More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aave_2039 on replicon NC_008752
Organism: Acidovorax citrulli AAC00-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
CP001509  ECD_01980  multidrug efflux system, subunit B  56.78 
 
 
1040 aa  768    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4416  acriflavin resistance protein  59.33 
 
 
1039 aa  765    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.248497  normal  0.815285 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1550  acriflavin resistance protein D  49.12 
 
 
1071 aa  665    Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1581  acriflavin resistance protein  56.78 
 
 
1040 aa  767    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.132425  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1611  AcrB/AcrD/AcrF family protein  46.13 
 
 
1032 aa  648    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.651571  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0737  acriflavin resistance protein  51.6 
 
 
1054 aa  654    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2593  acriflavin resistance protein  46.28 
 
 
1072 aa  649    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.392078  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3553  multidrug efflux system subunit MdtB  58.23 
 
 
1039 aa  784    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3102  multidrug efflux system subunit MdtB  57.62 
 
 
1052 aa  827    Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS03142  drug efflux pump transmembrane protein  60.71 
 
 
1041 aa  847    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS03143  drug efflux transmembrane protein  49.25 
 
 
1033 aa  662    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2257  acriflavin resistance protein  58.51 
 
 
1043 aa  770    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.130423 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1308  AcrB/AcrD/AcrF family protein  50.74 
 
 
1034 aa  655    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.582807  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2217  multidrug efflux system subunit MdtB  56.78 
 
 
1040 aa  767    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2330  acriflavin resistance protein  56.77 
 
 
1032 aa  774    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.290618  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1128  acriflavin resistance protein  50.74 
 
 
1034 aa  661    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.0555006 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2483  acriflavin resistance protein  57.11 
 
 
1036 aa  751    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.137837  normal  0.300491 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2095  acriflavin resistance protein  50.67 
 
 
1053 aa  672    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.238073  normal  0.0214179 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2801  acriflavin resistance protein  56.94 
 
 
1032 aa  790    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0747979  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0570  acriflavin resistance protein  51.29 
 
 
1103 aa  697    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.231767  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0571  acriflavin resistance protein  60.61 
 
 
1046 aa  827    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.606736  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2685  multidrug efflux system subunit MdtB  57.45 
 
 
1040 aa  799    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1171  acriflavin resistance protein  59.53 
 
 
1039 aa  823    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0727301 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4182  acriflavin resistance protein  48.84 
 
 
1033 aa  659    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.559486  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1265  acriflavin resistance protein  49.53 
 
 
1044 aa  642    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.192962 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2520  acriflavin resistance protein  59.3 
 
 
1045 aa  793    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0450532  normal  0.025752 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1522  acriflavin resistance protein  54.8 
 
 
1040 aa  734    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.15115 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1331  multidrug efflux system subunit MdtB  57.49 
 
 
1052 aa  829    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1500  AcrB/AcrD/AcrF family protein  61.08 
 
 
1036 aa  832    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1330  multidrug efflux system subunit MdtC  48.27 
 
 
1024 aa  657    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2522  acriflavin resistance protein  58.08 
 
 
1034 aa  788    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.984252  normal  0.292991 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1772  acriflavin resistance protein  62.08 
 
 
1045 aa  819    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.547611  normal  0.651632 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1168  acriflavin resistance protein  50 
 
 
1038 aa  686    Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3488  acriflavin resistance protein  51.41 
 
 
1046 aa  651    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.18169  normal  0.10741 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1213  multidrug efflux system subunit MdtC  48.27 
 
 
1024 aa  656    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000000286734  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4305  acriflavin resistance protein  59.17 
 
 
1037 aa  815    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0526146  normal  0.0479981 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1652  acriflavin resistance protein  45.83 
 
 
1037 aa  648    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.257724  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2287  acriflavin resistance protein  79.08 
 
 
1026 aa  1091    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0362502  normal  0.921003 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1158  multidrug efflux system subunit MdtB  57.18 
 
 
1040 aa  773    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1335  putative RND efflux transporter  47.62 
 
 
1028 aa  665    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.14004  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2855  acriflavin resistance protein  50.39 
 
 
1054 aa  665    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.427735 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2867  AcrB/AcrD/AcrF family protein  60.97 
 
 
1036 aa  838    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2709  RND efflux transporter  58.95 
 
 
1043 aa  788    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1214  multidrug efflux system subunit MdtB  57.49 
 
 
1052 aa  829    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.243575  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1566  multidrug efflux system subunit MdtB  56.78 
 
 
1040 aa  767    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.84187  normal  0.306812 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4747  acriflavin resistance protein  56.43 
 
 
1041 aa  758    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.201948  normal  0.322043 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2901  acriflavin resistance protein  53.96 
 
 
1038 aa  713    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0661735  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1576  acriflavin resistance protein  61.3 
 
 
1044 aa  821    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03981  acriflavin resistance protein D  50.26 
 
 
1082 aa  689    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2559  acriflavin resistance protein  54.62 
 
 
1042 aa  719    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0108247  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0985  multidrug efflux system subunit MdtB  56.91 
 
 
1040 aa  768    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.442979 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0743  acriflavin resistance protein  54.65 
 
 
1044 aa  763    Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.590398 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0837  acriflavin resistance protein  49.6 
 
 
1030 aa  672    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2419  acriflavin resistance protein  57.66 
 
 
1053 aa  741    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.198078  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2827  acriflavin resistance protein  74.74 
 
 
1052 aa  1013    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.68497  normal  0.224548 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4390  acriflavin resistance protein  50.4 
 
 
1030 aa  657    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.0580594 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2908  multidrug efflux system protein  60.91 
 
 
1040 aa  811    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.442487  normal  0.66419 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0134  acriflavin resistance protein  50.06 
 
 
1065 aa  710    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2009  AcrB/AcrD/AcrF family cation efflux protein  56.69 
 
 
1041 aa  762    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0269291  normal  0.0260573 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2570  acriflavin resistance protein  53.71 
 
 
1041 aa  714    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.0830521 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1597  acriflavin resistance protein  52.02 
 
 
1044 aa  694    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1233  acriflavin resistance protein  49.87 
 
 
1043 aa  668    Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3893  multidrug ABC transporter  48.79 
 
 
1035 aa  662    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1512  acriflavin resistance protein  53.68 
 
 
1042 aa  693    Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.901552  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1509  acriflavin resistance protein  50.6 
 
 
1048 aa  683    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1123  acriflavin resistance protein  57.75 
 
 
1041 aa  784    Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.47049 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2064  acriflavin resistance protein  53.68 
 
 
1042 aa  730    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.730897  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3603  acriflavin resistance protein  61.85 
 
 
1037 aa  834    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0448996  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0512  acriflavin resistance protein  49.59 
 
 
1100 aa  661    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.196913  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0513  acriflavin resistance protein  59.79 
 
 
1051 aa  812    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0135048  normal  0.800803 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0600  acriflavin resistance protein  51.52 
 
 
1066 aa  673    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0654802  normal  0.436006 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1079  acriflavin resistance protein  60.45 
 
 
1039 aa  822    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0757795  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4318  acriflavin resistance protein  58.49 
 
 
1041 aa  821    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.329827 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2830  acriflavin resistance protein  53.69 
 
 
1092 aa  798    Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2923  acriflavin resistance protein  48.67 
 
 
1074 aa  642    Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0817893  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4167  acriflavin resistance protein  60.71 
 
 
1035 aa  774    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0718  acriflavin resistance protein  59.53 
 
 
1039 aa  825    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3101  multidrug efflux system subunit MdtC  48.27 
 
 
1024 aa  656    Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0416497  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2105  acriflavin resistance protein  60.13 
 
 
1037 aa  817    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3933  multidrug resistance protein mdtB  55.18 
 
 
1042 aa  716    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.906804 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1368  multidrug resistance protein MdtB  61.08 
 
 
1036 aa  834    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3536  putative component of multidrug efflux pump, mdtB-like protein  49.22 
 
 
1048 aa  703    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2430  acriflavin resistance protein  60.08 
 
 
1030 aa  805    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.157087  normal  0.957896 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2187  acriflavin resistance protein  57.01 
 
 
1032 aa  773    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1079  acriflavin resistance protein  60.32 
 
 
1039 aa  819    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_31890  putative RND efflux transporter  58.82 
 
 
1043 aa  787    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0910827  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4183  acriflavin resistance protein  60.11 
 
 
1044 aa  838    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0790325  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_45890  putative RND efflux transporter  48.26 
 
 
1036 aa  656    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.961343 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3554  multidrug efflux system subunit MdtC  47.36 
 
 
1026 aa  643    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1197  acriflavin resistance protein  59.53 
 
 
1039 aa  825    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.385942  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0451  acriflavin resistance protein  45.94 
 
 
1055 aa  640    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.931818 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3308  acriflavin resistance protein  73.01 
 
 
1046 aa  1011    Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1363  multidrug resistance protein MdtB  60.34 
 
 
1036 aa  833    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.387551  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2203  acriflavin resistance protein  59.84 
 
 
1029 aa  804    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2204  acriflavin resistance protein  48.93 
 
 
1036 aa  657    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0345  acriflavin resistance protein  50.6 
 
 
1051 aa  663    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2371  acriflavin resistance protein  45.6 
 
 
1035 aa  646    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.916635  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1489  acriflavin resistance protein  49.87 
 
 
1071 aa  662    Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2039  acriflavin resistance protein  100 
 
 
1186 aa  2326    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  decreased coverage  0.00865323  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2367  multidrug efflux system subunit MdtB  56.91 
 
 
1040 aa  768    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>