More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BbuZS7_0613 on replicon NC_011728
Organism: Borrelia burgdorferi ZS7



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011728  BbuZS7_0613  cysteinyl-tRNA synthetase  100 
 
 
480 aa  983    Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.618315  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0092  cysteinyl-tRNA synthetase  45.73 
 
 
492 aa  427  1e-118  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0131697  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1693  cysteinyl-tRNA synthetase  42.15 
 
 
465 aa  390  1e-107  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.508304  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1163  cysteinyl-tRNA synthetase  39.33 
 
 
460 aa  372  1e-102  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3324  cysteinyl-tRNA synthetase  39.59 
 
 
461 aa  368  1e-100  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000668205  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0590  cysteinyl-tRNA synthetase  37.92 
 
 
470 aa  338  1.9999999999999998e-91  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.919384  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5013  cysteinyl-tRNA synthetase  36.25 
 
 
462 aa  327  3e-88  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.90332  normal  0.0598909 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02459  cysteinyl-tRNA synthetase  38.1 
 
 
457 aa  323  4e-87  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6692  cysteinyl-tRNA synthetase  36.27 
 
 
465 aa  322  7e-87  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.955073  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2381  cysteinyl-tRNA synthetase  36.16 
 
 
493 aa  318  2e-85  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0229  cysteinyl-tRNA synthetase  36.44 
 
 
510 aa  314  1.9999999999999998e-84  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.063419  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2592  cysteinyl-tRNA synthetase  34.51 
 
 
785 aa  311  2e-83  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0164  cysteinyl-tRNA synthetase  37.65 
 
 
475 aa  306  7e-82  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.0618453  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2033  cysteinyl-tRNA synthetase  34.75 
 
 
481 aa  302  8.000000000000001e-81  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.570064  normal  0.0642748 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0349  cysteinyl-tRNA synthetase  35.29 
 
 
527 aa  301  2e-80  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.348008  normal  0.382318 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1644  cysteinyl-tRNA synthetase  37.37 
 
 
472 aa  299  6e-80  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0846  cysteinyl-tRNA synthetase  38.97 
 
 
466 aa  299  9e-80  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000447814  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1012  cysteinyl-tRNA synthetase  36.57 
 
 
468 aa  296  7e-79  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1818  cysteinyl-tRNA synthetase  34.69 
 
 
480 aa  287  2.9999999999999996e-76  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2065  cysteinyl-tRNA synthetase  35.88 
 
 
468 aa  283  6.000000000000001e-75  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00052706  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0171  cysteinyl-tRNA synthetase  35.26 
 
 
469 aa  279  8e-74  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000554263  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0211  cysteinyl-tRNA synthetase  33.74 
 
 
483 aa  275  1.0000000000000001e-72  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2264  cysteinyl-tRNA synthetase  33.4 
 
 
484 aa  274  2.0000000000000002e-72  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.0988589 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0086  cysteinyl-tRNA synthetase  35.05 
 
 
466 aa  273  5.000000000000001e-72  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0320  cysteinyl-tRNA synthetase  34.08 
 
 
484 aa  273  6e-72  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2392  cysteinyl-tRNA synthetase  32.68 
 
 
484 aa  271  1e-71  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2253  cysteinyl-tRNA synthetase  33.82 
 
 
465 aa  271  2e-71  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000000105277  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2511  cysteinyl-tRNA synthetase  35.04 
 
 
459 aa  270  5e-71  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.000000706228  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2198  cysteinyl-tRNA synthetase  32.65 
 
 
484 aa  268  1e-70  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0303  cysteinyl-tRNA synthetase  34.69 
 
 
470 aa  267  4e-70  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.209155  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5552  cysteinyl-tRNA synthetase  33.27 
 
 
499 aa  267  4e-70  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2424  cysteinyl-tRNA synthetase  33.88 
 
 
466 aa  266  5e-70  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0090  cysteinyl-tRNA synthetase  35.67 
 
 
466 aa  266  8e-70  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000484516  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3992  cysteinyl-tRNA synthetase  32.3 
 
 
495 aa  265  2e-69  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.980065 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1698  cysteinyl-tRNA synthetase  35.02 
 
 
481 aa  263  4e-69  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.261335  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0031  cysteinyl-tRNA synthetase  32.8 
 
 
493 aa  263  4e-69  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.173028  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3324  cysteinyl-tRNA synthetase  33.61 
 
 
470 aa  263  4.999999999999999e-69  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0251973  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2737  cysteinyl-tRNA synthetase  33.74 
 
 
466 aa  263  6e-69  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3418  cysteinyl-tRNA synthetase  33.2 
 
 
497 aa  261  2e-68  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3906  cysteinyl-tRNA synthetase  34.73 
 
 
500 aa  261  3e-68  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0469019  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2043  cysteinyl-tRNA synthetase  34.44 
 
 
448 aa  261  3e-68  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8442  Cysteine--tRNA ligase  32.22 
 
 
459 aa  260  3e-68  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1221  cysteinyl-tRNA synthetase  34.01 
 
 
459 aa  260  4e-68  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000543718  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3718  cysteinyl-tRNA synthetase  32.81 
 
 
486 aa  259  5.0000000000000005e-68  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0768  cysteinyl-tRNA synthetase  34.17 
 
 
459 aa  260  5.0000000000000005e-68  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.202696  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0923  cysteinyl-tRNA synthetase  34.02 
 
 
456 aa  259  7e-68  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1634  cysteinyl-tRNA synthetase  32.42 
 
 
493 aa  259  7e-68  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.0430499 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1345  cysteinyl-tRNA synthetase  34.01 
 
 
461 aa  258  1e-67  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.164999  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003837  cysteinyl-tRNA synthetase  35.31 
 
 
460 aa  258  2e-67  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00000455216  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2498  cysteinyl-tRNA synthetase  33.74 
 
 
459 aa  258  2e-67  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000158827  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1376  cysteinyl-tRNA synthetase  33.86 
 
 
479 aa  257  3e-67  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  decreased coverage  0.0031117  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1263  cysteinyl-tRNA synthetase  34.92 
 
 
505 aa  257  4e-67  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.227331  normal  0.0688568 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2933  cysteinyl-tRNA synthetase  34.01 
 
 
461 aa  256  5e-67  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.395948  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1903  cysteinyl-tRNA synthetase  35.71 
 
 
459 aa  256  6e-67  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0485  cysteinyl-tRNA synthetase  34.34 
 
 
486 aa  255  1.0000000000000001e-66  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG1878  cysteinyl-tRNA synthetase  33.07 
 
 
490 aa  254  2.0000000000000002e-66  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2485  cysteinyl-tRNA synthetase  33.6 
 
 
457 aa  254  2.0000000000000002e-66  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.326225  normal  0.762234 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0089  cysteinyl-tRNA synthetase  33.86 
 
 
465 aa  254  2.0000000000000002e-66  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0086  cysteinyl-tRNA synthetase  33.86 
 
 
465 aa  254  2.0000000000000002e-66  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00483591  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0085  cysteinyl-tRNA synthetase  33.86 
 
 
465 aa  254  2.0000000000000002e-66  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0089  cysteinyl-tRNA synthetase  33.86 
 
 
465 aa  254  2.0000000000000002e-66  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000157643  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1805  cysteinyl-tRNA synthetase  32.45 
 
 
481 aa  254  2.0000000000000002e-66  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00000188358  normal  0.435527 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0100  cysteinyl-tRNA synthetase  33.86 
 
 
465 aa  254  2.0000000000000002e-66  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  5.67266e-60 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0415  cysteinyl-tRNA synthetase  31.39 
 
 
490 aa  254  3e-66  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.148475  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1538  cysteinyl-tRNA synthetase  34.55 
 
 
459 aa  253  4.0000000000000004e-66  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.205032  hitchhiker  0.0027552 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0084  cysteinyl-tRNA synthetase  33.47 
 
 
465 aa  253  5.000000000000001e-66  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4002  cysteinyl-tRNA synthetase  31.53 
 
 
489 aa  253  6e-66  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.993734 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00960  cysteinyl-tRNA synthetase  32.73 
 
 
484 aa  253  7e-66  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000000845689  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0089  cysteinyl-tRNA synthetase  33.67 
 
 
465 aa  252  8.000000000000001e-66  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0154063  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0057  cysteinyl-tRNA synthetase  33.13 
 
 
485 aa  252  9.000000000000001e-66  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2684  cysteinyl-tRNA synthetase  33.2 
 
 
459 aa  252  1e-65  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00000025745  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3365  cysteinyl-tRNA synthetase  32.13 
 
 
481 aa  251  2e-65  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3116  cysteinyl-tRNA synthetase  33.95 
 
 
459 aa  251  2e-65  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000569576  decreased coverage  0.000000405781 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0120  cysteinyl-tRNA synthetase  33.06 
 
 
465 aa  250  4e-65  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000252042  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2722  cysteinyl-tRNA synthetase  32.8 
 
 
486 aa  250  4e-65  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.688362 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01842  cysteinyl-tRNA synthetase  34.29 
 
 
460 aa  250  5e-65  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0398  cysteinyl-tRNA synthetase  33.74 
 
 
477 aa  250  5e-65  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000244083  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00355  cysteinyl-tRNA synthetase  33.87 
 
 
474 aa  249  6e-65  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.229746  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0807  cysteinyl-tRNA synthetase  33.6 
 
 
504 aa  249  6e-65  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3800  cysteinyl-tRNA synthetase  33.73 
 
 
480 aa  249  7e-65  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0207  cysteinyl-tRNA synthetase  33.26 
 
 
447 aa  249  9e-65  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3653  cysteinyl-tRNA synthetase  35.46 
 
 
465 aa  248  1e-64  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0084  cysteinyl-tRNA synthetase  33.06 
 
 
465 aa  249  1e-64  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000240351  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0313  cysteinyl-tRNA synthetase  32.58 
 
 
476 aa  247  3e-64  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.625731 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0471  cysteinyl-tRNA synthetase  33.13 
 
 
484 aa  247  3e-64  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.361627  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4174  cysteinyl-tRNA synthetase  33.86 
 
 
494 aa  247  3e-64  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.801152  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0710  cysteinyl-tRNA synthetase  31.21 
 
 
486 aa  246  4e-64  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1810  cysteinyl-tRNA synthetase  31.85 
 
 
485 aa  246  4.9999999999999997e-64  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0706644  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1662  cysteinyl-tRNA synthetase  31.81 
 
 
478 aa  246  6.999999999999999e-64  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.69895  normal  0.620733 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0534  cysteinyl-tRNA synthetase  32.92 
 
 
476 aa  246  8e-64  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0472255  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0100  cysteinyl-tRNA synthetase  31.87 
 
 
481 aa  246  8e-64  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0458  cysteinyl-tRNA synthetase  33.13 
 
 
484 aa  246  9e-64  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0193  cysteinyl-tRNA synthetase  31.74 
 
 
486 aa  245  9.999999999999999e-64  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.152577  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0500  cysteinyl-tRNA synthetase  34.57 
 
 
455 aa  245  9.999999999999999e-64  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.996276  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2051  cysteinyl-tRNA synthetase  32.58 
 
 
461 aa  246  9.999999999999999e-64  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0707347  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1666  cysteinyl-tRNA synthetase  32.72 
 
 
458 aa  244  3e-63  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.226197  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0308  cysteinyl-tRNA synthetase  32.78 
 
 
459 aa  244  3e-63  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0117  cysteinyl-tRNA synthetase  33.81 
 
 
447 aa  244  3e-63  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0530  cysteinyl-tRNA synthetase  32.32 
 
 
460 aa  243  5e-63  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.474927  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1653  cysteinyl-tRNA synthetase  32.44 
 
 
471 aa  243  6e-63  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>