More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmet_4871 on replicon NC_007974
Organism: Cupriavidus metallidurans CH34



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007974  Rmet_4871  AraC family transcriptional regulator  100 
 
 		 361 aa  730    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1416  AraC family transcriptional regulator  35.02 
 
 		 339 aa  164  3e-39  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2418  transcriptional regulator, AraC family  32.92 
 
 		 338 aa  129  1.0000000000000001e-28  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1501  transcriptional regulator  27.84 
 
 		 347 aa  122  7e-27  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0125  transcriptional regulator  31.75 
 
 		 325 aa  122  8e-27  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2824  transcriptional regulator, AraC family  32.3 
 
 		 338 aa  120  3e-26  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.60964 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2508  transcriptional regulator  28.01 
 
 		 336 aa  119  9.999999999999999e-26  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.207874  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1553  transcriptional regulator  28.26 
 
 		 331 aa  114  3e-24  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.741987 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2221  transcriptional regulator  34.82 
 
 		 330 aa  112  9e-24  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4083  AraC family transcriptional regulator  31.7 
 
 		 341 aa  110  4.0000000000000004e-23  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0474473  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4536  AraC family transcriptional regulator  30.56 
 
 		 334 aa  109  9.000000000000001e-23  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2846  AraC family transcriptional regulator  31.02 
 
 		 330 aa  108  1e-22  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2573  transcriptional regulator, AraC family with amidase-like domain  27.11 
 
 		 345 aa  108  1e-22  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0072  transcriptional regulator  25.15 
 
 		 347 aa  108  1e-22  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000158985 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1313  AraC family transcriptional regulator  30.09 
 
 		 306 aa  108  2e-22  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.459937  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5208  transcriptional regulator, AraC family  23.94 
 
 		 324 aa  108  2e-22  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.0000934033  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4411  helix-turn-helix domain-containing protein  30.09 
 
 		 334 aa  108  2e-22  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.321471  normal  0.2451 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2641  transcriptional activator FtrA  32.43 
 
 		 322 aa  107  3e-22  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0897  transcriptional regulator  29.95 
 
 		 335 aa  106  7e-22  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.825741  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3506  AraC family transcriptional regulator  29.38 
 
 		 330 aa  106  7e-22  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.939341  normal  0.0589755 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4194  AraC family transcriptional regulator  25.15 
 
 		 335 aa  105  1e-21  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0109567  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3467  AraC family transcriptional regulator  29.85 
 
 		 323 aa  105  1e-21  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3785  AraC family transcriptional regulator  25.3 
 
 		 335 aa  105  1e-21  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0920  AraC family transcriptional regulator  29.17 
 
 		 334 aa  104  2e-21  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0068  transcriptional regulator  29.49 
 
 		 347 aa  104  2e-21  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0711239 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2062  transcriptional activator FtrA  31.1 
 
 		 329 aa  104  3e-21  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0070  transcriptional regulator  29.49 
 
 		 347 aa  104  3e-21  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.020859 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2234  AraC family transcriptional regulator  28.78 
 
 		 330 aa  103  5e-21  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.962439 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4121  helix-turn-helix, AraC type  29.17 
 
 		 334 aa  103  5e-21  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5041  transcriptional regulator  31.88 
 
 		 331 aa  102  8e-21  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00544571 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4869  AraC family transcriptional regulator  29.77 
 
 		 337 aa  102  1e-20  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1489  helix-turn-helix- domain containing protein AraC type  24.24 
 
 		 323 aa  102  1e-20  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.616641 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4697  transcriptional regulator  27.78 
 
 		 331 aa  102  1e-20  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.207414  normal  0.0598838 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3787  transcriptional regulator  22.89 
 
 		 321 aa  102  1e-20  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.113221 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4427  transcriptional regulator, AraC family  28.24 
 
 		 336 aa  101  2e-20  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.326492  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2599  AraC family transcriptional regulator  28.18 
 
 		 343 aa  101  2e-20  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3759  helix-turn-helix- domain containing protein AraC type  24.8 
 
 		 326 aa  101  3e-20  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3712  transcriptional regulator  29.86 
 
 		 336 aa  100  3e-20  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.990015  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1857  AraC family transcriptional regulator  32.37 
 
 		 338 aa  99.8  6e-20  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.18222 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0720  AraC family transcriptional regulator  24.85 
 
 		 326 aa  98.6  1e-19  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000016714 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1692  transcriptional regulator, AraC family  32.56 
 
 		 333 aa  98.6  1e-19  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3344  helix-turn-helix- domain containing protein AraC type  25 
 
 		 327 aa  98.2  2e-19  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.430093 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_57630  AraC family transcriptional regulator  28.24 
 
 		 299 aa  98.6  2e-19  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.963773 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5008  putative transcriptional regulator  28.7 
 
 		 332 aa  98.2  2e-19  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.250322  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1246  AraC family transcriptional regulator  30.63 
 
 		 332 aa  97.8  3e-19  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.481495  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1693  AraC family transcriptional regulator  27.44 
 
 		 321 aa  97.8  3e-19  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.69841  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1599  transcriptional regulator  26.09 
 
 		 361 aa  96.3  8e-19  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.97604  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2301  transcriptional regulator  24.3 
 
 		 324 aa  96.3  8e-19  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.0634001 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0622  transcriptional regulator  29.6 
 
 		 340 aa  95.9  9e-19  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.553854  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5151  AraC family transcriptional regulator  28.8 
 
 		 316 aa  95.1  1e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.479428  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2168  transcriptional regulator, AraC family  34.55 
 
 		 320 aa  95.5  1e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1918  transcriptional regulator, AraC family  28.69 
 
 		 327 aa  95.5  1e-18  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2532  AraC family transcriptional regulator  32.34 
 
 		 333 aa  95.5  1e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.607958 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6692  transcriptional regulator, AraC family  29.69 
 
 		 313 aa  94.7  2e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.178977 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0104  AraC family transcriptional regulator  23.08 
 
 		 328 aa  95.1  2e-18  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2659  AraC family transcriptional regulator  31.02 
 
 		 333 aa  95.1  2e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7121  transcriptional activator FtrA  28.4 
 
 		 328 aa  95.1  2e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0749123  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2921  AraC family transcriptional regulator  27.76 
 
 		 317 aa  94  4e-18  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2641  AraC family transcriptional regulator  31.84 
 
 		 338 aa  94  4e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5267  AraC family transcriptional regulator  26.4 
 
 		 320 aa  94  4e-18  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.589428 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5155  AraC family transcriptional regulator  28.11 
 
 		 348 aa  93.6  5e-18  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.976904 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4495  AraC family transcriptional regulator  30.88 
 
 		 340 aa  93.6  5e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0230  transcriptional regulator  25.99 
 
 		 315 aa  93.2  6e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.964133 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2955  transcriptional regulator, AraC family  28.11 
 
 		 317 aa  93.2  7e-18  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.012422  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6340  transcriptional regulator, AraC family  28.76 
 
 		 326 aa  93.2  7e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000351976 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5943  transcriptional regulator  31.84 
 
 		 338 aa  92.8  8e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.295801 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2740  transcriptional activator FtrA  27.65 
 
 		 317 aa  92.8  9e-18  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.187912 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2426  transcriptional regulator, AraC family  22.15 
 
 		 326 aa  92.4  9e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.971153  normal  0.0916341 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6821  AraC family transcriptional regulator  30.23 
 
 		 324 aa  91.7  2e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2002  AraC family transcriptional regulator  31.34 
 
 		 341 aa  91.3  2e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.513633  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2612  AraC family transcriptional regulator  31.34 
 
 		 341 aa  91.3  2e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4716  transcriptional regulator, AraC family  28.94 
 
 		 341 aa  91.3  3e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.777825 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2327  transcriptional regulator  27.32 
 
 		 316 aa  90.9  3e-17  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.223293  normal  0.02817 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5245  AraC family transcriptional regulator  26.96 
 
 		 328 aa  90.5  4e-17  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.608948  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1687  AraC family transcriptional regulator  29.78 
 
 		 345 aa  90.5  4e-17  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0447832  normal  0.915417 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6279  AraC family transcriptional regulator  25.47 
 
 		 338 aa  89.7  6e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.147886  normal  0.656807 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1271  transcriptional regulator, AraC family  28.11 
 
 		 317 aa  90.1  6e-17  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.607833  normal  0.171456 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0686  AraC family transcriptional regulator  30.85 
 
 		 330 aa  89.7  7e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.334624 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0564  AraC family transcriptional regulator  27.19 
 
 		 285 aa  89.4  8e-17  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.682443  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6986  transcriptional regulator, AraC family  28.44 
 
 		 356 aa  89.7  8e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.667581  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3263  transcriptional regulator, AraC family  21.78 
 
 		 326 aa  89  1e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.380473 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0640  AraC family transcriptional regulator  29.57 
 
 		 322 aa  89.4  1e-16  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2675  transcriptional regulator, AraC family  29.33 
 
 		 344 aa  89  1e-16  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.307401  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2003  AraC family transcriptional regulator  28.8 
 
 		 342 aa  88.6  1e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0833293 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3593  AraC family transcriptional regulator  26.73 
 
 		 342 aa  88.2  2e-16  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6861  AraC family transcriptional regulator  24.92 
 
 		 350 aa  87.8  3e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.133867  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2723  transcriptional regulator, AraC family  24.06 
 
 		 331 aa  87  4e-16  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.844059  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2051  transcriptional regulator, AraC family  31.39 
 
 		 344 aa  86.7  5e-16  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0974748 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2762  transcriptional regulator, AraC family  25.89 
 
 		 332 aa  87  5e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0171097 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01004  Transcriptional regulator containing an amidase domain and an AraC-type DNA-binding HTH domain  23.38 
 
 		 329 aa  87  5e-16  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0283206  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5407  transcriptional regulator, AraC family  30.56 
 
 		 313 aa  86.7  6e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.439375  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4847  AraC family transcriptional regulator  28.04 
 
 		 315 aa  86.7  6e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2142  AraC family transcriptional regulator  24.47 
 
 		 324 aa  86.7  6e-16  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS02019  transcription regulator protein  25.85 
 
 		 387 aa  86.3  7e-16  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2066  AraC family transcriptional regulator  31.19 
 
 		 338 aa  86.7  7e-16  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.623235  normal  0.45327 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5440  AraC family transcriptional regulator  27.57 
 
 		 315 aa  86.3  7e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5422  AraC family transcriptional regulator  27.57 
 
 		 315 aa  86.3  7e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0424919  normal  0.013013 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1334  putative transcriptional regulator  28.57 
 
 		 317 aa  86.3  8e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2087  transcriptional activator FtrA  29.91 
 
 		 321 aa  85.9  9e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.31788  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1433  helix-turn-helix domain-containing protein  32.54 
 
 		 326 aa  86.3  9e-16  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.392956  normal  0.582162 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>