80 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bmur_0898 on replicon NC_014150
Organism: Brachyspira murdochii DSM 12563



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014150  Bmur_0898  TPR repeat-containing protein  100 
 
 
273 aa  543  1e-153  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2321  TPR repeat-containing protein  29.06 
 
 
750 aa  68.2  0.0000000001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0481  TPR repeat-containing protein  25.19 
 
 
3145 aa  60.8  0.00000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.948354 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1872  TPR repeat-containing protein  28.04 
 
 
594 aa  60.1  0.00000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0261679  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2583  TPR repeat-containing protein  25.72 
 
 
729 aa  59.3  0.00000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24171  hypothetical protein  25.65 
 
 
733 aa  58.2  0.0000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3116  TPR repeat-containing serine/threonin protein kinase  23.1 
 
 
878 aa  55.8  0.0000007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2073  TPR domain-containing protein  23.83 
 
 
417 aa  55.1  0.000001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0409184  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1619  TPR domain-containing protein  21.28 
 
 
626 aa  54.7  0.000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0978258  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2599  TPR domain-containing protein  21.76 
 
 
614 aa  53.1  0.000004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0734298  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0970  TPR domain-containing protein  21.76 
 
 
614 aa  53.1  0.000004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0177  TPR repeat-containing protein  21.76 
 
 
614 aa  53.1  0.000004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0453  TPR domain-containing protein  21.76 
 
 
626 aa  53.1  0.000005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.311085  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3015  TPR domain-containing protein  21.76 
 
 
626 aa  53.1  0.000005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2967  TPR repeat-containing protein  21.76 
 
 
614 aa  53.1  0.000005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2906  TPR repeat-containing protein  21.76 
 
 
614 aa  53.1  0.000005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0475913  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1745  TPR repeat-containing protein  22.55 
 
 
402 aa  52  0.00001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0376  tetratricopeptide TPR_4  22.31 
 
 
929 aa  50.8  0.00002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0607  tetratricopeptide TPR_2  23.08 
 
 
957 aa  51.2  0.00002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.21285 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1699  TPR repeat-containing protein  29.95 
 
 
409 aa  50.8  0.00002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.52405  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0901  TPR repeat-containing protein  24.62 
 
 
409 aa  50.4  0.00003  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1273  TPR repeat-containing protein  23.05 
 
 
879 aa  50.1  0.00004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10800  TPR repeat-containing protein  26.09 
 
 
245 aa  50.1  0.00004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1172  TPR repeat-containing protein  23.64 
 
 
4079 aa  49.7  0.00005  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1518  TPR repeat-containing protein  25.89 
 
 
375 aa  49.7  0.00005  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.946116  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1653  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  31.28 
 
 
758 aa  48.1  0.0001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0447  TPR domain-containing protein  32.14 
 
 
992 aa  47.4  0.0002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  unclonable  0.000620141  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0699  TPR repeat-containing protein  29.55 
 
 
563 aa  47.8  0.0002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000000000888687 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0213  TPR repeat-containing protein  26.56 
 
 
409 aa  48.1  0.0002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2656  TPR repeat-containing protein  20.45 
 
 
568 aa  47  0.0003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.000000162187  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1658  TPR repeat-containing protein  23.63 
 
 
250 aa  47  0.0004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0788  TPR repeat-containing protein  25.33 
 
 
1101 aa  47  0.0004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  unclonable  0.000957174  n/a   
 
 
-
 
NC_006680  CNK02410  general transcriptional repressor, putative  19.46 
 
 
1101 aa  46.6  0.0004  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2626  TPR repeat-containing protein  37.1 
 
 
587 aa  46.2  0.0005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3793  TPR repeat-containing protein  26.32 
 
 
428 aa  46.2  0.0005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.085128 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0927  TPR repeat-containing protein  25.58 
 
 
291 aa  46.2  0.0006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3518  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  26.19 
 
 
320 aa  46.2  0.0006  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2093  TPR repeat-containing protein  33.8 
 
 
1714 aa  45.8  0.0007  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1603  TPR repeat-containing protein  26.44 
 
 
804 aa  45.4  0.001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0163  TPR repeat-containing protein  44.23 
 
 
356 aa  45.1  0.001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00233758  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1641  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  28.97 
 
 
292 aa  45.1  0.001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0791  TPR repeat-containing protein  24.18 
 
 
1063 aa  45.4  0.001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0118647  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0904  TPR repeat-containing protein  21.72 
 
 
612 aa  45.4  0.001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.587904  normal  0.769196 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1067  TPR repeat-containing protein  25 
 
 
264 aa  44.3  0.002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0755  TPR repeat-containing protein  21.25 
 
 
421 aa  44.3  0.002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_02941  hypothetical protein  25.19 
 
 
1676 aa  44.3  0.002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.673691 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0369  TPR repeat-containing protein  25.22 
 
 
446 aa  44.7  0.002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_19131  hypothetical protein  25.41 
 
 
936 aa  44.7  0.002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.105709 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4440  TPR repeat-containing protein  27.2 
 
 
393 aa  44.3  0.002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1114  TPR domain-containing protein  23.76 
 
 
299 aa  43.9  0.003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0729535  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1361  TPR repeat-containing protein  22.68 
 
 
1276 aa  43.9  0.003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2555  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  22.83 
 
 
250 aa  43.9  0.003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.58946e-23 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0195  TPR repeat-containing protein  21.8 
 
 
931 aa  43.9  0.003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_02811  hypothetical protein  24.56 
 
 
837 aa  43.9  0.003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.370164 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2555  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  25.63 
 
 
804 aa  43.9  0.003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.152731  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1429  PDZ/DHR/GLGF domain protein  24.89 
 
 
668 aa  43.9  0.003  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  unclonable  0.00000000000479067  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0959  hypothetical protein  28.83 
 
 
620 aa  43.9  0.003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.868556 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3028  TPR repeat-containing protein  28.81 
 
 
620 aa  43.1  0.004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.985806  normal  0.0142271 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4770  sulfotransferase  24.9 
 
 
887 aa  43.1  0.004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.185793 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0991  TPR repeat-containing protein  27.95 
 
 
357 aa  43.1  0.004  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00161827  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2993  TPR repeat-containing protein  20.92 
 
 
789 aa  43.5  0.004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00312978 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0083  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  25 
 
 
2240 aa  43.1  0.004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2470  TPR repeat-containing protein  22.77 
 
 
581 aa  43.5  0.004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3056  TPR repeat-containing protein  23.9 
 
 
543 aa  43.5  0.004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0336  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  23 
 
 
557 aa  43.1  0.005  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000572448  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3470  sulfotransferase  32.14 
 
 
532 aa  43.1  0.005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0341  TPR repeat-containing protein  27.96 
 
 
752 aa  43.1  0.005  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.132358  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2491  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  20.49 
 
 
689 aa  43.1  0.005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0516  TPR repeat-containing protein  31.03 
 
 
673 aa  42.7  0.006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.000000776603  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2866  tetratricopeptide TPR_2  28.8 
 
 
215 aa  42.7  0.007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0768  TPR repeat-containing protein  27.73 
 
 
258 aa  42.4  0.007  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.638517  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0026  TPR repeat-containing protein  40.58 
 
 
116 aa  42.7  0.007  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.042859  n/a   
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_863  predicted protein  25.45 
 
 
708 aa  42.7  0.007  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.622244  normal  0.0203568 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1934  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  29.52 
 
 
413 aa  42.4  0.009  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1518  TPR repeat-containing protein  29.91 
 
 
597 aa  42.4  0.009  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00971618 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2811  tetratricopeptide TPR_2  22.27 
 
 
782 aa  42.4  0.009  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0319314  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2604  TPR repeat-containing protein  23.25 
 
 
927 aa  42.4  0.009  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.010408  normal  0.426767 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1504  TPR repeat-containing protein  23.77 
 
 
1313 aa  42.4  0.009  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_54602  predicted protein  27.68 
 
 
740 aa  42.4  0.009  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2947  tetratricopeptide TPR_2  23.26 
 
 
321 aa  42  0.01  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.708581 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>