82 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bmur_1067 on replicon NC_014150
Organism: Brachyspira murdochii DSM 12563



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014150  Bmur_1067  TPR repeat-containing protein  100 
 
 
264 aa  521  1e-147  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0982  TPR domain-containing protein  29.49 
 
 
750 aa  59.3  0.00000007  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.682285 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2707  glycosyl transferase family protein  30.43 
 
 
1486 aa  53.5  0.000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.228337 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11910  TPR repeat-containing protein  30.82 
 
 
394 aa  53.1  0.000005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000944223  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3556  TPR repeat-containing protein  33.33 
 
 
291 aa  50.1  0.00003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.276509  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0362  TPR repeat-containing protein  25.16 
 
 
804 aa  50.1  0.00003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.587657  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4362  tetratricopeptide TPR_2  25.34 
 
 
725 aa  50.1  0.00003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.714509 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1475  TPR repeat-containing protein  36.62 
 
 
467 aa  50.4  0.00003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.260545  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2604  TPR repeat-containing protein  27.4 
 
 
927 aa  50.1  0.00003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.010408  normal  0.426767 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1653  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  27.21 
 
 
758 aa  50.1  0.00004  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2954  TPR repeat-containing protein  22.11 
 
 
468 aa  48.9  0.00008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.126198  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0226  TPR repeat-containing protein  32.89 
 
 
322 aa  48.1  0.0001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2862  TPR repeat-containing protein  31.48 
 
 
448 aa  48.5  0.0001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.375816 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1449  tetratricopeptide TPR_2  24.14 
 
 
1067 aa  48.5  0.0001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1317  TPR repeat-containing protein  29.2 
 
 
135 aa  48.5  0.0001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.0000000000469709  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0481  TPR repeat-containing protein  33.82 
 
 
3145 aa  48.5  0.0001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.948354 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1516  tetratricopeptide repeat family protein  25.83 
 
 
561 aa  47.8  0.0002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1499  TPR repeat-containing protein  24.87 
 
 
486 aa  47.4  0.0002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.329638 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0115  glycosyl transferase family protein  33.85 
 
 
892 aa  47.4  0.0002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.411081  normal  0.6079 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0661  TPR repeat-containing methyltransferase  25.83 
 
 
561 aa  47  0.0003  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.25847  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1704  TPR repeat-containing protein  35.59 
 
 
265 aa  47  0.0003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.12979e-21 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2904  TPR repeat-containing protein  28.57 
 
 
265 aa  47.4  0.0003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000121078  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0311  TPR repeat-containing protein  27.87 
 
 
513 aa  47.4  0.0003  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0753033  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2947  tetratricopeptide TPR_2  32.93 
 
 
321 aa  46.6  0.0004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.708581 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1549  TPR repeat-containing protein  29.1 
 
 
265 aa  46.2  0.0005  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000551888  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2957  TPR repeat-containing protein  30.56 
 
 
297 aa  45.8  0.0007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.338311  normal  0.060469 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3244  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  35.38 
 
 
699 aa  45.8  0.0007  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3161  TPR repeat-containing protein  30.56 
 
 
297 aa  45.8  0.0007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0781  TPR domain-containing protein  30.58 
 
 
924 aa  45.8  0.0008  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.55707  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0163  TPR repeat-containing protein  25.54 
 
 
356 aa  45.4  0.0008  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00233758  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1746  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  27.59 
 
 
767 aa  45.4  0.0009  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1102  tetratricopeptide TPR_2  27.78 
 
 
1507 aa  45.1  0.001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2530  TPR repeat-containing protein  27.42 
 
 
608 aa  45.1  0.001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.187337  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3213  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  32.84 
 
 
639 aa  45.4  0.001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.000022774  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0158  tetratricopeptide repeat protein  25.4 
 
 
400 aa  44.7  0.001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.185124  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2537  TPR repeat-containing serine/threonin protein kinase  27.34 
 
 
850 aa  45.1  0.001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6434  TPR repeat-containing protein  34.92 
 
 
230 aa  45.1  0.001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.257359  normal  0.680724 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3796  tetratricopeptide TPR_2  25.29 
 
 
1040 aa  44.7  0.001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0083  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  29.29 
 
 
2240 aa  45.4  0.001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0299  TPR repeat-containing protein  28.57 
 
 
458 aa  45.1  0.001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2321  TPR repeat-containing protein  27.74 
 
 
750 aa  45.1  0.001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2515  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  26.85 
 
 
265 aa  44.3  0.002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000326196  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1432  TPR domain-containing protein  28.85 
 
 
573 aa  44.3  0.002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0898  TPR repeat-containing protein  25 
 
 
273 aa  44.3  0.002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4022  TPR repeat-containing protein  27.03 
 
 
628 aa  43.9  0.002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2403  tetratricopeptide TPR_4  26.67 
 
 
267 aa  44.7  0.002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.0000143988  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1975  hypothetical protein  22.95 
 
 
379 aa  43.9  0.002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.000000448675  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0594  tetratricopeptide TPR_4  19.86 
 
 
601 aa  43.9  0.003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0402  TPR repeat-containing protein  30.99 
 
 
596 aa  43.9  0.003  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1712  TPR repeat-containing protein  26.76 
 
 
595 aa  43.5  0.003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.884408 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0089  TPR repeat-containing protein  28.57 
 
 
388 aa  43.5  0.004  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.159552  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0396  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  22.16 
 
 
479 aa  43.5  0.004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.000000170755  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0471  TPR repeat-containing protein  28.48 
 
 
1297 aa  43.5  0.004  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1682  TPR repeat-containing protein  31.25 
 
 
1127 aa  43.5  0.004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.592663 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5110  TPR repeat-containing protein  25 
 
 
288 aa  43.1  0.004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.163263  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0122  glycosyl transferase, group 1  24.19 
 
 
3301 aa  43.5  0.004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.326818 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24101  hypothetical protein  29.57 
 
 
725 aa  43.5  0.004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2853  TPR repeat-containing protein  33.82 
 
 
3172 aa  43.1  0.004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4770  sulfotransferase  38.1 
 
 
887 aa  43.1  0.004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.185793 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0576  hypothetical protein  27.69 
 
 
147 aa  43.1  0.005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1813  TPR repeat-containing protein  26.49 
 
 
952 aa  43.1  0.005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3719  TPR repeat-containing protein  31.67 
 
 
405 aa  42.7  0.005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3697  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  30.3 
 
 
293 aa  42.7  0.006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.984045  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3815  TPR repeat-containing protein  31.67 
 
 
399 aa  42.7  0.006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1312  TPR repeat-containing protein  21.78 
 
 
1069 aa  42.7  0.006  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.530092  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0732  TPR repeat-containing protein  32.14 
 
 
235 aa  42.7  0.006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1589  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  26.25 
 
 
572 aa  42.7  0.007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.499739 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1033  hypothetical protein  23.6 
 
 
414 aa  42.7  0.007  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1657  TPR repeat-containing protein  30.56 
 
 
594 aa  42.4  0.007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0658919  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4478  TPR domain-containing protein  27.03 
 
 
219 aa  42.7  0.007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.404717  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4528  TPR domain protein  27.03 
 
 
219 aa  42.7  0.007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000798973  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0913  TPR repeat-containing protein  27.27 
 
 
280 aa  42.4  0.008  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.249159  normal 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0006  TPR repeat-containing protein  28.47 
 
 
287 aa  42.4  0.008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011681  PHATRDRAFT_47492  predicted protein  27.94 
 
 
640 aa  42  0.009  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  decreased coverage  0.00475484  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1300  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  39.39 
 
 
771 aa  42.4  0.009  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006680  CNK02410  general transcriptional repressor, putative  19.58 
 
 
1101 aa  42  0.009  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1669  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  26.19 
 
 
476 aa  42  0.009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.42993  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0531  TPR repeat-containing protein  28.99 
 
 
287 aa  42  0.01  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.259397  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0276  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  31.51 
 
 
624 aa  42  0.01  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2073  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  23.85 
 
 
214 aa  42  0.01  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0814777  normal  0.412873 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4515  TPR domain protein  23.78 
 
 
219 aa  42  0.01  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.037102  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3107  TPR repeat-containing protein  26.25 
 
 
219 aa  42  0.01  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>