More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene LGAS_0338 on replicon NC_008530
Organism: Lactobacillus gasseri ATCC 33323



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008530  LGAS_0338  cysteinyl-tRNA synthetase  100 
 
 		 472 aa  985    Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000985703  hitchhiker  0.00000017831 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0303  cysteinyl-tRNA synthetase  62.16 
 
 		 470 aa  617  1e-175  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.209155  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0086  cysteinyl-tRNA synthetase  56.26 
 
 		 466 aa  550  1e-155  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0090  cysteinyl-tRNA synthetase  56.05 
 
 		 466 aa  533  1e-150  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000484516  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0162  cysteinyl-tRNA synthetase  55.2 
 
 		 468 aa  530  1e-149  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.296388  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0084  cysteinyl-tRNA synthetase  53.59 
 
 		 465 aa  522  1e-147  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2043  cysteinyl-tRNA synthetase  53.3 
 
 		 448 aa  522  1e-147  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0084  cysteinyl-tRNA synthetase  53.49 
 
 		 465 aa  520  1e-146  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000240351  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0089  cysteinyl-tRNA synthetase  53.38 
 
 		 465 aa  518  1e-146  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0154063  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0089  cysteinyl-tRNA synthetase  53.38 
 
 		 465 aa  518  1e-146  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0086  cysteinyl-tRNA synthetase  53.38 
 
 		 465 aa  518  1e-146  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00483591  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0085  cysteinyl-tRNA synthetase  53.38 
 
 		 465 aa  518  1e-146  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0089  cysteinyl-tRNA synthetase  53.38 
 
 		 465 aa  518  1e-146  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000157643  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0120  cysteinyl-tRNA synthetase  53.28 
 
 		 465 aa  520  1e-146  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000252042  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0100  cysteinyl-tRNA synthetase  53.38 
 
 		 465 aa  518  1e-146  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  5.67266e-60 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2253  cysteinyl-tRNA synthetase  53.6 
 
 		 465 aa  514  1e-144  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000000105277  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1559  cysteinyl-tRNA synthetase  53.62 
 
 		 467 aa  509  1e-143  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2737  cysteinyl-tRNA synthetase  52.54 
 
 		 466 aa  505  9.999999999999999e-143  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2424  cysteinyl-tRNA synthetase  52.53 
 
 		 466 aa  506  9.999999999999999e-143  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0110  cysteinyl-tRNA synthetase  53.38 
 
 		 465 aa  506  9.999999999999999e-143  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.033401  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0117  cysteinyl-tRNA synthetase  53.62 
 
 		 447 aa  508  9.999999999999999e-143  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0170  cysteinyl-tRNA synthetase  51.16 
 
 		 466 aa  503  1e-141  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.183538  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0207  cysteinyl-tRNA synthetase  52.55 
 
 		 447 aa  502  1e-141  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5216  cysteinyl-tRNA synthetase  52.53 
 
 		 465 aa  504  1e-141  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00001018  unclonable  2.47403e-25 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2065  cysteinyl-tRNA synthetase  52.23 
 
 		 468 aa  498  1e-140  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00052706  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0846  cysteinyl-tRNA synthetase  51.9 
 
 		 466 aa  496  1e-139  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000447814  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1645  cysteinyl-tRNA synthetase  51.37 
 
 		 472 aa  494  9.999999999999999e-139  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0256229  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3324  cysteinyl-tRNA synthetase  50.21 
 
 		 470 aa  482  1e-135  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0251973  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0552  cysteinyl-tRNA synthetase  49.47 
 
 		 466 aa  483  1e-135  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0566  cysteinyl-tRNA synthetase  49.47 
 
 		 466 aa  483  1e-135  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1012  cysteinyl-tRNA synthetase  50.53 
 
 		 468 aa  481  1e-134  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2484  cysteinyl-tRNA synthetase  48.55 
 
 		 476 aa  473  1e-132  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000672423  normal  0.0231509 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2732  cysteinyl-tRNA synthetase  47.07 
 
 		 474 aa  454  1.0000000000000001e-126  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.511576  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0403  cysteinyl-tRNA synthetase  45.74 
 
 		 474 aa  452  1.0000000000000001e-126  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00611212  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2722  cysteinyl-tRNA synthetase  45.73 
 
 		 486 aa  446  1.0000000000000001e-124  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.688362 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0171  cysteinyl-tRNA synthetase  46.2 
 
 		 469 aa  443  1e-123  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000554263  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0057  cysteinyl-tRNA synthetase  46.42 
 
 		 485 aa  443  1e-123  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0188  cysteinyl-tRNA synthetase  45.49 
 
 		 478 aa  442  1e-123  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.272447  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00960  cysteinyl-tRNA synthetase  47.35 
 
 		 484 aa  444  1e-123  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000000845689  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0193  cysteinyl-tRNA synthetase  45.82 
 
 		 486 aa  442  1e-123  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.152577  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0398  cysteinyl-tRNA synthetase  46.36 
 
 		 477 aa  441  9.999999999999999e-123  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000244083  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0265  cysteinyl-tRNA synthetase  43.79 
 
 		 500 aa  441  9.999999999999999e-123  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.0000000351954  normal  0.0179812 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0509  cysteinyl-tRNA synthetase  46.65 
 
 		 465 aa  436  1e-121  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2233  cysteinyl-tRNA synthetase  45.29 
 
 		 501 aa  436  1e-121  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.056881  normal  0.890291 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0100  cysteinyl-tRNA synthetase  46.54 
 
 		 481 aa  436  1e-121  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5208  cysteinyl-tRNA synthetase  45.16 
 
 		 494 aa  432  1e-120  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4002  cysteinyl-tRNA synthetase  45.89 
 
 		 489 aa  434  1e-120  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.993734 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0031  cysteinyl-tRNA synthetase  44.29 
 
 		 493 aa  433  1e-120  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.173028  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3883  cysteinyl-tRNA synthetase  45.88 
 
 		 480 aa  434  1e-120  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0471  cysteinyl-tRNA synthetase  43.55 
 
 		 484 aa  431  1e-119  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.361627  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3800  cysteinyl-tRNA synthetase  45.47 
 
 		 480 aa  429  1e-119  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0404  cysteinyl-tRNA synthetase  44.78 
 
 		 487 aa  429  1e-119  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.751484  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0710  cysteinyl-tRNA synthetase  46.12 
 
 		 486 aa  430  1e-119  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1634  cysteinyl-tRNA synthetase  44.27 
 
 		 493 aa  431  1e-119  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.0430499 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0458  cysteinyl-tRNA synthetase  42.94 
 
 		 484 aa  431  1e-119  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3365  cysteinyl-tRNA synthetase  44.54 
 
 		 481 aa  428  1e-118  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1589  cysteinyl-tRNA synthetase  44.06 
 
 		 487 aa  427  1e-118  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.354492  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_13190  cysteinyl-tRNA synthetase  44.98 
 
 		 499 aa  428  1e-118  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.633789  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0500  cysteinyl-tRNA synthetase  46.22 
 
 		 455 aa  425  1e-118  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.996276  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1810  cysteinyl-tRNA synthetase  44.58 
 
 		 485 aa  428  1e-118  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0706644  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3718  cysteinyl-tRNA synthetase  43.35 
 
 		 486 aa  422  1e-117  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0415  cysteinyl-tRNA synthetase  44.24 
 
 		 490 aa  424  1e-117  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.148475  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_19450  cysteinyl-tRNA synthetase  44.06 
 
 		 498 aa  422  1e-117  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  unclonable  0.000000000839474 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0534  cysteinyl-tRNA synthetase  45.26 
 
 		 476 aa  420  1e-116  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0472255  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0107  cysteinyl-tRNA synthetase  45.4 
 
 		 459 aa  421  1e-116  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2571  cysteinyl-tRNA synthetase  45.72 
 
 		 461 aa  419  1e-116  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.00897166  hitchhiker  0.0000307026 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0936  cysteinyl-tRNA synthetase  45.51 
 
 		 460 aa  419  1e-116  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1844  cysteinyl-tRNA synthetase  45.11 
 
 		 463 aa  420  1e-116  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3508  cysteinyl-tRNA synthetase  45.61 
 
 		 460 aa  415  9.999999999999999e-116  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2138  cysteinyl-tRNA synthetase  45.09 
 
 		 478 aa  416  9.999999999999999e-116  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0357828 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0313  cysteinyl-tRNA synthetase  43.98 
 
 		 476 aa  415  9.999999999999999e-116  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.625731 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3036  cysteinyl-tRNA synthetase  45.27 
 
 		 478 aa  418  9.999999999999999e-116  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2511  cysteinyl-tRNA synthetase  44.38 
 
 		 459 aa  415  9.999999999999999e-116  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.000000706228  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0923  cysteinyl-tRNA synthetase  45.8 
 
 		 456 aa  418  9.999999999999999e-116  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1662  cysteinyl-tRNA synthetase  45.29 
 
 		 478 aa  415  9.999999999999999e-116  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.69895  normal  0.620733 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2051  cysteinyl-tRNA synthetase  45.68 
 
 		 461 aa  418  9.999999999999999e-116  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0707347  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_41360  cysteinyl-tRNA synthetase  45.82 
 
 		 460 aa  417  9.999999999999999e-116  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.490011 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3742  cysteinyl-tRNA synthetase  45.44 
 
 		 460 aa  412  1e-114  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.156882  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2110  cysteinyl-tRNA synthetase  45.85 
 
 		 460 aa  414  1e-114  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000230638 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2249  cysteine--tRNA ligase  44.04 
 
 		 485 aa  414  1e-114  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000746597  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3638  cysteinyl-tRNA synthetase  44.54 
 
 		 460 aa  413  1e-114  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.1842 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4174  cysteinyl-tRNA synthetase  43.98 
 
 		 494 aa  414  1e-114  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.801152  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1881  cysteinyl-tRNA synthetase  44.56 
 
 		 464 aa  415  1e-114  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1599  cysteinyl-tRNA synthetase  45.06 
 
 		 476 aa  414  1e-114  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  hitchhiker  0.00000906806  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2878  cysteinyl-tRNA synthetase  44.95 
 
 		 460 aa  414  1e-114  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.846571  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2660  cysteinyl-tRNA synthetase  45.61 
 
 		 461 aa  412  1e-114  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0958679  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1538  cysteinyl-tRNA synthetase  44.75 
 
 		 459 aa  413  1e-114  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.205032  hitchhiker  0.0027552 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3116  cysteinyl-tRNA synthetase  44.19 
 
 		 459 aa  412  1e-114  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000569576  decreased coverage  0.000000405781 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003837  cysteinyl-tRNA synthetase  44.17 
 
 		 460 aa  413  1e-114  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00000455216  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1439  cysteinyl-tRNA synthetase  43.42 
 
 		 459 aa  412  1e-114  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000326973  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3653  cysteinyl-tRNA synthetase  44.78 
 
 		 465 aa  414  1e-114  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2905  cysteinyl-tRNA synthetase  44.95 
 
 		 460 aa  411  1e-113  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.242748  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2933  cysteinyl-tRNA synthetase  46.47 
 
 		 461 aa  410  1e-113  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.395948  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1735  cysteinyl-tRNA synthetase  44.74 
 
 		 460 aa  410  1e-113  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.27756  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1248  cysteinyl-tRNA synthetase  46.03 
 
 		 461 aa  410  1e-113  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.000407868  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2684  cysteinyl-tRNA synthetase  45.17 
 
 		 459 aa  409  1e-113  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00000025745  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01842  cysteinyl-tRNA synthetase  43.75 
 
 		 460 aa  409  1e-113  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1345  cysteinyl-tRNA synthetase  46.35 
 
 		 461 aa  412  1e-113  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.164999  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2786  cysteinyl-tRNA synthetase  44.74 
 
 		 460 aa  411  1e-113  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.401544  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1952  cysteinyl-tRNA synthetase  44.9 
 
 		 485 aa  410  1e-113  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  decreased coverage  0.00515246  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>