71 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cagg_3815 on replicon NC_011831
Organism: Chloroflexus aggregans DSM 9485



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011831  Cagg_3815  CRISPR-associated RAMP protein, Cmr1 family  100 
 
 		 495 aa  969    Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.433858  normal  0.206813 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0912  CRISPR-associated RAMP protein, Cmr1 family  71.38 
 
 		 344 aa  456  1e-127  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4232  CRISPR-associated RAMP Cmr1 family protein  80.63 
 
 		 219 aa  368  1e-100  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2398  accumulation associated protein  41.09 
 
 		 2397 aa  120  7.999999999999999e-26  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.53067  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1663  hypothetical protein  27.37 
 
 		 2449 aa  119  9.999999999999999e-26  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0478  cell-surface large adhesin  41.5 
 
 		 2851 aa  115  1.0000000000000001e-24  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0803  CRISPR-associated RAMP protein, Cmr1 family  37.43 
 
 		 423 aa  100  4e-20  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1119  G5 domain protein  30.87 
 
 		 1859 aa  100  5e-20  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.983019  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1353  hypothetical protein  29.01 
 
 		 366 aa  99  2e-19  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.119885  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1748  hypothetical protein  41.07 
 
 		 1408 aa  99  2e-19  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2610  Collagen triple helix repeat protein  39.34 
 
 		 767 aa  92.4  2e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.965964  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3831  CRISPR-associated RAMP protein, Cmr1 family  45.63 
 
 		 355 aa  89.7  1e-16  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.253704  hitchhiker  0.000219898 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0313  CRISPR-associated RAMP Cmr1 family protein  56.25 
 
 		 406 aa  89.7  1e-16  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0930  CRISPR-associated RAMP protein, Cmr1 family  43.27 
 
 		 331 aa  89.4  1e-16  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.000000100004  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0586  Collagen triple helix repeat protein  37.87 
 
 		 606 aa  89.4  1e-16  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4245  CRISPR-associated RAMP Cmr1 family protein  44.66 
 
 		 356 aa  88.2  3e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2593  CRISPR-associated RAMP Cmr1 family protein  40.38 
 
 		 356 aa  87  7e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.275443 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4285  Collagen triple helix repeat protein  37.82 
 
 		 648 aa  81.3  0.00000000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.275713  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8097  AAA ATPase containing von Willebrand factor type A (vWA) domain-like protein  28.65 
 
 		 521 aa  79  0.0000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5064  Collagen triple helix repeat protein  31.14 
 
 		 839 aa  75.9  0.000000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.18046  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1986  CRISPR-associated RAMP protein, Cmr1 family  42.2 
 
 		 369 aa  74.7  0.000000000003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4370  triple helix repeat-containing collagen  46.72 
 
 		 344 aa  74.3  0.000000000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.324657  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1632  large adhesin  41.81 
 
 		 2914 aa  73.9  0.000000000006  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1587  translation initiation factor IF-2  31.58 
 
 		 1128 aa  70.5  0.00000000007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.73073  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2697  hypothetical protein  40.85 
 
 		 382 aa  67  0.0000000007  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1276  Outer membrane autotransporter barrel protein  41.67 
 
 		 1049 aa  66.2  0.000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0821611 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5487  cell wall anchor domain-containing protein  29.27 
 
 		 3242 aa  64.7  0.000000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2569  hypothetical protein  40.94 
 
 		 442 aa  64.3  0.000000004  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_16981  translation initiation factor IF-2  38.37 
 
 		 1126 aa  63.9  0.000000007  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2081  translation initiation factor IF-2  35.43 
 
 		 1104 aa  60.8  0.00000005  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3685  triple helix repeat-containing collagen  39.57 
 
 		 493 aa  60.5  0.00000006  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1925  triple helix repeat-containing collagen  38.06 
 
 		 492 aa  60.5  0.00000008  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8979  hypothetical protein  39.52 
 
 		 307 aa  58.2  0.0000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3686  triple helix repeat-containing collagen  36.2 
 
 		 587 aa  54.7  0.000003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0739  YSIRK Gram-positive signal peptide  30.37 
 
 		 2035 aa  55.1  0.000003  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4914  Collagen triple helix repeat protein  47.13 
 
 		 283 aa  54.7  0.000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.209024  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0991  superfamily I DNA/RNA helicase  35.83 
 
 		 2622 aa  53.9  0.000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0592  translation initiation factor IF-2  33.58 
 
 		 1176 aa  53.9  0.000007  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1256  Serine/threonine protein kinase-like protein  24.72 
 
 		 751 aa  53.1  0.00001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.189583 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2039  acriflavin resistance protein  33.33 
 
 		 1186 aa  50.8  0.00006  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  decreased coverage  0.00865323  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5054  Collagen triple helix repeat protein  37.8 
 
 		 298 aa  50.1  0.00008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0339954  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3176  DNA topoisomerase III  41.27 
 
 		 873 aa  50.4  0.00008  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0044  serine/threonine protein kinase  60.98 
 
 		 863 aa  50.1  0.00009  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0701705  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1924  triple helix repeat-containing collagen  36.02 
 
 		 466 aa  49.7  0.0001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03032  putative GPI-anchored protein (Eurofung)  56.9 
 
 		 432 aa  48.9  0.0002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.189791 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2888  Serine/threonine protein kinase-like protein  35.67 
 
 		 659 aa  48.9  0.0002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.301029  normal  0.670701 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5836  Collagen triple helix repeat protein  40.19 
 
 		 1426 aa  48.1  0.0003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.278516  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2599  triple helix repeat-containing collagen  42.55 
 
 		 222 aa  48.5  0.0003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0118729  normal  0.173421 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5623  hypothetical protein  46.73 
 
 		 778 aa  47.4  0.0005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  decreased coverage  0.00516948  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_24120  hypothetical protein  66.67 
 
 		 322 aa  47.8  0.0005  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0688  Cytochrome P450-like protein  37.18 
 
 		 450 aa  47.4  0.0006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.539443 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3346  Non-ribosomal peptide synthetase modules and related protein-like protein  44 
 
 		 1864 aa  47.4  0.0006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0153259 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3560  protein of unknown function DUF312  55.1 
 
 		 258 aa  47.4  0.0006  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02400  hypothetical protein  49.21 
 
 		 341 aa  47  0.0007  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.908964  normal  0.0923769 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2923  cell wall surface anchor family protein  31.52 
 
 		 746 aa  47  0.0008  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00390  cell elongation-specific peptidoglycan biosynthesis regulator RodA  44.64 
 
 		 543 aa  47  0.0009  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.476273 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1608  collagen triple helix repeat protein  34.05 
 
 		 1101 aa  46.2  0.001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.712053 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2870  YD repeat protein  31.79 
 
 		 2144 aa  46.2  0.001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0804  Collagen triple helix repeat  44.94 
 
 		 288 aa  46.2  0.001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.479308  normal  0.0397602 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1259  hypothetical protein  30.58 
 
 		 403 aa  45.8  0.002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.459414  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1304  Collagen triple helix repeat protein  38.42 
 
 		 319 aa  45.4  0.002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.174683  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3684  triple helix repeat-containing collagen  33.68 
 
 		 468 aa  45.4  0.002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2666  Collagen triple helix repeat protein  58.7 
 
 		 289 aa  45.8  0.002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.371908 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4113  Collagen triple helix repeat  38.24 
 
 		 212 aa  45.4  0.002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.366844  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0409  hypothetical protein  38.33 
 
 		 527 aa  45.1  0.003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.282348  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0713  Collagen triple helix repeat protein  39.38 
 
 		 322 aa  44.3  0.005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1432  pseudouridine synthase, Rsu  19.88 
 
 		 610 aa  43.9  0.007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000648222 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1926  triple helix repeat-containing collagen  34.1 
 
 		 582 aa  43.9  0.007  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0893  Collagen triple helix repeat protein  42.67 
 
 		 644 aa  43.5  0.009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.216124  normal  0.507094 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_16741  translation initiation factor IF-2  31.19 
 
 		 1161 aa  43.1  0.01  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4749  OmpA/MotB domain-containing protein  40.95 
 
 		 717 aa  43.5  0.01  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0350948  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>