More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rcas_2138 on replicon NC_009767
Organism: Roseiflexus castenholzii DSM 13941



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009767  Rcas_2138  cysteinyl-tRNA synthetase  100 
 
 
478 aa  982    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0357828 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3036  cysteinyl-tRNA synthetase  93.05 
 
 
478 aa  919    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1725  cysteinyl-tRNA synthetase  68.22 
 
 
472 aa  661    Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3108  cysteinyl-tRNA synthetase  64.12 
 
 
466 aa  606  9.999999999999999e-173  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00597205  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0061  cysteinyl-tRNA synthetase  54.11 
 
 
458 aa  506  9.999999999999999e-143  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0055  cysteinyl-tRNA synthetase  54.03 
 
 
457 aa  504  1e-141  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_61  cysteinyl-tRNA synthetase  54.14 
 
 
457 aa  504  1e-141  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1829  cysteinyl-tRNA synthetase  54.37 
 
 
453 aa  493  9.999999999999999e-139  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0086  cysteinyl-tRNA synthetase  51.16 
 
 
466 aa  476  1e-133  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1589  cysteinyl-tRNA synthetase  48.1 
 
 
487 aa  471  1.0000000000000001e-131  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.354492  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2253  cysteinyl-tRNA synthetase  50.42 
 
 
465 aa  470  1.0000000000000001e-131  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000000105277  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1012  cysteinyl-tRNA synthetase  49.9 
 
 
468 aa  468  1.0000000000000001e-131  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0090  cysteinyl-tRNA synthetase  49.89 
 
 
466 aa  466  9.999999999999999e-131  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000484516  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0398  cysteinyl-tRNA synthetase  50.1 
 
 
477 aa  460  9.999999999999999e-129  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000244083  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0057  cysteinyl-tRNA synthetase  50.1 
 
 
485 aa  458  1e-127  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2737  cysteinyl-tRNA synthetase  47.06 
 
 
466 aa  455  1e-127  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2424  cysteinyl-tRNA synthetase  47.37 
 
 
466 aa  456  1e-127  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2732  cysteinyl-tRNA synthetase  50.1 
 
 
474 aa  457  1e-127  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.511576  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3365  cysteinyl-tRNA synthetase  49.49 
 
 
481 aa  453  1.0000000000000001e-126  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0403  cysteinyl-tRNA synthetase  50 
 
 
474 aa  454  1.0000000000000001e-126  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00611212  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0404  cysteinyl-tRNA synthetase  48.39 
 
 
487 aa  452  1.0000000000000001e-126  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.751484  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1109  cysteinyl-tRNA synthetase  46.77 
 
 
488 aa  451  1e-125  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.98105  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2484  cysteinyl-tRNA synthetase  50.1 
 
 
476 aa  451  1e-125  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000672423  normal  0.0231509 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0193  cysteinyl-tRNA synthetase  48.17 
 
 
486 aa  449  1e-125  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.152577  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00960  cysteinyl-tRNA synthetase  46.73 
 
 
484 aa  448  1.0000000000000001e-124  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000000845689  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0084  cysteinyl-tRNA synthetase  48.11 
 
 
465 aa  446  1.0000000000000001e-124  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000240351  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0846  cysteinyl-tRNA synthetase  47.48 
 
 
466 aa  445  1.0000000000000001e-124  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000447814  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2065  cysteinyl-tRNA synthetase  47.07 
 
 
468 aa  446  1.0000000000000001e-124  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00052706  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0031  cysteinyl-tRNA synthetase  46.91 
 
 
493 aa  447  1.0000000000000001e-124  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.173028  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0188  cysteinyl-tRNA synthetase  48.47 
 
 
478 aa  443  1e-123  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.272447  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0089  cysteinyl-tRNA synthetase  47.69 
 
 
465 aa  442  1e-123  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0154063  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0089  cysteinyl-tRNA synthetase  47.9 
 
 
465 aa  444  1e-123  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0086  cysteinyl-tRNA synthetase  47.9 
 
 
465 aa  444  1e-123  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00483591  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0085  cysteinyl-tRNA synthetase  47.9 
 
 
465 aa  444  1e-123  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0089  cysteinyl-tRNA synthetase  47.9 
 
 
465 aa  444  1e-123  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000157643  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0120  cysteinyl-tRNA synthetase  47.69 
 
 
465 aa  442  1e-123  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000252042  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0210  cysteinyl-tRNA synthetase  48.09 
 
 
460 aa  442  1e-123  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0208  cysteinyl-tRNA synthetase  48.09 
 
 
460 aa  442  1e-123  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0100  cysteinyl-tRNA synthetase  47.9 
 
 
465 aa  444  1e-123  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  5.67266e-60 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0100  cysteinyl-tRNA synthetase  47.56 
 
 
481 aa  441  9.999999999999999e-123  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1634  cysteinyl-tRNA synthetase  47.02 
 
 
493 aa  440  9.999999999999999e-123  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.0430499 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0084  cysteinyl-tRNA synthetase  47.27 
 
 
465 aa  438  1e-121  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3800  cysteinyl-tRNA synthetase  47.24 
 
 
480 aa  437  1e-121  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0429  cysteinyl-tRNA synthetase  46.91 
 
 
455 aa  436  1e-121  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0110  cysteinyl-tRNA synthetase  47.48 
 
 
465 aa  436  1e-121  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.033401  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4174  cysteinyl-tRNA synthetase  46.81 
 
 
494 aa  436  1e-121  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.801152  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3883  cysteinyl-tRNA synthetase  47.03 
 
 
480 aa  436  1e-121  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5216  cysteinyl-tRNA synthetase  47.27 
 
 
465 aa  433  1e-120  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00001018  unclonable  2.47403e-25 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3324  cysteinyl-tRNA synthetase  45.74 
 
 
470 aa  434  1e-120  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0251973  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0265  cysteinyl-tRNA synthetase  44.84 
 
 
500 aa  431  1e-119  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.0000000351954  normal  0.0179812 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1645  cysteinyl-tRNA synthetase  45.76 
 
 
472 aa  430  1e-119  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0256229  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_13190  cysteinyl-tRNA synthetase  48.11 
 
 
499 aa  428  1e-119  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.633789  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1667  cysteinyl-tRNA synthetase  50.2 
 
 
479 aa  429  1e-119  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.67425  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0171  cysteinyl-tRNA synthetase  45.53 
 
 
469 aa  431  1e-119  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000554263  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0303  cysteinyl-tRNA synthetase  47.06 
 
 
470 aa  429  1e-119  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.209155  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2722  cysteinyl-tRNA synthetase  46.15 
 
 
486 aa  430  1e-119  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.688362 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0482  cysteinyl-tRNA synthetase  48.38 
 
 
485 aa  428  1e-118  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00357659 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2043  cysteinyl-tRNA synthetase  45.44 
 
 
448 aa  426  1e-118  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0064  cysteinyl-tRNA synthetase  45.99 
 
 
469 aa  427  1e-118  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.00940017  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2571  cysteinyl-tRNA synthetase  47.4 
 
 
461 aa  422  1e-117  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.00897166  hitchhiker  0.0000307026 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2511  cysteinyl-tRNA synthetase  46.43 
 
 
459 aa  423  1e-117  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.000000706228  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0902  cysteinyl-tRNA synthetase  47.36 
 
 
474 aa  424  1e-117  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1221  cysteinyl-tRNA synthetase  46.85 
 
 
459 aa  425  1e-117  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000543718  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2753  cysteinyl-tRNA synthetase  46.32 
 
 
459 aa  422  1e-117  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.0000000279239  normal  0.0782158 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1844  cysteinyl-tRNA synthetase  48.53 
 
 
463 aa  424  1e-117  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0170  cysteinyl-tRNA synthetase  47.27 
 
 
466 aa  419  1e-116  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.183538  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0509  cysteinyl-tRNA synthetase  48.43 
 
 
465 aa  419  1e-116  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1166  cysteinyl-tRNA synthetase  47.07 
 
 
461 aa  419  1e-116  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00193068  normal  0.0129624 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1791  cysteinyl-tRNA synthetase  46.23 
 
 
459 aa  420  1e-116  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1601  cysteinyl-tRNA synthetase  46.11 
 
 
459 aa  420  1e-116  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.0000000105927  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0566  cysteinyl-tRNA synthetase  45.88 
 
 
466 aa  419  1e-116  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3718  cysteinyl-tRNA synthetase  47.77 
 
 
486 aa  421  1e-116  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0313  cysteinyl-tRNA synthetase  43.36 
 
 
476 aa  419  1e-116  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.625731 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0552  cysteinyl-tRNA synthetase  45.88 
 
 
466 aa  419  1e-116  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1590  cysteinyl-tRNA synthetase  46.32 
 
 
459 aa  421  1e-116  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.000000000784367  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1624  cysteinyl-tRNA synthetase  46.32 
 
 
459 aa  421  1e-116  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.00000105095  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1952  cysteinyl-tRNA synthetase  46.45 
 
 
485 aa  419  1e-116  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  decreased coverage  0.00515246  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0382  cysteinyl-tRNA synthetase  43.42 
 
 
475 aa  421  1e-116  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.477113  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2051  cysteinyl-tRNA synthetase  48.44 
 
 
461 aa  421  1e-116  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0707347  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0710  cysteinyl-tRNA synthetase  47.67 
 
 
486 aa  419  1e-116  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0107  cysteinyl-tRNA synthetase  49.9 
 
 
459 aa  417  9.999999999999999e-116  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1278  cysteinyl-tRNA synthetase  46.65 
 
 
461 aa  415  9.999999999999999e-116  Yersinia pestis Angola  Bacteria  decreased coverage  0.000000565226  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0679  cysteinyl-tRNA synthetase  45.82 
 
 
470 aa  418  9.999999999999999e-116  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3152  cysteinyl-tRNA synthetase  46.86 
 
 
461 aa  416  9.999999999999999e-116  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00287269  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1538  cysteinyl-tRNA synthetase  45.59 
 
 
459 aa  416  9.999999999999999e-116  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.205032  hitchhiker  0.0027552 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1487  cysteinyl-tRNA synthetase  45.89 
 
 
461 aa  417  9.999999999999999e-116  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00000012906  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3014  cysteinyl-tRNA synthetase  46.65 
 
 
461 aa  415  9.999999999999999e-116  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000439481  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1599  cysteinyl-tRNA synthetase  44.19 
 
 
476 aa  416  9.999999999999999e-116  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  hitchhiker  0.00000906806  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003837  cysteinyl-tRNA synthetase  46.01 
 
 
460 aa  417  9.999999999999999e-116  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00000455216  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2498  cysteinyl-tRNA synthetase  45.68 
 
 
461 aa  417  9.999999999999999e-116  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  0.000000973737  normal  0.0233858 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2566  cysteinyl-tRNA synthetase  45.68 
 
 
461 aa  417  9.999999999999999e-116  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.0000164638  normal  0.0688617 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1810  cysteinyl-tRNA synthetase  49.58 
 
 
485 aa  416  9.999999999999999e-116  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0706644  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2933  cysteinyl-tRNA synthetase  45.93 
 
 
461 aa  416  9.999999999999999e-116  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.395948  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0117  cysteinyl-tRNA synthetase  46.4 
 
 
447 aa  415  9.999999999999999e-116  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2664  cysteinyl-tRNA synthetase  45.68 
 
 
461 aa  417  9.999999999999999e-116  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000406523  normal  0.136129 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0471  cysteinyl-tRNA synthetase  44.83 
 
 
484 aa  412  1e-114  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.361627  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2684  cysteinyl-tRNA synthetase  46.01 
 
 
459 aa  413  1e-114  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00000025745  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0936  cysteinyl-tRNA synthetase  48.74 
 
 
460 aa  414  1e-114  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2498  cysteinyl-tRNA synthetase  45.38 
 
 
459 aa  414  1e-114  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000158827  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0534  cysteinyl-tRNA synthetase  43.15 
 
 
476 aa  415  1e-114  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0472255  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>