More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acid345_3992 on replicon NC_008009
Organism: Candidatus Koribacter versatilis Ellin345



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008009  Acid345_3992  cysteinyl-tRNA synthetase  100 
 
 		 495 aa  1021    Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.980065 
 
 
-
 
NC_002620  TC0164  cysteinyl-tRNA synthetase  42.21 
 
 		 475 aa  400  9.999999999999999e-111  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.0618453  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3365  cysteinyl-tRNA synthetase  42.83 
 
 		 481 aa  395  1e-108  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1644  cysteinyl-tRNA synthetase  41.85 
 
 		 472 aa  394  1e-108  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1012  cysteinyl-tRNA synthetase  42.71 
 
 		 468 aa  392  1e-108  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2065  cysteinyl-tRNA synthetase  43.51 
 
 		 468 aa  394  1e-108  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00052706  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3324  cysteinyl-tRNA synthetase  43.25 
 
 		 470 aa  385  1e-105  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0251973  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2737  cysteinyl-tRNA synthetase  43.29 
 
 		 466 aa  383  1e-105  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2424  cysteinyl-tRNA synthetase  43.4 
 
 		 466 aa  384  1e-105  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1810  cysteinyl-tRNA synthetase  41.78 
 
 		 485 aa  385  1e-105  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0706644  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0846  cysteinyl-tRNA synthetase  41.97 
 
 		 466 aa  380  1e-104  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000447814  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0171  cysteinyl-tRNA synthetase  42.2 
 
 		 469 aa  379  1e-104  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000554263  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2253  cysteinyl-tRNA synthetase  41.13 
 
 		 465 aa  380  1e-104  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000000105277  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0404  cysteinyl-tRNA synthetase  40.75 
 
 		 487 aa  372  1e-102  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.751484  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1735  cysteinyl-tRNA synthetase  40.69 
 
 		 460 aa  372  1e-102  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.27756  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0057  cysteinyl-tRNA synthetase  42.12 
 
 		 485 aa  374  1e-102  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0338  cysteinyl-tRNA synthetase  42.13 
 
 		 472 aa  372  1e-102  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000985703  hitchhiker  0.00000017831 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2511  cysteinyl-tRNA synthetase  38.8 
 
 		 459 aa  369  1e-101  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.000000706228  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0107  cysteinyl-tRNA synthetase  40.85 
 
 		 459 aa  369  1e-101  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2571  cysteinyl-tRNA synthetase  39.76 
 
 		 461 aa  370  1e-101  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.00897166  hitchhiker  0.0000307026 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1003  cysteinyl-tRNA synthetase  40.24 
 
 		 488 aa  371  1e-101  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2407  cysteinyl-tRNA synthetase  41.55 
 
 		 460 aa  370  1e-101  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0439107  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3800  cysteinyl-tRNA synthetase  41.83 
 
 		 480 aa  366  1e-100  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3742  cysteinyl-tRNA synthetase  40.12 
 
 		 460 aa  367  1e-100  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.156882  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1361  cysteinyl-tRNA synthetase  40.24 
 
 		 488 aa  367  1e-100  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0086  cysteinyl-tRNA synthetase  39.76 
 
 		 466 aa  367  1e-100  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0936  cysteinyl-tRNA synthetase  40.12 
 
 		 460 aa  368  1e-100  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2786  cysteinyl-tRNA synthetase  40.85 
 
 		 460 aa  367  1e-100  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.401544  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_23530  cysteinyl-tRNA synthetase  41.38 
 
 		 461 aa  366  1e-100  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2878  cysteinyl-tRNA synthetase  41.06 
 
 		 460 aa  366  1e-100  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.846571  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2905  cysteinyl-tRNA synthetase  41.06 
 
 		 460 aa  365  1e-99  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.242748  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1667  cysteinyl-tRNA synthetase  39.52 
 
 		 479 aa  365  1e-99  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.67425  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1645  cysteinyl-tRNA synthetase  41.47 
 
 		 472 aa  364  2e-99  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0256229  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2933  cysteinyl-tRNA synthetase  40.37 
 
 		 461 aa  364  2e-99  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.395948  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0923  cysteinyl-tRNA synthetase  39.72 
 
 		 456 aa  363  3e-99  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2051  cysteinyl-tRNA synthetase  39.8 
 
 		 461 aa  363  3e-99  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0707347  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0398  cysteinyl-tRNA synthetase  42.57 
 
 		 477 aa  363  4e-99  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000244083  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0509  cysteinyl-tRNA synthetase  40.08 
 
 		 465 aa  363  5.0000000000000005e-99  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0100  cysteinyl-tRNA synthetase  39.88 
 
 		 481 aa  363  5.0000000000000005e-99  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2732  cysteinyl-tRNA synthetase  42.46 
 
 		 474 aa  362  8e-99  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.511576  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0089  cysteinyl-tRNA synthetase  39.28 
 
 		 465 aa  361  1e-98  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0086  cysteinyl-tRNA synthetase  39.28 
 
 		 465 aa  361  1e-98  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00483591  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0085  cysteinyl-tRNA synthetase  39.28 
 
 		 465 aa  361  1e-98  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0089  cysteinyl-tRNA synthetase  39.28 
 
 		 465 aa  361  1e-98  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000157643  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1345  cysteinyl-tRNA synthetase  40.32 
 
 		 461 aa  362  1e-98  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.164999  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0303  cysteinyl-tRNA synthetase  39.88 
 
 		 470 aa  362  1e-98  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.209155  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1166  cysteinyl-tRNA synthetase  39.92 
 
 		 461 aa  362  1e-98  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00193068  normal  0.0129624 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1221  cysteinyl-tRNA synthetase  38.71 
 
 		 459 aa  362  1e-98  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000543718  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0100  cysteinyl-tRNA synthetase  39.28 
 
 		 465 aa  361  1e-98  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  5.67266e-60 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0084  cysteinyl-tRNA synthetase  39.08 
 
 		 465 aa  360  2e-98  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1263  cysteinyl-tRNA synthetase  40.48 
 
 		 505 aa  361  2e-98  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.227331  normal  0.0688568 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3638  cysteinyl-tRNA synthetase  39.84 
 
 		 460 aa  360  3e-98  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.1842 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0084  cysteinyl-tRNA synthetase  38.96 
 
 		 465 aa  360  3e-98  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000240351  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0089  cysteinyl-tRNA synthetase  39.08 
 
 		 465 aa  359  5e-98  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0154063  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2043  cysteinyl-tRNA synthetase  39.6 
 
 		 448 aa  359  6e-98  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0031  cysteinyl-tRNA synthetase  38.93 
 
 		 493 aa  359  6e-98  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.173028  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0193  cysteinyl-tRNA synthetase  41.24 
 
 		 486 aa  359  7e-98  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.152577  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0500  cysteinyl-tRNA synthetase  40 
 
 		 455 aa  359  7e-98  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.996276  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3036  cysteinyl-tRNA synthetase  41.73 
 
 		 478 aa  358  8e-98  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0566  cysteinyl-tRNA synthetase  39.31 
 
 		 466 aa  357  1.9999999999999998e-97  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0120  cysteinyl-tRNA synthetase  38.88 
 
 		 465 aa  358  1.9999999999999998e-97  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000252042  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2138  cysteinyl-tRNA synthetase  41.93 
 
 		 478 aa  358  1.9999999999999998e-97  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0357828 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1538  cysteinyl-tRNA synthetase  38.13 
 
 		 459 aa  358  1.9999999999999998e-97  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.205032  hitchhiker  0.0027552 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0552  cysteinyl-tRNA synthetase  39.31 
 
 		 466 aa  357  1.9999999999999998e-97  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0403  cysteinyl-tRNA synthetase  40.08 
 
 		 474 aa  357  1.9999999999999998e-97  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00611212  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0170  cysteinyl-tRNA synthetase  40 
 
 		 466 aa  357  2.9999999999999997e-97  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.183538  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3883  cysteinyl-tRNA synthetase  40.84 
 
 		 480 aa  357  2.9999999999999997e-97  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2249  cysteine--tRNA ligase  39.03 
 
 		 485 aa  357  2.9999999999999997e-97  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000746597  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003837  cysteinyl-tRNA synthetase  38.74 
 
 		 460 aa  357  2.9999999999999997e-97  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00000455216  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3116  cysteinyl-tRNA synthetase  38.97 
 
 		 459 aa  356  3.9999999999999996e-97  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000569576  decreased coverage  0.000000405781 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3014  cysteinyl-tRNA synthetase  39.52 
 
 		 461 aa  356  5e-97  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000439481  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1278  cysteinyl-tRNA synthetase  39.52 
 
 		 461 aa  356  5e-97  Yersinia pestis Angola  Bacteria  decreased coverage  0.000000565226  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01842  cysteinyl-tRNA synthetase  38.54 
 
 		 460 aa  356  5.999999999999999e-97  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3152  cysteinyl-tRNA synthetase  39.52 
 
 		 461 aa  356  5.999999999999999e-97  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00287269  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1439  cysteinyl-tRNA synthetase  39.27 
 
 		 459 aa  355  1e-96  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000326973  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2121  cysteinyl-tRNA synthetase  41.15 
 
 		 485 aa  355  2e-96  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00371034  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0242  cysteinyl-tRNA synthetase  38.62 
 
 		 459 aa  354  2e-96  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0090  cysteinyl-tRNA synthetase  40.36 
 
 		 466 aa  353  2.9999999999999997e-96  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000484516  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1881  cysteinyl-tRNA synthetase  39.02 
 
 		 464 aa  353  2.9999999999999997e-96  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0415  cysteinyl-tRNA synthetase  38.66 
 
 		 490 aa  353  4e-96  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.148475  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2498  cysteinyl-tRNA synthetase  36.67 
 
 		 459 aa  353  5e-96  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000158827  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2484  cysteinyl-tRNA synthetase  41.04 
 
 		 476 aa  352  7e-96  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000672423  normal  0.0231509 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2893  cysteinyl-tRNA synthetase  39.22 
 
 		 463 aa  352  7e-96  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.751187  normal  0.0110862 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5208  cysteinyl-tRNA synthetase  38.03 
 
 		 494 aa  352  1e-95  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0188  cysteinyl-tRNA synthetase  39.56 
 
 		 478 aa  351  2e-95  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.272447  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2110  cysteinyl-tRNA synthetase  39.55 
 
 		 460 aa  351  2e-95  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000230638 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4174  cysteinyl-tRNA synthetase  39.49 
 
 		 494 aa  350  3e-95  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.801152  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3508  cysteinyl-tRNA synthetase  40.16 
 
 		 460 aa  350  3e-95  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1589  cysteinyl-tRNA synthetase  39.03 
 
 		 487 aa  349  5e-95  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.354492  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0110  cysteinyl-tRNA synthetase  38.15 
 
 		 465 aa  349  7e-95  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.033401  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1487  cysteinyl-tRNA synthetase  38.03 
 
 		 461 aa  349  8e-95  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00000012906  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2566  cysteinyl-tRNA synthetase  37.4 
 
 		 461 aa  349  8e-95  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.0000164638  normal  0.0688617 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2498  cysteinyl-tRNA synthetase  37.4 
 
 		 461 aa  348  9e-95  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  0.000000973737  normal  0.0233858 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2684  cysteinyl-tRNA synthetase  37.6 
 
 		 459 aa  348  1e-94  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00000025745  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1791  cysteinyl-tRNA synthetase  37.3 
 
 		 459 aa  347  2e-94  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1653  cysteinyl-tRNA synthetase  39.68 
 
 		 471 aa  348  2e-94  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4002  cysteinyl-tRNA synthetase  38.07 
 
 		 489 aa  347  2e-94  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.993734 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1271  cysteinyl-tRNA synthetase  38.18 
 
 		 456 aa  347  3e-94  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3324  cysteinyl-tRNA synthetase  39.04 
 
 		 461 aa  347  3e-94  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000668205  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1554  cysteinyl-tRNA synthetase  39.09 
 
 		 485 aa  347  3e-94  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>