More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cfla_0681 on replicon NC_014151
Organism: Cellulomonas flavigena DSM 20109



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014151  Cfla_0681  two component transcriptional regulator, LuxR family  100 
 
 		 223 aa  436  1e-121  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000015615 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0138  two component transcriptional regulator, LuxR family  48.13 
 
 		 220 aa  191  6e-48  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.84841  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6494  two component LuxR family transcriptional regulator  38.43 
 
 		 235 aa  112  3e-24  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0149487  normal  0.504125 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2504  two component LuxR family transcriptional regulator  34.12 
 
 		 218 aa  105  5e-22  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  decreased coverage  0.00866313  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2295  two component transcriptional regulator, LuxR family  34.84 
 
 		 222 aa  104  1e-21  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.031577  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2092  two component transcriptional regulator, LuxR family  35.38 
 
 		 216 aa  102  4e-21  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0968  two component LuxR family transcriptional regulator  37.9 
 
 		 220 aa  102  4e-21  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2250  two component transcriptional regulator, LuxR family  34.72 
 
 		 217 aa  102  5e-21  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.137071 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1917  two component transcriptional regulator, LuxR family  39.91 
 
 		 215 aa  100  1e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1034  two component transcriptional regulator, LuxR family  34.69 
 
 		 213 aa  100  1e-20  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0503  response regulator receiver protein  35.45 
 
 		 226 aa  101  1e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.544154  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0244  two component transcriptional regulator, LuxR family  35.68 
 
 		 216 aa  100  2e-20  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3437  two component transcriptional regulator, LuxR family  35.57 
 
 		 248 aa  99.8  3e-20  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.39912  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0320  two component transcriptional regulator, LuxR family  34.58 
 
 		 218 aa  98.6  7e-20  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.308686  normal  0.0930841 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1746  two component transcriptional regulator, LuxR family  34.72 
 
 		 222 aa  98.6  7e-20  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.139209  normal  0.0305301 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0945  response regulator receiver  35.82 
 
 		 216 aa  98.6  7e-20  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0407172  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2541  two component transcriptional regulator, LuxR family  35.98 
 
 		 215 aa  98.2  9e-20  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.92112  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4062  two component LuxR family transcriptional regulator  34.22 
 
 		 216 aa  97.8  1e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0448793  normal  0.300284 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6933  two component LuxR family transcriptional regulator  34.84 
 
 		 244 aa  97.8  1e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.322421 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1910  two component transcriptional regulator, LuxR family  36.04 
 
 		 218 aa  96.7  2e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0263  two component LuxR family transcriptional regulator  35.38 
 
 		 214 aa  97.1  2e-19  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.103764 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5906  two component LuxR family transcriptional regulator  36.4 
 
 		 228 aa  97.1  2e-19  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.363446  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1971  two component LuxR family transcriptional regulator  35.55 
 
 		 216 aa  96.7  3e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.356635  normal  0.773651 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2699  two component transcriptional regulator, LuxR family  35 
 
 		 226 aa  96.3  3e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.000000630711  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4344  two component LuxR family transcriptional regulator  32.66 
 
 		 219 aa  96.3  3e-19  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.218307 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4729  two component transcriptional regulator, LuxR family  33.49 
 
 		 212 aa  95.5  5e-19  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4304  response regulator receiver  37.37 
 
 		 216 aa  95.5  6e-19  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.894661  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3050  two component transcriptional regulator, LuxR family  36.74 
 
 		 214 aa  95.5  6e-19  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.127757  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2449  two component LuxR family transcriptional regulator  35 
 
 		 211 aa  95.5  6e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.265588 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3253  two component LuxR family transcriptional regulator  32.42 
 
 		 213 aa  95.1  7e-19  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0097  two component transcriptional regulator, LuxR family  36.04 
 
 		 209 aa  94.7  9e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.142871  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2258  two component LuxR family transcriptional regulator  36.87 
 
 		 224 aa  94.7  1e-18  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.124896  normal  0.0124728 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1460  two component transcriptional regulator, LuxR family  35.68 
 
 		 224 aa  94  2e-18  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.659068  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3240  two component transcriptional regulator, LuxR family  34.3 
 
 		 224 aa  93.6  2e-18  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6085  two component transcriptional regulator, LuxR family  36.68 
 
 		 217 aa  93.6  2e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5165  two component transcriptional regulator, LuxR family  37.84 
 
 		 214 aa  93.2  3e-18  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.852017  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0190  two component transcriptional regulator, LuxR family  35 
 
 		 219 aa  93.2  3e-18  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.146862  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2491  LuxR response regulator receiver  33.65 
 
 		 242 aa  92.8  4e-18  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.470277  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1446  two component transcriptional regulator, LuxR family  35.68 
 
 		 223 aa  92.8  4e-18  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0454  two component LuxR family transcriptional regulator  36.04 
 
 		 208 aa  92.4  4e-18  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.698939  hitchhiker  0.00367889 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3480  two component transcriptional regulator, LuxR family  32.02 
 
 		 210 aa  92.4  5e-18  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.147525 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2623  two component transcriptional regulator, LuxR family  32.02 
 
 		 210 aa  92.4  5e-18  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3983  two component LuxR family transcriptional regulator  32.24 
 
 		 214 aa  92.4  5e-18  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.714996  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3924  two component LuxR family transcriptional regulator  32.24 
 
 		 214 aa  92.4  5e-18  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.278782 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4502  two component transcriptional regulator, LuxR family  35.71 
 
 		 205 aa  92.4  5e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.438194 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0799  two component transcriptional regulator, LuxR family  29.72 
 
 		 226 aa  92  6e-18  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4038  two component transcriptional regulator, LuxR family  32.52 
 
 		 253 aa  92  6e-18  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0340  two component LuxR family transcriptional regulator  36.89 
 
 		 221 aa  91.7  8e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0115466 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1487  two component LuxR family transcriptional regulator  34.65 
 
 		 231 aa  91.7  8e-18  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0122618  normal  0.753042 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6700  two component LuxR family transcriptional regulator  35.96 
 
 		 257 aa  91.7  9e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3331  response regulator receiver protein  35.35 
 
 		 227 aa  91.3  1e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.832029  normal  0.250763 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2341  two component transcriptional regulator, LuxR family  33.64 
 
 		 215 aa  91.3  1e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3862  two component transcriptional regulator, LuxR family  35.51 
 
 		 213 aa  91.3  1e-17  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00236143  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0500  two component transcriptional regulator, LuxR family  30.15 
 
 		 226 aa  91.3  1e-17  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1142  two component LuxR family transcriptional regulator  33.77 
 
 		 222 aa  90.5  2e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.661777  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2140  response regulator receiver  35.12 
 
 		 218 aa  90.1  2e-17  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.95288  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0198  two component transcriptional regulator, LuxR family  33.18 
 
 		 218 aa  90.9  2e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2472  two component transcriptional regulator, LuxR family  35.78 
 
 		 221 aa  90.5  2e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0113125  hitchhiker  0.00367669 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3331  two component transcriptional regulator, LuxR family  36.49 
 
 		 216 aa  90.5  2e-17  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0226882  normal  0.21338 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2300  response regulator receiver protein  34.27 
 
 		 213 aa  89.7  3e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA2071  LuxR family DNA-binding response regulator  34.93 
 
 		 215 aa  89.7  3e-17  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2950  LuxR response regulator receiver  35 
 
 		 221 aa  89.7  3e-17  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0810  two component transcriptional regulator, LuxR family  34.1 
 
 		 219 aa  90.1  3e-17  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1463  LuxR family DNA-binding response regulator  34.93 
 
 		 215 aa  89.7  3e-17  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1532  two component transcriptional regulator, LuxR family  38.19 
 
 		 220 aa  90.1  3e-17  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0114765  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1100  LuxR family DNA-binding response regulator  34.93 
 
 		 215 aa  89.7  3e-17  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1379  LuxR family DNA-binding response regulator  34.93 
 
 		 215 aa  89.7  3e-17  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2364  LuxR family DNA-binding response regulator  34.93 
 
 		 215 aa  89.7  3e-17  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2280  two component LuxR family transcriptional regulator  32.24 
 
 		 214 aa  89.7  3e-17  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.92337  normal  0.457915 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1684  response regulator receiver protein  35.2 
 
 		 207 aa  90.1  3e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.966789 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3545  LuxR family two component transcriptional regulator  33.96 
 
 		 213 aa  89.4  4e-17  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.701363 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5717  two component LuxR family transcriptional regulator  34.76 
 
 		 220 aa  89.4  4e-17  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.873964  hitchhiker  0.00405289 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0277  response regulator receiver protein  33.16 
 
 		 214 aa  89.4  4e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3248  LuxR family DNA-binding response regulator  34.93 
 
 		 215 aa  89.4  4e-17  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.780539  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3133  LuxR family DNA-binding response regulator  34.93 
 
 		 215 aa  89.4  4e-17  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1168  LuxR family transcriptional regulator  32.65 
 
 		 216 aa  89  5e-17  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0555  two component LuxR family transcriptional regulator  33.5 
 
 		 228 aa  89  5e-17  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21820  two component transcriptional regulator, LuxR family  31.12 
 
 		 211 aa  89  5e-17  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3029  two component transcriptional regulator, LuxR family  31.94 
 
 		 815 aa  89  5e-17  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00871852  hitchhiker  0.00628617 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5633  two component transcriptional regulator, LuxR family  33.02 
 
 		 203 aa  89  5e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.603295  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0828  response regulator  32.65 
 
 		 216 aa  89  5e-17  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0183204  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1260  putative nitrate/nitrite DNA-binding response regulator  29.9 
 
 		 206 aa  89  6e-17  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3909  two component LuxR family transcriptional regulator  32.38 
 
 		 211 aa  89  6e-17  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.755905  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4551  two component transcriptional regulator, LuxR family  27.31 
 
 		 208 aa  89  6e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.000124934  normal  0.0275678 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3421  two component LuxR family transcriptional regulator  34.93 
 
 		 223 aa  89  6e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0556432 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1992  two component transcriptional regulator, LuxR family  32.87 
 
 		 218 aa  88.6  6e-17  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0330  LuxR response regulator receiver  32.39 
 
 		 219 aa  88.6  7e-17  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.673991  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0315  two component LuxR family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 214 aa  88.6  7e-17  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0084678 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0094  two component transcriptional regulator, LuxR family  31.65 
 
 		 233 aa  88.6  7e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0277195 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2270  two component transcriptional regulator, LuxR family  36.99 
 
 		 242 aa  88.6  7e-17  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000113212 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4145  two component transcriptional regulator, LuxR family  37.73 
 
 		 216 aa  88.6  8e-17  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1152  two component LuxR family transcriptional regulator  33.5 
 
 		 225 aa  88.2  9e-17  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0530  two component transcriptional regulator, LuxR family  32.56 
 
 		 214 aa  88.2  9e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0201422  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7225  two component LuxR family transcriptional regulator  32.26 
 
 		 229 aa  88.2  9e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0516  two component transcriptional regulator, LuxR family  30.77 
 
 		 231 aa  88.2  9e-17  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2387  two component transcriptional regulator, LuxR family  28.21 
 
 		 207 aa  87.4  1e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.132486  normal  0.384012 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1222  two component LuxR family transcriptional regulator  33.5 
 
 		 225 aa  87.4  1e-16  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0632  two component LuxR family transcriptional regulator  32 
 
 		 224 aa  87.8  1e-16  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00385785  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8722  response regulator receiver protein  32.08 
 
 		 210 aa  87.8  1e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0636  two component transcriptional regulator, LuxR family  34.11 
 
 		 214 aa  87.4  1e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.583432 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>