169 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CND00630 on replicon NC_006686
Organism: Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_006686  CND00630  expressed protein  100 
 
 
648 aa  1308    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1407  DEAD/DEAH box helicase-like  29.44 
 
 
624 aa  57.8  0.0000006  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.721389  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0604  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  40.38 
 
 
491 aa  57  0.000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.631555 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2935  ATP-dependent RNA helicase RhlE  29.38 
 
 
476 aa  56.2  0.000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_28472  ATP-dependent RNA helicase  31.52 
 
 
836 aa  55.1  0.000004  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.196096 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1528  ATP-dependent RNA helicase RhlE  28.65 
 
 
477 aa  55.1  0.000004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.515167  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_09651  putative ATP-dependent RNA helicase  28.65 
 
 
636 aa  54.7  0.000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3108  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  30.27 
 
 
550 aa  54.7  0.000005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_10125  ATP-dependent RNA helicase (Drs1), putative (AFU_orthologue; AFUA_1G14990)  28.17 
 
 
814 aa  54.7  0.000006  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  hitchhiker  0.00305342  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0237  DEAD/DEAH box helicase-like  38.24 
 
 
498 aa  54.7  0.000006  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0187  DEAD/DEAH box helicase domain protein  29.48 
 
 
453 aa  53.1  0.00002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7154  DEAD/DEAH box helicase domain protein  32 
 
 
479 aa  52.8  0.00002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.557352 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0169  DEAD/DEAH box helicase domain protein  29.48 
 
 
449 aa  52.8  0.00002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000249286 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2850  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  30.64 
 
 
444 aa  52.4  0.00003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3851  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  29.78 
 
 
513 aa  51.6  0.00004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00282331 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2838  DEAD-box ATP dependent DNA helicase  32.89 
 
 
449 aa  51.2  0.00006  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2444  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  32.24 
 
 
449 aa  50.8  0.00008  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000483539 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2514  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  32.24 
 
 
449 aa  50.8  0.00008  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  unclonable  0.0000164023 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28600  DNA/RNA helicase, superfamily II  28.04 
 
 
570 aa  50.8  0.00008  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.219312 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05480  DEAD/DEAH box helicase domain protein  27.91 
 
 
527 aa  50.1  0.0001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  0.00000000000000471221  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3466  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  33.91 
 
 
526 aa  50.1  0.0001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0905  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  33.91 
 
 
525 aa  50.1  0.0001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0870  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  33.91 
 
 
525 aa  50.1  0.0001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06483  hypothetical protein  32.56 
 
 
527 aa  50.1  0.0001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01750  ATP-dependent RNA helicase mak5 (EC 3.6.1.-) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:Q5BCI0]  33.64 
 
 
770 aa  49.3  0.0002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.267965  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1082  ATP-dependent DEAD/DEAH box RNA-helicase  30.43 
 
 
567 aa  49.7  0.0002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5967  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  30.86 
 
 
477 aa  49.7  0.0002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4920  DEAD/DEAH box helicase-like  29.21 
 
 
446 aa  49.7  0.0002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00126468  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3878  DEAD/DEAH box helicase domain protein  28.09 
 
 
486 aa  49.7  0.0002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0657  ATP-dependent RNA helicase  32.04 
 
 
450 aa  49.3  0.0002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3129  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  30.29 
 
 
549 aa  49.7  0.0002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0838  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  33.65 
 
 
549 aa  49.7  0.0002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0810  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  29.41 
 
 
578 aa  49.3  0.0002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1682  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  36.26 
 
 
451 aa  49.7  0.0002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.747215  normal  0.719236 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1660  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  36.26 
 
 
451 aa  49.7  0.0002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1645  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  36.26 
 
 
451 aa  49.7  0.0002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.55741  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2698  DEAD/DEAH box helicase domain protein  36.26 
 
 
451 aa  49.7  0.0002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.029027  hitchhiker  0.0000852127 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4741  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  28.26 
 
 
491 aa  49.7  0.0002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1778  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  33.87 
 
 
479 aa  48.9  0.0003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1379  DEAD/DEAH box helicase-like  31.43 
 
 
552 aa  48.9  0.0003  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5192  DEAD/DEAH box helicase-like  30.86 
 
 
507 aa  48.5  0.0003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4569  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  30.29 
 
 
483 aa  48.5  0.0003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0474956 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2643  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  27.16 
 
 
533 aa  48.9  0.0003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2606  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  31.54 
 
 
449 aa  48.9  0.0003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.581519  hitchhiker  0.0000000487661 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1273  DEAD/DEAH box helicase-like protein  27.71 
 
 
456 aa  48.9  0.0003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00163925 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1537  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  37.5 
 
 
449 aa  48.5  0.0003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.713304  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0439  DEAD/DEAH box helicase domain protein  32.35 
 
 
441 aa  48.9  0.0003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3228  DEAD/DEAH box helicase domain protein  28.48 
 
 
444 aa  48.5  0.0004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.157836  normal  0.116835 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0817  DEAD/DEAH box helicase-like protein  28.82 
 
 
452 aa  48.5  0.0004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.187281  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1623  DEAD/DEAH box helicase-like protein  26.92 
 
 
424 aa  48.5  0.0004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.216615  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5667  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  30.86 
 
 
507 aa  48.5  0.0004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.110628 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0896  DEAD/DEAH box helicase domain protein  34 
 
 
515 aa  48.1  0.0004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0158  ATP-dependent RNA helicase RhlB  38.82 
 
 
428 aa  48.5  0.0004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.495687 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00568  ATP-dependent RNA helicase RhlB  33.33 
 
 
429 aa  48.1  0.0005  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.595668  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1945  DEAD/DEAH box helicase-like  33.33 
 
 
411 aa  48.1  0.0005  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4221  ATP-dependent RNA helicase RhlB  35.24 
 
 
421 aa  48.1  0.0005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0989994  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6264  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  30.86 
 
 
511 aa  48.1  0.0005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_1024  ATP-dependent RNA helicase RhlE  39.78 
 
 
451 aa  48.1  0.0005  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3204  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  26.64 
 
 
559 aa  48.1  0.0005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1460  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  31.94 
 
 
442 aa  48.1  0.0005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7264  DEAD/DEAH box helicase  30.86 
 
 
481 aa  47.8  0.0006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3043  DEAD/DEAH box helicase-like  28.12 
 
 
452 aa  47.8  0.0006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000626056  normal  0.930079 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0703  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  35 
 
 
494 aa  47.8  0.0006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1452  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  32.69 
 
 
471 aa  47.8  0.0007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  unclonable  0.0000222801  unclonable  0.00000844821 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1820  helicase, C-terminal:Type III restriction enzyme, res subunit:DEAD/DEAH box helicase, N-terminal  26.47 
 
 
447 aa  47.4  0.0008  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.219559 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0452  DEAD/DEAH box helicase domain protein  32.48 
 
 
604 aa  47.4  0.0009  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_24549  predicted protein  36.84 
 
 
346 aa  47.4  0.0009  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.546495 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2419  DEAD/DEAH box helicase domain protein  27.49 
 
 
452 aa  46.6  0.001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.131978  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0142  putative ATP-dependent RNA helicase (DEAD/DEAH box helicase)  35.64 
 
 
495 aa  47  0.001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_15280  DNA/RNA helicase, superfamily II  32.52 
 
 
611 aa  46.6  0.001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.170483  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1148  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  27.53 
 
 
489 aa  46.6  0.001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4088  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  31.68 
 
 
461 aa  46.6  0.001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.26538 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2697  ATP-dependent RNA helicase RhlB  32.68 
 
 
438 aa  47  0.001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.578293  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00764  RNA helicase  28.07 
 
 
454 aa  46.2  0.002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.697529  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2845  DEAD/DEAH box helicase domain protein  28.07 
 
 
454 aa  46.2  0.002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0542  DEAD/DEAH box helicase domain protein  26.02 
 
 
411 aa  46.2  0.002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.337517  normal  0.833057 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0883  ATP-dependent RNA helicase RhlE  27.49 
 
 
453 aa  45.8  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.809863  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3783  DEAD-box ATP dependent DNA helicase  30.77 
 
 
535 aa  46.2  0.002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0820  ATP-dependent RNA helicase RhlE  28.07 
 
 
454 aa  46.2  0.002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2846  ATP-dependent RNA helicase RhlE  28.07 
 
 
454 aa  46.2  0.002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.0376153 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0855  ATP-dependent RNA helicase RhlE  27.49 
 
 
453 aa  46.2  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1816  DEAD/DEAH box helicase-like  29.06 
 
 
531 aa  46.2  0.002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3057  DEAD/DEAH box helicase domain protein  29.86 
 
 
577 aa  45.8  0.002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.186187 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4013  ATP-dependent RNA helicase RhlB  24.56 
 
 
430 aa  46.2  0.002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00781  hypothetical protein  28.07 
 
 
454 aa  46.2  0.002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.74748  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2135  DEAD/DEAH box helicase-like  34.04 
 
 
435 aa  45.8  0.002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011681  PHATRDRAFT_47365  predicted protein  29.09 
 
 
603 aa  45.8  0.002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.776919  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0202  DEAD/DEAH box helicase domain protein  33.96 
 
 
590 aa  46.2  0.002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.940477  normal  0.073291 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0962  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  30.48 
 
 
443 aa  46.6  0.002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0923709  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0915  ATP-dependent RNA helicase RhlE  27.49 
 
 
453 aa  45.8  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3825  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  28.9 
 
 
443 aa  46.2  0.002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2555  ATP-dependent RNA helicase RhlE  28.07 
 
 
454 aa  46.2  0.002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0945  ATP-dependent RNA helicase RhlE  28.07 
 
 
455 aa  46.2  0.002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1892  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  26.16 
 
 
398 aa  45.8  0.002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00338  ATP-dependent RNA helicase RhlB  31.58 
 
 
437 aa  46.2  0.002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0851  ATP-dependent RNA helicase RhlE  28.07 
 
 
454 aa  46.2  0.002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0862  ATP-dependent RNA helicase RhlE  28.07 
 
 
454 aa  46.2  0.002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1594  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  29.01 
 
 
465 aa  46.2  0.002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.509668  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0968  ATP-dependent RNA helicase RhlE  27.49 
 
 
453 aa  46.2  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0947  ATP-dependent RNA helicase RhlE  27.49 
 
 
453 aa  45.8  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.283527  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>