More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PICST_28472 on replicon NC_009068
Organism: Scheffersomyces stipitis CBS 6054



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009068  PICST_28472  ATP-dependent RNA helicase  100 
 
 
836 aa  1700    Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.196096 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01750  ATP-dependent RNA helicase mak5 (EC 3.6.1.-) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:Q5BCI0]  42.93 
 
 
770 aa  395  1e-108  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.267965  normal 
 
 
-
 
NC_006693  CNH00280  ATP dependent RNA helicase, putative  34.49 
 
 
772 aa  333  5e-90  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009367  OSTLU_41563  predicted protein  35.19 
 
 
394 aa  244  3e-63  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.00221239  hitchhiker  0.000541076 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_10125  ATP-dependent RNA helicase (Drs1), putative (AFU_orthologue; AFUA_1G14990)  32.38 
 
 
814 aa  226  2e-57  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  hitchhiker  0.00305342  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0927  DEAD/DEAH box helicase-like  36.82 
 
 
445 aa  212  2e-53  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.220122 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0773  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  35.21 
 
 
502 aa  211  4e-53  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal  0.463701 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3362  ATP-dependent RNA helicase  34.52 
 
 
484 aa  209  2e-52  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3164  DEAD/DEAH box helicase domain protein  35.4 
 
 
580 aa  209  3e-52  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.536296  normal  0.424534 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2746  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  34.03 
 
 
678 aa  208  4e-52  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.633229  normal  0.123801 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0225  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  33.82 
 
 
538 aa  207  6e-52  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2896  DEAD/DEAH box helicase domain protein  34.9 
 
 
567 aa  207  7e-52  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.581814 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2339  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  33.5 
 
 
520 aa  205  2e-51  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0312074 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1022  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  33.58 
 
 
435 aa  206  2e-51  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.0284952 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1704  DEAD/DEAH box helicase-like  33.5 
 
 
520 aa  205  2e-51  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2892  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  34.56 
 
 
433 aa  206  2e-51  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2316  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  33.5 
 
 
520 aa  205  2e-51  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0234  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  33.82 
 
 
511 aa  205  3e-51  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5063  DEAD/DEAH box helicase  33.82 
 
 
529 aa  204  4e-51  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3241  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  34.56 
 
 
433 aa  204  4e-51  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3088  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  34.56 
 
 
433 aa  204  4e-51  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1279  DEAD/DEAH box helicase domain protein  34.56 
 
 
433 aa  204  4e-51  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal  0.0871578 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3098  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  34.56 
 
 
433 aa  204  4e-51  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.872049  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2988  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  34.56 
 
 
433 aa  204  4e-51  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4484  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  33.58 
 
 
498 aa  204  5e-51  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0262  DEAD/DEAH box helicase  33.82 
 
 
533 aa  203  8e-51  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0267  DEAD-box ATP dependent DNA helicase  33.82 
 
 
525 aa  203  9e-51  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0233  DEAD-box ATP dependent DNA helicase  33.82 
 
 
528 aa  203  9e-51  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.714358  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0219  DEAD/DEAH box helicase  33.82 
 
 
528 aa  203  9e-51  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0281  ATP-dependent RNA helicase, DEAD/DEAH box family  33.82 
 
 
525 aa  203  9e-51  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0247  DEAD-box ATP dependent DNA helicase  33.82 
 
 
528 aa  203  9e-51  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0259  ATP-dependent RNA helicase, DEAD/DEAH box family  33.82 
 
 
528 aa  203  9e-51  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1383  DEAD-box ATP dependent DNA helicase  34.31 
 
 
433 aa  203  9.999999999999999e-51  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0221  DEAD/DEAH box helicase  33.82 
 
 
528 aa  203  9.999999999999999e-51  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.983114  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2809  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  34.07 
 
 
433 aa  203  9.999999999999999e-51  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0919  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  33.82 
 
 
432 aa  202  1.9999999999999998e-50  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.00000178347  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5658  DEAD/DEAH box helicase-like  33 
 
 
527 aa  201  3e-50  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0950  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  33.33 
 
 
432 aa  202  3e-50  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1250  DEAD/DEAH box helicase domain protein  33 
 
 
489 aa  200  7.999999999999999e-50  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1095  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  32.84 
 
 
432 aa  200  7.999999999999999e-50  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.627345 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1195  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  34.07 
 
 
433 aa  200  9e-50  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009367  OSTLU_41606  predicted protein  33.57 
 
 
755 aa  200  9e-50  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.323573 
 
 
-
 
NC_009375  OSTLU_19237  predicted protein  33.57 
 
 
710 aa  200  1.0000000000000001e-49  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.554541  normal  0.150728 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1365  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  34.9 
 
 
529 aa  199  2.0000000000000003e-49  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011681  PHATRDRAFT_14032  predicted protein  34.73 
 
 
467 aa  199  2.0000000000000003e-49  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1333  DEAD/DEAH box helicase domain protein  31.89 
 
 
493 aa  198  3e-49  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.218178  normal  0.0904092 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2503  DEAD/DEAH box helicase domain protein  32.76 
 
 
506 aa  198  4.0000000000000005e-49  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.817106 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0206  DEAD/DEAH box helicase domain protein  31.94 
 
 
466 aa  197  5.000000000000001e-49  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.00471201  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1760  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  33.17 
 
 
527 aa  197  5.000000000000001e-49  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1646  DEAD/DEAH box helicase domain protein  34.79 
 
 
545 aa  197  5.000000000000001e-49  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_04233  ATP-dependent rRNA helicase rrp3 (EC 3.6.1.-) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:Q5B5E7]  33.25 
 
 
465 aa  197  6e-49  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.078552  normal  0.363381 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_22900  DNA/RNA helicase, superfamily II  31.34 
 
 
657 aa  197  8.000000000000001e-49  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3118  DEAD/DEAH box helicase domain protein  34.22 
 
 
530 aa  197  8.000000000000001e-49  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2292  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  32.23 
 
 
482 aa  197  9e-49  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.229861  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2794  DEAD/DEAH box helicase domain protein  32.39 
 
 
510 aa  197  9e-49  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.15323  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1193  DEAD/DEAH box helicase  33.17 
 
 
481 aa  196  1e-48  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.444937  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1688  DEAD-box ATP dependent DNA helicase  32.19 
 
 
509 aa  196  1e-48  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.279594  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2571  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  32.76 
 
 
510 aa  197  1e-48  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.948447  normal 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0323  DEAD/DEAH box helicase  33.17 
 
 
482 aa  196  2e-48  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0723689  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1917  ATP-dependent RNA helicase RhlE  33.17 
 
 
482 aa  196  2e-48  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0135106  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1352  putative ATP-dependent RNA helicase 2  33.17 
 
 
559 aa  195  2e-48  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.051549  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0961  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  32.76 
 
 
509 aa  196  2e-48  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0175474  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3295  putative ATP-dependent RNA helicase 2  32.68 
 
 
491 aa  195  2e-48  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1040  DEAD/DEAH box helicase  33.17 
 
 
482 aa  196  2e-48  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.33431  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0456  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  35.29 
 
 
546 aa  196  2e-48  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.441946  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1201  DEAD/DEAH box helicase  33.17 
 
 
482 aa  196  2e-48  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0820684  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0828  ATP-dependent RNA helicase RhlE  33.17 
 
 
482 aa  196  2e-48  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.00138839  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1629  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  34.81 
 
 
538 aa  195  2e-48  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.343673  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1185  DEAD/DEAH box helicase domain protein  32.1 
 
 
414 aa  195  3e-48  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.505533 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3068  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  32.84 
 
 
433 aa  195  3e-48  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.546349  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1182  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  35.56 
 
 
541 aa  195  4e-48  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  hitchhiker  0.00431867  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1452  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  34.82 
 
 
546 aa  194  5e-48  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.661924  normal  0.15207 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000619  ATP-dependent RNA helicase RhlE  32.93 
 
 
522 aa  194  5e-48  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1087  DEAD/DEAH box helicase domain protein  33.33 
 
 
467 aa  194  5e-48  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0981  ATP-dependent RNA helicase RhlE  32.92 
 
 
571 aa  194  6e-48  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0265  superfamily II DNA/RNA helicase  33.33 
 
 
485 aa  194  6e-48  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0981  DEAD/DEAH box helicase domain protein  33.5 
 
 
405 aa  194  7e-48  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00015169  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1240  DEAD/DEAH box helicase domain protein  32.85 
 
 
506 aa  194  8e-48  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.502604  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0371  hypothetical protein  33.25 
 
 
656 aa  193  1e-47  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0359  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  33.25 
 
 
453 aa  193  1e-47  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.992502  normal  0.993295 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0819  DEAD/DEAH box helicase  33.25 
 
 
461 aa  193  1e-47  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.295778  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0141  ATP-dependent RNA helicase DbpA  34.55 
 
 
457 aa  193  1e-47  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0250  DEAD/DEAH box helicase domain protein  32.27 
 
 
643 aa  193  1e-47  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.173354  decreased coverage  0.00154512 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2355  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  32.76 
 
 
497 aa  193  1e-47  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.651471  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4664  ATP-dependent RNA helicase rhlE, putative  33.67 
 
 
442 aa  192  2e-47  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1916  hypothetical protein  31.92 
 
 
575 aa  192  2e-47  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2156  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  31.37 
 
 
506 aa  192  2e-47  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.00000532471  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1538  DEAD/DEAH box helicase domain protein  34.77 
 
 
436 aa  192  2e-47  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2235  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  32.76 
 
 
511 aa  192  2e-47  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2118  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  31.37 
 
 
506 aa  192  2e-47  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  unclonable  0.000000739492  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2820  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  35.21 
 
 
556 aa  191  4e-47  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00179058  normal  0.0521879 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1641  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  34.01 
 
 
439 aa  191  4e-47  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00551625  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6484  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  32.13 
 
 
499 aa  191  5e-47  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.685816  normal  0.838885 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2476  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  33.09 
 
 
461 aa  191  5e-47  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.753535  normal  0.196706 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3809  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  32.02 
 
 
506 aa  191  5e-47  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.300559  normal  0.339526 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0237  DEAD/DEAH box helicase-like  32.85 
 
 
498 aa  191  5.999999999999999e-47  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1472  DEAD/DEAH box helicase domain protein  31.19 
 
 
541 aa  191  7e-47  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  unclonable  0.000000440496  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1793  DEAD/DEAH box helicase  32.17 
 
 
491 aa  190  8e-47  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.353288 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0722  DEAD/DEAH box helicase domain protein  34.56 
 
 
538 aa  190  8e-47  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.240435  decreased coverage  0.00164487 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05560  ATP-dependent RNA helicase  30.49 
 
 
639 aa  190  9e-47  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.978664  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>