070  transcriptional regulator  27.54 
 
 		 347 aa  96.7  6e-19  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.020859 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2062  transcriptional activator FtrA  30 
 
 		 329 aa  96.3  7e-19  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0068  transcriptional regulator  27.54 
 
 		 347 aa  96.3  7e-19  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0711239 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1215  transcriptional regulator, AraC family  30.22 
 
 		 356 aa  96.3  8e-19  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.836684  normal  0.0161998 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1692  transcriptional regulator, AraC family  30.86 
 
 		 333 aa  95.5  1e-18  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2221  transcriptional regulator  25.75 
 
 		 330 aa  94.7  2e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2087  transcriptional activator FtrA  29.8 
 
 		 321 aa  94.4  3e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.31788  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3293  transcriptional regulator  30.71 
 
 		 323 aa  94  3e-18  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4194  AraC family transcriptional regulator  25.6 
 
 		 335 aa  93.2  6e-18  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0109567  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4495  AraC family transcriptional regulator  30.67 
 
 		 340 aa  92.8  7e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0923  AraC family transcriptional regulator  29.75 
 
 		 331 aa  92.8  7e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.147864  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3593  AraC family transcriptional regulator  26.52 
 
 		 342 aa  92.4  1e-17  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1687  AraC family transcriptional regulator  29.37 
 
 		 345 aa  91.7  2e-17  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0447832  normal  0.915417 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2051  transcriptional regulator, AraC family  30.8 
 
 		 344 aa  91.7  2e-17  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0974748 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1003  AraC family transcriptional regulator  26.17 
 
 		 332 aa  91.3  2e-17  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.194559  hitchhiker  0.0000278765 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1437  AraC family transcriptional regulator  26.92 
 
 		 326 aa  91.3  2e-17  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.424387 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2066  AraC family transcriptional regulator  30.4 
 
 		 338 aa  90.9  3e-17  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.623235  normal  0.45327 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3467  AraC family transcriptional regulator  31 
 
 		 323 aa  90.9  3e-17  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4080  transcriptional regulator  30.54 
 
 		 348 aa  90.9  3e-17  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2003  AraC family transcriptional regulator  30.84 
 
 		 342 aa  90.9  3e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0833293 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2659  AraC family transcriptional regulator  29.83 
 
 		 333 aa  90.5  4e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3021  AraC family transcriptional regulator  28.06 
 
 		 361 aa  90.1  5e-17  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.826436 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5890  transcriptional activator FtrA  29.39 
 
 		 321 aa  89.7  6e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6692  transcriptional regulator, AraC family  28.87 
 
 		 313 aa  89.7  6e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.178977 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5233  AraC family transcriptional regulator  29.67 
 
 		 349 aa  89.4  8e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.896357  normal  0.182047 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5976  transcriptional regulator  28.27 
 
 		 325 aa  89  9e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.557743  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2234  AraC family transcriptional regulator  28.77 
 
 		 330 aa  89  1e-16  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.962439 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3933  AraC family transcriptional regulator  32.57 
 
 		 337 aa  89  1e-16  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2133  transcriptional regulator, AraC family  28.73 
 
 		 321 aa  89  1e-16  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.205913  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1553  transcriptional regulator  26.28 
 
 		 331 aa  88.6  1e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.741987 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2875  ThiJ/PfpI domain-containing protein  29.89 
 
 		 330 aa  89  1e-16  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.276432  normal  0.168058 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0125  transcriptional regulator  27.31 
 
 		 325 aa  89  1e-16  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2675  transcriptional regulator, AraC family  26.5 
 
 		 344 aa  89  1e-16  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.307401  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3759  helix-turn-helix- domain containing protein AraC type  21.25 
 
 		 326 aa  89  1e-16  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4737  transcriptional activator FtrA  29.05 
 
 		 321 aa  87.8  2e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.196215 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4697  transcriptional regulator  22.48 
 
 		 331 aa  88.2  2e-16  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.207414  normal  0.0598838 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3556  transcriptional regulator  32.08 
 
 		 319 aa  88.6  2e-16  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.253425 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1645  transcriptional regulator AraC family  29.17 
 
 		 327 aa  87.8  2e-16  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1836  transcriptional regulator  27.8 
 
 		 327 aa  87.4  3e-16  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5041  transcriptional regulator  27.4 
 
 		 331 aa  87.4  3e-16  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00544571 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4536  AraC family transcriptional regulator  22.48 
 
 		 334 aa  87.4  3e-16  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3506  AraC family transcriptional regulator  28.77 
 
 		 330 aa  87.4  3e-16  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.939341  normal  0.0589755 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3109  AraC family transcriptional regulator  27.1 
 
 		 320 aa  87.4  3e-16  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.59349 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0720  AraC family transcriptional regulator  25.46 
 
 		 326 aa  87  4e-16  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000016714 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2641  transcriptional activator FtrA  29.55 
 
 		 322 aa  87.4  4e-16  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1848  transcriptional regulator, AraC family  31.97 
 
 		 338 aa  87  4e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.172735  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1489  helix-turn-helix- domain containing protein AraC type  22.9 
 
 		 323 aa  87  4e-16  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.616641 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1705  helix-turn-helix domain-containing protein  22.82 
 
 		 320 aa  86.7  5e-16  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.29723  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3021  transcriptional regulator, AraC family  26.79 
 
 		 372 aa  86.7  6e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3778  AraC family transcriptional regulator  24.15 
 
 		 329 aa  86.3  6e-16  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0051  transcriptional regulator  26.87 
 
 		 323 aa  86.3  7e-16  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.929929  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1918  transcriptional regulator, AraC family  29 
 
 		 327 aa  86.3  7e-16  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4716  transcriptional regulator, AraC family  26.07 
 
 		 341 aa  86.3  7e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.777825 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2197  AraC family transcriptional regulator  28.45 
 
 		 314 aa  86.3  8e-16  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3170  transcriptional regulator  33.48 
 
 		 327 aa  85.9  8e-16  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4316  transcriptional regulator, AraC family  32.6 
 
 		 320 aa  86.3  8e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0104  AraC family transcriptional regulator  27.31 
 
 		 328 aa  85.9  8e-16  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5349  AraC family transcriptional regulator  28 
 
 		 325 aa  86.3  8e-16  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1313  AraC family transcriptional regulator  22.15 
 
 		 306 aa  85.9  9e-16  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.459937  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2573  transcriptional regulator, AraC family with amidase-like domain  25.99 
 
 		 345 aa  85.9  9e-16  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4201  AraC family transcriptional regulator  29.36 
 
 		 312 aa  85.9  9e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4411  helix-turn-helix domain-containing protein  22.15 
 
 		 334 aa  85.5  0.000000000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.321471  normal  0.2451 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0897  transcriptional regulator  25.46 
 
 		 335 aa  85.5  0.000000000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.825741  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2856  AraC family transcriptional regulator  29.68 
 
 		 314 aa  85.5  0.000000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B3004  transcriptional regulator  27.72 
 
 		 319 aa  85.5  0.000000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000291789  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3699  transcriptional activator FtrA  30.24 
 
 		 324 aa  85.9  0.000000000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.507684  normal  0.317961 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0719  transcriptional regulator, AraC family  29.12 
 
 		 318 aa  85.5  0.000000000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5008  putative transcriptional regulator  24.54 
 
 		 332 aa  85.5  0.000000000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.250322  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_57630  AraC family transcriptional regulator  24.41 
 
 		 299 aa  85.5  0.000000000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.963773 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4869  AraC family transcriptional regulator  24.41 
 
 		 337 aa  85.5  0.000000000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6986  transcriptional regulator, AraC family  27.06 
 
 		 356 aa  84.7  0.000000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.667581  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1794  AraC family transcriptional regulator  28.38 
 
 		 338 aa  84.7  0.000000000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.112719  hitchhiker  0.00342809 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1100  AraC family transcriptional regulator  31.51 
 
 		 334 aa  84.3  0.000000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.0397278 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0920  AraC family transcriptional regulator  25 
 
 		 334 aa  84.7  0.000000000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7121  transcriptional activator FtrA  27.42 
 
 		 328 aa  85.1  0.000000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0749123  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6096  AraC family transcriptional regulator  27.85 
 
 		 342 aa  84.3  0.000000000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0835  transcriptional activator FtrA  27.72 
 
 		 318 aa  84.3  0.000000000000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0872  transcriptional activator FtrA  27.72 
 
 		 318 aa  84.3  0.000000000000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.637455  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2922  transcriptional regulator  30.67 
 
 		 337 aa  84  0.000000000000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4290  AraC family transcriptional regulator  26.65 
 
 		 347 aa  84.3  0.000000000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1567  AraC family transcriptional regulator  30.67 
 
 		 337 aa  84  0.000000000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.226821  normal  0.377129 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1565  transcriptional activator FtrA  27.72 
 
 		 318 aa  84.3  0.000000000000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0715182  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0055  transcriptional activator FtrA  27.72 
 
 		 318 aa  84.3  0.000000000000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.00213604  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4565  AraC family transcriptional regulator  28.66 
 
 		 332 aa  84  0.000000000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.644708 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5090  AraC family transcriptional regulator  28.66 
 
 		 332 aa  84  0.000000000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.893585 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6340  transcriptional regulator, AraC family  27.88 
 
 		 326 aa  84  0.000000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000351976 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1330  transcriptional regulator, AraC family  22.83 
 
 		 326 aa  84.3  0.000000000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.521973  normal  0.989615 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>