83 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Clim_0884 on replicon NC_010803
Organism: Chlorobium limicola DSM 245



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010803  Clim_0884  amine oxidase  100 
 
 		 438 aa  900    Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0926  amine oxidase  55.17 
 
 		 435 aa  479  1e-134  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  decreased coverage  0.00368983  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1802  amine oxidase  56.29 
 
 		 439 aa  473  1e-132  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.0000252839  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0152  amine oxidase  37.9 
 
 		 439 aa  298  1e-79  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0027  protoporphyrinogen oxidase  24.3 
 
 		 463 aa  62.4  0.00000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1366  amine oxidase  25.27 
 
 		 523 aa  57  0.0000007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  decreased coverage  0.00171854  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0140  hypothetical protein  46.77 
 
 		 432 aa  53.1  0.000009  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.63632  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2329  amine oxidase  23.38 
 
 		 503 aa  52.8  0.00001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0980631  hitchhiker  0.00114882 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1144  protoporphyrinogen oxidase  21.51 
 
 		 441 aa  52  0.00002  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3599  FAD dependent oxidoreductase  36.99 
 
 		 346 aa  50.8  0.00005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.469063 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4414  NAD/FAD-dependent oxidoreductase-like  38.03 
 
 		 381 aa  50.4  0.00005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0288059  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2115  FAD dependent oxidoreductase  23.23 
 
 		 397 aa  50.1  0.00007  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12692  protoporphyrinogen oxidase  23.01 
 
 		 452 aa  50.4  0.00007  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000133849  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2540  FAD dependent oxidoreductase  22.32 
 
 		 397 aa  50.1  0.00008  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1666  protoporphyrinogen oxidase  28.57 
 
 		 469 aa  50.1  0.00008  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0036  UDP-galactopyranose mutase  36 
 
 		 647 aa  50.1  0.00008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.404508  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_01891  zeta-carotene desaturase  41.94 
 
 		 486 aa  49.7  0.0001  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.905208  normal  0.646889 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0012  protoporphyrinogen oxidase  23.4 
 
 		 469 aa  49.3  0.0001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_01311  zeta-carotene desaturase  40.32 
 
 		 478 aa  49.7  0.0001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.0941429  normal  0.461178 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2259  amine oxidase  25.41 
 
 		 459 aa  49.7  0.0001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  decreased coverage  0.00770255  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1824  glutamate synthase (NADPH)  50 
 
 		 677 aa  49.7  0.0001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.344079  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0340  phytoene desaturase  47.06 
 
 		 542 aa  48.9  0.0002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.0903063 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2058  NAD/FAD-binding protein-like protein  22.26 
 
 		 408 aa  48.5  0.0002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.00023874  normal  0.0560685 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0160  hypothetical protein  36.62 
 
 		 319 aa  48.5  0.0002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.443199  normal  0.129694 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0288  DNA photolyase FAD-binding protein  28.57 
 
 		 843 aa  48.5  0.0002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2356  zeta-carotene desaturase  37.1 
 
 		 488 aa  49.3  0.0002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3551  protoporphyrinogen oxidase  21.86 
 
 		 495 aa  48.5  0.0002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.0051763  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3176  carotene 7,8-desaturase  37.1 
 
 		 482 aa  48.5  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0534  amine oxidase  38.57 
 
 		 647 aa  48.5  0.0002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.666818  normal  0.352078 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1178  amine oxidase  35.23 
 
 		 454 aa  48.1  0.0003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0392628  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1484  zeta-carotene desaturase  40.32 
 
 		 486 aa  48.1  0.0003  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.22429  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0517  amine oxidase  38.57 
 
 		 647 aa  48.5  0.0003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2903  FAD dependent oxidoreductase  33.02 
 
 		 358 aa  48.5  0.0003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0779713  normal  0.848921 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2545  phytoene desaturase  36.36 
 
 		 536 aa  48.1  0.0003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.139145  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1553  protoporphyrinogen oxidase  21.84 
 
 		 473 aa  48.1  0.0003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0679  carotene 7,8-desaturase  35.48 
 
 		 489 aa  47.8  0.0004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1155  hypothetical protein  22.92 
 
 		 423 aa  47.4  0.0005  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0745  amine oxidase (flavin-containing)  40.79 
 
 		 469 aa  47.4  0.0005  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0200  zeta-carotene desaturase  35.48 
 
 		 479 aa  47.4  0.0005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5080  amine oxidase  27.21 
 
 		 506 aa  47  0.0006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.984429  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5168  amine oxidase  27.21 
 
 		 506 aa  47  0.0006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0796  phytoene desaturase  48.72 
 
 		 475 aa  46.6  0.0008  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0654  amine oxidase  30.77 
 
 		 438 aa  46.6  0.0008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.239854 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1893  protoporphyrinogen oxidase  22.45 
 
 		 421 aa  46.2  0.001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4788  carotene 7,8-desaturase  33.87 
 
 		 479 aa  45.8  0.001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3954  zeta-carotene desaturase  33.87 
 
 		 483 aa  46.2  0.001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.134571  normal  0.596487 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3390  amine oxidase  30 
 
 		 448 aa  46.6  0.001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5789  amine oxidase  23.85 
 
 		 444 aa  45.1  0.002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0804  hypothetical protein  35 
 
 		 468 aa  45.8  0.002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.230959  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1707  amine oxidase  50 
 
 		 408 aa  45.4  0.002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.588233  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2686  carotene 7,8-desaturase  32.26 
 
 		 490 aa  45.4  0.002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0732  amine oxidase  45.83 
 
 		 437 aa  45.8  0.002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.328082 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2493  protoporphyrinogen oxidase  27.27 
 
 		 476 aa  45.1  0.002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000052803 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4868  amine oxidase  37.14 
 
 		 645 aa  45.1  0.002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1552  hypothetical protein  40 
 
 		 435 aa  45.4  0.002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.113177  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_53974  zeta-carotene desaturase  36.07 
 
 		 591 aa  45.4  0.002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.246168  n/a   
 
 
-
 
NC_011676  PHATRDRAFT_45735  phytoene dehydrogenase  39.62 
 
 		 624 aa  45.4  0.002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3430  carotene 7,8-desaturase  32.26 
 
 		 490 aa  45.4  0.002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0073  amine oxidase  22.44 
 
 		 474 aa  44.7  0.003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0335  carotene 7,8-desaturase  35.48 
 
 		 488 aa  45.1  0.003  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1529  hypothetical protein  33.75 
 
 		 468 aa  45.1  0.003  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5459  amine oxidase  25.54 
 
 		 506 aa  45.1  0.003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.723961  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1822  amine oxidase  31.31 
 
 		 445 aa  44.3  0.004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4194  D-amino acid dehydrogenase small subunit  62.5 
 
 		 419 aa  44.3  0.004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0592  protoporphyrinogen oxidase  49.02 
 
 		 472 aa  43.9  0.005  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.916026  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2131  protoporphyrinogen oxidase  22.95 
 
 		 444 aa  44.3  0.005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.524947  normal  0.298059 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1906  FAD dependent oxidoreductase  29.35 
 
 		 351 aa  43.9  0.005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.118317  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5580  D-amino acid dehydrogenase small subunit  67.74 
 
 		 422 aa  43.9  0.005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0521  protoporphyrinogen oxidase  54.17 
 
 		 467 aa  44.3  0.005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1146  hypothetical protein  33.75 
 
 		 468 aa  44.3  0.005  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1481  FAD dependent oxidoreductase  30.49 
 
 		 341 aa  43.9  0.005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2710  twin-arginine translocation pathway signal  30.77 
 
 		 469 aa  43.9  0.006  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2662  CoB--CoM heterodisulfide reductase subunit A  48.78 
 
 		 658 aa  43.9  0.006  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1075  FAD dependent oxidoreductase  32.35 
 
 		 328 aa  43.9  0.006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.817137 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4048  FAD dependent oxidoreductase  46.34 
 
 		 407 aa  43.9  0.006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0468618 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0241  amine oxidase  31.88 
 
 		 508 aa  43.5  0.007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.363504 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0339  amine oxidase  26.32 
 
 		 423 aa  43.5  0.007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.39474  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0179  hypothetical protein  44.68 
 
 		 448 aa  43.5  0.008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0841  monoamine oxidase  50 
 
 		 378 aa  43.5  0.008  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.541876 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00915  CrtI1  31.71 
 
 		 488 aa  43.5  0.008  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.185647  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_04430  phytoene desaturase  50 
 
 		 548 aa  43.1  0.009  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1126  amine oxidase, flavin-containing protein  33.82 
 
 		 328 aa  43.1  0.009  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1483  glutamate synthase, small subunit  54.05 
 
 		 465 aa  43.1  0.01  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>